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.2004年10月;25(13):1605-12.
doi:10.1002/jcc.20084。

UCSF Chimera——用于探索性研究和分析的可视化系统

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UCSF Chimera——用于探索性研究和分析的可视化系统

埃里克·F·佩特森等。 计算机化学杂志. 2004年10月.
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摘要

讨论了可扩展可视化系统UCSF Chimera的设计、实现和功能。Chimera被划分为一个核心,提供基本服务和可视化,以及提供最高级功能的扩展。此体系结构确保扩展机制满足希望合并新功能的外部开发人员的需求。提出了两个不寻常的扩展:Multiscale,它增加了可视化大规模分子组装(如病毒外壳)的能力,以及Collaborative,它允许研究人员在不同的地点以交互方式共享Chimera会话。其他扩展包括Multalign Viewer,用于显示多序列比对和相关结构;ViewDock,用于筛选对接配体方向;电影,用于回放分子动力学轨迹;和Volume Viewer,用于显示和分析体积数据。本文讨论了Chimera在现实世界中的使用,以及预期的未来发展方向。Chimera包括完整的用户文档,对学术和非营利用户免费,并可从以下站点获得Microsoft Windows、Linux、Apple Mac OS X、SGI IRIX和HP Tru64 Unixhttp://www.cgl.ucsf.edu/chimera/。

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