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.1975年10月20日；405(2):442-51.
doi:10.1016/0005-2795（75）90109-9。

T4噬菌体溶菌酶二级结构预测值与观察值的比较

B W马修斯

T4噬菌体溶菌酶二级结构预测值与观察值的比较

B W马修斯. Biochim生物物理学报. .

摘要

许多研究人员根据氨基酸序列对T4噬菌体溶菌酶二级结构的预测与X射线晶体学实验测定的蛋白质结构进行了比较。在分子的氨基末端一半内，许多方法预测的螺旋位置与观察到的结构相当吻合，但在分子的羧基一半内，整体一致性较差。对于11种不同的螺旋线预测，给出预测与观测之间相关性的系数范围为0.14至0.42。β-片区和转弯的预测精度通常低于螺旋线的预测精度，在许多情况下，预测和观测之间的一致性并不比随机选择残差的预期好。T4噬菌体溶菌酶的结构预测远不如腺苷酸激酶的结构预测成功（Schulz等人（1974）Nature 250，140-142）。没有一种预测方法明显优于所有其他方法，虽然基于大量已知蛋白质结构的经验预测往往比基于有限样本的预测更准确，但准确度的提高并不显著，这表明，仅仅通过包含更多来自额外蛋白质结构测定的数据，目前经验预测方法的准确性不会显著提高。

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