跳到主页内容
美国国旗

美国政府的官方网站

Dot政府

gov意味着它是官方的。
联邦政府网站通常以.gov或.mil结尾。之前分享敏感信息，确保你在联邦政府政府网站。

Https系统

网站是安全的。
这个https（https）：//确保您连接到官方网站，并且您提供的任何信息都是加密的并安全传输。

访问密钥 NCBI主页 MyNCBI主页 主要内容 主导航
.2000年8月1日；97(16):9127-32.
doi:10.1073/pnas.97.16.9127。

使用15000只小鼠发育cDNA微阵列对中期妊娠胎盘和胚胎进行全基因组表达谱分析

田中T S 1, S A Jaradat公司, M K林, G J卡古尔, X王, M J格拉霍瓦茨, S潘塔诺, Y萨诺, Y Piao公司, R Nagaraja村, H Doi公司, W H Wood第三, K G贝克尔, M S Ko公司
附属公司

使用15000只小鼠发育cDNA微阵列对中期妊娠胎盘和胚胎进行全基因组表达谱分析

田中T S等。 美国国家科学院程序. .

摘要

cDNA微阵列技术越来越多地用于监测各种组织和细胞类型中的全球基因表达模式。然而，由于缺乏适当的cDNA收集，特别是在早期发育阶段，限制了其在哺乳动物发育中的应用。为了克服这一问题，采用基于PCR-的cDNA文库构建方法，从植入前和植入前胚胎、胚胎期（E）12.5天雌性性腺/中肾和新生卵巢中提取52374个表达序列标签。从这些cDNA集合中，组装了代表15264个独特基因（78%为新基因，22%为已知基因）的微阵列。在最初的应用中，对胎盘和胚胎基因表达谱的差异进行了评估。在发育的E12.5阶段，基于三次重复实验，720个基因（6.5%）在胎盘和胚胎之间的表达显示出统计学上的显著差异。在胎盘中高表达的289个基因中，61个胎盘特异性基因编码了一种新的催乳素样蛋白。因此，胎盘高表达（且经常特异）的基因数量比之前报道的总数增加了5倍，说明了微阵列在组织特异性基因发现和哺乳动物发育程序分析方面的潜力。

PubMed免责声明

数字

图1
图1
15K小鼠cDNA微阵列的构建。显示了用于EST世代的cDNA文库以及从每个文库中收集的EST数量(左侧)。通过序列相似性对EST进行聚类，并从每个基因簇中选择具有代表性的cDNA克隆。显示了15264（15K）独特基因集中cDNA克隆的数量和来源(赖特).
图2
图2
胚胎和胎盘间15K基因在E12.5的表达谱。(A类)实验程序示意图和典型杂交的伪彩色图像。在去除母体组织后，将胚胎和胎盘（包括卵黄囊和羊膜）解剖出来，用于提取RNA。每个样本的放射性标记cDNA分别在15K微阵列上杂交。对每个样品分别进行三次杂交。胎盘中的基因表达水平表示为红色，胚胎中的基因表示为绿色。两个样本中常见表达的基因呈黄色。(B类)对于每个基因，分别从胎盘和胚胎的三个独立杂交中计算平均表达水平（以任意单位表示），并显示在散点图上。胚胎和胎盘之间表达水平显著不同且显著性水平为5%的基因(P（P）<0.05）显示为绿色斑点，其他基因显示为灰色斑点。实线显示胚胎和胎盘之间存在2倍的表达差异；虚线表示10倍的表达差异。所选基因的Northern blot分析结果以散点图中的坐标显示。共检测了28个克隆，并显示了10个克隆的Northern印迹。根据Northern blot上的表达模式对斑点进行颜色编码：胎盘特异表达（红色）、胚胎特异表达（蓝色）、常见表达基因（黄色），胎盘和胚胎中均未检测到表达（黑色）。显示统计显著差异的基因用正方形表示，而不显示的基因用圆圈表示。
图3
图3
新的胎盘特异性基因。(A类，顶部)现场H3018B06基因杂交。用从H3018B06转录的地高辛标记RNA（bar=1 mm）对E13.5胚胎胎盘的横切面进行探测。(左下角)顶部面板中用矩形标记的区域的放大视图（bar=100μm）。(右下角)控制就地与滋养层细胞特异性基因4311杂交（bar=1mm）。Am，羊膜；Br，大脑；F1，前肢；Hl，后肢；In，肠；胎盘。(B类)H3018B06的核苷酸和假定氨基酸序列。(C类)小鼠H3018B06基因与负鼠PRL基因的氨基酸序列比对。
请参阅PMC中的此图像和版权信息

类似文章

查看所有类似文章

引用人

查看所有“引用者”文章

工具书类

    1. Ferea T L，Brown P O.Curr Opin Genet Dev.1999；9:715–722.-公共医学
    1. Duggan D J、Bittner M、Chen Y、Meltzer P、Trent J M.Nat Genet。1999;21:10–14.-公共医学
    1. DeRisi J L、Iyer V R、Brown P O.Science。1997;278:680–686.-公共医学
    1. Chu S、DeRisi J、Eisen M、Mulholland J、Botstein D、Brown P O、Herskowitz I科学。1998;282:699–705.-公共医学
    1. Spellman P T、Sherlock G、Zhang M Q、Iyer V R、Anders K、Eisen M B、Brown P O、Botstein D、Futcher B.Mol Biol Cell。1998;9:3273–3297。-项目管理咨询公司-公共医学

关联数据