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.2000年6月20日;39(24):7050-62.
doi:10.1021/bi000280v。

阿拉伯非核酸(ANA)的合成和生物物理性质:圆二色谱、熔化温度和ANA对核糖核酸酶H的敏感性。RNA杂交双工体

附属公司

阿拉伯非核酸(ANA)的合成和生物物理性质:圆二色谱、熔化温度和ANA对核糖核酸酶H的敏感性。RNA杂交双工体

A M诺罗尼亚等。 生物化学. .

摘要

阿糖核酸(ANA)是RNA的2’-差向异构体,由阿糖核酸构建块通过常规固相磷酰胺合成法合成。此外,首次对混合碱组成的ANA链的生化和理化性质进行了评价。ANA表现出了作为反义试剂所需的某些特性。它们与互补RNA形成双链体,直接降解靶RNA分子的RNase H,并对3'-核酸外切酶表现出抗性。由于RNA不会引发核糖核酸酶H的活性,我们的研究结果表明,C2’处的立体化学(ANA与RNA)是核糖核酸酶H激活的关键决定因素。C2’处的立体化学反转很可能伴随着呋喃糖褶皱从C3’-内切(RNA)到C2’-内切(“类DNA”)的构象变化pucker(ANA)[Noronha和Damha(1998)核酸研究26,2665-2671;Venkateswaru和Ferguson(1999)美国化学学会杂志121,5609-5610]。这就产生了ANA/RNA杂交体,其CD光谱(即螺旋构象)与天然DNA/RNA底物比纯RNA/RNA双重底物更为相似。这些特征,再加上ara-2'OH基团投射到螺旋的主要凹槽中(在那里它们不应干扰RNase H结合),有助于解释ANA/RNA杂交体的RNA酶H活性。

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