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第36卷（7）；2020年4月1日

文章

乳房X射线照相密度的器官模型显示，辐射照射下异常菌落形成的频率较高
郑庆素（音译）、巴赫拉姆·帕文（Bahram Parvin）
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 1989–1993.2019年11月28日在线发布。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz888
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项目管理委员会7141857
摘要 第条 PDF–220万
SCGid：从未培养真核生物的单细胞测序文库进行连续筛选和基因组预测的一致方法
Kevin R Amses、William J Davis、Timothy Y James
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 1994–2000.2019年11月25日在线发布。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz866
预防性维修识别码：
项目管理委员会7141854
摘要 第条 PDF–300万
CRISPRitz：快速、高通量和差异感知生物信息学用于CRISPR基因组编辑的非靶点识别
萨缪尔·坎塞列里（Samuele Cancellieri）、马修·C·坎弗（Matthew C Canver）、尼古拉·鲍比里（Nicola Bombieri）、罗莎尔巴·朱格诺（Rosalba Giugno）、卢卡·皮内罗（Luca Pinello）
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 2001–2008.在线发布2019年11月25日。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz867
预防性维修识别码：
项目管理委员会7141852
摘要 第条 PDF–609K格式
Episo：通过亚硫酸氢盐处理的RNA高通量测序定量评估亚型水平的RNA 5-甲基胞嘧啶
刘俊峰、安资阳、罗建军、李静、李飞飞、张志华
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 2033–2039.2019年12月3日在线发布。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz900
预防性维修识别码：
PMC7141862号
摘要 第条 PDF–632K
植物门：从相似基因组的大样本中快速估计进化距离
Fabian Klötzl、Bernhard Haubold
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 2040–2046.2019年12月2日在线发布。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz903
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下午7141870
摘要 第条 PDF–428K
使用Ribo-seq数据精确检测短和长活性ORF
Saket Choudhary、Wenzheng Li、Andrew D.Smith
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 2053–2059.在线发布2019年11月21日。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz878
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项目管理委员会7141849
摘要 第条 PDF–692K
肿瘤进化树的距离度量
扎克·迪纳多（Zach DiNardo）、基兰·汤姆林森（Kiran Tomlinson）、安娜·里兹（Anna Ritz）、莱拉·奥斯珀（Layla Oesper）
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 2090–2097.2019年11月21日在线发布。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz869
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PMC7141873号
摘要 第条 PDF–250万
在连续谱系地理学推断中纳入异质采样概率——在湄公河地区H5N1病毒传播中的应用
西蒙·德利科尔、菲利普·莱梅、让·阿托伊斯、托米·塔姆、爱丽丝·福萨罗、伊莎贝拉·莫内、乔瓦尼·卡特利、德米特里·库兹涅佐夫、伊奥尼斯·塞纳里奥斯、格温奈尔·多芬、万塔内·卡尔普拉维德、索菲·冯·多布舒埃茨、菲利普·克莱斯、斯科特·H·纽曼、马克·阿苏查德、盖伊·贝勒、马吕斯·吉尔伯特
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 2098–2104.2019年12月2日在线发布。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz882
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PMC7141868号
摘要 第条 PDF–1000万
DeepMSA：构建深度多序列比对以改进远程组织学蛋白质的接触预测和折叠识别
张成新、郑伟、S M Mortuza、杨莉、张扬
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 2105–2112.2019年11月18日在线发布。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz863
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PMC7141871号
摘要 第条 PDF–250万
基于三维深卷积神经网络的蛋白质对接模型评价
小王、Genki Terashi、Charles W Christopover、Mengmeng Zhu、Daisuke Kihara
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 2113–2118.2019年11月20日在线发布。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz870
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项目管理委员会7141855
摘要 第条 PDF–610万
基于高效机器学习的抗体互补性决定区域设计
葛柳、曾浩扬、乔纳斯·穆勒、布兰登·卡特、王子恒、乔纳斯席尔茨、杰拉尔丁·霍尼、迈克尔·E·伯恩鲍姆、斯特凡·尤尔特、大卫·K·吉福德
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 2126–2133.2019年11月28日在线发布。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz895
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下午7141872
摘要 第条 PDF–480万
dSreg：整合剪接和RNA结合蛋白活性变化的贝叶斯模型
卡洛斯·马丁·戈麦斯、恩里克·拉拉·佩齐、法蒂玛·桑切兹·卡波
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 2134–2141.2019年12月13日在线发布。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz915
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PMC7141860号
摘要 第条 PDF–120万
Easy-HLA：一个经过验证的web应用程序套件，用于显示HLA的全部细节打字
埃斯特勒·杰法德、索菲·利莫、亚历山德雷·瓦伦西克、米歇尔·达亚、哈罗德·沃森、达拉·托格森、凯瑟琳·巴恩斯，代表中国民航局、安妮·塞斯布朗·戈蒂埃、皮埃尔·安托因·古拉德、尼古拉·文斯
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 2157–2164.2019年11月21日在线发布。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz875
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项目管理委员会8248894
摘要 第条 PDF–310万
All-FIT：基于等位基因频率的高深度测序数据肿瘤纯度插补
Jui Wan Loh、Caitlin Guccione、Frances Di Clemente、Gregory Riedlinger、Shridar Ganesan、Hossein Khiabanian
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 2173–2180.2019年11月21日在线发布。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz865
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PMC7141867号
摘要 第条 PDF–130万
肿瘤细胞新治疗靶点预测的模糊建模与全局优化
马可·S·诺比利、朱塞皮娜·沃塔、罗伯塔·帕洛里尼、西蒙·斯波劳尔、亨贝托·德·维托、保罗·卡扎尼加、弗朗西丝卡·里恰迪埃洛、吉安卡洛·毛里、莉莉亚·阿尔贝吉纳、费迪南多·齐亚拉多纳、丹妮拉·贝索齐
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 2181–2188.在线发布2019年11月21日。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz868
预防性维修识别码：
PMC7141866号
摘要 第条 PDF–250万
利用深度学习将人类基因与年龄相关疾病联系起来
Fabio Fabris、Daniel Palmer、Khalid M Salama、Joáo Pedro de Magalháes、Alex A Freitas
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 2202–2208.2019年12月17日在线发布。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz887
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项目管理委员会7141856
摘要 第条 PDF–159K
蛋白质组数据依赖性采集质谱中缺失值的使用，以实现疾病活动识别
凯瑟琳·麦格尔克、阿里安娜·达利亚蒂、大卫·齐亚塞里尼、戴夫·李、达伦工厂、伊沃娜·巴里塞维奇-琼斯、珍妮特·凯萨尔、瑞切尔·艾尼曼、瑞秋·里德、贝萨尼·盖里、理查德·丹温、安娜·尼古拉、伯纳德·基夫尼、安妮·巴顿、安东尼·德·惠顿、诺法尔·盖夫曼
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 2217–2223.2019年12月2日在线发布。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz898
预防性维修识别码：
项目管理委员会7141869
摘要 第条 PDF–808K
生物医学本体论中的形式公理改进了相关数据的分析和解释
Fatima Zohra Smaili、Xin Gao、Robert Hoehndorf
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 2229–2236.2019年12月10日在线发布。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz920
预防性维修识别码：
下午7141863
摘要 第条 PDF–170万
KofamKOALA:KEGG Ortholog基于轮廓HMM和自适应得分阈值的分配
Takuya Aramaki、Romain Blanc-Mathieu、Hisashi Endo、Koichi Ohkubo、Minoru Kanehisa、Susumu Goto、Hiroyuki Ogata
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 2251–2252.2019年11月19日在线发布。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz859
预防性维修识别码：
项目管理委员会7141845
摘要 第条 PDF–69K
融合织机：组装转录体中的融合检测
Readman Chiu、Ka Ming Nip、Inanc Birol
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 2256–2257.2019年12月2日在线发布。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz902
预防性维修识别码：
PMC7141844号
摘要 第条 PDF–941K
NeoFuse：从RNA测序数据预测融合新抗原
乔治·福塔基斯（Georgios Fotakis）、迪特马尔·里德（Dietmar Rieder）、马琳·海德尔（Marlene Haider）、兹拉特科·特拉亚诺斯基（Zlatko Trajanoski）、弗朗西丝卡·菲诺特洛
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 2260–2261.2019年11月22日在线发布。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz879
预防性维修识别码：
PMC7141848号
摘要 第条 PDF–468K
popSTR2支持微卫星的临床和人群规模基因分型
斯内斯·迪斯·克里斯特蒙德斯多蒂、汉内斯·佩格特森、古德尼·阿尔纳多蒂、比亚尼·V·哈尔多森
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 2269–2271.2019年12月5日在线发布。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz913
预防性维修识别码：
PMC7141861号
摘要 第条 PDF–790K
Logomaker：Python中漂亮的序列徽标
贾斯汀·金尼（Justin B Kinney）·阿马尔·塔林（Ammar Tareen）
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 2272–2274.2019年12月10日在线发布。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz921
预防性维修识别码：
PMC7141850型
摘要 第条 PDF–536K
GABAC：基因组数据的算术编码解决方案
简·沃赫斯、汤姆·帕里登斯、费比安·穆特费林、刘德米拉·梅因策、布赖恩·布利斯、杨明宇、伊多娅·奥乔亚、扬·福斯蒂尔、约恩·奥斯特曼、米凯尔·赫内兹
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 2275–2277.2019年12月12日在线发布。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz922
预防性维修识别码：
下午7141842
摘要 第条 PDF–781K
传输引导的快速且节省内存的实现
Sarah Lutteropp、Alexey M Kozlov、Alexandros Stamatakis
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 2280–2281.2019年11月22日在线发布。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz874
预防性维修识别码：
项目管理委员会7141843
摘要 第条 PDF–206K
DNA读取查看器（DRV）：蛋白质结合DNA片段特异性决定模式的可视化
克里斯蒂安·亚当（Krisztian Adam）、佐尔坦·戈盖瓦尔（Zoltan Gyorgypal）、佐尔坦·赫格杜斯（Zoltan-Hegedus）
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 2286–2287.2019年12月3日在线发布。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz906
预防性维修识别码：
项目管理委员会7141859
摘要 第条 PDF–653K
牢房工作台:R/生物导体用于比较单细胞RNA-seq分析方法的软件
Su Shian、Tian Luyi、Dong Xueyi、Peter F Hickey、Saskia Freytag、Matthew E Ritchie
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 2288–2290.2019年11月28日在线发布。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz889
预防性维修识别码：
PMC7141847号
摘要 第条 PDF–940K
SimRVSequences：模拟家谱遗传序列数据的R包
Christina Nieuwoudt、Angela Brooks-Wilson、Jinko Graham
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 2295–2297.2019年11月25日在线发布。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz881
预防性维修识别码：
项目管理委员会7141864
摘要 第条 PDF–74K
Link-HD：探索和整合异质微生物群落的通用框架
Laura M Zingaretti、Gilles Renand、Diego P Morgavi、Yulixis Ramayo-Caldas
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 2298–2299.在线发布2019年11月18日。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz862
预防性维修识别码：
项目管理委员会7141858
摘要 第条 PDF–463K
脓毒症：纵向组学分析和趋势识别
Sergii Domanskyi、Carlo Piermarocchi、George I Mias
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 2306–2307.2019年11月28日在线发布。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz896
预防性维修识别码：
PMC7141865号
摘要 第条 PDF–266K
大脑：scRNA-seq数据的交互式可视化
罗曼·希尔杰（Roman Hillje）、朱塞佩·佩利奇码头（Pier Giuseppe Pelicci）、卢西拉·卢齐（Lucilla Luzi）
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 2311–2313.2019年11月25日在线发布。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz877
预防性维修识别码：
项目管理委员会7141853
摘要 第条 PDF–100万
ClinVAP：从变体到治疗方案的报告策略
Bilge Sürün、Charlotta P I Schärfe、Mathew r Divine、Julian Heinrich、Nora C Toussaint、Lukas Zimmermann、Janina Beha、Oliver Kohlbacher
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 2316–2317.2019年12月12日在线发布。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz924
预防性维修识别码：
PMC7141851号
摘要 第条 PDF–126K

原始纸张

数据和文本挖掘

Epiviz基因组数据的前瞻性可视化和统计分析
Zhe Cui、Jayaram Kancherla、Kyle W Chang、Niklas Elmqvist、Héctor Corrada Bravo
生物信息学。2020年4月1日；36(7): 2195–2201.2019年11月29日在线发布。数字对象标识：10.1093/生物信息学/btz883
预防性维修识别码：
项目管理委员会7868663
摘要 第条 PDF–240万
文章来自生物信息学由以下人员提供牛津大学出版社