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第8卷（12）；2012年12月

教育类

利用课堂游戏教授生物数据集成基础
玛丽亚·维多利亚·施奈德（Maria Victoria Schneider）、拉斐尔·希梅内兹（Rafael C.Jimenez）
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002789。2012年12月27日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002789
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项目经理3531283
摘要 第条 PDF–778K
转化生物信息学导论
俄罗斯·B·奥尔特曼
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002796。2012年12月27日在线发布。数字对象标识：10.1371/journal.pcbi.1002796
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项目经理3531318
第条 PDF–159K
第三章小分子与疾病
大卫·S·威斯哈特
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002805。2012年12月27日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002805
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项目经理3531289
摘要 第条 PDF–100万
第十二章人体微生物组分析
Xochitl C.Morgan、Curtis Huttenhower
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002808。2012年12月27日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002808
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PMC3531975
摘要 第条 PDF–538K
第二章：疾病生物学的数据驱动观点
Casey S.Greene，Olga G.Troyanskaya
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002816。2012年12月27日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002816
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项目经理3531282
摘要 第条 PDF–110万
第七章药物基因组学
Konrad J.Karczewski、Roxana Daneshjou、Russ B.Altman
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002817。2012年12月27日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002817
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项目经理3531317
摘要 第条 PDF–130万
第四章蛋白质相互作用与疾病
Mileidy W.Gonzalez，Maricel G.Kann
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002819。2012年12月27日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002819
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项目经理3531279
摘要 第条 PDF–980K
第5章：复杂疾病的网络生物学方法
Dong Yeon Cho、Yoo-Ah Kim、Teresa M.Przytycka
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002820。2012年12月27日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002820
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项目经理3531284
摘要 第条 PDF–395K
第六章结构变异与医学基因组学
本杰明·拉斐尔
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002821。2012年12月27日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002821
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项目经理3531322
摘要 第条 PDF–110万
第11章：全基因组关联研究
威廉·布什（William S.Bush）、杰森·摩尔（Jason H.Moore）
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002822。2012年12月27日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002822
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项目经理3531285
摘要 第条 PDF–516K
第13章：基因组时代的电子健康记录挖掘
约书亚·C·丹尼
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002823。2012年12月27日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002823
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摘要 第条 PDF文件–588K
第十四章肿瘤基因组分析
Miguel Vazquez、Victor de la Torre、Alfonso Valencia
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002824。2012年12月27日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002824
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项目经理3531315
摘要 第条 PDF–674K
第一章生物医学知识整合
菲利普·佩恩
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002826。2012年12月27日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002826
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项目经理3531314
摘要 第条 PDF–830K
第九章：运用疾病本体论进行分析
尼甘·沙阿、泰勒·科尔、马克·穆森
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002827。2012年12月27日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002827
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下午C3531278
摘要 第条 PDF–550万
第10章：挖掘全基因组遗传标记
张翔、黄顺平、张昭君、王伟
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002828。2012年12月27日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002828
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项目经理3531292
摘要 第条 PDF–374K
第八章生物知识的汇编与解释
朱汉金
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002858。2012年12月27日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002858
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PMC3531281型
摘要 第条 PDF–640万

编辑

科学软件开放开发的十条简单规则
Andreas Prlić，James B.Procter
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002802。2012年12月6日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002802
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项目经理3516539
第条 PDF–127K

审查

真核细胞形态和运动计算模型的比较
威廉·霍姆斯、利亚·埃德尔斯坦-凯舍特
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002793。2012年12月27日在线发布。数字对象标识：10.1371/journal.pcbi.1002793
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PMC3531321型
摘要 第条 PDF–200万

研究文章

ACME：自动细胞形态提取仪用于细胞膜的全面重建
Kishore R.Mosaliganti、Ramil R.Noche、Fengzhu Xiong、Ian A.Swinburne、Sean G.Megason
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002780。2012年12月6日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002780
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项目经理3516542
摘要 第条 PDF–560万
通过ISH图像分类定位小脑层基因
Lior Kirsch、Noa Liscovitch、Gal Chechik
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002790。2012年12月20日在线发布。数字对象标识：10.1371/journal.pcbi.1002790
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下午3527225
摘要 第条 PDF–110万
H法测定心脏流量的敏感性分析2 18利用能量传递途径的动态同位素模型进行O提供标记
David W.Schryer、Pearu Peterson、Ardo Illaster、Marko Vendelin
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002795。2012年12月6日在线发布。数字对象标识：10.1371/journal.pcbi.1002795
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项目经理3516558
摘要 第条 PDF–110万
血液肿瘤染色体易位相关基因的基因组标记
Mikhail Shugay、Iñigo Ortiz de Mendíbil、JoséL.Vizmanos、Francisco J.Novo
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002797。2012年12月6日在线发布。数字对象标识：10.1371/journal.pcbi.1002797
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项目经理3516532
摘要 第条 PDF–1.2米
利用转录因子占有率和染色质状态的综合模型预测时空基因表达
Bartek Wilczynski、Ya-Hsin Liu、Zhen Xuan Yeo、Eileen E.M.Furlong
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002798。2012年12月6日在线发布。数字对象标识：10.1371/journal.pcbi.1002798
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项目经理3516547
摘要 第条 PDF–901K
具有糖结构靶向自定义特征的肽配体的分子进化
尼尔斯·罗肯多夫（Niels Röckendorf）、马克斯·博施巴赫（Markus Borschbach）、安德烈亚斯·弗雷（Andreas Frey）
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002800。2012年12月13日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002800
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项目经理3521706
摘要 第条 PDF–651K
将毛囊生长动力学建模为可激发介质
菲利普·J·穆雷、菲利普·梅尼、马克西姆·V·普利克斯、程明忠、露丝·E·贝克
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002804。2012年12月20日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002804
PMCID公司：
项目经理3527291
摘要 第条 PDF–430万
SnIPRE：使用泊松随机效应模型进行选择推断
Kirsten E.Eilertson、James G.Booth、Carlos D.Bustamante
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002806。2012年12月6日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002806
PMCID公司：
项目经理3516574
摘要 第条 PDF–110万
细胞色素的电子转移相互作用c（c）
亚历山大·沃尔科夫，尼科·A·J·范·努兰
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002807。2012年12月6日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002807
PMCID公司：
项目经理3516563
摘要 第条 PDF–880K
多尺度网络中单个神经元与振荡活动交叉耦合的任务依赖性变化
Ryan T.Canolty、Karunesh Ganguly、Jose M.Carmena
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002809。2012年12月20日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002809
PMCID公司：
项目经理3527280
摘要 第条 PDF–310万
摩擦流体中波动游泳的力学
杨丁（Yang Ding）、莎拉·夏普（Sarah S.Sharpe）、安德鲁·梅斯（Andrew Masse）、丹尼尔·戈德曼（Daniel I.Goldman）
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002810。2012年12月27日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002810
PMCID公司：
PMC3531286型
摘要 第条 PDF–150万
通过RNA聚合酶结合位点设计调节启动子强度大肠杆菌
Robert C.Brewster、Daniel L.Jones、Rob Phillips
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002811。2012年12月13日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002811
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项目经理3521663
摘要 第条 PDF–802K
端粒花束形成的定量动力学
David M.Richards、Emma Greer、Azahara C.Martin、Graham Moore、Peter J.Shaw、Martin Howard
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002812。2012年12月6日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002812
PMCID公司：
项目经理3516562
摘要 第条 PDF–130万
网络环境中上升的光纤突发大小和橄榄形阈下振荡
Jornt R.De Gruijl、Paolo Bazzigaluppi、Marcel T.G.De Jeu、Chris I.De Zeeuw
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002814。2012年12月13日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002814
PMCID公司：
项目经理3521668
摘要 第条 PDF–100万
参数可识别性和敏感性分析预测胰腺癌和星形细胞STAT1活性增强的靶点
Katja Rateitschak、Felix Winter、Falko Lange、Robert Jaster、Olaf Wolkenhauer
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002815。2012年12月20日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002815
PMCID公司：
下午3527226
摘要 第条 PDF–130万
芽孢杆菌细胞间通讯的进化
Jordi van Gestel、Martin A.Nowak、Corina E.Tarnita
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002818。2012年12月20日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002818
PMCID公司：
项目经理3527279
摘要 第条 PDF–732K
可靠的B细胞表位预测：方法开发和改进基准的影响
Jens Vindahl Kringelum、Claus Lundegaard、Ole Lund、Morten Nielsen
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002829。2012年12月27日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002829
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项目经理3531324
摘要 第条 PDF–110万
miRNA靶向联合识别SNP在骨密度中潜在作用的新模型
Claudia Coronnello、Ryan Hartmaier、Arshi Arora、Luai Huleihel、Kusum V.Pandit、Abha S.Bais、Michael Butterworth、Naftali Kaminski、Gary D.Stormo、Steffi Oestereich、Panayiotis V.Benos
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002830。2012年12月20日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002830
PMCID公司：
项目经理3527281
摘要 第条 PDF–999K
系统发育多样性理论揭示微生物群落结构
James P.O'Dwyer、Steven W.Kembel、Jessica L.Green
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002832。2012年12月20日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002832
PMCID公司：
项目经理3527210
摘要 第条 PDF–843K
基于近似贝叶斯计算的系统动力学推断和模型评估：以流感为例
奥利弗·拉特曼（Oliver Ratmann）、盖东克（GéDonker）、亚当·梅耶尔（Adam Meijer）、克里斯托夫·弗雷泽（Christophe Fraser）、卡蒂亚·科勒（Katia Koelle）
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002835。2012年12月27日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002835
PMCID公司：
项目经理3531293
摘要 第条 PDF–570万
软结合突触可塑性增加存储容量
Mark C.W.van Rossum、Maria Shippi、Adam B.Barrett
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002836。2012年12月20日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002836
PMCID公司：
项目经理3527223
摘要 第条 PDF格式–544K
大鼠震颤皮层的三维重建和标准化用于单神经元形态的精确配准
Robert Egger、Rajeevan T.Narayanan、Moritz Helmstaedter、Christiaan P.J.de Kock、Marcel Oberlaender
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002837。2012年12月20日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002837
PMCID公司：
项目经理3527218
摘要 第条 PDF–140万
PERT：一种在不同微环境和发育条件下对人体血液样本进行表达反褶积的方法
乔文莲、杰拉尔德·昆、伊丽莎白·沙沙尔、梅雨、奎德·莫里斯、彼得·赞斯特拉
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002838。2012年12月20日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002838
PMCID公司：
项目经理3527275
摘要 第条 PDF–140万
蛋白质组的普遍趋势表明最后一个常见的油性祖先
Ranjan V.Mannige、Charles L.Brooks、Eugene I.Shakhnovich
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002839。2012年12月27日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002839
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项目经理3531291
摘要 第条 PDF–716K
补体C3d的两面：天生免疫与适应性免疫联系中静电的演变
Chris A.Kieslich、Dimitrios Morikis
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002840。2012年12月27日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002840
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项目经理3531323
摘要 第条 PDF–713K
两人互动的计算表型揭示了神经对深度思考的不同反应
Ting Xiang、Debajyoti Ray、Terry Lohrenz、Peter Dayan、P.Read Montague
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002841。2012年12月27日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002841
PMCID公司：
PMC3531325
摘要 第条 PDF–538K
分子动力学模拟揭示Hsp70变构通讯的分子机制
费德里卡·奇亚普里、伊万·梅雷利、乔治·科伦坡、卢西亚诺·米拉内西、朱利亚·莫拉
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002844。2012年12月27日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002844
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下午C3531320
摘要 第条 PDF–170万
用分子力学预测纤维结合蛋白纤维的本体材料性能
Mark J.Bradshaw、Man C.Cheung、Daniel J.Ehrlich、Michael L.Smith
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002845。2012年12月27日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002845
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项目经理3531316
摘要 第条 PDF–920K
核相关蛋白影响大肠杆菌以生长阶段特定的方式
托比亚斯·沃内克、弗兰·苏佩克、本·莱纳
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002846。2012年12月20日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002846
PMCID公司：
项目经理3527292
摘要 第条 PDF–604K
钙波在内皮细胞网络中的传播：基于模型的理论和实验研究
Juexuan Long、Michael Junkin、Pak Kin Wong、James Hoying、Pierre Deymier
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002847。2012年12月27日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002847
PMCID公司：
项目经理3531288
摘要 第条 PDF–130万
细菌子实体的互连海绵状结构
Cameron W.Harvey、Huijing Du、Zhiliang Xu、Dale Kaiser、Igor Aranson、Mark Alber
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002850。2012年12月27日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002850
PMCID公司：
项目经理3531287
摘要 第条 PDF–260万
Motif D在脊髓灰质炎病毒RNA依赖性RNA聚合酶催化的核苷酸并入中的作用是什么？
沈虎军、孙慧、李国辉
公共科学图书馆计算生物学。2012年12月；8（12）：e1002851。2012年12月27日在线发布。数字对象标识：10.1371/日记.pcbi.1002851
PMCID公司：
PMC3531290型
摘要 第条 PDF–450万
文章来自PLOS计算生物学由以下人员提供多环芳烃