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第3卷；  2002

研究文章

比较RNA网站（CRW）：核糖体、内含子和其他RNA比较序列和结构信息的在线数据库
Jamie J Cannone、Sankar Subramanian、Murray N Schnare、James R Collett、Lisa M D’Souza、Yushi Du、Brian Feng、Nan Lin、Lakshmi V Madabusi、Kirsten Müller、Nupur Pande、Zhidi Shang、Nang Yu、Robin R Gutell
BMC生物信息学。2002;3: 2.2002年1月17日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-2
更正：
BMC生物信息学。2002; 3: 15.
预防性维修识别码：
第5690页
摘要 第条 PDF–100万
用于高密度寡核苷酸阵列分析的匹配积分分布（MOID）算法
周英耀、鲁本·阿巴扬
BMC生物信息学。2002;3: 3.2002年1月22日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-3
预防性维修识别码：
PMC65509型
摘要 第条 PDF–439K
表达谱数据解释的变异来源和实验方法的影响
Marina Bakay、Yi-Wen Chen、Rehannah Borup、Po Zhao、Kanneboyina Nagaraju、Eric P Hoffman
BMC生物信息学。2002;3: 4.2002年1月31日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-4
预防性维修识别码：
PMC65691型
摘要 第条 PDF–759K
基因组微生物CoDing-Sequences的重新注释：发现新基因和注释不准确的基因
Stéphanie Bocs、Antoine Danchin、Claudine Médigue
BMC生物信息学。2002;3: 5.2002年2月5日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-5
预防性维修识别码：
PMC77393号
摘要 第条 PDF–441K
寻找序列特异性寡核苷酸探针用于物种鉴定的算法和程序
Alexander E Pozhitkov，Diethard Tautz
BMC生物信息学。2002;3: 9.2002年3月6日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-9
预防性维修识别码：
项目编号100321
摘要 第条 PDF–20万
RNA:（鸟嘌呤-N2）甲基转移酶RsmC/RsmD及其同系物的重访——基于未表征的Mj0882蛋白结构的活性位点的生物信息学分析和预测
Janusz M Bujnicki，Leszek Rychlewski
BMC生物信息学。2002;3: 10.2002年4月3日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-10
预防性维修识别码：
项目102759
摘要 第条 PDF–874K
通过生物文献的系统分析确定人类基因之间的功能关系
陶永川、鲁道夫·莱贝尔
BMC生物信息学。2002;3: 16.2002年6月7日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-16
预防性维修识别码：
项目经理116673
摘要 第条 PDF–304K
一种用于序列与RNA二级结构最佳比对的高效记忆动态编程算法
肖恩·雷迪
BMC生物信息学。2002;3: 18.2002年7月2日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-18
预防性维修识别码：
项目经理119854
摘要 第条 PDF–434K
参与PTGS的SGS3蛋白发现一个家族
亚历克斯·贝特曼
BMC生物信息学。2002;3: 21.2002年8月5日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-21
预防性维修识别码：
项目经理119857
摘要 第条 PDF–272K
微阵列结果：准确度如何？
拉维·科塔帕利（Ravi Kothapalli）、肖恩·尤德（Sean J Yoder）、施里坎·马内（Shrikant Mane）、小托马斯·洛夫兰（Thomas P Loughran，Jr）
BMC生物信息学。2002;3: 22.2002年8月23日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-22
预防性维修识别码：
项目经理126254
摘要 第条 PDF–632K
用Affymetrix微阵列减少方差的计算方法
斯蒂芬·韦尔（Stephen Welle）、安德鲁·布鲁克斯（Andrew I Brooks）、查尔斯·桑顿（Charles A Thornton）
BMC生物信息学。2002;3: 23.2002年8月30日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-23
预防性维修识别码：
PMC126253项目
摘要 第条 PDF–220万
疾病相关突变的功能重要性
Sean D Mooney，Teri E Klein
BMC生物信息学。2002;3: 24.2002年9月9日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-24
预防性维修识别码：
项目经理128831
摘要 第条 PDF–246K
利用SVMHC预测MHC I类结合肽
皮埃尔·德内斯（Pierre Dönnes）、阿恩·埃洛夫森（Arne Elofsson）
BMC生物信息学。2002;3: 25.2002年9月11日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-25
预防性维修识别码：
29981英镑
摘要 第条 PDF–296K
人肾癌表达谱的功能分类分析
Michael A Gieseg、Theresa Cody、Michael Z Man、Steven J Madore、Mark A Rubin、Eric P Kaldjian
BMC生物信息学。2002;3: 26.2002年9月30日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-26
预防性维修识别码：
PMC130042型
摘要 第条 PDF–821K
DNA阵列杂交实验的模拟以及后续图像和数据分析中关键参数的评估
Christoph K Wierling、Matthias Steinfath、Thorsten Elge、Steffen Schulze-Kremer、Pia Aanstad、Matthew Clark、Hans Lehrach、Ralf Herwig
BMC生物信息学。2002;3: 29.2002年10月22日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-29
预防性维修识别码：
项目经理138793
摘要 第条 PDF–988K
基因组的计算检测顺式-早期应用于身体模式的调节模块果蝇属胚胎
Nikolaus Rajewsky、Massimo Vergassola、Ulrike Gaul、Eric D Siggia
BMC生物信息学。2002;3: 30.2002年10月24日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-30
预防性维修识别码：
项目经理139975
摘要 第条 PDF–331K
通过克隆EST序列来理解它们
约翰·帕金森、大卫·B·吉利亚诺、马克·布拉克斯特
BMC生物信息学。2002;3: 31.2002年10月25日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-31
预防性维修识别码：
PMC137596型
摘要 第条 PDF–293K
寡核苷酸肌肉芯片的开发和生产：用于不明确EST的验证
Rehannah HA Borup、Stefano Toppo、Yi-Wen Chen、Tanya M Teslovich、Gerolamo Lanfranchi、Giorgio Valle、Eric P Hoffman
BMC生物信息学。2002;3: 33.2002年10月29日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-33
预防性维修识别码：
PMC137597型
摘要 第条 PDF–550K
信号转导网络的自动建模
马丁·斯特芬（Martin Steffen）、阿莱格拉·佩蒂（Allegra Petti）、约翰·阿赫（John Aach）、帕特里克·德哈塞勒（Patrik D’haeseler）、乔治·丘奇（George Church）
BMC生物信息学。2002;3: 34.2002年11月1日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-34
预防性维修识别码：
37599英镑
摘要 第条 PDF–862K
SOM的聚类很容易揭示不同的基因表达模式：淋巴瘤再分析研究的结果
Junbai Wang、Jan Delabie、Hans Christian Aasheim、Erlend Smeland、Ola Myklebost
BMC生物信息学。2002;3: 36.2002年11月24日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-36
预防性维修识别码：
项目经理138792
摘要 第条 PDF文件–868K
全序列分解区分无嘌呤/无嘧啶核酸内切酶中的功能模块“分子”
凯瑟琳·谢恩（Catherine H Schein）、努曼·奥祖根（NumanØzgün）、塔达希德·伊祖米（Tadahide Izumi）、沃纳·布劳恩（Werner Braun）
BMC生物信息学。2002;3: 37.2002年11月25日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-37
预防性维修识别码：
项目经理149231
摘要 第条 PDF–130万
量化生化网络模型的稳健性
兰玛，巴勃罗·伊格莱西亚斯
BMC生物信息学。2002;3: 38.2002年12月13日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-38
预防性维修识别码：
项目经理139978
摘要 第条 PDF格式–443K
物种特异性蛋白质序列和折叠优化
米歇尔·杜蒙蒂尔（Michel Dumonier）、卡特琳娜·米查利科娃（Katerina Michalickova）、克里斯托弗·霍格（Christopher WV Hogue）
BMC生物信息学。2002;3: 39.2002年12月17日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-39
预防性维修识别码：
项目经理139977
摘要 第条 PDF–506000

方法论文章

用隐马尔可夫模型方法识别和表征大蛋白超家族中的亚家族特异性特征
Kevin Truong，Mitsuhiko Ikura
BMC生物信息学。2002;3: 1.2002年1月10日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-1
预防性维修识别码：
PMC65048型
摘要 第条 PDF–845K
任意离散序列的通用序列映射
乔纳斯·S·阿尔梅达（Jonas S Almeida）、苏珊娜·文加（Susana Vinga）
BMC生物信息学。2002;3: 6.2002年2月5日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-6
预防性维修识别码：
PMC90187型
摘要 第条 PDF–849K
将超表达上游基序与基因表达关联：真核生物调控元件发现的计算方法
Michele Caselle、Ferdinando Di Cunto、Paolo Provero
BMC生物信息学。2002;3: 7.2002年2月14日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-7
预防性维修识别码：
PMC77394号
摘要 第条 PDF–607000
塔克–a格雷普用于DNA
哈里·曼格拉姆
BMC生物信息学。2002;3: 8.2002年3月6日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-8
预防性维修识别码：
PMC99049型
摘要 第条 PDF–245K
同源归纳：使用机器学习改进序列相似性搜索
安德烈亚斯·卡瓦特（Andreas Karwath），罗斯·D·金（Ross D King）
BMC生物信息学。2002;3: 11.2002年4月23日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-11
预防性维修识别码：
项目编号107726
摘要 第条 PDF–383000
核心基因：一种识别和编目小基因组中“核心”基因的计算工具
尼赫特·扎法尔、拉贾·马祖姆德、唐纳德·塞托
BMC生物信息学。2002;3: 12.2002年4月24日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-12
预防性维修识别码：
项目经理11185
摘要 第条 PDF–500K
NBLAST：用于NxN比较的BLAST的簇变体
米歇尔·杜蒙蒂尔（Michel Dumonier）、克里斯托弗·霍格（Christopher WV Hogue）
BMC生物信息学。2002;3: 13.2002年5月8日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-13
预防性维修识别码：
项目编号113272
摘要 第条 PDF–206K
RIO：使用直向同源物的重新采样推断，通过自动系统发育组学分析蛋白质组
Christian M Zmasek、Sean R Eddy
BMC生物信息学。2002;3: 14.2002年5月16日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-14
预防性维修识别码：
项目经理116988
摘要 第条 PDF文件–461K
极限倍变化模型：从微阵列数据中选择差异表达基因的实用方法
David M Mutch、Alvin Berger、Robert Mansourian、Andreas Rytz、Matthew-Alan Roberts
BMC生物信息学。2002;3: 17.2002年6月21日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-17
预防性维修识别码：
项目经理117238
摘要 第条 PDF–460K
基因组可视化：展示人类基因组数据和注释的技术
Ann E Loraine，Gregg A Helt
BMC生物信息学。2002;3: 19.2002年7月30日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-19
预防性维修识别码：
19855年
摘要 第条 PDF–533K
袋鼠–生物序列的模式匹配程序
多伦·贝特尔（Doron Betel）、克里斯托弗·霍格（Christopher WV Hogue）
BMC生物信息学。2002;3: 20.2002年7月31日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-20
预防性维修识别码：
项目经理119856
摘要 第条 PDF–258K
Oliz，一套Perl脚本，用于使用来自3'非翻译区域的50个寡核苷酸设计微阵列
郝晨，伯特·M·夏普
BMC生物信息学。2002;3: 27.2002年10月6日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-27
预防性维修识别码：
PMC130177型
摘要 第条 PDF–326K
通用序列映射（bUSM）的高效布尔实现
约翰·施瓦克，乔纳斯·S·阿尔梅达
BMC生物信息学。2002;3: 28.2002年10月21日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-28
预防性维修识别码：
PMC137598型
摘要 第条 PDF–378K
SeqHound：作为生物信息学研究平台的生物序列和结构数据库
Katerina Michalickova、Gary D Bader、Michel Dumontier、Hao Lieu、Doron Betel、Ruth Isserlin、Christopher WV Hogue
BMC生物信息学。2002;3: 32.2002年10月25日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-32
预防性维修识别码：
项目经理138791
摘要 第条 PDF–342K
FunSpec：基于web的酵母集群解释器
Mark D Robinson、Jörg Grigull、Naveed Mohammad、Timothy R Hughes
BMC生物信息学。2002;3: 35.2002年11月13日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-35
预防性维修识别码：
项目经理139976
摘要 第条 PDF–953K
ORFer–从GenBank检索蛋白质序列和开放阅读框架，并将其存储到关系数据库或文本文件中
Konrad Büssow、Steve Hoffmann、Volker Sievert
BMC生物信息学。2002;3: 40.2002年12月19日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-40
预防性维修识别码：
第139979页
摘要 第条 PDF–229K

更正

比较RNA网站（CRW）：核糖体、内含子和其他RNA比较序列和结构信息的在线数据库：更正
Jamie J Cannone、Sankar Subramanian、Murray N Schnare、James R Collett、Lisa M D’Souza、Yushi Du、Brian Feng、Nan Lin、Lakshmi V Madabusi、Kirsten Müller、Nupur Pande、Zhidi Shang、Nang Yu、Robin R Gutell
BMC生物信息学。2002;3: 15.2002年5月31日在线发布。数字对象标识：10.1186/1471-2105-3-15
更正：
BMC生物信息学。2002; 3: 2.
预防性维修识别码：
项目经理116672
更正 PDF–136K
文章来自BMC生物信息学由以下人员提供BMC公司