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细胞生物学杂志。1998年10月19日;143(2): 359–373.
数字对象标识:10.1083/jcb.143.2.359
预防性维修识别码:PMC2132826型
PMID:9786948

酵母线粒体融合需要跨膜GTPase Fzo1p

摘要

膜融合是建立线粒体室形态和细胞分布所必需的。果蝇属,基因突变模糊洋葱(fzo公司)GTPase阻断精子发生过程中发育调控的线粒体融合事件。在这里,我们报道了模糊洋葱,Fzo1p,在线粒体融合中起着直接和保守的作用。有条件的fzo1型突变导致线粒体网在酵母交配过程中断裂并阻断线粒体融合。Fzo1p是一种线粒体完整膜蛋白,其GTPase结构域暴露在细胞质中。改变GTPase结构域中保守残基的点突变不会影响Fzo1p的定位,但会破坏线粒体融合。亚细胞器分馏表明Fzo1p跨越外层,与线粒体内膜紧密相连。这种拓扑结构可能需要在融合反应期间协调两个线粒体膜的行为。我们建议模糊洋葱跨膜GTPases家族作为分子开关调节线粒体膜对接和/或融合的关键步骤。

关键词:GTPase、膜融合、线粒体、线粒体DNA、细胞器形态

T型线粒体膜的同型或自融合在控制这些重要细胞器的拷贝数和细胞分布方面起着重要作用(Bereiter-Hahn和Voth,1994年). 在芽殖酵母和一些哺乳动物细胞中,线粒体分裂平衡了频繁的线粒体融合事件,使隔室保持为高度分支的管状网络(霍夫曼和艾弗斯,1973年;史蒂文斯,1981年;Koning等人,1993年;Nunnari等人,1997年;赫尔曼,1998). 线粒体融合还可以在分化过程中重塑线粒体形态。大鼠骨骼肌细胞中的单个线粒体进行胚胎后融合,生成分支线粒体网(Bakeeva等人,1981年). 在昆虫的精子发生过程中,融合会产生和精子鞭毛轴丝相关的巨大线粒体(林斯利和德意志,1980年;富勒,1993年). 这种相互连接的大线粒体隔室的产生被认为有助于能量和代谢物以及化学和电信号在这些细胞中的分布(Bakeeva等人,1978年;Ichas等人,1997年). 控制线粒体融合的遗传和分子机制尚未确定。

已经对分泌和内吞途径中调节膜异型和同型融合的分子进行了较为详细的研究。这两种融合类型都需要细胞溶质因子NSF和SNAP(或同源物)以及称为v-和t-SNARE的室特异性整合膜蛋白(Denesvre和Malhotra,1996年;普费弗,1996年;罗斯曼,1996年;Hay和Scheller,1997年;爱德华森,1998年;哥特和菲舍尔·冯·莫拉德,1998年;Patel等人,1998年;Rabouille等人,1998年). 在异型融合过程中,v/t-SNARE配对促进囊泡与靶膜的稳定结合,可能足以催化双层混合(Weber等人,1998年). 相反,内质网和高尔基体膜的同型融合依赖于常驻t-SNARE之间的自我相互作用(Patel等人,1998年;Rabouille等人,1998年). 酵母液泡融合需要v/t-SNARE配对以实现最佳融合,但仅包含t-SNARE配对的液泡之间可能发生(效率较低)(Nichols等人,1997年). 因此,在某些情况下,在同型融合反应中对“类”膜的识别可能由室特异性t-SNARE之间的同型相互作用介导。在融合过程中,NSF和SNAP通常会在对接前破坏膜内无生产力的SNARE关联(Mayer等人,1996年;Otto等人,1997年)也可能调节对接后膜融合前SNARE构象的变化(Söllner等人,1993年).

尽管有报道称VAMP-1 SNARE的一种亚型定位于转染上皮细胞中的线粒体(Isenmann等人,1998年)NSF、SNAP和SNARE家族中的分子与线粒体融合无关。这并不完全出乎意料,因为线粒体融合与细胞中大多数其他膜融合反应不同,需要两个不同的脂质双层的顺序混合。此外,线粒体室在进化上不同于分泌和内吞途径的室。因此,尽管膜融合的一般机制可能是保守的,但介导线粒体融合的分子机制可能是独特的。线粒体融合所需的新基因,模糊洋葱(fzo公司),1最近通过分析果蝇属精子发生缺陷突变体(Hales和Fuller,1997年). 在苍蝇的精子细胞分化过程中,单个线粒体结合,融合成两个巨大的细胞器,并紧紧缠绕在一起,形成内嵌核,这是一种横切面类似洋葱的球形结构(林斯利和德意志,1980年;富勒,1993年). 中的突变fzo公司基因破坏线粒体融合,导致单个线粒体的无组织聚集体与伸长的轴丝不适当结合(Hales和Fuller,1997年).fzo公司编码一个预测的跨膜GTPase,在融合开始时在线粒体室检测到,融合完成后很快消失。在一起fzo公司突变表型和Fzo蛋白的表达模式表明,该分子要么调节线粒体融合,要么是线粒体融合的直接介体。

发现fzo公司酵母、线虫和哺乳动物中的同源物定义了一个新的多域、高分子量GTPase家族,并提出了这些分子通常控制不同生物体和细胞类型中线粒体融合事件的可能性(Hales和Fuller,1997年). Fzo家族成员包含一个氨基末端GTPase结构域、两个相邻的羧基末端跨膜结构域和多个七肽重复序列(见图。图11 A类) (Hales和Fuller,1997年). 这里我们展示了酿酒酵母的直系同源物果蝇属Fzo,Fzo1p,是一种线粒体完整膜蛋白,在有丝分裂生长期间维持管状线粒体网所需,并证明该蛋白在酵母交配期间线粒体融合中发挥直接作用。两个保守基因的突变FZO1型GTPase基序破坏线粒体融合,但不影响Fzo1p定位。亚细胞分离和蛋白酶保护实验表明,蛋白质的氨基末端(包含必需的GTPase结构域和多个七肽重复序列)延伸到细胞质中,在那里它可以参与细胞器对接/融合,并与调节GTP结合或水解的分子相互作用。此外,Fzo1p在亚线粒体分馏研究中的分布表明,该蛋白的羧基末端可能与两个线粒体膜相互作用。这种拓扑结构与SNARE分子和病毒融合蛋白的拓扑结构相似,表明Fzo1p可能在线粒体小室的对接和融合中发挥直接作用。

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S公司.酿酒FZO1是线粒体功能所必需的。(A类)显示预测GTPase位置的三个Fzo家族成员的结构域(GTP酶),七分位重复(Hep公司)和跨膜(TM(TM))域。整个蛋白质序列和预测的GTPase结构域之间的氨基酸同源性S公司.酿酒Fzo1p、,S公司.蓬贝Fzo1p(最新的家庭成员),以及D.黑腹果蝇显示Fzo家族成员。GenBank/EMBL/DDBJ注册号如下:S公司.酿酒(Z36048号),S公司.蓬贝(ALO23533),以及D类.黑腹食肉动物(U95821型). (B类)fzo1Δ细胞在可发酵和不可发酵碳源上表现出生长缺陷。两个fzo1Δ(顶部、JSY1809和JSY1810)和两个野生型(底部,JSY1811和JSY1812)菌株在30°C的YPDextrose培养基上生长2天(左边)或YP甘油培养基在30°C下培养5天(正确的).

材料和方法

菌株与遗传技术

所有酵母菌株(表(表一))与2010财年同源(Winston等人,1995年). 所有培养基(包括YP葡萄糖、YP甘油、SDextrose、SGalacose和SRaffinose)的制备如下所述Sherman等人(1986)。菌株在30°C下生长,除非另有说明。基因和分子克隆操作遵循标准技术(Maniatis等人,1982年;Sherman等人,1986年;Baudin等人,1993年). 这个大肠杆菌寄主菌株JM109(Promega公司。)用于质粒的所有细菌操作。

表一

本研究中使用的酵母菌株

应变基因型+(质粒)
JSY999型 MATαleu2Δ1 his3Δ200 ura3-52 rho +
JSY1373型 MATa/αleu2Δ1/leu2△1 his3Δ200/his3Δ200 ura3-52/ura3-52 rho +
JSY1808型 MATa/αleu2Δ1/leu2△1 his3Δ200/his3Δ200 ura3-52/ura3-52 fzo1Δ:his3/fzo1 rho +
JSY1809型 MATαleu2Δ1 his3Δ200 ura3-52 fzo1Δ::his3 rho0
JSY1810型 MATa leu2Δ1 his3Δ200 ura3-52 fzo1Δ::his3 rho0
JSY1811型 MATαleu2Δ1 his3Δ200 ura3-52 FZO1 rho +
JSY1812型 MATa leu2Δ1 his3Δ200 ura3-52 FZO1 rho +
2028年JSY MATa leu2Δ1 his3Δ200 ura3-52 trp1Δ63 lys2Δ-202 FZO1::N个-3XMYC公司ρ +
JSY2034型 MATa leu2Δ1 his3Δ200 ura3-52 trp1Δ63 lys2Δ-202 FZO1::N个-3倍ρ +
JSY2038型 MATa leu2Δ1 his3Δ200 ura3-52 fzo1Δ::his3 rho ++(pRS416-FZO1型)
JSY2270 MATa leu2Δ1 his3Δ200 ura3-52 FZO1 rho ++(第页镀锌1-N-3XMYC型-FZO1型)
JSY2273型 MATa leu2Δ1 his3Δ200 ura3-52 fzo1Δ::his3 rho ++(第页镀锌1-N-3XMYC型-FZO1型)
JSY2287型 MATa leu2Δ1 his3Δ200 ura3-52 trp1Δ63 lys2Δ-202 fzo1Δ::his3 rho ++(pRS416-FZO1型)
JSY2288型 MATa leu2Δ1 his3Δ200 ura3-52 trp1Δ63 lys2Δ-202 FZO1 rho ++(pRS416-FZO1型)
JSY2354型 MATa leu2Δ1 his3Δ200 ura3-52 trp1Δ63 lys2Δ-202 fzo1Δ::his3+(pRS414)
JSY2355型 MATa leu2Δ1 his3Δ200 ura3-52 trp1Δ63 lys2Δ-202 fzo1Δ::his3+(pRS414-fzo1型[T221A])
JSY2356型 MATa leu2Δ1 his3Δ200 ura3-52 trp1Δ63 lys2Δ-202 fzo1Δ::his3+(pRS414-fzo1型[K371A])
JSY2357型 MATa leu2Δ1 his3Δ200 ura3-52 trp1Δ63 lys2Δ-202 fzo1Δ::his3+(pRS414-fzo1型【K200A】)
第2358页 MATa leu2Δ1 his3Δ200 ura3-52 trp1Δ63 lys2Δ-202 fzo1Δ::his3+(pRS414-fzo1型【S201N】)
JSY2392型 MATa leu2Δ1 his3Δ200 ura3-52 trp1Δ63 lys2Δ-202 fzo1Δ:his3+(pRS414-FZO1型)
JSY2394型 MATa leu2Δ1 his3Δ200 ura3-52 trp1Δ63 lys2Δ-202 fzo1Δ::his3 rho ++(pRS414-N-9XMYC-FZO1型)
JSY2555型 MATαleu2Δ1 his3Δ200 ura3-52 rho0
JSY2579型 MATa leu2Δ1 his3Δ200 ura3-52 fzo1Δ::his3 rho0+(pRS416-FZO1型)
JSY2634型 MATa leu2Δ1 his3Δ200 ura3-52 fzo1Δ::his3 rho ++(第页镀锌1-N-3XMYC型-FZO1型)+(pRS416-ADH-COXIVpre-GFP)
JSY2793型 MATαleu2Δ1 his3Δ200 ura3-52 trp1Δ63 fzo1Δ::his3 rho ++(pRS414-FZO1型)+(pRS416-ADH-COXIVpre-GFP)
JSY2802型 MATαleu2Δ1 his3Δ200 ura3-52 trp1Δ63 lys2Δ-202 fzo1Δ:his3 rho ++(pRS414-fzo1-1型)+(pRS416-ADH-COXIVpre-GFP)
JSY2804型 MATa leu2Δ1 his3Δ200 ura3-52 trp1Δ63 fzo1Δ::his3 rho ++(pRS414-fzo1-1型)+(pRS416-ADH-COXIVpre-GFP)
JSY2926型 MATαleu2Δ1 his3Δ200 ura3-52 trp1Δ63 fzo1Δ:his3 rho ++(pRS414-FZO1型)

质粒构建

对于pRS416-FZO1型,包含FZO1型利用含有工程EcoRI位点P297(5-GGGG公司GAATTC公司CCAGGTACAGAATGCTGGTTGAAAG-3′)和P298(5′-GGGGGAATTC公司CTTGCTCCTTGTTGTCTTAAATGGAG-3′),并克隆到pRS416中唯一的EcoRI位点(经测序验证;Stratagene,La Jolla,CA)。pRS416的EcoRI片段-FZO1型被亚克隆到pRS414(Stratagene)中以生成pRS415-FZO1型.pRS414-FZO1型和pRS416-FZO1型质粒补充了线粒体形态缺陷和线粒体DNA的丢失fzo1Δ。要生成镀锌1规范形式的FZO1型,一个PCR片段,在FZO1型(N-3XMYC-FZO1型)使用带有工程SalI,P379(5′-GGGG)的引物从JSY2028(见下文)中扩增GTCGAC公司TATCTAATCGTGTCTAATTTCTTC-3′)和XbaI,P380(5′-GGGGTCTAGA公司TTAACGATGTCTAGGGAACAAGCTGGAG-3′),站点。PCR片段被克隆到pRS415中-镀锌1(Mumberg等人,1994年)(马里兰州Rockville的American Type Culture Collection)生成p加仑1-N-3XMYC型-FZO1型(pRS415)-镀锌1-N-3XMYC型-FZO1型,通过测序验证)。SRaffinose的生长提供了N-3XMYC-Fzo1p的充分表达镀锌1补体线粒体形态和生长缺陷的启动子fzo1Δ细胞。在保守基因中产生突变FZO1型GTPase结构域,来自pRS416的3.5kb EcoRI片段-FZO1型克隆到pALTER-1的EcoRI位点(Promega公司。)创建pALTER-1-FZO1型.定点突变(改变位点II;Promega公司。)使用以下诱变寡核苷酸进行:K200A(5′-GATGTAAATACTGGCGCC公司TCAGCTCTTGCAAC-3′,介绍一个EheI站点);S201N(5′-CAGGTGATGTAAAATACTGGTAAAATGCAT公司TATGCAACTCTCTATAAGCG-3′,介绍NsiI站点);T221A(5′-GGATCAGCTACCATGCGCA公司AATGTATTTCCGAA-3′,介绍Fsp I站点);K371A(5′-GTTTTTTTTGTGAAA公司 GCTT公司TTGACAAAAATCAGGG-3′,介绍了HindIII站点)。通过限制性酶切鉴定突变体,并通过序列分析确认突变体。被诱变的fzo1型将基因亚克隆到pRS414和pRS424的EcoRI位点中。

fzo1Δ::HIS3细胞的制备与表征

这个fzo1Δ::HIS3通过将二倍体菌株JSY1373转化为含有50 bpFZO1型侧翼序列被HIS3型基因(Baudin等人,1993年). 这个fzo1Δ::HIS3中断精确地删除了整个FZO1型编码序列并通过PCR分析验证。在孢子化杂合二倍体(JSY1808)的39个四分体中HIS3型标记分离为2:2,YP葡萄糖生长缓慢,YP甘油无法生长。使用一级抗孔蛋白抗血清(1:200稀释;分子探针,Eugene OR)和二级山羊抗小鼠FITC抗体(1:100稀释)(宾夕法尼亚州西格罗夫Jackson ImmunoResearch Laboratories,West Grove)在四个四分体中观察线粒体形态(Pringle等人,1991年). DAPI(4,6-二氨基-2-苯基吲哚;25 ng/ml),以可视化mtDNA。交配JSY1810证实线粒体DNA丢失(fzo1Δ)到一个ρo(o)试验菌株JSY2555(FZO1型,ρo(o)). 第RS416页-FZO1型被转换为fzo1Δ菌株(JSY1810)产生JSY2579(野生型线粒体形态,无可检测mtDNA)。生成rhoo(o)菌株JSY2555(野生型线粒体形态,未检测到线粒体DNA),rho+菌株(JSY999)在含有25μg/ml溴化乙锭的合成最小培养基中培养两次达到饱和(Fox等人,1991年).

野生型(JSY1812)和fzo1Δ(JSY1810)电池基本上按照所述进行了以下修改(Yaffe,1995年). 在固定之前,菌株在YP葡萄糖中生长,另外两次更换无水Spurr树脂(Polysciences,Inc.,Warrington,PA),然后隔夜培养,以实现样品的最大渗透。

N-3XMYC-Fzo1p的消耗

为了耗尽N-3XMYC-Fzo1p,p加仑1-N-3XMYC型-FZO1型将质粒转化为JSY2038(fzo1Δρ++第RS416页-FZO1型)和失去pRS416的细胞-FZO1型在含有5-FOA(5-氟有机酸)的SRaffinose培养基上选择质粒,得到JSY2273(fzo1Δρ++第页镀锌1-N-3XMYC型-FZO1型). JSY2273在缺乏亮氨酸的SRaffinose培养基中培养24小时,以选择p镀锌1-N-3XMYC型-FZO1型为了阻断N-3XMYC-Fzo1p的表达,收集、冲洗细胞,并在SDextrose减去亮氨酸的条件下生长,密度为2.5×106通过DiOC染色,在指定的时间点评估线粒体形态和mtDNA核仁分布6(3,3′二己基氧基碳菁)(Molecular Probes Inc.)(赫尔曼等人,1997年)或DAPI(Pringle等人,1991年)分别是。JSY2270型(FZO1型ρ++第页镀锌1-N-3XMYC型-FZO1型),包含野生类型FZO1型基因,在N-3XMYC-Fzo1p缺失期间,线粒体形态或线粒体DNA没有任何变化(数据未显示)。在指定的时间点,通过Western blotting(抗MYC抗体)分析总细胞提取物中的N-3XMYC-Fzo1蛋白水平(哈洛和莱恩,1988年). 去除印迹并用抗-3-PGK(3-磷酸甘油酸激酶)(1:1000稀释)(Molecular Probes Inc.)重制,以控制蛋白质载量的差异。通过GFP(绿色荧光蛋白)染色对含有pRS416-ADH-COXIVpre-GFP质粒(JSY2634;mito-GFP)的JSY2273细胞的线粒体形态进行评分。

fzo1-1突变的产生和表征

这个fzo1-1型低保真度聚合酶链式反应产生温度敏感等位基因(Muhlrad等人,1992年). 突变的pRS414-FZO1型质粒被转化为一株菌株,其中fzo1Δ::HIS3被pRS416覆盖-FZO1型(JSY2287)。pRS416的损失-FZO1型从这些细胞中选择生长在含有5-FOA的培养基上。含有pRS414的细胞-FZO1型在SG甘油培养基上测试突变质粒在25°C和37°C下的生长。鉴定出一株在37°C下不可见的菌株(fzo1-1型). 含有突变版本的FZO1型被恢复,当重新传输到缺少FZO1型在SG甘油培养基上引起温度敏感性增长。pRS414的转换-fzo1-1型野生型菌株的质粒显示fzo1-1型温度敏感性生长缺陷是隐性的。线粒体形态学检查fzo1-1型DiOC染色细胞6(未显示)或mito-GFP。

为了检测交配过程中线粒体的融合,fzo1Δ+第RS414页-fzo1-1型标记有mito-GFP(JSY2802)或Mitotracker red(JSY2804)(Molecular Probes Inc.)的细胞在25°C或37°C下交配,并按照以下描述进行分析Nunnari等人(1997年).

MYC-标记Fzo1p的构建与分析

3XMYC表位被直接引入起始Met下游FZO1型(JSY2028)如所述Schneider等人(1995)为了添加额外的MYC表位标签,N-3XMYC-FZO1型利用P297和P298从JSY2028中扩增出5′和3′侧翼序列的编码区加500 bp,并克隆到pRS426的EcoRI位点,产生pRS426-N-3XMYC-FZO1型(通过序列分析验证)。N-3XMYC型-FZO1型被亚克隆到pALTER-1的EcoRI位点(缺少NotI位点),并用NotI消化以释放3XMYC标记。含有来自质粒pMPY-3XMYC的3XMYC-表位的NotI片段(Schneider等人,1995年)插入氨基末端NotI位点FZO1型PCR筛选和序列分析用于鉴定包含9XMYC插入物的克隆(pALTER-1-N-9XMYC-FZO1型). N-9X-MYC-FZO1型克隆到pRS414的EcoRI位点以生成pRS414-N-9XMYC-FZO1型.fzo1Δ仅表达3XMYC标记的细胞(pRS426-N-3XMYC-FZO1型; JSY2028)或9XMYC-tagged(pRS414-N-9XMYC-FZO1型; JSY2394)Fzo1蛋白在非发酵碳源上正常生长,保留线粒体DNA,具有野生型线粒体形态,表明融合蛋白具有功能。使用抗MYC小鼠单克隆抗体(9E10;1:1000)通过总蛋白提取物的Western blotting检测所有MYC标记的Fzo1p形式(加州里士满伯克利抗体公司)(赫尔曼等人,1997年). N-9XMYC-Fzo1p在JSY2392中进行了本地化(fzo1Δ+第RS414页-FZO1型)和JSY2394通过间接免疫荧光法,使用一级抗MYC抗体(1:100稀释)和一级山羊抗小鼠FITC二级抗体(1:1100稀释)(Jackson ImmunoResearch)(Pringle等人,1991年).

N-9XMYC-Fzo1p的生化分析

一株表达N-9XMYC-Fzo1p的菌株(JSY2394)在缺乏色氨酸的SG乳糖培养基中生长,以选择pRS414-N-9XMY-FZO1型质粒。细胞裂解物(胞浆)通过差异沉淀分离,生成线粒体颗粒和线粒体后上清液(Daum等人,1982年;辛塞尔和达姆,1995年). 通过蛋白质印迹分析来自每个级分的样品(细胞当量)。为了确定N-9XMYC-Fzo1p的膜结合,将从JSY2394中纯化的100μg线粒体在12000℃下制成丸10分钟,重悬于75μl 100 mM Na中2一氧化碳pH 11.5或1%Triton X-100,含1 mM PMSF、1μg/ml抑肽酶和1μg/ml亮氨酸蛋白酶,在冰上培养30分钟,然后在10000030分钟。通过Western blotting分析等体积颗粒和上清液组分。线粒体内膜和外膜(Daum等人,1982年)加载到5 ml 0.85–1.6 M蔗糖梯度(0.8、1.1、1.35和1.6 M)上,然后在2°C的Beckman SW50.1转子中以30000 rpm离心16 h(加利福尼亚州Fullerton)。梯度被分为13个单独的400μl组分,并通过Western blotting进行分析。使用NIH图像1.60(马里兰州贝塞斯达国立卫生研究院)比较蛋白质水平。通过在含有100μg/ml胰蛋白酶的破胶缓冲液(0.6 M甘露醇,20 mM Hepes-KOH,pH 7.4)中培养100μg纯化线粒体(来自JSY2394)来确定N-9XMYC-Fzo1p在线粒体上的定位(西格玛化学公司。密苏里州圣路易斯)。为了破坏外膜,用9体积的OS缓冲液(20 mM Hepes-KOH,pH 7.4)稀释线粒体,并将胰蛋白酶添加到最终浓度100μg/ml。20分钟后,通过添加大豆胰蛋白酶抑制剂(2.5 mg/ml,西格玛化学公司。)和1 mM PMSF。样品通过Western blotting进行分析。在以下稀释液中使用指示的抗体进行蛋白质印迹:抗MYC(1:1000)、抗孔蛋白(1:1000b条 2(1:10,000).

FZO1 GTPase点突变分析

pRS414,pRS415-FZO1型,pRS414包含FZO1型GTPase点突变被改组为JSY2287(fzo1Δρ++第RS416页-FZO1型),以产生以下菌株:()JSY2354型(fzo1Δ+pRS414);(b条)JSY2392型(fzo1Δ+第RS414页-FZO1型); (c(c))JSY2355型(fzo1Δ+第RS414页-fzo1[T221A]); (d日)第2356页(fzo1Δ+pRS414型-fzo1(K371A)); (e(电子))JSY2357型(fzo1Δ+第RS414页-fzo1[K200A]); 和((f))JSY2358型(fzo1Δ+第RS414页-fzo1[S201N]). 当在低拷贝或高拷贝质粒上引入野生型时,突变Fzo1蛋白没有引起线粒体形态(抗孔蛋白染色)、线粒体DNA核仁保留(DAPI染色)或功能(甘油生长)缺陷FZO1型应变(JSY2288)(数据未显示)。亚细胞分离(见上文)和抗Fzo1p抗体的Western印迹证实,突变蛋白在fzo1Δ单元格(未显示数据)。

显微镜技术

在上查看单元格蔡司Axioplan显微镜(1.25×光学设置;卡尔蔡司公司。纽约州桑伍德),如所述Roeder等人(1998年)图像是使用与Macintosh Quadra 840AV计算机接口的滨松C5810彩色3CCD相机(滨松光电,日本滨松市)拍摄的。对于三维荧光显微镜,使用徕卡共焦显微镜和100×1.4 N.a.物镜(瑞士圣加仑徕卡公司)进行数据采集。所有的快门、舞台动作和图像采集都由计算机控制。通过以~0.2-μm的间隔移动载物台获得图像。使用日立H-700电子显微镜(日本东京)观察薄片,并使用柯达161数码相机系统v1.55b(伊士曼柯达公司。纽约州罗切斯特)。数字图像被组装成数字并按罗德和肖(1996).

结果

酿酒酵母FZO1对维持线粒体形态和保留线粒体DNA是必需的

为了确定Fzo家族成员是否普遍控制线粒体融合,我们破坏了S公司.酿酒FZO1在二倍体菌株中。在孢子形成和分离之后,fzo1Δ相对于野生型,单倍体细胞在含有可发酵碳源葡萄糖的培养基上表现出显著的生长缺陷,并且不能在含有不可发酵碳源甘油的培养基上生长(图。(图11 B类). 这种生长模式也称为“小”表型(杜洪,1981年),是线粒体呼吸缺陷菌株的特征,表明FZO1型破坏正常的线粒体功能。

间接免疫荧光显示Fzo1p是营养生长细胞线粒体网络正常组织所必需的(图。(图2)。2). 在野生型菌株中,孔蛋白染色的线粒体膜在细胞表面呈分支管状网络分布(图。(图2,2,A类B类). 相比之下,不到1%的fzo1Δ细胞中含有野生型线粒体网络,fzo1Δ突变体包含一到五个球形或稍长的线粒体结构,这些结构定位于细胞皮层,但在细胞周围分布不均匀(图。(图2,2,G公司H(H)). 此外,在突变体的细胞质中偶尔观察到散布着许多小线粒体(数据未显示)。线粒体形态fzo1Δ细胞类似于肌动蛋白细胞骨架异常的突变体(Drubin等人,1993年;Lazzarino等人,1994年). 然而,我们没有观察到肌动蛋白和微管细胞骨架的组织缺陷fzo1Δ应变(未显示数据)。尽管迄今为止发现的许多酵母线粒体形态突变体也有相关的线粒体遗传缺陷(Burgess等人,1994年;Sogo和Yaffe,1994年;Berger等人,1997年;赫尔曼和肖,1998年),我们的分析没有发现线粒体遗传缺陷fzo1Δ与野生类型相关的单元格(未显示数据)。因此,Fzo1p控制酵母中的线粒体网络组织,但在分裂期间线粒体运输到子细胞并不需要。

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fzo1Δ细胞表现出线粒体形态缺陷,线粒体DNA丢失。(A–X)用抗孔蛋白抗血清染色的酵母细胞间接免疫荧光图像显示线粒体膜(最左边的列)和DAPI以可视化细胞核和线粒体DNA(中间立柱;白色箭头在里面C类D类表示mtDNA核仁)。相同细胞的相控图像显示在最右边的列. (A–F)野生型rho线粒体的正常形态和线粒体DNA核仁的分布+应变(JSY1812)。(G–L)突变体fzo1Δρo(o)细胞(JSY1810)含有球形或稍长的线粒体结构,缺乏DAPI染色的线粒体DNA。(M–R(M–R))野生型线粒体形态在fzo1Δρo(o)野生型重新引入后的突变株(JSY2579)FZO1型基因。(S–X)野生型rho的线粒体形态正常o(o)缺乏mtDNA的菌株(JSY2555)。(Y–A(Y–A)')野生型和fzo1Δ细胞。(Y(Y))野生型细胞(JSY1812)的线粒体分布均匀地分布在整个细胞皮层,并显示出许多嵴(黑色箭头). (Z轴A类′)线粒体图谱fzo1Δ细胞(JSY1810)在细胞外围聚集在一起,嵴较少。N个,细胞核;V(V),液泡;ρ +,含有线粒体DNA;ρo(o)缺少线粒体DNA。条形图:(A–X)5微米;(Y–A(Y–A)′)1μm。

透射电子显微镜显示线粒体形态和分布在超微结构水平上也存在异常fzo1Δ在野生型细胞中,线粒体图谱分布在整个外周细胞质中,并包含精细的嵴(线粒体内膜的内陷)(图。(图22 Y(Y)). 相比之下,线粒体特征fzo1Δ细胞似乎聚集在质膜附近的一个或两个区域(图。(图2,2,Z轴A类′),与间接免疫荧光观察到的线粒体分布相似(图。(图2,2,G公司H(H)). 线粒体的簇状分布fzo1Δ可能代表一个塌陷但仍相互连接的线粒体网的紧密相对的小管。或者,这些簇可以由单个未融合的线粒体片段组成(见下文)。横断面还显示fzo1Δ线粒体通常含有较少的嵴或完全缺乏嵴(图。(图2,2,Z轴A类′).

Fzo1p的野生型功能也需要用于线粒体DNA核仁的维持。用DNA-特异性染料DAPI标记的野生型细胞通常含有染色鲜艳的细胞核以及位于细胞外围的25-50个点状线粒体DNA核仁(图。(图2,2,C类D类). 相反,线粒体核仁在fzo1Δ电池(图。(图2,2,J型). 的十字架fzo1Δ用已知的rhoo(o)菌株(缺乏线粒体DNA)证实线粒体基因组在fzo1Δ单元格(未显示数据)。因为线粒体DNA编码线粒体呼吸功能所必需的RNA和蛋白质(Pon和Schatz,1991年),这些结果提出了以下可能性fzo1Δ线粒体形态缺陷是线粒体DNA丢失的间接结果。然而,野生型的重新引入FZO1型该基因足以在fzo1Δ电池(图。(图2,2,M(M)N个)在没有mtDNA的情况下(图。(图2,2,O(运行)P(P)). 恢复的线粒体网络的形态与在同基因rho中观察到的形态相同o(o)含有野生型的菌株FZO1型基因(图。(图2,2,S–V型). 这些结果表明线粒体DNA的丢失以及由此导致的线粒体呼吸缺陷不会导致野生型细胞的线粒体形态缺陷(Guan等人,1993年)或在中fzo1Δ突变体,表明Fzo1p是维持正常线粒体形态的直接需要。

Fzo1p缺失研究表明线粒体形态的改变先于线粒体DNA核仁的丢失。A类镀锌1将质粒上的N-3XMYC标记形式的Fzo1p导入fzo1Δ使用质粒洗牌技术防止线粒体DNA丢失的突变菌株(参考材料和方法)。在含棉籽糖的培养基中生长(既不诱导也不抑制镀锌1启动子)导致N-3XMYC-Fzo1p的充分表达,以完全支持野生型生长并恢复野生型线粒体形态fzo1Δ电池(图。(图3,,A类,实心正方形,t吨=0,D类,通配符). 转移到含有葡萄糖的培养基中以阻断N-3XMYC-Fzo1p的表达后镀锌1启动子、小份样品在指定时间和线粒体形态(DiOC6染色)和线粒体DNA分布(DAPI染色)。在移植后的8小时内,野生型线粒体网络分解成更小的片段,最终崩塌,每个细胞形成一到五个球形或稍长的膜簇(图。(图3,,A类D类). 这些线粒体簇在8小时时的数量、形状和大小与在fzo1Δ抗孔蛋白染色突变体(图。(图2,2,G公司H(H)). 移位后8小时观察到的线粒体形态缺陷并没有严重影响线粒体功能,因为这些畸形的细胞器仍然能够积累对膜电位敏感的染料DiOC6(陈,1988). 用抗MYC抗血清进行的蛋白质印迹显示,在耗竭实验过程中,N-3XMYC-Fzo1蛋白水平降低了10倍(图。(图3 C类). 即使在8小时后,当大多数细胞表现出有缺陷的线粒体形态时,也没有检测到缺乏DAPI染色的mtDNA核仁的细胞(图。(图3 B类). 此外,在最初的N-3XMYC-Fzo1p表达阻断24小时后(11次加倍),只有25%的细胞缺乏核仁,这使得线粒体DNA分裂成芽不太可能需要Fzo1 p(数据未显示)。总之,这些结果表明,Fzo1p的缺失首先导致线粒体膜形态的缺陷,然后才导致线粒体DNA维持的缺陷。

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Fzo1p功能的耗尽或丧失会导致线粒体形态和线粒体DNA维持的缺陷。(A–D)Fzo1p的耗尽会导致线粒体形态缺陷,这是线粒体DNA核仁丢失之前的缺陷。fzo1Δ含有p的细胞镀锌1-N-3XMYC型-FZO1型(JSY2273)从允许Fzo1p表达接近野生水平的棉子糖培养基转移到葡萄糖培养基,葡萄糖培养基抑制来自镀锌1发起人。(A类)DiOC评分的线粒体形态6转移到耗尽培养基后染色(n个=100):线粒体形态分为野生型(分支管状网络)、中间型(管状浓缩网络)、空型(球形或部分拉长结构)和未染色型(非呼吸线粒体不积聚DiOC6). (B类)在Fzo1p缺失期间,通过DAPI染色记分的mtDNA核仁的分布如图所示A类(n个= 200). 突变线粒体形态类别包括中间、空和未染色类别A类. (C类)耗尽实验期间的N-3XMYC-Fzo1p水平。用抗MYC抗血清进行Western blotting分析从等量细胞制备的蛋白提取物。耗竭期间的N-3XMYC-Fzo1蛋白水平被标准化为野生型表达的N-3XML YC-Fzo1p水平FZO1型发起人(重量=1; JSY2034)。(D类)用GFP矩阵靶向形式(mito-GFP)可视化的具有代表性的野生型、中间型和空线粒体形态。(E类F类)温度敏感型fzo1-1型突变导致线粒体网络快速可逆断裂(E类)fzo1-1型细胞不能在37°C的非发酵碳源上生长。fzo1Δ含有pRS414的菌株-FZO1型(JSY2926)或pRS414-fzo1-1型(JSY2793)在SDextrose培养基上生长(左侧面板)在25°C或37°C和SG甘油介质中放置2天(右侧面板)在25°或37°C下持续6天。(F类)线粒体形态学FZO1型(JSY2793)和fzo1-1型(JSY2802)细胞在25°C下生长,并在37°C下移动10分钟。用mito-GFP观察线粒体室。显示了具有代表性的单元格。(G公司)对数相位fzo1-1型25°C下生长的细胞(JSY2804)(t吨=0)移至37°C。在37°C下20分钟后,细胞恢复到25°C。在指定时间使用mito-GFP定量线粒体形态(n个≥ 200). 给出了一个具有代表性的实验。棒材,2.5μm。

37℃条件fzo1-1突变体的线粒体网络片段

线粒体的形态可能在一定程度上受到反膜融合和膜裂变反应的调节(Nunnari等人,1997年). 如果fzo1型突变是为了阻止膜融合,我们预测持续的线粒体分裂最初会导致线粒体网络断裂。为了测试这一点,需要一个条件FZO1型等位基因(fzo1-1型)通过替换野生类型识别FZO1型突变质粒FZO1型质粒fzo1Δ应变(参考材料和方法)。fzo1-1型允许的增长fzo1Δ在25°C但不是37°C的SG甘油培养基上应变(图。(图3 E类). 这个fzo1-1型序列包含三种不同的核苷酸变化,导致预测多肽中的氨基酸替换K538I、N543I和P553Q(参考材料和方法)。DiOC染色6(未显示数据)或GFP(图。(图3,,F类G公司)证明线粒体网络形态在大多数(76%)fzo1-1型在允许温度下生长的细胞(图。(图3,,F类,fzo1-1型,25°C类、和G公司,t吨=0最小值)。然而,在转换到37°C后10分钟,99%的fzo1-1型细胞分裂成许多均匀分布的小线粒体隔室(图。(图3,,F类,fzo1-1型,37°C,以及G公司,t吨=10分钟). 在37°C下长时间孵育后,这些线粒体片段聚集在一起,形成大的膜聚集体,类似于在fzo1Δ应变(未显示数据)。如果在37°C下20分钟后,温度降至25°C,线粒体网络在60分钟内恢复野生型形态(图。(图3 G公司). 在对照实验中,在25°C或37°C下生长的野生型菌株中从未观察到线粒体断裂(图。(图3 F类,FZO1型,25°C类37°C类). 在条件下观察到线粒体网络的快速断裂fzo1-1型该菌株直接证明Fzo1p控制酵母中的线粒体形态,并与该蛋白在线粒体膜融合中的作用相一致。

fzo1-1阻断交配过程中的线粒体融合

细胞融合后不久,酵母合子中就出现了线粒体融合和内容物混合(阿兹皮罗兹和布托,1993年;Nunnari等人,1997年). 为了直接测试Fzo1p在线粒体融合中的需求,我们检测了fzo1-1型交配过程中线粒体含量混合突变。通过用荧光活性染料Mitotracker red标记单倍体亲本和用基质靶向形式的GFP(mito-GFP)标记另一单倍体亲本来观察线粒体网络(Nunnari等人,1997年). 交配和合子形成后,用荧光共聚焦显微镜检查荧光团的分布。在25°C或37°C下进行的野生型细胞交配中,这两个荧光标记快速且完全位于合子中,表明亲代线粒体膜融合,线粒体内容物混合(Nunnari等人,1997年)(表(表二)。). 线粒体融合在fzo1-1型×fzo1-1型合子在25°C下形成(图。(图4,4,A–D; 表II)。). 相反,线粒体网络支离破碎,无法融合fzo1-1型×fzo1-1型合子在37°C下形成(图。(图4,4,E–L; 表II)。). 什么时候?fzo1-1型用共焦显微镜对合子进行光学切片,线粒体膜含有单倍体衍生的绿色和红色荧光标记,但从未共定位(图。(图4,4,E–L). 此外,fzo1-1型×fzo1-1型在限制温度下形成的合子包含未融合的线粒体,即使它们完成了核配并形成了新的芽(图。(图4,4,I–L型). 因此,fzo1-1型导致线粒体对接和/或融合受阻,而不仅仅是延迟。最后,线粒体融合在交配中也减少了fzo1-1型以及37°C下的野生型亲本(表(表二),),表明Fzo1p的功能在两个单倍体亲本中都是有效线粒体融合所必需的。

表二

合子中的线粒体融合

融合线粒体
交叉应变°C(摄氏度)未受精卵有芽合子
FZO1型 +×FZO1型 + 2540/50 (80%)50/50 (100%)
3718/50 (36%)51/51 (100%)
FZO1型 +×fzo1-1型 2540/55 (73%)53/56 (95%)
37 1/49 (2%)32/60 (53%)
fzo1-1型×fzo1-1型 2527/50 (54%)51/55 (93%)
37 0/51 (0%) 4/53 (8%)
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FZO1型在交配过程中线粒体融合所必需的。fzo1-1型相反交配型细胞(JSY2802和JSY2804)用mito-GFP或Mitotracker红标记,并在25°交配(A–D)和37°C(E–H(E–H)I–L型). 共聚焦显微镜用于对丝裂原-GFP的分布进行评分(绿色在里面B类,F类、和J型)和Mitotracker(红色在里面C类,G公司、和K(K))在串行光学部分中(显示了具有代表性的单个光学部分)。线粒体内容物的融合和混合(黄色的在里面D类)在合并的mito-GFP和Mitotracker红色图像中进行评估(D类,H(H)、和L(左)). 用相控显微镜观察合子的形态(A类,E类、和). 合子芽在右边A类在顶部.白色箭头,亲代线粒体膜混合的区域。棒材,5μm。

我们认为fzo1-1型突变通过干扰线粒体运动和/或分布间接阻止线粒体融合。首先,尽管线粒体网络在37°C时断裂fzo1-1型×fzo1-1型合子,这些膜碎片正常分离成子细胞,表明线粒体运动没有严重受损(图。(图4,4,I–L型,箭头). 第二,线粒体断裂fzo1-1型×fzo1-1型合子似乎不会阻碍它们的结合。我们经常在合子颈部附近或二倍体子细胞中观察到红色和绿色线粒体隔室紧密并置(图。(图4,4,H(H)五十、 箭头). 总之,这些结果提供了令人信服的证据,证明Fzo1p在线粒体融合中起着至关重要的直接作用。

Fzo1p是一种线粒体外膜蛋白,其GTPase结构域面向细胞质

Fzo1蛋白定位于营养生长酵母细胞的线粒体网络(图。(图5)。5). 构建了一个编码Fzo1p的质粒,该质粒在氨基末端附近标记有九个MYC表位(N-9XMYC-Fzo1 p),并证明其可以修复线粒体形态缺陷、线粒体DNA丢失表型和甘油生长缺陷fzo1Δ应变(未显示数据)。抗-MYC抗体在表达N-9XMYC-Fzo1p的野生型细胞制备的提取物中识别出116-kD蛋白(图。(图66 A类,车道2)但不是天然Fzo1蛋白(图。(图66 A类,车道1). 抗MYC抗体的间接免疫荧光显示,N-9XMYC-Fzo1p定位于野生型细胞中的线粒体网络,并均匀分布在该隔室上(图。(图5,5,A–D). 这些细胞中DAPI染色的mtDNA核仁模式与荧光信号重叠,证实N-9XMYC-Fzo1p位于线粒体网络上(图。(图5,5,B类D类; 比较白色箭头在里面A类C类具有B类C类). 当细胞被针对天然Fzo1蛋白产生的多克隆抗体染色时,也获得了类似的结果(数据未显示)。在对照实验中,在只表达野生型Fzo1p的细胞中没有检测到信号(图。(图55 E类).

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Fzo1p定位于线粒体网络(A–D)fzo1Δ用抗MYC抗血清对表达N-9XMYC-Fzo1蛋白的细胞(JSY2394)进行染色(A类C类)和DAPI(B类D类). N-9XMYC-Fzo1p染色与线粒体线粒体线粒体核仁标记完全一致(比较白色箭头在里面A类C类具有B类D类). (E类F类)抗-MYC血清未染色fzo1Δ表达缺乏MYC标记的Fzo1p的细胞(JSY2392)。棒材,5μm。

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Fzo1p是一种线粒体完整膜蛋白,其GTPase结构域暴露在细胞质中。(A类)总细胞提取物fzo1Δ含有野生型pRS414的细胞-FZO1型(车道1; JSY2392)或pRS414-N-9XMYC-FZO1型质粒(车道2; JSY2394),用抗MYC抗血清通过蛋白质印迹分析。相同的fzo1Δ携带pRS414-N-9XMYC的菌株-FZO1型(JSY2394)用于6亿-F类. (B类)N-9XMYC-Fzo1p与线粒体蛋白孔蛋白共分馏。等量细胞的蛋白提取物通过差速离心分离,通过SDS-PAGE分离,并与抗MYC、抗孔蛋白和抗3-PGK血清进行Western印迹分析。细胞质溶胶核后细胞质提取物;水户粗线粒体颗粒;PMS公司,上清液中线粒体耗尽(C类)N-9XMYC-Fzo1p是一种完整的膜蛋白。纯化线粒体(M(M))处理以溶解外周膜蛋白(0.1 M Na2一氧化碳)或整体膜蛋白(1%Triton X-100),分离成颗粒(P(P))和上清液(S公司)并通过SDS-PAGE和Western blotting进行分析。可溶性细胞色素的释放b条 2和外围设备F10.1M Na后上清液部分的βATP酶亚基2一氧化碳经Western blotting证实治疗有效(数据未显示)。(D类E类)N-9XMYC-Fzo1p在中等密度线粒体膜组分中分馏。30–50%蔗糖梯度的馏分(顶部,分数1)用抗MYC、抗孔蛋白和抗CoxIV血清进行Western blotting分析。(E类)每部分总N-MYC-Fzo1p、孔蛋白和CoxIV的百分比。(F类)Fzo1p的GTPase结构域暴露在线粒体的细胞质表面1),胰蛋白酶处理(通道4100μg/ml)和渗透性休克(车道24)线粒体通过SDS-PAGE和免疫印迹抗MYC和抗细胞色素进行分析b条 2血清。

亚细胞分离证实了Fzo1p的线粒体定位(图。(图66 B类). 在核后细胞提取物的差速离心过程中,N-9XMYC-Fzo1p与线粒体颗粒以及线粒体外膜蛋白孔蛋白共分馏(图。(图66 B类,水户). 在含有细胞质蛋白3-PGK的线粒体后上清液部分中未检测到N-9XMYC-Fzo1p(图。(图66 B类,PMS公司). 使用抗Fzo1p抗血清对天然Fzo1蛋白进行分级后,从野生型细胞中获得了类似的结果(数据未显示)。

Fzo1p表现得像一种完整的膜蛋白,这是根据其羧基末端附近两个紧密间隔且保守的疏水结构域预测的(参见图。图11 A类) (Hales和Fuller,1997年). 当用100 mM Na提取含有N-9XMYC-Fzo1p的线粒体时2一氧化碳pH 11.5,为了释放外周膜蛋白,N-9XMYC-Fzo1p和完整的外膜蛋白孔蛋白都对碳酸钠提取有抵抗力,并且仍然与膜颗粒相关(图。(图66 C类). 相反,当线粒体膜用1%Triton X-100溶解时,Fzo1p和孔蛋白被释放到上清液中(图。(图66 C类). 在细胞器被渗透和机械方法破坏后,Fzo1p仍与线粒体膜相关,以释放可溶性膜间隙和基质蛋白(图。(图66 D类和数据未显示)。

对蔗糖密度梯度上分离的亚线粒体膜组分的分析表明,Fzo1p与线粒体内外膜都相关。N-9XMYC-Fzo1p以中等密度分馏,其与包含完整膜蛋白CoxIV的内膜囊泡和包含孔蛋白的外膜囊泡的分布重叠,但不同(图。(图6,6,D类E类). 虽然这一结果并不能证明Fzo1p跨越两个线粒体膜,但这种分离模式是“被捕获”的易位中间产物的特征,这些中间产物跨越由易位孔形成的接触部位的两个线粒体薄膜(Pon等人,1989年). 以前已经观察到与线粒体内外膜分离并在接触部位富集的蛋白质(Pon等人,1989年).

Fzo1p以其氨基末端GTPase结构域和邻近的七肽重复序列为导向,暴露在线粒体室的细胞质表面。用胰蛋白酶处理分离的完整线粒体,使Fzo1p氨基末端的MYC标签完全消化(图。(图66 F类,车道). 相反,细胞色素b条 2是膜间隙中的一种蛋白质,对蛋白质水解具有抵抗力,这表明线粒体外层膜保持完整(图。(图66 F类,车道). 细胞色素b条 2然而,如果线粒体外膜被渗透性休克破坏(图。(图66 F类,车道4). 由于Fzo1p的行为类似于完整的膜蛋白,这些数据还表明Fzo1 p羧基末端的至少一个疏水结构域嵌入线粒体外膜。

靶向线粒体Fzo蛋白的信号和机制可能是保守的。当cDNA编码黑腹果蝇Fzo蛋白被引入野生型细胞镀锌1低拷贝质粒果蝇属蛋白质与线粒体膜共分离,通过Western blotting和特异性抗体检测D类.黑腹食肉动物同源(数据未显示)。然而果蝇属Fzo蛋白不能修复线粒体形态或线粒体DNA丢失表型S公司.酿酒酵母fzo1Δ应变。

Fzo1p函数需要保守的GTPase域

Fzo1p GTPase结构域包含四个保守基序,命名为G1–G4(图。(图77 A类). 在大多数GTPase中,这些结构域是GTP结合和水解以及核苷酸结合引起的构象变化所必需的(Bourne等人,1991年). Fzo1p四个G基序中三个的保守残基(k200年S201N型在G1中,t221年在G2中,和K371A公司通过定点突变改变G4)(图。(图77 A类). 已知所有这些氨基酸替换都会破坏其他GTPase中核苷酸结合或与效应蛋白的相互作用(Sigal等人,1986年;Adari等人,1988年;Cales等人,1988年;费格和库珀,1988年;Farnsworth和Feig,1991年;Vojtek等人,1993年;Murphy等人,1997年). 当低拷贝质粒含有突变fzo1型基因被引入fzo1Δ细胞中,突变Fzo1蛋白在野生型水平上表达,并通过差速离心和免疫印迹抗Fzo1p抗血清测定靶向线粒体室(数据未显示)。然而fzo1(K200A),fzo1(S201N)、和fzo1(T221A)突变基因未能修复甘油生长缺陷或线粒体形态缺陷fzo1Δ应变(图。(图77 B类). 有趣的是,含有fzo1(K200A)fzo1(T221A)突变基因含有可检测的mtDNA核仁(图。(图77 B类)尽管核仁总数相对于野生型减少了(1-5而不是25-50)(数据未显示)。这些突变Fzo1蛋白可能保留了线粒体DNA维持所需的一些剩余功能。或者,含有这些突变蛋白的细胞失去线粒体基因组的速度可能比fzo1型-空单元格。G4结构域中一个保守残基的突变(K371A公司)没有破坏FZO1型(图。(图77 B类). 这一结果有些令人惊讶,因为赖氨酸371在整个GTP超家族中都是保守的,并且已知是Ras与GTP高亲和力结合所必需的(Der等人,1988年;Bourne等人,1991年). 此外果蝇fzo对蛋白质的功能有适度但显著的影响(Hales和Fuller,1997年). 最后,与过度表达野生型Fzo1p的细胞(2μ载体的10-20倍)相比,过度表达突变Fzo1蛋白的野生型细胞(2-μ载体的10-10倍)没有显示显性生长或线粒体形态缺陷(数据未显示)。这些观察结果表明,GTP结合和/或水解对Fzo1p功能至关重要。

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GTPase结构域突变阻断Fzo1p功能。(A类)Fzo1p的示意图显示了GTPase结构域基序(G1–G4;不按比例)的位置和序列,并指出了改变保守残基的突变。突变氨基酸位于原始残基上方。(B类)G1和G2基序的突变破坏了Fzo1p的功能。甘油生长、线粒体形态(抗孔蛋白、,n个=400),以及mtDNA核仁分布(DAPI染色,n个≥100)分析fzo1Δ包含野生型的单元格(JSY2354)FZO1型(JSY2392)或突变fzo1型基因(JSY2355-2358)携带低拷贝质粒(pRS414)。

讨论

Fzo1p调节线粒体融合

我们已经证明Fzo1p是酵母线粒体融合所需的跨膜GTPase。线粒体膜在非允许温度条件下迅速断裂fzo1-1型应变。因为线粒体融合和分裂的相反过程是有丝分裂细胞中线粒体网络的网状结构的原因(Nunnari等人,1997年),对这个结果最简单的解释是fzo1-1型导致融合过程中的选择性阻滞,线粒体持续分裂导致分裂。fzo1-1型是唯一一个具有片段化表型的酵母线粒体形态突变体,这与其在线粒体融合中的新作用一致。纯合子中线粒体融合和内容物混合也被阻断fzo1-1型×fzo1-1型合子和杂合子减少fzo1-1型×FZO1型 +交配。功能性Fzo1蛋白可能需要在相反的线粒体膜上进行有效融合。如果是这种情况,那么在fzo1-1型×FZO1型 +杂合子中新的蛋白质合成和互补可能导致交配。或者,只有一个融合伴侣上的功能性Fzo1蛋白可以允许Fzo1p之间的融合+和Fzo1p线粒体膜效率较低。

FZO1型基因,Fzo1蛋白缺失,或fzo1-1型菌株在37°C下会导致线粒体膜严重结块和聚集。我们在所有这些条件下观察到的线粒体形态的巨大缺陷似乎可能是由融合中的组成块引起的。虽然线粒体形态异常的酵母突变体的线粒体遗传通常是有缺陷的(Burgess等人,1994年;Sogo和Yaffe,1994年;Berger等人,1997年;赫尔曼,1998)Fzo1p功能的丧失并不影响线粒体膜在有丝分裂期间的运动或转运fzo1-1型fzo1Δ细胞被有效地传递到子芽(参见图。图22 G公司). Fzo1p功能缺陷也会导致线粒体基因组的丢失。虽然我们不能排除Fzo1p直接参与mtDNA复制和/或分离,但有几条证据表明fzo1Δ细胞是线粒体形态变化的次要结果。首先,当Fzo1p从野生型细胞中耗尽时,在DAPI染色的线粒体DNA核仁丢失之前的数小时内,可以观察到线粒体膜结构的缺陷。其次,许多研究表明,影响线粒体形态的突变导致线粒体DNA稳定性降低(Guan等人,1993年;Burgess等人,1994年;Sogo和Yaffe,1994年;Berger等人,1997年;赫尔曼,1998). 还需要进一步的实验来确定线粒体DNA丢失的机制fzo1型突变菌株。

Fzo1线粒体膜结合和拓扑

免疫定位、分馏和蛋白酶消化研究表明,Fzo1p是一种完整的膜蛋白,其氨基末端显示在线粒体表面。这种拓扑结构将Fzo1p的GTPase结构域和相邻的七肽重复序列定位在细胞质中,它们可以与可能调节Fzo1蛋白功能的结合伙伴和/或调节分子相互作用。考虑到不同Fzo家族成员的畴结构和总电荷分布的守恒性(图。(图11 A类;Hales和Fuller,1997年),我们预测来自其他生物体的Fzo同源物将显示类似的线粒体分布和拓扑结构。

据报道,线粒体融合在线粒体内外膜之间的稳定接触点启动(Bereiter-Hahn和Voth,1994年). Fzo蛋白的羧基末端可能在融合反应中协调这两个位置的脂质双层的行为中发挥重要作用。蛋白酶消化和蛋白质溶解研究表明,Fzo1p的羧基末端疏水结构域中至少有一个嵌于线粒体外膜。此外,Fzo1p在蔗糖梯度中迁移,具有部分重叠线粒体内膜和外膜标记的中等密度部分。在与线粒体接触位点物理相关的蛋白质中观察到了这种分馏模式(Pon等人,1989年)表明Fzo1p位于这些构造中。有许多拓扑结构可以解释Fzo1p与两个线粒体膜分离的能力。Fzo1p可能跨越两个膜,其羧基末端在基质中,如最初提出的Hales和Fuller(1997)或者,Fzo1p的羧基末端尾部可以延伸到膜间空间并与内膜中的蛋白质相互作用。最后,Fzo1p可能只与其他蛋白质形成的接触部位的外膜相关。Fzo1p羧基末端的定位将有助于区分这些模型。

虽然果蝇属和酵母Fzo蛋白都是线粒体融合所必需的,一些观察结果表明它们可能受到不同的调节。首先,我们的研究表明果蝇属Fzo蛋白有效地靶向野生型酵母的线粒体膜,但不能拯救野生型酵母中的线粒体表型fzo1Δ应变(未显示数据)。其次果蝇属Fzo和酵母Fzo1蛋白在这两种生物体中表现出不同的表达模式。果蝇属Fzo仅在线粒体融合发生的短时间内在精子线粒体上检测到(Hales和Fuller,1997年)这表明线粒体融合的时间可以通过控制Fzo的表达、定位和/或降解来进行发育调控。相反,酵母Fzo1p蛋白水平和线粒体定位在有丝分裂生长、交配或减数分裂期间没有改变(数据未显示),这与线粒体融合发生在酵母生命周期的所有阶段的观察结果一致(Pon和Schatz,1991年;Nunnari等人,1997年;赫尔曼和肖,1998年). 在延时研究中,当一个线粒体小管的尖端与另一个线粒体微管的尖端或侧面接触时,可以观察到酵母线粒体融合(Nunnari等人,1997年). 这就意味着关键的融合成分在线粒体小管尖端被定位或特异性激活(Nunnari等人,1997年). 我们观察到Fzo1p均匀分布于线粒体室,这表明融合机制并不局限于尖端。相反,Fzo1p可以在膜接触部位局部激活。

Fzo1功能需要氨基末端GTPase结构域

Fzo1p的GTPase结构域对其功能至关重要,可以作为调节线粒体对接和/或融合的分子开关。这个fzo1(K200A)fzo1(S201N)G1基序的突变相当于减少鸟嘌呤核苷酸结合的Ras GTPase的突变(Sigal等人,1986年;费格和库珀,1988年;Farnsworth和Feig,1991年). 这个fzo1(T221A)G2基序中的取代是基于Ras突变,该突变消除了与效应分子的相互作用(Adari等人,1988年;Cales等人,1988年;Vojtek等人,1993年;Murphy等人,1997年). 这些突变都没有破坏Fzo1p的定位,这表明将Fzo1p靶向线粒体不需要GTP结合和/或水解。

相比之下fzo1(K371A)G4基序的突变保留了野生型功能,能够修复线粒体融合、线粒体DNA维持和甘油生长的缺陷fzo1型突变细胞。这种赖氨酸在GTPases超家族中高度保守(Bourne等人,1991年)并且是Ras中GTP结合囊的有效核苷酸结合和稳定所必需的(Lys117)(Der等人,1988年;Pai等人,1990年). 尽管Ras中Lys117的突变显著降低了其对GTP的亲和力,但它不会破坏其致癌潜能(Clanton等人,1986年;Der等人,1988年). 此外,G4基序的类似突变果蝇属Fzo没有完全破坏线粒体融合(Hales和Fuller,1997年). 这些结果表明,酵母和苍蝇Fzo蛋白可能对GTP具有较高的内在亲和力,而不会因G4赖氨酸的改变而完全受损。或者,就核苷酸结合而言,该赖氨酸可完全(酵母Fzo1p)或部分(苍蝇Fzo)可有可无。

酵母类动力蛋白Vps1p和Dnm1p的突变形式(Vater等人,1992年;Otsuga等人,1998年),哺乳动物动力蛋白(Herskovits等人,1993年;范德布利克等人,1993年)、和Ras(Sigal等人,1986年;费格和库珀,1988年;Farnsworth和Feig,1991年)当在野生型细胞中过度表达时,诱导显性表型。这些显性表型被认为是由于蛋白质的突变形式要么滴定出来,要么阻断了其功能所需的结合伙伴的活性。相比之下,我们测试的Fzo1p的失活形式均未在野生型细胞中诱导显性线粒体表型(数据未显示)。对这些结果最简单的解释是,Fzo1p单独起作用,或者Fzo1的GTPase结构域中的突变完全破坏了其与自身或其他蛋白质相互作用的能力。

Fzo1p作用机制的模型

鉴于已知其他完整膜蛋白在融合中的作用,我们建议Fzo GTPases作为分子开关直接介导线粒体对接和/或膜融合。Fzo家族成员的域结构和我们为Fzo1p确定的拓扑结构都与该模型一致。Fzo分子与介导膜融合事件的两类整合膜蛋白具有共同的结构特征。SNARE在囊泡运输和细胞器膜同型融合过程中调节膜对接和融合(Denesvre和Malhotra,1996年;Hay和Scheller,1997年;爱德华森,1998年;Götte和Fischer von Mollard,1998年;韦伯等人,1998年). 病毒型融合蛋白调节细胞外膜对接和融合事件(Hernandez等人,1996年;霍维拉等人,1996年). SNARE和病毒融合蛋白在其氨基末端结构域中都含有多个七肽重复序列。这些重复序列形成平行的卷曲线圈,被提议用于介导反方向膜上v-和t-SNARE的直接结合以及膜内病毒融合蛋白的寡聚(Kee等人,1995年;Hernandez等人,1996年;Hanson等人,1997年;Hay和Scheller,1997年;休森,1997年). 我们的研究表明,Fzo1p中的两个氨基末端七肽重复序列延伸到细胞质中。如果Fzo1p具有类似SNARE的功能,这些重复序列可以介导Fzo1 p与自身或与相反线粒体膜上的另一蛋白结合伙伴的直接或间接关联。Fzo1p的细胞质GTPase结构域可能起到控制这种Fzo1相互作用的速率或保真度的作用,类似于Rab GTPase调节SNARE-SNARE关联的方式(卢巴欣和沃特斯,1997年). Fzo1p作为一种新型的线粒体SNARE发挥作用的想法很有吸引力,因为由S公司.酿酒基因组定位于线粒体隔室(H.R.B.Pelham,个人通讯)。

或者,Fzo1p的作用可能更像病毒融合蛋白(怀特,1990年,1992;Hernandez等人,1996年;休森,1997年;乔等人,1998). 这些完整的膜蛋白含有额外的疏水性融合肽,通常被掩盖。当被激活时,融合肽插入靶膜,产生停靠状态。蛋白质的构象变化将膜拉在一起并促进融合。Fzo1p在其细胞质域中包含两个类似于融合肽的疏水序列(赫尔曼,1998). Fzo1p可能利用其GTPase活性作为开关来刺激这些假定的融合肽插入相邻的线粒体膜。GTPase结构域还可能调节Fzo1p的构象变化,在肽插入后将两个对接的线粒体膜拉在一起。Fzo1p与两个线粒体膜紧密相关的观察结果表明,它也可能调节内膜的融合。预测的跨膜结构域和最接近Fzo1p羧基末端的七肽重复序列是否能够影响内膜行为尚待观察。

致谢

我们感谢R.Jensen(马里兰州巴尔的摩市约翰斯·霍普金斯大学)提供的有丝分裂GFP质粒和细胞色素b条2抗体,犹他大学健康科学中心(犹他州盐湖城)研究显微镜设施(K.H.Albertine和N.B.Chandler)的工作人员,以协助超微结构研究,Q.Tieu(加利福尼亚大学戴维斯分校)以技术协助分离fzo1-1型等位基因。

这项工作得到了美国癌症协会(CB-97)和美国国立卫生研究院(NIH)(GM-53466)对J.M.Shaw的资助,国家科学基金会(MCB-9724143)对J.Nunnari的资助,以及美国国立卫生研究院(HD-29194)对M.T.Fuller的资助。G.J.Hermann、K.G.Hales和J.P.Mills得到了NIH培训拨款的支持(分别为GM-07464、HG-00044和GM-07790)。犹他大学显微镜研究设施由美国国立卫生研究院(NIH)资助(S10-RR-10489)。犹他州健康科学测序设施得到了美国国家癌症研究所的资助(5-P30CA42014)。

本文中使用的缩写

3-PGK系列3-磷酸甘油酸激酶
5-视野5-氟有机酸
考克斯IV细胞色素氧化酶亚基IV
DAPI公司4′,6-二氨基-2-苯基吲哚
DiOC6公司3,3′二己基氧基碳菁
fzo公司 模糊洋葱基因
GFP公司绿色荧光蛋白
线粒体DNA线粒体DNA

脚注

地址:犹他州盐湖城犹他大学生物系Janet M.Shaw,UT 84112。电话:(801)585-6205。传真:(801)581-4668。电子邮件:ude.hatu.ecniecsoib@wahs或Jodi Nunnari,加州大学戴维斯分校分子和细胞生物学系,加利福尼亚州95616。电话:(530)754-9774。传真:(530)752-7522。电子邮件:ude.sivadcu.atesep@otimzf

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文章来自细胞生物学杂志由以下人员提供洛克菲勒大学出版社