iScience。2023年1月20日;26(1): 105810.
进化力量的复杂相互作用继续塑造着古老的共生基因组
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主要文本
(iScience)25, 104786; 2022年8月19日)
在本文的原始版本中,基因被注释为在Nesophrosyne公司夏威夷叶蝉共生体坎迪达斯Sulcia muelleri“和”加利福尼亚州。Nasuia deltocephlinacola“实际上存在。其中一些基因,特别是在纳苏亚,未被初始注释工作和软件包识别。作者修改了他们的注释方法,并手动检查每一个已识别的损失,以寻找进一步的注释推断错误。在重新标记这些基因区域后,作者更新了他们的基因丢失和保留计数,并修改了图1和图2,以反映这些新数据和结果。原文中与下列基因推断丢失相关的讨论部分不再适用:苏尔西亚(rpsO、pheT、rbfA、infC)和纳苏亚(rsmD、rpmJ、rpmG、rpsQ、rpsS、SCO2、hisD). 作者证实,这并不影响论文的科学信息,因为在密切相关的物种中仍然会发生聚合和独特的基因丢失。作者对给读者带来的不便深表歉意。作者诚挚地邀请其他人继续检查和复制科学工作。作者感谢Alejandro Manzano Marín博士向我们指出了这些错误,并指出了可能导致这些错误注释的方法错误。导致这些错误注释的方法学问题可能在其他类似的富含A+T核苷酸的微小共生体基因组的比较基因组工作中很常见。
图1.在苏尔西亚夏威夷特有叶蝉的基因组(Nesophrosyne公司)(原件)
图1.在苏尔西亚夏威夷特有叶蝉的基因组(Nesophrosyne公司)(已更正)
图2.在纳苏亚夏威夷特有叶蝉的基因组(Nesophrosyne公司)(原件)
图2.在纳苏亚夏威夷地方性叶蝉的基因组(Nesophrosyne公司)(已更正)