背景
泛素蛋白酶体系统(UPS)调节许多细胞功能,包括蛋白酶体降解、选择性自噬、细胞信号传导、受体运输和内吞、DNA损伤反应、细胞周期、细胞存活、细胞增殖和细胞死亡等[1——三]. UPS的功能障碍或失调与一系列病理和疾病有关,包括血液系统恶性肿瘤[4]. 硼替佐米或卡非佐米抑制UPS成分的活性已被证明是治疗多发性骨髓瘤(MM)和幔细胞淋巴瘤(MCL)的一种治疗策略[5]. 事实上,UPS的基本成分包括泛素酶、氘酶和26S蛋白酶体[6]. 迄今为止,许多E3泛素连接酶与血液系统恶性肿瘤的发病机制有关[7——10]. 相反,含有约100个家族蛋白的氘激酶(DUBs)可以从底物中去除泛素链,从而控制底物的稳定性、相互作用或定位[11,12]. 根据结构域结构将DUB分为六个家族:泛素特异性蛋白酶(USPs,58个成员)、泛素羧基末端水解酶(UCHs,4个成员),卵巢肿瘤相关蛋白酶(OTU,16个成员)和Machado-Joseph病蛋白结构域蛋白酶(MJDs,4成员),含有JAB1/PAB1/MPN结构域的金属酶(JAMMs,12个成员),以及与含有Ub的新DUB家族相互作用的基序(MINDYs,4个成员)(图) [12]. 因此,越来越多的证据表明DUB的调节异常在血液恶性肿瘤的发病机制中起着重要作用[13,14]. 此外,一些DUB在造血干细胞(HSC)向所有血细胞系分化的过程中也很重要,相关疾病与血液恶性肿瘤有关[15——18]. 然而,大多数DUB及其在血液恶性肿瘤进展中的作用尚未得到广泛研究。在这篇综述中,我们将重点介绍DUB在不同类型血液恶性肿瘤中的作用以及靶向小分子抑制剂的开发。
人类DUBs。人体DUB由半胱氨酸蛋白酶和金属蛋白酶组成。根据结构域结构,DUB可分为六个家族:泛素特异性蛋白酶(USPs)、泛素羧基末端水解酶(UCHs)、卵巢肿瘤相关蛋白酶(OTU)、Machado-Joseph病蛋白域蛋白酶(MJDs)、JAB1/PAB1/MPN域金属酶(JAMMs)、,以及与含Ub-的新型DUB家族(MINDY)相互作用的母题
慢性粒细胞白血病中的DUB
慢性粒细胞白血病(CML)是一种骨髓增生性肿瘤,约占成人白血病新诊断病例的15%[19]. BCR-ABL占所有确诊CML病例的95%,其作用是构成活性蛋白酪氨酸激酶[20]. 令人欣慰的是,大多数CML患者在接受酪氨酸激酶抑制剂(TKIs)治疗后可以获得完全缓解,有些患者甚至停止TKIs治疗以获得无治疗缓解(TFR)[21,22]. 然而,耐药和复发限制了TKIs通过BCR-ABL依赖和独立机制治疗CML的应用[23]. BCR-ABL依赖性机制通过BCR-ABL公司ABL激酶结构域的基因扩增、突变和MDR1的上调[24]. 到目前为止,BCR-ABL独立机制还没有被很好地理解。CML中的白血病干细胞(LSC)的生存并不依赖BCR-ABL激酶活性,并且以BCR-ABL-independent的方式对TKI不敏感,因此导致复发[25]. 此外,RAS/MAPK或PI3K信号通路的异常激活也有助于BCR-ABL非依赖性TKI抵抗[26,27]. 一些DUB已被确定与BCR-ABL信号通路相关,其他DUB可克服BCR-ABL-dependent或independent TKI耐药性。与CML相关的DUB如图所示。
慢性粒细胞白血病中的DUB。红色箭头代表癌基因,绿色箭头代表CML中的肿瘤抑制因子。周围的文字描述了DUB的底物或信号通路或效应
USP7参与DNA损伤反应、DNA复制、表观遗传学和病毒感染[28]. 更重要的是,USP7因其在肿瘤发生中的作用而被确定为多种癌症的潜在治疗靶点[29]. 已经开发了几种USP7的小分子特异性抑制剂[30,31]. 在CML中,USP7与BCR-ABL发生物理相互作用,并被BCR-ABL磷酸化(Tyr243)。磷酸化USP7增加了去泛素活性,从而促进磷酸酶和张力蛋白同源物(PTEN)的核排斥,从而破坏了PTEN在CML细胞中的抑癌功能[32,33]. 还证明USP7与BCR-ABL相互作用,阻止其多泛素化和降解,从而抑制其下游信号转导[34]. 此外,USP7主要在正常CD34的细胞核中表达+细胞,但在原CML CD34中+在细胞核和细胞质中都有表达[35]. USP7在胞浆中与BCR-ABL结合,并通过核体内的PML网络调节PTEN去泛素化。
USP9X在人类癌症中充当癌基因或肿瘤抑制因子,并且在正常发育和疾病的生物学后果方面也发挥作用[36]. 小分子WP1130对USP9X的抑制可诱导BCR-ABL泛素化和转运,导致伊马替尼敏感和耐药CML细胞的凋亡。虽然WP1130抑制USP9X活性,但USP9X与BCR-ABL泛素化增加无关。CML细胞中USP9X-沉默可降低抗凋亡蛋白MCL-1,从而增加对伊马替尼和其他凋亡刺激的敏感性[37,38].
USP10是一种S相激酶相关蛋白2(SKP2)的氘化酶,它与BCR-ABL相互作用,是激活CML中BCR-ABL所必需的。SKP2是一种E3连接酶,通过促进BCR-ABL的K63连接泛素化来增强BCR-ABL的活性[39]. 虽然USP10氘化并稳定SKP2,但它不能直接降低BCR-ABL的泛素化。总之,USP10抑制抑制伊马替尼敏感和耐药CML细胞的增殖。
USP15参与与癌症和其他相关疾病相关的各种细胞途径[40]. USP15在CML中显著下调,其抑制减少了caspase-6的去泛素化并促进了caspase-6的降解,从而减弱CML细胞的凋亡并促进了伊马替尼的耐药性[41].
USP18(UBP43)是一种ISG15特异性异肽酶,其表达被干扰素(IFN)激活[42].使用18-在BCR-ABL逆转录病毒转导/移植试验中,与野生型细胞相比,缺乏的骨髓细胞显示出CML发育的显著延迟。然而,使用18和干扰素受体R1(伊夫纳1)带有p210 BCR-ABL转导的双缺陷骨髓细胞逆转了对CML疾病发展的最初抵抗,这表明1型IFN信号在CML发展抵抗中的重要作用使用18-骨髓细胞缺乏[43].
USP25通过与不同的肿瘤坏死因子(TNF)受体相关因子(TRAF)蛋白相互作用,在先天免疫反应、自身免疫和肿瘤发生的调节中发挥重要作用[44]. BCR-ABL降解被认为是克服TKIs耐药性的一种策略,因此抑制BCR-ABL的去泛素酶可能是有效的。USP25氘化并抑制BCR-ABL的降解,其耗竭抑制BCR-ABL介导的信号传导和细胞增殖[45].
USP47参与细胞存活[46],细胞增殖[47,48]、DNA损伤修复[23,49,50],上皮-间充质转化[51]和炎症[52,53]. 事实证明47美元敲除显著延长BCR-ABL和BCR-ABL的存活时间T315I型-通过减少白血病干/祖细胞诱导CML小鼠。机制研究表明,USP47氘化并稳定Y盒结合蛋白1(YB-1),并参与CML细胞的DNA损伤修复[23]. 研究表明,USP47是BCR-ABL诱导的CML所必需的,可以克服BCR-ABL-非依赖性耐药。
CML CD34中A20表达显著下调+细胞与正常骨髓CD34的比较+细胞。A20过度表达抑制CML CD34中的细胞增殖、细胞周期并促进凋亡+细胞。此外,A20过表达显著降低K562和CML CD34中NF-κB信号通路(P65和IκBα磷酸化)+单元格[54].
BAP1在CML转录水平下调,是一种与DNA修复调节因子BRCA1相互作用的氘化酶[55]. 研究表明,BAP1是BCR-ABL诱导CML中BRCA1下调的主要环节。
总之,靶向某些氘化酶,如USP7、USP9X、USP10、USP15、USP25和USP47,可以有效克服CML中的TKIs耐药性,而一些氘化酶类在维持CML干/祖细胞的自我更新能力方面发挥着重要作用。对于TKI不耐受或复发的患者,单独使用氘激酶抑制剂或与TKI联合使用可能有效解决临床问题。
急性髓细胞白血病的DUB
急性髓细胞白血病(AML)是一种以原始造血干细胞或祖细胞克隆增殖为特征的疾病。骨髓细胞的异常分化导致未成熟恶性细胞数量增加,分化的红细胞、血小板和白细胞数量减少[56]. 尽管一些新药被用于治疗AML患者,但AML患者的标准治疗仍然是化疗。然而,一些患者无法忍受这种治疗,尤其是老年患者,但效果似乎有限[57——59]. 事实上,大多数接受化疗的患者都会复发,这是由耐药白血病细胞(RLC)再生引起的[60]. 此外,白血病干细胞(LSC)和耐药性(FLT3抑制剂、BCL2抑制剂等)仍是AML治疗的难题[61——63]. 进一步研究AML发病的分子机制将有助于AML的治疗效果。与AML相关的DUB如图所示。
急性髓性白血病中的DUB。红色箭头代表癌基因,绿色箭头代表AML中的肿瘤抑制因子。USP22在AML中起癌基因或肿瘤抑制因子的作用,具体取决于上下文。周围的文字描述了急性髓性白血病中DUB的底物或相关蛋白
USP1在几种癌症组织类型中经常过度表达[64]. 在AML细胞中,USP1去泛素化DNA结合抑制剂1(ID1),并将其从蛋白酶体降解中拯救出来,蛋白酶体降解在细胞转化中发挥作用。USP1抑制剂SJB2-043通过破坏同源重组促进ID1降解并抑制原代AML细胞生长[65].
通过全转录组测序分析,USP2被鉴定为MLL(也称为KMT2A)在婴儿急性髓系白血病中的融合伴侣[66]. 另一项研究表明,急性白血病患者反复与MLL-USP2融合等位基因相关,以及与USP8、AF4和AF9的MLL融合伙伴关系[67,68]. MLL-USP2融合蛋白通过三种机制可能有助于MLL-r白血病的发生:(a)USP2稳定MLL以保护其免受泛素蛋白酶体降解,(b)显性负性抑制野生型MLL转录,以及(c)通过USP2调节细胞周期、细胞增殖或其他细胞功能。
USP7是一种PTEN去平衡酶,在急性髓性白血病中直接与核磷蛋白(NPM1)/突变核磷蛋白(NPMc+)相互作用。NPM1阻止USP7介导的PTEN在细胞核内的去泛素化,从而促进PTEN向细胞质的穿梭。PTEN通过USP7去泛素活性保持在细胞质中,而去泛素酶活性由NPMc+调节[69]. 此外,USP7抑制通过与CHK1蛋白的相互作用和调节使AML对化疗敏感[70]. 此外,USP7双歧化酶将非标准PRC1.1多梳复合物作用于AML细胞中的靶位点和基因调控功能[71]. 总之,USP7是AML有希望的治疗靶点。
USP9X抑制FLT3-ITD的K63连锁多聚泛素化,而FLT3-ITT反向磷酸化USP9X以增强泛素化和蛋白酶体降解。抑制剂WP1130或G9对USP9X的抑制通过阻断FLT3下游信号事件在FLT3-ITD驱动细胞中显示出强大的抗白血病作用[72].
USP10被确定为在AML中对氢醌的关键DUB,并比野生型FLT3更稳定FLT3-ITD。HBX19818抑制USP10对FLT3-ITD阳性AML细胞和小鼠模型显示抗白血病作用。它与FLT3抑制剂协同工作,克服FLT3拮抗剂耐药性[73]. 另一种USP10抑制剂Wu-5也表现出抗AML的作用,克服了FLT3抑制剂的耐药性,并通过靶向FLT3和AMPKα途径协同增强克雷诺拉尼的抗白血病作用[74]. 由USP10稳定的脾脏酪氨酸激酶(SYK)对AML患者的AML转化和白血病克隆的维持至关重要。FLT3-ITD阳性AML中发现高度激活的SYK,它促进Myc转录程序,并对TKI耐药性至关重要[75,76]. 在一例复发性AML-M5a伴t(11,16)(q23;q24)的青少年患者中发现MLL-USP10融合[77]. 到目前为止,已经发现USP2、USP8和USP10与MLL融合,这表明DUB可能是MLL-r白血病的潜在靶点。
USP14和UCHL5抑制剂b-AP15抑制AML小鼠模型中的器官浸润[78]. 另一种化合物NiPT能有效抑制USP14和UCHL5活性,诱导AML细胞的细胞毒性和蛋白酶体抑制[79]. Aurora激酶B(Aurora B)是一种有丝分裂检查点激酶,已被发现在几种白血病中过度表达[80]. USP14通过去泛素Aurora B抑制化疗药物诱导的白血病细胞凋亡[81].
USP15在人类白血病细胞中高度表达,与AML细胞中的FUS相互作用并稳定FUS[15]. 据报道,FUS是一种RNA/DNA结合蛋白,可促进HSC自我更新[82]. 在正常造血过程中,USP15缺失会损害造血干细胞和祖细胞(HSPCs)体外增殖和体内重建潜能[15]. 在MLL-AF9白血病中,USP15调节TIFAB去泛素化,降低p53信号,相应地促进白血病细胞功能和白血病的发展[83].
USP18是从白血病融合蛋白AML1-ETO表达小鼠中克隆的,该融合蛋白可阻断细胞因子诱导的单核细胞终末分化[84]. 研究表明,USP18稳定了PML/RARα蛋白,并抑制了对全反式维甲酸(RA)敏感和对RA耐药的急性早幼粒细胞白血病(APL)细胞的凋亡[85]. 然而,其他研究人员发现USP18可以通过靶向PML结构域来对抗UBE1L依赖的PML/RARα降解,而不是RA-依赖的PML/RARα降解[86].
与FLT3-WT AML CD34相比,FLT3-ITD显著诱导USP22 mRNA表达+c-Myc诱导的细胞,从而减少泛素化并增强SIRT1的稳定性[87]. 相反,USP22缺乏阻断髓样分化,从而促进Ras-driven骨髓增生性肿瘤的AML。从机制上讲,USP22氘化PU.1并促进其靶基因表达[88]. 总之,USP22在白血病转化或病理过程中显示出不同的功能。
USP28过度表达不仅抑制AML细胞增殖,而且使AML细胞对5′-氮杂胞苷(5′-AZA)诱导的凋亡敏感。USP28通过KLHL2(一种泛素E3连接酶)与尿苷胞苷激酶1(UCK1)结合,并拮抗KLHL2介导的UCK1的多泛素化,后者在激活5′-AZA中具有既定作用[89].
USP37与早幼粒细胞白血病锌指(PLZF)/维甲酸受体α(RARA)融合蛋白相互作用并稳定其蛋白水平。患有PLZF/RARA融合蛋白的急性早幼粒细胞白血病(APL)患者对全反式维甲酸(ATRA)治疗有很大抵抗力,预后不良[90].
发现USP42(内含子1)与RUNX1(内含子7)(t(7,21)(p22;q22)/RUNX1-USP42)在AML中融合,但USP42的功能尚不清楚[91]. 然而,后来的研究表明RUNX1的第6外显子或第7外显子与USP42的第3外显子融合,CD56和CD7异常表达[92,93]. RUNX1-UPS42的AML患者预后不良[94]. 提示USP42在AML-ETO阳性AML患者中可能起重要作用。
USP48参与ATRA诱导的APL细胞分化。ATRA在APL细胞系中的治疗可导致24小时内的细胞核移位和USP48的放松调控。USP48过度表达抑制APL细胞增殖并促进ATRA介导的分化[95].
BRCA1/BRCA2-containing complex 3(BRCC3)是JAMMs家族的一员,能够裂解Lys-63连接的多-双肽链[96]. BRCC3突变可改善AML1-ETO阳性AML细胞系的增殖,并在体外培养的小鼠造血祖细胞中实现无限自我更新。然而,BRCC3突变的AML1-ETO阳性AML患者表现出良好的预后,因为BRCC3失活可能导致BRCA1-A复合体修复DNA损伤的能力受损,继而对DNA损伤化疗更敏感[97]. 小鼠和人类AML的发病机制可能存在显著差异。
A20在AML衍生DC(AML-DC)中表达上调,AML-DC与AML白血病细胞分化[98]. 此外,在单核-巨噬细胞分化(THP-1细胞)过程中,A20表达增加[99]. 然而,AML患者T细胞中A20的表达低于健康对照组[100]. A20共同作为AML的肿瘤抑制因子。
BAP1缺失抑制具有ASXL1突变或MLL融合的髓系白血病细胞的生长。ASXL1突变或MLL融合与多种髓系肿瘤的不良预后相关。从机制上讲,C-末端截断突变ASXL1(ASXL1-MT)与BAP1形成复合物,并通过消除H2AK119泛素化诱导HOXA基因和IRF8的上调[101,102].
总之,一些氘酶,如USP9X、USP10、USP18和USP37,与白血病融合蛋白直接相关。此外,其他氘酶,如USP2、USP8、USP10和USP42,与白血病相关基因融合,表明氘酶在AML的发病机制中起着重要作用。
急性淋巴细胞白血病中的DUB
急性淋巴细胞白血病(ALL)是由在分化早期被阻断的淋巴细胞(包括T和B细胞)恶性增殖引起的,其可侵入骨髓、血液和髓外部位[103]. 急性淋巴细胞白血病的一线治疗是化疗,通常包括三个阶段:诱导、巩固和维持[104]. 放射治疗可用于有中枢神经系统(CNS)或睾丸白血病证据的患者,而异基因造血细胞移植和生长因子治疗是所有治疗的补充[105,106]. 新的免疫治疗策略,如单克隆抗体和嵌合抗原受体(CAR)T细胞,也正在开发中[107,108]. 然而,尽管在过去几十年中取得了巨大进展,但成人和老年急性淋巴细胞白血病患者(>60岁)的急性淋巴细胞白血病管理仍然具有挑战性。与ALL相关的DUB如图所示。
急性淋巴细胞白血病中的DUB。红色箭头表示癌基因,绿色箭头表示ALL中的肿瘤抑制因子。周围的文字描述了不同类型ALL DUB中涉及的底物或信号通路
在患有B-ALL的婴儿患者中发现USP2/USP8-MLL重排[66,109]. 在急性淋巴细胞白血病中,大多数婴儿ALL的特征是MLL重排(约70-80%,预后较差)。靶向USP2/USP8可能对改善MLL重排白血病的预后很重要。
在全基因组关联研究(GWAS)中,USP7被确定为T-ALL的易感基因座[110]并且在T-ALL细胞中显著上调[111]. 从机制上讲,USP7去泛素化并稳定NOTCH1,这导致NOTCH1靶点的转录水平降低并阻断T-ALL细胞生长[111,112]. 然而,USP7在儿童T-ALL中经常发生突变,体细胞杂合子功能丧失突变(单倍体不足)主要影响TAL1癌基因异常激活的亚群。USP7的单倍体不足通过与TAL1相互作用促进细胞生长和转录下调E蛋白靶点[113]. 具体地说,USP7与费城染色体阳性(Ph+)ALL中的p190 BCR-ABL相互作用,USP7-活性降低与p53蛋白稳定性相关[114].
USP9X抑制通过抑制mTORC1活性降低白血病细胞生长,增强B-ALL的自发凋亡并克服糖皮质激素抵抗[115]. 然而,USP9X水平与T-ALL患者的生存率呈正相关,并且敲除USP9X不会诱导T-ALL细胞的凋亡和生长抑制[116]. 据报道,药物或基因抑制USP9X,以及低剂量鲁索立替尼治疗,可能通过限制JAK信号传导,促进CRLF2阳性B-ALL伴唐氏综合征(DS-ALL)细胞的存活[117]. 这些发现表明USP9X可能在不同类型的ALL中发挥不同的作用。
USP24抑制显著诱导T-ALL细胞的生长抑制和凋亡。WP1130通过直接与T-ALL细胞中USP24的活性位点口袋相互作用来阻断USP24活性。USP24抑制通过机制调节Mcl-1的稳定性,加速线粒体跨膜电位的崩溃[116].
T-ALL中USP44表达升高。USP44过表达通过调节Cdc20-APC/C活性,导致整个染色体不稳定,以及有丝分裂前细胞周期蛋白B增加[118].
UCHL1在淋巴细胞白血病细胞系的分化过程中降低,其表达与凋亡途径无关[119]. 然而,UCHL1参与分化的机制尚未阐明。
A20在ALL患者和细胞系中高水平表达,可促进增殖、调节细胞周期进展并诱导化疗耐药[120]. A20在成人B-ALL中也过度表达,这可能与B-ALL的发病机制有关[121].
CYLD在原发性T-ALL中显著下调[122]. CYLD的过度表达可以消除T-ALL中组成性活性Notch1的能力[123]. 有趣的是,正常人外周血单个核细胞中分裂的CYLD过度表达具有对这些细胞基因组进行编程的固有能力,从而导致T细胞系ALL[124]. 总之,CYLD在ALL中起到了肿瘤抑制剂的作用。
综上所述,USP7、USP9X、USP24和USP44已被证明可以促进ALL作为致癌基因的发展。然而,USP7和USP9X也在ALL中起到肿瘤抑制基因的作用。因此,针对不同的氘酶可能在某些类型的ALL中发挥作用。
慢性淋巴细胞白血病中的DUB
慢性淋巴细胞白血病(CLL)是最常见的成人白血病,它是由损害克隆B细胞凋亡的特定基因组改变引起的[125]. 随着靶向B细胞受体信号的激酶抑制剂的发展,CLL治疗在过去十年中发生了变化。例如,布鲁顿酪氨酸激酶(BTK)和异形选择性磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)抑制剂破坏了B细胞受体信号传导。此外,BCL2(B细胞淋巴瘤2)已成为另一个重要的治疗靶点[126]. 对于老年和高危CLL患者,新的分子靶向药物与以前的化疗方案或单克隆抗体方案相比显示出良好的优势。然而,耐药性、副作用和高成本是目前存在的问题。
与正常供体相比,USP7在CLL中过度表达。抑制USP7可通过同源重组部分损害DNA修复,从而破坏E3连接酶RAD18的稳定性,导致DNA损伤的累积,从而独立于共济失调毛细血管扩张症突变(ATM)和p53杀死CLL细胞[127,128]. USP7还显示可以促进PTEN从细胞核的去定位,从而以p53不必要的方式丧失其部分抑癌功能[129]. 总之,以USP7为靶点是杀死CLL细胞的有效策略。
与正常B细胞相比,CLL细胞中的CYLD显著下调,这与CLL患者的总生存率(OS)较低有关[130,131]. 作为Wnt/β-catenin通路的下游效应器,淋巴样增强子结合因子1(LEF1)可以抑制CYLD的转录,下调的CYRD抑制TNF-α诱导的坏死[130,132]. 此外,在许多B细胞慢性淋巴细胞白血病患者的样本中检测到CYLD的选择性剪接,这可能导致CD5+通过持续NF-κB信号传导实现B细胞扩增[133].
A20在几种B细胞恶性肿瘤中负调节NF-κB活性。然而,在CLL细胞的基因分析中,A20位点既没有突变也没有异常的DNA甲基化,而A20的表达是正常的[134,135]. 这些结果表明A20在CLL的发病机制中可能没有显著作用。
多发性骨髓瘤中的DUB
多发性骨髓瘤(MM)是第二常见的血液系统恶性肿瘤,其特征是在骨髓中积聚产生M蛋白的单克隆浆细胞[136]. 新药物(如蛋白酶体抑制剂、免疫调节药物和靶向细胞表面分子的抗体)的使用,以及年轻患者的大剂量治疗和自体干细胞移植(ASCT),显著改善了多发性骨髓瘤患者的预后[137]. 然而,大多数患者经历多次复发,最终死于疾病本身或治疗相关并发症,尤其是老年患者[138]. 新发病机制的发现将有助于开发新的治疗药物,以克服耐药性和复发问题。关于氘化酶调节MM发病机制的报告揭示了以氘化物为靶点的巨大潜力。与MM相关的DUB如图所示。
多发性骨髓瘤中的DUB。红色箭头表示MM中的癌基因,绿色箭头表示MM的肿瘤抑制因子。周围的文本描述了MM中DUB的底物或信号通路
USP1参与DNA损伤反应和细胞分化,在一些MM病例中过表达,并与不良预后有关。SJB3-019A是USP1的选择性抑制剂,可降低细胞活力,触发细胞凋亡,克服MM细胞对硼替佐米的耐药性,下调更新/存活相关蛋白,甚至促进MM干细胞分化[139].
USP5和OTUB1稳定c-Maf并促进骨髓瘤细胞增殖和存活[140——143]这表明USP5/c-Maf或OTUB1/c-Maf轴可能是骨髓瘤治疗的潜在靶点。甲苯咪唑下调USP5的表达,干扰USP5和c-Maf之间的相互作用,导致c-Maf泛素化水平增加,随后c-Maf降解[140]. MiR-125a抑制USP5的表达,从而减少MM细胞的增殖和存活[144]. 硼替佐米诱导的周围神经病变(BIPN)是硼替佐米特治疗最严重的副作用之一[145]. 有趣的是,在小鼠模型中,USP5在这一病理过程中被上调以稳定Cav3.2,这是BIPN所必需的T型钙通道[146]. 南昌霉素(Nam)是一种聚酮类抗生素,在OTUB1存在下可抑制c-Maf活性,表明Nam具有通过靶向OTUB1/c-Maf轴治疗MM的潜力[147].
USP7过度表达预示预后不良,USP7抑制可克服MM对硼替佐米的耐药性[148,149]. USP7通过稳定NEK2或抑制IκBα参与硼替佐米耐药,从而激活NF-κB信号通路[149,150]. USP7还通过其他机制促进MM细胞生长并抑制细胞凋亡。例如,USP7稳定转录因子Maf家族成员(c-Maf和MafA),这些转录因子在MM中高度表达,并有助于MM细胞的侵袭、粘附和迁移[151]. USP7刺激DNA甲基转移酶1(DNMT1)活性,阻断USP7增强氧化表观遗传剂RRx-001的抗MM活性[152]. 同样,另一种USP7抑制剂P5091在体内外抑制MM细胞生长并增加细胞凋亡[148,151]. 有趣的是,其他USP7抑制剂上调了通常被表观遗传抑制复合物多梳抑制剂2(PRC2)沉默的基因的转录,并增强了PIM和PI3K抑制剂以及DNA损伤剂的活性[153].
USP9X可以去除Mcl-1上的Lys48连接的聚-泛素链,从而防止其降解。它还促进细胞存活,其在MM中的过度表达与不良临床结局有关[154,155]. USP24还可以稳定Mcl-1并促进MM细胞存活,而不依赖于USP9X。靶向USP9X的小分子抑制剂WP1130在体内外诱导MM细胞凋亡[156]. 与WP1130相比,其他先导化合物T5165804和CP2005以更高的纳米效力抑制USP9X对MM细胞系的活性[157].
USP14和UCHL5靶向蛋白酶体的19S调节亚基,影响蛋白酶体对蛋白质底物的吸收以进行降解,在MM中高度表达,b-AP15对它们的抑制克服了硼替佐米的耐药性[78,158,159]. USP14通过在Bcl-xl凋亡途径和Wnt-signaling途径之间架起桥梁,参与多发性骨髓瘤细胞的细胞粘附介导耐药(CAM-DR)[160].
与正常健康患者相比,MM患者的USP15表达上调。USP15沉默通过抑制NF-κB通路诱导MM细胞增殖抑制和凋亡。反过来,NF-κB p65可以促进USP15的表达,从而形成正反馈环[161].
UCHL1在许多MM病例中高度表达,并作为不良预后因素[162,163]. UCHL1损伤mTORC1活性并增加mTORC2介导的增殖激酶Akt磷酸化,从而促进MM细胞的存活[164].
PMSD14/Rpn11是26S蛋白酶体的组成部分,26S蛋白酶体是一种多蛋白复合物,可催化泛素化细胞内蛋白质的降解[165]. 抑制PMSD14激活caspase级联和内质应激反应信号,触发MM细胞凋亡并克服硼替佐米耐药[166].
在MM中观察到NF-κB通路的异常激活[167]而CYLD是NF-κB通路的负调控因子,并且在16q12时CYRD的状态与MM患者的临床结局高度相关[168]. 除了影响NF-κB信号传导外,CYLD的缺失或低表达也会使MM细胞对Wnt配体敏感,这表明CYRD在MM中的另一种可能的抑瘤机制[169]. 此外,值得注意的是,蛋白酶体抑制剂对NF-κB信号传导的抑制作用,可以在MM治疗期间观察到,可能至少部分通过CYLD的细胞积累介导[170].
A20是NF-κB通路的抑制物,由于基因拷贝数减少,在MM中经常下调[171]. 小檗胺治疗导致A20的表达增加,抑制MM细胞的增殖[172].
综上所述,氘酶抑制剂已被证明能有效克服硼替佐米耐药性,因此,将氘酶抑制物与现有疗法相结合将成为一种新的治疗策略。
霍奇金淋巴瘤中的DUB
霍奇金淋巴瘤(HL)是一种起源于生发中心或生发后中心B细胞的淋巴恶性肿瘤,其特征是肿瘤微环境中恶性细胞数量较少,免疫效应细胞数量较多[173]. 原发性HL可以通过放射治疗和多药化疗治愈,甚至复发或难治性HL也可以通过大剂量化疗和自体造血干细胞移植有效治疗或治愈。此外,使用抗体药物结合物和免疫检查点抑制剂的免疫治疗已被证明对HL有效[174]. 由于目前对HL的治疗效果令人满意,对HL中氘化酶的研究较少。
经典霍奇金淋巴瘤(cHL)是一种占95%病例的HL亚型,其特征是存在不到1%的恶性单核霍奇金细胞和多核Reed-Sternberg细胞(HRS细胞)与非肿瘤细胞混合[175]. 由A20和CYLD调节的NF-κB信号通路对HRS细胞的生存和增殖非常重要[176]. 近40%的HL病例中存在A20基因的突变或缺失,导致cHL细胞中NF-κB的组成性活性,而A20重组则使A20缺陷的cHL电池具有细胞毒性[177——179]. 在四种常用的cHL细胞系中的一种中检测到CYLD的缺失或DNA拷贝数丢失,并且在低频率下检测到CYLD的双等位基因突变[180,181]提示CYLD功能受损可能与某些慢性粒细胞白血病有关。
非霍奇金淋巴瘤中的DUB
非霍奇金淋巴瘤(NHL)约占所有淋巴瘤的90%,可细分为B细胞淋巴瘤和T细胞/NK细胞淋巴瘤。非霍奇金淋巴瘤的分类复杂且不断演变,世界卫生组织的最新分类中列出了80多种不同的亚型[182,183]. 每种NHL都有其独特的组织学和生物学特征,以及不同的治疗策略和临床结果,使NHL成为一种复杂的疾病[184]. 从治疗的角度来看,NHL分为高级别和低级别淋巴瘤。低级别NHL患者可以通过手术切除或放射治疗治愈,但大多数患者出现在晚期或转化为高级别疾病[185]. 对于高级别NHL患者,化疗仍然是主要的治疗方法,一些患者还将接受放射治疗。对于B细胞源性淋巴瘤,CD20单克隆抗体免疫治疗也将联合使用[186,187]. 然而,化疗期间或化疗后的耐药性和复发是需要解决的主要问题,尤其是对于T细胞/NK细胞淋巴瘤。与NHL相关的DUB如图所示。
非霍奇金淋巴瘤中的DUBs。红色箭头代表癌基因,绿色箭头代表NHL中的肿瘤抑制因子。周围的文字描述了参与不同类型淋巴瘤DUB的底物或信号通路。CRLs:cullin RING E3泛素连接酶
ML364对USP2的抑制导致细胞周期蛋白D1降解增加,并导致套细胞淋巴瘤(MCL)细胞系(Mino细胞)的细胞周期阻滞[188]. 此外,USP2稳定Mdm2,Mdm2拮抗p53的促凋亡活性,并可能导致皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)的治疗耐药性[189].
USP9X在侵袭性B细胞淋巴瘤患者的样本中高度表达。通过破坏B细胞淋巴瘤中X连锁凋亡抑制蛋白(XIAP)的稳定性,敲除USP9X导致淋巴瘤生长受到抑制,化疗敏感性增加,与Mcl-1无关[190]. 在弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)和滤泡性淋巴瘤(FL)中,USP9X氘化Mcl-1并防止其降解,而高水平的Mcl-1与B细胞淋巴瘤患者的恶性B细胞增殖和不良预后相关[154].
USP14和UCHL5在DLBCL细胞的细胞质中异常表达[191]. b-AP15对USP14和UCHL5的抑制可诱导DLBCL ABC和GBC亚型的细胞凋亡和抑制细胞迁移[192]. 此外,USP14抑制剂IU1可导致胸腺恶性淋巴瘤(MLT)小鼠模型的肿瘤消退[193].
USP21在DLBCL中过度表达,并通过维持非霍奇金淋巴瘤中致癌分子zeste同源物2增强子(EZH2)的稳定性来促进细胞增殖[194,195]. 靶向抑制USP21活性导致EZH2减少,从而抑制细胞生长,而不依赖于EZH2突变。另一个靶向EZH2的DUB,USP36,发现于鼻自然杀伤/T细胞淋巴瘤(NKTL)。USP36通过从EZH2中去除K222连接的聚-泛素链来稳定EZH2[196].
USP34在DLBCL中的表达显著高于反应性淋巴增生。USP34过度表达与年龄、生发中心B细胞样(GCB)亚型、多发结外受累和DLBCL中较高的国际预后指数(IPI)评分有关[197]. 此外,在转化的DLBCL(tDLBCL)中检测到USP34基因扩增[198].
检测到UCHL1在Burkitt淋巴瘤(BL)和DLBCL中均高表达,这与不良临床结局相关[199]. 在BL细胞中使用特异性shRNA敲除UCHL1导致细胞增殖减少,以及LFA-1依赖的强同型粘附[200]. 机制上,异常表达的UCHL1可以通过下调拮抗性磷酸酶PHLPP1和Akt信号通路激活Akt途径[201]以及促进mTORC2组装[202]. 同时,UCHL1可以绕过mTORC1,促进eIF4F的组装,eIF4F是Akt和mTOR下游的翻译调节因子,是MYC驱动的小鼠B细胞恶性肿瘤所必需的[202].
CSN5被鉴定为癌基因的阳性调节器和抑癌基因的阴性调节器[203——205]. CSN5i-3是CSN5抑制剂,在异种移植模型中抑制人源性细胞系SU-DHL-1(间变性大细胞淋巴瘤,ALCL)的生长[206]. 此外,CSN5敲除部分通过CSN5-HSP90途径抑制DLBCL细胞的生长[207].
A20突变和/或缺失与各种B细胞或T细胞淋巴瘤亚型有关,包括粘膜相关淋巴组织(MALT)淋巴瘤、DLBCL、MCL、FL和NKTL[208——210]. 在NKTL中,A20的单等位基因缺失发生在18%的病例中,而没有检测到双等位基因的缺失[175]. A20突变发生在50%以上的ABC-DLBCL和一小部分GCB-DLBCL中[211]. 用佛波酯-肉豆蔻酸酯(PMA)和龙霉素(IONO)上调A20可有效诱导DLBCL细胞株OCI-LY1细胞周期阻滞在G0/G1期,抑制细胞增殖并诱导凋亡[212]. 携带A20基因双等位基因失活的DLBCL细胞系中A20的再表达导致细胞凋亡并损害NF-κB信号[211]. A20敲除后,T细胞中的NF-κB信号可以被CD3单独激活,而不是CD3/CD28共同刺激[213]. 然而,A20缺乏并不是我们所有NKTL队列的预后因素。它与高IPI亚组中较短的PFS相关[175].
MALT1的选择性抑制剂阻断了MALT1对CYLD的切割,该抑制剂在体内外抑制ABC-DLBCL细胞的生长[214]. 成人T细胞白血病/淋巴瘤(ATLL)细胞中也检测到CYLD异常,因为超磷酸化的CYRD失去了去除RIP1上泛素链的功能,导致NF-κB通路持续激活[215]. 此外,BTK抑制剂下调CYLD磷酸化可诱导非GCB-DLBCL的细胞凋亡和肿瘤生长抑制,尤其是在利妥昔单抗耐药的复发/难治病例中[216].
综上所述,NHL有多种类型,一些氘酶在某些类型的NHL中显示出重要意义。然而,去泛素酶在NHL中的发病机制作用以及相关的联合治疗仍需进一步研究。
血液恶性肿瘤中的DUB抑制剂
与E3连接酶不同,大多数DUB可以根据其半胱氨酸蛋白酶或金属蛋白酶进行给药[12,217]. 迄今为止,一些DUB,特别是USP家族中的DUB,已成功作为小分子抑制剂靶向,在体内外显示细胞毒性作用。除了潜在的治疗意义外,抑制剂的使用也大大有助于理解DUB在各种过程中的作用。在表中,我们列出了迄今为止已报道的DUB抑制剂,以及它们是否用于血液恶性肿瘤。
表1
化合物 | 结构 | DUB目标 | 报告年份和参考 | 血液学恶性肿瘤及参考文献 |
---|
PR-619型 | | 许多DUB | 2011 [218] | / |
SJB3-019A型 | | 美国药典1 | 2013年[65] | 反洗钱[65],毫米[139]、B-ALL[219] |
SJB2–043号 | | 反洗钱[65] |
ML323型 | | 2014 [220] | CML公司[221] |
ML364型 | | USP2、USP8 | 2016 [188] | 淋巴瘤[188] |
问题29 | | 美国药典2 | 2015 [222] | / |
LCAHA公司 | | 2017 [223] | / |
标准1吨 | | 2018 [224] | / |
6TG型 | | 2018 [225] | / |
伟哥灵A | | USP4、USP5、UCHL1 | 2013 [226] | / |
第5091页 | | USP7、USP47 | 2012 [148,227] | MM(毫米)[148,151],毫秒[228] |
{“类型”:“entrez-protein”,“属性”:{“文本”:“P22077”,“term_id”:“134707”,“term_text”:“P22077”}}第22077页 | | 2013 [229] | CML公司[23]、MDS[228]、反洗钱[73] |
HBX41108型 | | 美国药典7 | 2009 [230] | / |
GNE-6776、GNE-6640 | | 2017 [30] | 反洗钱[30] |
XL188型 | | 2017 [231] | / |
FT671、FT827 | | 2017年[232] | / |
第217564页 | | 2017 [233] | / |
化合物4 | | 2017 [31] | / |
XL177A型 | | 2020 [234] | / |
HY50737A、HY50796 | | USP7、USP8 | 2010 [235] | / |
HBX19818型 | | USP7、USP10 | 2012 [236] | 反洗钱[76] |
工作包1130 | | USP5、USP9X、USP14、UCHL1、UCHL5 | 2007 [237] | CML公司[37,38],毫米[141,156]、淋巴瘤[238]、反洗钱[239] |
9-(乙氧基亚氨基)-9H-茚并[1,2-b]吡嗪-2,3-二亚硝酸盐 | | 美国药典8 | 2010 [235] | / |
T5165804,CP2005 | | 美国药典9X | 2014 [157] | MM(毫米)[157] |
吴-5 | | 美国药典10 | 2020年[74] | 反洗钱[74] |
斯巴丁-1 | | USP10、USP13 | 2011 [240] | CML公司[39,241]、反洗钱[242] |
EOAI3402143公司 | | USP5、USP9X、USP24 | 2015 [156] | MM(毫米)[156] |
米托蒽醌 | | 美国药典11 | 2013年[243] | 反洗钱[244]、淋巴瘤[245] |
b-AP15 | | USP14、UCHL5 | 2011 [78] | 反洗钱[78,81],毫米[159,246]、DLBCL[192]、MCL[247] |
VLX1570型 | | 2015 [248] | MM(毫米)[248,249],全部[250] |
奥拉诺芬 | | 2014 [251] | MM(毫米)[252,253],全部[254]、CLL[255]、CML[256]、反洗钱[257],淋巴瘤[258,259] |
国际单位1 | | 美国药典14 | 2010 [260] | / |
IU1–248型 | | 2018 [261] | / |
RA-9型 | | 蛋白酶体相关DUB | 2014 [262] | / |
GSK2643943A型 | | 美国药典20 | 2016 [263] | / |
NCI677397号 | | 美国标准普尔24 | 2021 [264] | / |
AZ1型 | | USP25、USP28 | 2017 [265] | / |
15-氧螺菌内酯 | | 美国药典30 | 2014 [266] | / |
MF-094型 | | 2018 [267] | / |
LDN57444号 | | UCHL1、UCHL3 | 2003 [268] | / |
LDN91946号 | | UCHL1号机组 | 2007 [269] | / |
Z-VAE(Ome)-fmk | | 2012年[270] | / |
TCID公司 | | 第三次接触 | 2012 [271] | / |
NSC112200号 | | TRABID公司 | 2012 [272] | / |
BC-1471号 | | AMSH公司 | 2017 [273] | / |
卡普兹明 | | PSMD14/Rpn11 | 2017 [274] | MM(毫米)[274] |
硫鲁汀 | | 2017 [275] | / |
邻菲罗啉 | | 2017 [166] | MM(毫米)[166] |
标准操作规程10 | | 2018 [276] | / |
CSN5i-3型 | | CSN5号机组 | 2016 [206] | 淋巴瘤[206] |
国际BAP | | BAP1号机组 | 2021 [102] | 白血病[102] |
虽然DUB是治疗血液恶性肿瘤的有希望的药物靶点,但开发DUB特异性抑制剂并非易事。这是因为:1)DUB在其催化域中表现出复杂的结构特征以及家族成员之间的相似性,这使得其难以定位;2) 一些DUB具有高分子量,这导致晶体形成和获得完整晶体结构的困难;3) DUB在泛素结合后可能发生构象变化,表明其活性位点具有灵活性,这对小分子的预测和计算机模拟提出了挑战,导致效率低下;4) DUBs的调节机制是复杂的,涉及催化活性的变构调节和/或底物介导的催化。