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生物标记研究。2021; 9: 17.
2021年3月4日在线发布。 数字对象标识:10.1186/s40364-021-00270-3号
预防性维修识别码:项目管理委员会7934371
PMID:33663588

抑制BCL11B诱导PTK7下调导致T细胞急性淋巴细胞白血病生长迟缓和凋亡

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摘要

T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)是一种预后不良的侵袭性白血病亚型,对该病迫切需要生物标志物和新的治疗靶点。我们以前的研究发现,抑制B细胞白血病/淋巴瘤11B(BCL11B公司)该基因可显著促进T-ALL细胞的凋亡和生长迟缓,但其作用的分子机制尚不清楚。本研究旨在研究BCL11B公司并进一步探讨其在T-ALL细胞中的作用。我们发现了泰国国家电力公司7是潜在的下游目标BCL11B公司在T-ALL中。与健康人(HI)相比,泰国国家电力公司7在T-ALL细胞中过度表达,并且BCL11B公司表达与泰国国家电力公司7表达式。重要的是,BCL11B公司降低击倒泰国国家电力公司7在T-ALL细胞中表达。类似于BCL11B公司沉默,下调泰国国家电力公司7通过上调肿瘤坏死因子(TNF)相关凋亡诱导配体的表达抑制Molt-4细胞增殖和诱导凋亡(TRAIL(跟踪))和第27页总之,我们的研究表明泰国国家电力公司7是潜在的下游目标BCL11B公司和下调泰国国家电力公司7通过抑制BCL11B公司该途径诱导T-ALL细胞生长迟缓和凋亡。

补充信息

在线版本包含补充材料,可访问10.1186/s40364-021-00270-3。

致编辑:

B细胞白血病/淋巴瘤11B(BCL11B公司)基因在T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)的发生发展中起着重要作用[1,2]. 我们以前的研究表明BCL11B公司有效抑制T-ALL细胞增殖并诱导其凋亡[,4]. 蛋白酪氨酸激酶7(PTK7)是sgc8 DNA适配体的靶蛋白,已被确定为T-ALL的潜在生物标志物[5]. 然而BCL11B公司以及两者之间的关系BCL11B公司泰国国家电力公司7保持未定义状态。在本研究中,我们确定了BCL11B公司使用基因表达总表(GEO)数据库对T-ALL患者的靶基因进行研究,并使用特异性siRNAs(小干扰核糖核酸)下调T-ALL细胞系中该基因的表达,以探讨其机制。

共使用GEO数据库中的220名新发T-ALL患者和我们中心的36名T-ALL外周血单个核细胞(PBMC)进行分析和验证。GSE13159标准GSE28497标准数据集,我们发现BCL11B公司在T-ALL中高度表达(P(P) < 0.001,图1a和S1a) ●●●●。这些结果与我们之前的研究一致[6]. 此外泰国国家电力公司7在中找到GSE13159标准,GSE28497标准和PBMC(P(P) < 0.05,图1a-b和S1b) ,这也与之前的报告一致[7]. 接下来,确定BCL11B公司,的BCL11B公司通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)进一步表征共表达网络。有趣的是,生物信息学分析[8]在表达BCL11B公司泰国国家电力公司7在里面GSE13159标准,GSE28497标准和PBMC(P(P) < 0.05,图1b-c和S1c) ●●●●。此外,我们研究了BCL11B公司泰国国家电力公司7来自癌症细胞系百科全书(CCLE)的不同细胞系。以前的研究表明BCL11B公司在急性型成人T细胞白血病/淋巴瘤(ATLL)中过度表达,在其他淋巴瘤类型中表达不足。一致地,BCL11B公司泰国国家电力公司7在T-ALL细胞系中高表达,但在淋巴瘤细胞系中低表达(图1d-e)。根据这些发现,我们建议泰国国家电力公司7可能是一个重要的基因下游BCL11B公司在T-ALL中。

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之间的正相关BCL11B公司泰国国家电力公司7T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)。()的表达式级别BCL11B公司(左侧面板)和泰国国家电力公司7(右面板)T-ALL患者和健康个体GSE13159标准数据集。(b条)验证以下各项之间的相关性BCL11B公司泰国国家电力公司7。的表达式级别泰国国家电力公司7T-ALL患者和His患者PBMC中的基因(左侧面板)。线性相关分析BCL11B公司泰国国家电力公司7T-ALL样本中的基因(右侧面板)。(c(c)BCL11B公司泰国国家电力公司7GSE13159标准数据集。左面板:通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)获得共表达模块。树状图下方的彩色行显示由动态树切割确定的模块分配。聚类树状图显示,在11个共表达网络模块中富集了10459个差异表达基因,而BCL11B公司泰国国家电力公司7位于同一个蓝色模块中。右侧面板:检测到BCL11B公司泰国国家电力公司7.两者BCL11B公司(d日)和泰国国家电力公司7(e(电子))与淋巴瘤细胞系相比,T-ALL高表达。数据通过癌症细胞系百科全书(CCLE)获得。详细方法见附加文件中的材料和方法1

我们试图进一步核实BCL11B公司泰国国家电力公司7在T-ALL和非T-ALL细胞系中的mRNA和蛋白质水平。如图所示2a、,BCL11B公司泰国国家电力公司7mRNA在T-ALL细胞系(Jurkat和Molt-4)中高度表达,但在BCL11B公司-阴性Burkitt淋巴瘤细胞系(Raji)。接下来,使用适体来测定泰国国家电力公司7在Jurkat和Raji细胞中。Sgc-8是PTK7特异性适配体,用Cy5荧光报告子标记,并在不同浓度下与Jurkat和Raji细胞孵育,这表明Cy5-Sgc8特异性地结合到Jurkat细胞,但与Razi细胞没有反应(图2b) ●●●●。令人兴奋的是泰国国家电力公司7沉默后的mRNA表达BCL11B公司Jurkat和Molt-4细胞以及脐血(CB)CD3+T细胞中的表达(图2c-d)。这些结果证实了泰国国家电力公司7可能受BCL11B公司T-ALL细胞系和人CD3+T细胞中的信号通路。基于上述结果,我们试图进一步了解泰国国家电力公司7在T-ALL细胞中。与阴性对照组相比,转染泰国国家电力公司7-siRNA显著减少(P(P) < 0.01,图2e-f)。同时,Annexin V/PI-阳性细胞显示泰国国家电力公司7-siRNA转染Molt-4细胞,达到34.66±5.21%(P(P) = 0.008,图2g) ●●●●。此外,最近的报告显示肿瘤坏死因子(TNF)相关的凋亡诱导配体(TRAIL(跟踪))和第27页被发现与BCL11B公司调控细胞周期和凋亡的途径[,9,10]. 有趣的是,TRAIL和p27的表达水平在泰国国家电力公司7-siRNA组,这与BCL11B公司-siRNA组(图2h) ●●●●。这些数据表明泰国国家电力公司7是下游BCL11B公司T-ALL细胞生长和凋亡的靶基因。

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下调泰国国家电力公司7诱导细胞生长迟缓和凋亡。()BCL11B公司泰国国家电力公司7T-ALL(Jurkat和Molt-4)和非T-ALL(Raji)细胞系中的mRNA表达水平。GAPDH公司用作内生引用。(b条)用不同浓度的Cy5-Sgc8处理培养的Jurkat和Raji细胞1h。流式细胞术分析Cy5-Sgc8与Jurkat细胞的特异性细胞结合。(c(c))的表达式泰国国家电力公司748小时后在T-ALL细胞系中BCL11B公司siRNA转染。(d日)的影响BCL11B公司siRNA在BCL11B公司转染CB CD3+T细胞48小时后实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测mRNA表达水平。使用阴性对照siRNA处理的细胞进行比较。(e(电子))在敲除后分析Molt-4细胞中的敲除效率泰国国家电力公司7基因。((f))将si转染Molt-4细胞-泰国国家电力公司7然后用细胞计数试剂盒-8(CCK-8)检测细胞增殖。()用流式细胞术检测转染si-PTK7的Molt-4细胞48h后的凋亡情况(小时)的表达式TRAIL(跟踪)第27页转染后48小时Molt-4细胞中的基因BCL11B公司siRNA和泰国国家电力公司7小干扰RNA。非特异性siRNA处理细胞作为阴性对照。星号表示具有统计学意义的差异(***,P(P) < 0.001; **,P(P) < 0.01; *,P(P) < 0.05)

总之,这是第一份报告,表明泰国国家电力公司7是一个重要的功能下游靶基因BCL11B公司在T-ALL中。我们的研究为目标定位提供了理论依据BCL11B/PTK7在T细胞恶性肿瘤治疗学的发展中。

致谢

不适用。

缩写

BCL11B公司B细胞白血病/淋巴瘤11B
CCLE公司癌细胞系百科全书
地理位置基因表达综合数据库
夏威夷群岛健康的个人
泰国国家电力公司7蛋白酪氨酸激酶受体7
多溴联苯胺外周血单核细胞
小干扰RNA小干扰核糖核酸
T-ALL公司T细胞急性淋巴细胞白血病
TRAIL(跟踪)肿瘤坏死因子(TNF)相关凋亡诱导配体
WGCNA公司加权基因共表达网络分析

作者的贡献

李克翰(Kehan Li)、陈存特(Cunte Chen)和高日丽(Rili Gao)进行了实验,撰写了论文,并对数据进行了分析。余喜宝、黄友雪、陈征、刘专迪、陈少华和黄鑫帮助分析了数据。罗庚新提供了原代细胞和患者信息。Grzegorz K.Przybelski、Li Yangqiu和Zeng Chengwu设计了研究并撰写了手稿。所有作者阅读并批准了最终手稿。

基金

这项工作得到了中国科技部政府间国际科技创新合作项目(No.2017YFE013160)、广东省科技计划(No.2020A0505100042)、波兰国家科学中心(No.DEC-2013/09/B/NZ1/01867)(GKP.)的资助,波兰国家研究与发展中心(编号:WPC1/BCL/2019)(GKP)、中国国家自然科学基金会(编号:81770158)和中国广州珠江科技新星计划(编号:201906010002)。

数据和材料的可用性

可根据要求提供数据。

声明

道德批准和参与同意

本研究得到暨南大学附属医院伦理委员会的批准。所有患者均获得书面知情同意书。

出版同意书

不适用。

竞争性利益

作者声明,他们没有相互竞争的利益。

脚注

出版商笔记

Springer Nature在公布的地图和机构关联中的管辖权主张方面保持中立。

李克翰、陈存德和高日丽为这项工作做出了同等贡献。

参与者信息

Grzegorz K.Przybelski,lp.nanzop.zcgi@ikslybyzrp.zrogezrg

李阳秋,moc.liamtoh@iluiqgnay公司

曾成武,moc.361@wcz-oib

工具书类

1Ha VL、Luong A、Li F、Casero D、Malvar J、Kim YM等。T-ALL相关基因BCL11B调节人类T细胞分化的初始阶段。白血病。2017;31(11):2503–2514. doi:10.1038/leu.2017.70。 [PMC免费文章][公共医学] [交叉参考][谷歌学者]
2Li L,Leid M,Rothenberg EV.依赖于转录因子Bcl11b的早期T细胞谱系承诺检查点。科学。2010;329(5987):89–93. doi:10.1126/science.1188989。 [PMC免费文章][公共医学] [交叉参考][谷歌学者]
三。Grabarczyk P、Przybyski GK、Depke M、Völker U、Bahr J、Assmus K等。抑制BCL11B表达导致恶性但非正常成熟T细胞凋亡。致癌物。2007;26(26):3797–3810. doi:10.1038/sj.onc.1210152。[公共医学] [交叉参考][谷歌学者]
4Huang X,Chen S,Shen Q,Chen S.,Yang L,Grabarczyk P,等。BCL11B表达下调通过BCL11B-935-siRNA抑制恶性T细胞增殖并诱导细胞凋亡。血液学。2011;16(4):236–242. doi:10.1179/102453311X13025568941961。[公共医学] [交叉参考][谷歌学者]
5Zhang Y,Li M,Gao X,Chen Y,Liu T.纳米技术在癌症诊断中的进展、挑战和机遇。血液肿瘤学杂志。2019;12(1):137. doi:10.1186/s13045-019-0833-3。 [PMC免费文章][公共医学] [交叉参考][谷歌学者]
6黄旭,陈S,沈Q,杨磊,李斌,钟磊,等。T细胞急性淋巴细胞白血病患者BCL11B基因及其亲属的表达模式分析。血液肿瘤学杂志。2010;(1):44. doi:10.1186/1756-8722-3-44。 [PMC免费文章][公共医学] [交叉参考][谷歌学者]
7姜刚,张明,岳B,杨明,卡特C,阿尔库兰SZ,等。PTK7:成熟T细胞和T细胞急性淋巴细胞白血病免疫表型特征的新生物标记物。Leuk研究。2012;36(11):1347–1353. doi:10.1016/j.leukres.2012.07.004。 [PMC免费文章][公共医学] [交叉参考][谷歌学者]
8Chen C,Liang C,Wang S,Chio C,Zhang Y,Zeng C,等。急性髓细胞白血病免疫检查点的表达模式。血液肿瘤学杂志。2020;13(1):28. doi:10.1186/s13045-020-00853-x。 [PMC免费文章][公共医学] [交叉参考][谷歌学者]
9Kamimura K、Mishima Y、Obata M、Endo T、Aoyagi Y、Kominami R。缺乏Bcl11b肿瘤抑制因子会导致DNA复制应激和损伤的脆弱性。致癌物。2007;26(40):5840–5850. doi:10.1038/sj.onc.120388。[公共医学] [交叉参考][谷歌学者]
10聂毅,陆伟,陈德,涂赫,郭Z,周X,等。抗CD19 CAR T细胞治疗后CD19阳性ALL复发的机制及相关策略。生物标记研究。2020;8:18.doi:10.1186/s40364-020-00197-1。 [PMC免费文章][公共医学] [交叉参考][谷歌学者]

文章来自生物标志物研究由以下人员提供BMC公司