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B细胞白血病/淋巴瘤11B(BCL11B公司)基因在T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)的发生发展中起着重要作用[1,2]. 我们以前的研究表明BCL11B公司有效抑制T-ALL细胞增殖并诱导其凋亡[三,4]. 蛋白酪氨酸激酶7(PTK7)是sgc8 DNA适配体的靶蛋白,已被确定为T-ALL的潜在生物标志物[5]. 然而BCL11B公司以及两者之间的关系BCL11B公司和泰国国家电力公司7保持未定义状态。在本研究中,我们确定了BCL11B公司使用基因表达总表(GEO)数据库对T-ALL患者的靶基因进行研究,并使用特异性siRNAs(小干扰核糖核酸)下调T-ALL细胞系中该基因的表达,以探讨其机制。
共使用GEO数据库中的220名新发T-ALL患者和我们中心的36名T-ALL外周血单个核细胞(PBMC)进行分析和验证。在{“类型”:“entrez-geo”,“属性”:{“文本”:“GSE13159”,“term_id”:“13159”}}GSE13159标准和{“类型”:“entrez-geo”,“属性”:{“文本”:“GSE28497”,“term_id”:“28497”}}GSE28497标准数据集,我们发现BCL11B公司在T-ALL中高度表达(P(P) < 0.001,图a和S1a) ●●●●。这些结果与我们之前的研究一致[6]. 此外泰国国家电力公司7在中找到{“类型”:“entrez-geo”,“属性”:{“文本”:“GSE13159”,“term_id”:“13159”}}GSE13159标准,{“类型”:“entrez-geo”,“属性”:{“文本”:“GSE28497”,“term_id”:“28497”}}GSE28497标准和PBMC(P(P) < 0.05,图a-b和S1b) ,这也与之前的报告一致[7]. 接下来,确定BCL11B公司,的BCL11B公司通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)进一步表征共表达网络。有趣的是,生物信息学分析[8]在表达BCL11B公司和泰国国家电力公司7在里面{“类型”:“entrez-geo”,“属性”:{“文本”:“GSE13159”,“term_id”:“13159”}}GSE13159标准,{“类型”:“entrez-geo”,“属性”:{“文本”:“GSE28497”,“term_id”:“28497”}}GSE28497标准和PBMC(P(P) < 0.05,图b-c和S1c) ●●●●。此外,我们研究了BCL11B公司和泰国国家电力公司7来自癌症细胞系百科全书(CCLE)的不同细胞系。以前的研究表明BCL11B公司在急性型成人T细胞白血病/淋巴瘤(ATLL)中过度表达,在其他淋巴瘤类型中表达不足。一致地,BCL11B公司和泰国国家电力公司7在T-ALL细胞系中高表达,但在淋巴瘤细胞系中低表达(图d-e)。根据这些发现,我们建议泰国国家电力公司7可能是一个重要的基因下游BCL11B公司在T-ALL中。
我们试图进一步核实BCL11B公司和泰国国家电力公司7在T-ALL和非T-ALL细胞系中的mRNA和蛋白质水平。如图所示a、,BCL11B公司和泰国国家电力公司7mRNA在T-ALL细胞系(Jurkat和Molt-4)中高度表达,但在BCL11B公司-阴性Burkitt淋巴瘤细胞系(Raji)。接下来,使用适体来测定泰国国家电力公司7在Jurkat和Raji细胞中。Sgc-8是PTK7特异性适配体,用Cy5荧光报告子标记,并在不同浓度下与Jurkat和Raji细胞孵育,这表明Cy5-Sgc8特异性地结合到Jurkat细胞,但与Razi细胞没有反应(图b) ●●●●。令人兴奋的是泰国国家电力公司7沉默后的mRNA表达BCL11B公司Jurkat和Molt-4细胞以及脐血(CB)CD3+T细胞中的表达(图c-d)。这些结果证实了泰国国家电力公司7可能受BCL11B公司T-ALL细胞系和人CD3+T细胞中的信号通路。基于上述结果,我们试图进一步了解泰国国家电力公司7在T-ALL细胞中。与阴性对照组相比,转染泰国国家电力公司7-siRNA显著减少(P(P) < 0.01,图e-f)。同时,Annexin V/PI-阳性细胞显示泰国国家电力公司7-siRNA转染Molt-4细胞,达到34.66±5.21%(P(P) = 0.008,图g) ●●●●。此外,最近的报告显示肿瘤坏死因子(TNF)相关的凋亡诱导配体(TRAIL(跟踪))和第27页被发现与BCL11B公司调控细胞周期和凋亡的途径[三,9,10]. 有趣的是,TRAIL和p27的表达水平在泰国国家电力公司7-siRNA组,这与BCL11B公司-siRNA组(图h) ●●●●。这些数据表明泰国国家电力公司7是下游BCL11B公司T-ALL细胞生长和凋亡的靶基因。
下调泰国国家电力公司7诱导细胞生长迟缓和凋亡。(一)BCL11B公司和泰国国家电力公司7T-ALL(Jurkat和Molt-4)和非T-ALL(Raji)细胞系中的mRNA表达水平。GAPDH公司用作内生引用。(b条)用不同浓度的Cy5-Sgc8处理培养的Jurkat和Raji细胞1h。流式细胞术分析Cy5-Sgc8与Jurkat细胞的特异性细胞结合。(c(c))的表达式泰国国家电力公司748小时后在T-ALL细胞系中BCL11B公司siRNA转染。(d日)的影响BCL11B公司siRNA在BCL11B公司转染CB CD3+T细胞48小时后实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测mRNA表达水平。使用阴性对照siRNA处理的细胞进行比较。(e(电子))在敲除后分析Molt-4细胞中的敲除效率泰国国家电力公司7基因。((f))将si转染Molt-4细胞-泰国国家电力公司7然后用细胞计数试剂盒-8(CCK-8)检测细胞增殖。(克)用流式细胞术检测转染si-PTK7的Molt-4细胞48h后的凋亡情况(小时)的表达式TRAIL(跟踪)和第27页转染后48小时Molt-4细胞中的基因BCL11B公司siRNA和泰国国家电力公司7小干扰RNA。非特异性siRNA处理细胞作为阴性对照。星号表示具有统计学意义的差异(***,P(P) < 0.001; **,P(P) < 0.01; *,P(P) < 0.05)
总之,这是第一份报告,表明泰国国家电力公司7是一个重要的功能下游靶基因BCL11B公司在T-ALL中。我们的研究为目标定位提供了理论依据BCL11B/PTK7在T细胞恶性肿瘤治疗学的发展中。