癌症科学。 2012年6月; 103(6): 1010–1021.
通过 空气污染指数 大肠癌的基因突变 , 1 , 1 , 1 , 1 , 1 , 1 和 1 , 2 , 三 Tomoo Yoshie公司
1 胃肠科, 内科, 神户大学医学研究生院, 科比 日本
Shin Nishiumi先生
1 胃肠科, 内科, 神户大学医学研究生院, 科比 日本
岩井义弘
1 胃肠科, 内科, 神户大学医学研究生院, 科比 日本
阿亚·萨凯
1 胃肠科, 内科, 神户大学医学研究生院, 科比 日本
井上俊
1 消化科, 内科, 神户大学医学研究生院, 科比 日本
武士·阿祖玛
1 胃肠科, 内科, 神户大学医学研究生院, 科比 日本
吉田正男(Masaru Yoshida)
1 胃肠科, 内科, 神户大学医学研究生院, 科比 日本
2 质谱综合中心, 神户大学医学研究生院, 科比 日本
三 代谢组学研究部, 神户大学医学研究生院, 科比 日本
1 胃肠科, 内科, 神户大学医学研究生院, 科比 日本
2 质谱综合中心, 神户大学医学研究生院, 科比 日本
三 代谢组学研究部, 神户大学医学研究生院, 科比 日本
通讯作者。 2011年10月21日收到; 2012年2月22日修订; 2011年2月26日接受。
补充资料
表S1。 血清中检测到的代谢物 空气污染指数
最小值/+ 小鼠和野生型小鼠。
GUID:1581F7B0-8CDA-4F2E-89C6-66217894BB54
表S2。 组织中检测到的代谢物 空气污染指数
最小值/+ 小鼠和野生型小鼠。
GUID:4B5FE9BF-DC2C-4E37-BEB0-C01855E8DA1C
表S3。 在中检测到的代谢物 软件 480个截断单元格 空气污染指数 和全长 空气污染指数 .
GUID:784705F3-D27A-487B-8DA3-DFE2A1FDFC67
表S4。 血清中检测到的代谢物 HT(高温) ‐29细胞移植裸鼠。
GUID:EC79FEE4-F341-49EC-8213-4DF16628FDA4
表S5。 血清中检测到的代谢物 软件 480个截断单元格 空气污染指数 ‐或全长 空气污染指数 植入裸鼠。
GUID:816A7AB2-F76E-4A34-AF1D-BDF5B83AAB4D
摘要 基因突变 空气污染指数 基因发生在结直肠癌发展的早期阶段。 为了获得对细胞异常激活机制的新见解 W公司 伴随的nt途径 空气污染指数 突变后,我们进行了基于气相色谱-质谱的半定量代谢组分析。 体外 实验比较 软件 480个细胞表达正常 空气污染指数 并被截断 空气污染指数 表明参与细胞内三羧酸循环后期阶段的代谢物水平,包括琥珀酸、富马酸和苹果酸,在 软件 480个细胞表达截短的 空气污染指数 。在 体内 研究中,我们发现大多数氨基酸在非息肉组织中的水平较高 空气污染指数
最小值/+ 小鼠的正常组织和息肉组织中 空气污染指数
最小值/+ 老鼠。 核糖醇,其水平在 空气污染指数
最小值/+ 老鼠和 软件 480个细胞表达截断的 空气污染指数 ,减少了 软件 480个细胞 空气污染指数 突变,但不影响 软件 表达全长的480个转染体 空气污染指数 。发现息肉组织中的肌氨酸水平显著高于 空气污染指数
最小值/+ 小鼠的非息肉组织和对照小鼠的正常组织,以及 软件 480个含有50μM肌氨酸的细胞的生长速度显著提高。 这些发现表明 空气污染指数 突变导致能量代谢途径的改变,这些改变可能与结直肠癌的发生有关。 ( 癌症科学 2012; 103: 1010–1021)
结直肠癌是最常见的癌症之一,是美国第二大癌症死亡原因,也是日本第三大癌症死亡因素。 1 日本东京国家癌症中心医院(National Cancer Center Hospital,Tokyo,Japan)估计,I期结直肠癌患者的5年生存率超过90%,但随着疾病阶段的进展,生存率会下降。 为了降低结直肠癌的死亡率,全世界都在研究新的筛查方法,特别是早期疾病的筛查方法和晚期疾病的新药物治疗方法。 大多数恶性结直肠癌起源于先前存在的良性腺瘤。 结直肠癌的发病率与癌基因和抑癌基因突变的多步骤积累有关。 2 , 三 基因突变 空气污染指数 基因出现在结直肠癌的早期阶段, 4 该基因被认为是结直肠癌发生的把关者。 2 中的突变 空气污染指数 该基因也与家族性腺瘤性息肉病(FAP)有关。 5 , 6 , 7 这是一种常染色体显性遗传疾病,通常会导致成百上千的大肠腺瘤。 此外,80-90%的散发性结直肠癌患者显示 空气污染指数 突变。 APC蛋白通过帮助β-catenin的降解负调控Wnt途径,而 空气污染指数 突变导致β-catenin的稳定和Wnt通路的激活。 稳定的β‐catenin促进Wnt靶基因的转录,然后导致异常细胞增殖。 最近,蛋白质组分析显示,小鼠肝脏中β-catenin的激活可能影响葡萄糖代谢, 8 因此,对由以下因素引起的代谢物变化的研究 空气污染指数 突变可能有助于阐明结直肠癌发生的机制。
截至2003年底,人类基因组已被完全鉴定。 蛋白质组学从此得到了深入研究。 2002年,Petricoin 等 . 9 利用蛋白质组分析发现了一种有效的卵巢癌诊断标志物,包括I期疾病。 因此,“临床蛋白质组学”应运而生,自那时以来,许多研究人员试图将蛋白质组学分析应用于医学领域,以找到有效的诊断标记并阐明未知的病理状况。 此外,还开发了代谢组学,这是对低分子量代谢物的综合研究。 在代谢组学的临床研究中,Sreekumar 等 . 10 利用高通量液相色谱-质谱和气相色谱-色谱-质谱联用技术(GCMS)揭示,肌氨酸是前列腺癌细胞侵袭性和侵袭性的潜在重要代谢中介因子。 此外,代谢组学在研究诊断生物标志物和/或阐明肺癌、胃肠道癌、胰腺癌和炎症性肠病的病理条件方面的价值也得到了证明。 11 , 12 , 13 , 14 , 15 , 16 , 17
在这项研究中,我们使用了APC 最小值/+ 小鼠和人结直肠癌细胞移植裸鼠。 APC多发性肠道肿瘤 最小值 )是第一个可遗传的突变体 空气污染指数 在小鼠中诱导的等位基因。 18 空气污染指数 最小值/+ 小鼠出现许多类似人类FAP的肠道病变,是研究结肠肿瘤发生中恶性转化的有用模型。 19 众所周知,植入人类肿瘤的裸鼠不仅保持其组织学外观,还保持其功能机制。 体外 实验使用表达截短APC的SW480人上皮性结直肠癌细胞和表达全长APC的SW480转染体进行。 APC的代谢组学分析 最小值/+ 小鼠、人结直肠癌细胞移植裸鼠、SW480细胞和SW480转染体通过GCMS进行检测,以及结直肠癌、, 空气污染指数 评估突变和代谢物水平。
材料和方法 细胞培养和治疗 Maree C.Faux博士(澳大利亚墨尔本路德维希癌症研究所)捐赠了表达截短APC的SW480细胞和表达全长APC的SW480转染体。 20 培养基由添加10%FBS、1%青霉素-链霉素和1.25 mg/mL G418的RPMI‐1640培养基组成。 细胞以5×10的速度生长 4 /在96孔板中培养24小时,然后暴露于阿拉伯糖醇、肌醇、核糖醇、L-脯氨酸、异亮氨酸、2-羟基丁酸、3-羟基丙酸和肌氨酸。 24小时后,将细胞计数试剂盒-8(日本熊本Dojindo实验室)提供的10μL溶液添加到平板的每个孔中,以评估细胞生长。
动物和实验设计 本研究中的所有治疗均由动物护理和使用委员会批准,并按照神户大学动物实验条例进行。 雌性6–8周龄C57BL/6J小鼠购自日本静冈(Clea Japan)。 空气污染指数 最小值/+ 小鼠取自杰克逊实验室(美国缅因州巴尔港)。 空气污染指数 最小值/+ 具有C57BL/6J背景的小鼠通过繁殖Min等位基因与雌性野生型C57BL/6J小鼠杂合的雄性小鼠来维持。 所有小鼠均在神户大学医学院动物研究所(日本神户)按照批准的实验方案在特定的无病原体设施中饲养和繁殖。 杀死小鼠,通过心脏穿刺收集其血液,然后通过3000离心分离其血清 克 在4°C下保持10分钟。 小肠的肠息肉和非息肉区域来自APC 最小值/+ 用显微镜观察老鼠。 正常小肠组织取自野生型C57BL/6J小鼠。
BALB/cAJc1‐nu/nu小鼠购自Clea Japan。 将人上皮性结肠癌HT-29细胞、表达截短APC的SW480细胞和表达全长APC的SW480转染体以2×10的剂量皮下植入6周龄雄性裸鼠体内 6 每只老鼠的细胞数。 在发现植入肿瘤扩大后,处死小鼠,通过心脏穿刺收集血液,然后分离血清。
组织学检查 将小鼠的肠组织解剖并用10%福尔马林固定,然后将石蜡包埋组织切片至5μm,并用H&E盲法染色。 使用显微镜(BX51;Olympus,Tokyo,Japan)观察切片。
样品采集和制备 根据我们之前报告中描述的方法,从血清中提取低分子量代谢物以及用于GCMS测量的预处理程序。 11 , 12 , 13 , 14 , 15 , 16 , 21
收集到的肠息肉、非息肉和正常组织在使用前保存在−80°C。 为了提取低分子量代谢物,将10 mg组织转移到干净的试管中,并在1000μL溶剂混合物(MeOH:H)中均质 2 O:氯甲烷 三 = 2.5:1:1). 然后将10μL 0.5 mg/mL 2-异丙基苹果酸(Sigma‐Aldrich,St.Louis,MO,USA)添加到每个试管中,并将混合物充分混合。 随后在37°C下以1200 rpm的转速摇晃混合物30分钟,然后在16000下离心 克 在4°C下保持3分钟。 将所得上清液(900μL)分别收集在干净的试管中。 然后450μL CHCl 三 在16000离心之前加入上清液 克 在4°C下保持3 min,并在干净的试管中分别收集500μL所得上清液。 将蒸馏水(200μL)添加到收集的上清液中,然后在16 000下离心 克 在4°C下保持3 min,并在干净的试管中分别收集500μL所得上清液。 然后,在肟化和衍生化之前,使用冷冻干燥器将收集的上清液冻干。 GCMS测量的肟化和后续衍生化是根据我们之前报告中描述的方法进行的。 11 , 12 , 13 , 14 , 15 , 16 , 21
用Krebs–Ringer HEPES缓冲液清洗SW480细胞和SW480转染体(70%–80%合流)两次并收集。 细胞在计数前用Krebs–Ringer HEPES缓冲液清洗两次,并收集在干净的试管中,然后用H清洗 2 O并使用冷冻干燥机进行冷冻干燥。 低分子量代谢物的提取和用于GCMS测量的预处理程序是根据我们之前报告中描述的方法进行的。 11 , 12 , 13 , 14 , 15 , 16 , 21
分析使用 GC公司 / 微软 和数据处理 根据之前报告中描述的方法, 21 GC/MS分析使用GCMS‐QP2010 Ultra(日本京都岛津)和熔融石英毛细管柱(CP‐SIL 8 CB低渗/MS,30 m×0.25 mm[内径],膜厚0.25μm;美国加利福尼亚州帕洛阿尔托安捷伦科技公司)进行。 使用MetAlign软件(Wageningen UR, http://www.pri.wur.nl/UK/products/MetAlign网站/ )和内部分析软件(AIoutput),如前一份报告所述。 22 对于半定量,使用2-异丙基苹果酸的峰高作为内部标准,计算并归一化每个离子的峰高。 在GC/MS分析中,由于三甲硅基(TMS)衍生化、异构体等原因,有时会检测到特定代谢物的多个峰。在这种情况下,采用最能反映代谢物水平的峰进行半定量评估。
蛋白质印迹分析 如我们之前的报告所述,从培养细胞中提取蛋白质,然后使用抗APC抗体(美国加州圣克鲁斯圣克鲁斯生物技术公司)和抗β肌动蛋白抗体(Sigma‐Aldrich)进行免疫印迹。 22
统计分析 结果表示为平均值±SE。 使用Student’s t吨 检验,概率水平0.05被用作显著性的标准。
结果 分析由 空气污染指数 突变,我们使用基于GCMS的代谢组分析,并评估APC组织和/或血清中代谢物的相对水平 最小值/+ 小鼠、SW480细胞和人类结直肠癌细胞植入裸鼠。 如图所示 (A) 51种代谢物在组织、血清和培养细胞中共享,在我们的分析系统中,检测到的代谢物的化学类别在血清、组织和培养细胞之间的分布相似(图 B–D)。
代谢组分析 空气污染指数
最小值/+ 小鼠和 软件 480人上皮性结直肠癌细胞。 (A) 基于血清和组织中检测到的代谢物的维恩图 空气污染指数
最小值/+ 小鼠、相应的对照小鼠,以及 软件 480个单元格。 圆图表示在血清(B)、组织(C)和 软件 480个单元格(D)。 其他包括胺、杂环、杂环分子、酮和醛。 括号中的值表示总数的百分比。
血清和息肉的代谢物分析 空气污染指数
最小值/+ 老鼠 用H&E染色进行组织病理学检查(图 C) 在APC的息肉病变中发现以细胞异型增生为特征的腺瘤增生 最小值/+ 小鼠及其部分非息肉病变。 从APC的血清和肠道组织中提取低分子量代谢物 最小值/+ 小鼠和相应的对照小鼠的血清和肠道组织中分别检测到126和131种代谢物(图 ,表S1、S2)。 在这些检测到的代谢物中,88种代谢物在组织和血清中共享(图 A) ●●●●。 在APC的血清中 最小值/+ 与相应的对照小鼠相比,44和27种代谢物的水平分别显著增加和减少(表 ). APC息肉病变 最小值/+ 与相应对照小鼠正常肠道组织中的代谢产物相比,25种代谢产物的水平显著增加,18种代谢产物水平降低(表 ). 此外,APC息肉病变中15和24种代谢物的水平分别显著升高和降低 最小值/+ 小鼠与APC非息肉病变小鼠的比较 最小值/+ 小鼠(表 ). 这些结果表明,血清和组织的代谢产物谱在 空气污染指数 突变小鼠和相应的对照小鼠。
基因突变 空气污染指数 基因导致消化道腺瘤的发生。 (A) 软件 480个大肠癌细胞表达截断 空气污染指数 和 软件 表达全长的480个转染体 空气污染指数 用抗β-catenin抗体进行免疫组化分析。 显示了具有代表性的图像。 绿色,β-catenin。 放大倍数,×200。 (B) 软件 480个细胞表达截断 空气污染指数 和 软件 表达全长的480个转染体 空气污染指数 进行Western blot分析 空气污染指数 抗体和抗‐β-actin抗体。 显示了具有代表性的图像。 (C) 小肠组织采集自 空气污染指数
最小值/+ 患有非息肉和息肉病变以及C57的小鼠 BL公司 /6 J型 小鼠和 H(H) & E类 染色。 显示了具有代表性的图像。 放大倍数,×100。
表1 血清水平在 空气污染指数
最小值/+ 小鼠和野生型小鼠
化学类别 折叠感应
P(P) ‐价值 空气污染指数 最小值/+ /控制 空气污染指数 最小值/+ 与控制相比 1-十六醇 醇和多元醇 4.56 <0.00001* 2-氨基丁酸 氨基酸 2.74 0.00081* 2-脱氢‐ d‐ 葡萄糖酸盐 羟基酸 1.21 0.04400* 2′-脱氧尿苷 核苷类似物 2.41 0.01200* 3,4-二羟基扁桃酸 羟基酸 1.27 0.00240* 3-羟基异戊酸 羟基酸 1.40 0.04700* 4-羟基扁桃酸盐 芳香酸 3.05 0.07700* 腺嘌呤 嘌呤和嘌呤衍生物 2.01 0.00010* 丙氨酸 氨基酸 2.01 0.00010* 邻氨基苯甲酸 氨基酸 2.75 0.00045* 阿拉伯糖-5-磷酸盐 碳水化合物 0.24 0.00230* 阿糖醇 醇和多元醇 0.27 0.00006* 抗坏血酸 羟基酸 5.27 0.00011* α‐山梨糖(或果糖) 碳水化合物 0.25 0.01600* 天门冬氨酸 氨基酸 1.98 0.00220* β-丙氨酸 氨基酸 0.49 0.00071* 苯甲酸 芳香酸 3.03 <0.00001* β‐谷氨酸 氨基酸 0.86 0.04800* β-乳糖 碳水化合物 2.06 0.00260* 瓜氨酸 氨基酸 2.24 0.00019* 针叶醛 羟基酸 17.90 0.00023* 半胱氨酸+胱氨酸 氨基酸 1.79 0.00058* 多帕 儿茶酚胺及其衍生物 0.50 0.02100* 果糖 碳水化合物 0.60 0.00032* 果糖-6-磷酸 磷酸糖 0.63 0.02400* 半乳糖胺 碳水化合物 4.40 <0.00001* 半乳糖 碳水化合物 0.78 0.00330美元* 半乳糖醛酸 羟基酸 0.56 0.00024* 葡萄糖酸盐 二羧酸 1.54 0.00150* 氨基葡萄糖 氨基糖苷类 1.78 0.00440* 葡萄糖醛酸盐 碳水化合物 0.57 0.00058* 谷氨酰胺 氨基酸 1.35 0.03300* 甘油酸 羟基酸 0.75 0.00300* 甘油 醇和多元醇 0.61 0.00037* 乙醇酸 羟基酸 0.41 <0.00001* 组氨酸 氨基酸 2.01 0.00140* 高丝氨酸 氨基酸 3.91 <0.00001* 羟基丁酸盐 羟基酸 2.57 0.00110* 肌苷 核苷类似物 0.35 0.02300* 酮异亮氨酸 酮酸 0.37 <0.00001* 酮伐林 酮酸 0.65 0.00048* 月桂酸 脂肪酸 1.47 0.00210* 赖氨酸 氨基酸 3.07 0.00002* Lyxose(或xlylose) 碳水化合物 1.52 0.000011* 丙二酸 二羧酸 1.87 0.00550* 甘露糖 碳水化合物 1.21 0.02900*
N个 乙酰基 d日 葡糖胺 碳水化合物 0.60 0.04300美元*
N个 辛酸 脂肪酸 5.57 <0.00001* 壬酸(C9) 氨基酸 1.90 0.00240* O‐磷酸乙醇胺 酰基磷酸盐 0.57 0.02700* 鸟氨酸 氨基酸 3.07 0.00007* 香精酸 嘧啶及其衍生物 3.65 <0.00001* 棕榈油酸 脂肪酸 0.20 <0.00001* 泛酸盐 氨基醇 1.54 0.00620* 苯丙氨酸 芳香酸 1.34 0.02900* 脯氨酸 氨基酸 2.68 0.00013* 腐烂 多胺 1.20 0.02700* 核糖醇 醇和多元醇 0.44 0.00077* 核糖 碳水化合物 0.28 <0.00001* 核酮糖-5-磷酸 磷酸糖 0.17 0.00068* 糖精 氨基酸 1.39 0.03200* 肌氨酸 氨基酸 5.92 0.00130* 胸腺嘧啶 嘧啶及其衍生物 3.19 0.00220* 反式-4-羟基-L-脯氨酸 氨基酸 2.07 0.00310* 色氨酸 氨基酸 0.37 0.00150* 酪氨酸 氨基酸 1.46 0.00110* 乌拉西尔 嘧啶及其衍生物 1.74 0.00033* 尿酸 嘌呤和嘌呤衍生物 0.55 0.00930* 缬氨酸 氨基酸 1.34 0.02800* 木糖醇 醇和多元醇 0.42 0.00083* 木质果糖 碳水化合物 0.58 0.00260*
表2 代谢产物的组织水平在 空气污染指数
最小值/+ 小鼠和野生型小鼠
化学类别 折叠感应
P(P) ‐价值 息肉/对照 息肉/非息肉 非息肉/对照 息肉与对照 息肉与非息肉 非息肉与对照 1,5‐水力发电‐ d日 葡萄糖醇 碳水化合物 0.41 1.35 0.30 0.00120* 0.20000 0.00011* 1,6-无水葡萄糖 碳水化合物 2.18 1.60 1.36 0.02900* 0.17000 0.33000 1-甲基组胺 环胺 2.59 1.91 1.35 0.08500 0.17000 0.04100* 2,3-二磷酸甘油酯 酰基磷酸盐 0.28 0.55 0.52 0.27000 0.04700* 0.46000 2-氨基丁酸 氨基酸 9.70 3.60 2.69 <0.00001* <0.00001* 0.00540* 2-羟基吡啶 羟基酸 1.41 0.74 1.90 0.06200 0.04100* 0.00710* 3-羟基丁酸 羟基酸 2.47 1.43 1.73 0.00015* 0.04700* 0.04100* 4-氨基丁酸 氨基酸 1.22 0.57 2.14 0.13000 0.00250* 0.00077* 4-羟基苄醇 醇和多元醇 1.26 0.72 1.76 0.12000 0.06000 0.01100* 5-羟基吲哚乙酸 吲哚和吲哚衍生物 2.38 1.42 1.67 0.03200* 0.23000 0.01200* 腺嘌呤 嘌呤和嘌呤衍生物 1.95 1.65 1.18 0.02800* 0.05300 0.40000 阿糖醇 醇和多元醇 0.82 0.64 1.29 0.32000 0.03800* 0.09800 抗坏血酸 羟基酸 3.91 5.80 0.67 0.01400* 0.00290* 0.59000 α‐山梨糖(或果糖) 碳水化合物 1.77 1.26 1.40 0.00210* 0.14000 0.05400 β-丙氨酸 氨基酸 1.30 1.06 1.22 0.02400* 0.56000 0.20000 β‐谷氨酸 氨基酸 0.23 0.29 0.79 0.00003* 0.00330* 0.20000 纤毛碱 氨基酸 0.12 0.16 0.75 0.00330* <0.00001* 0.32000 柠檬酸+异柠檬酸 三羧酸 8.18 4.60 1.78 0.16000 0.21000 0.02600* 胱硫醚 氨基酸 14.67 5.34 2.75 <0.00001* 0.00001* 0.01300* 半胱氨酸+胱氨酸 氨基酸 0.44 0.44 0.99 0.00480* 0.00100* 0.97000 二甲基苯并咪唑 杂环芳香族有机化合物 3.34 2.13 1.57 0.00250* 0.02100* 0.19000 果糖 碳水化合物 1.82 1.27 1.43 0.00160* 0.12000 0.04000* 果糖-6-磷酸 糖磷酸盐 3.67 1.32 2.78 0.01400* 0.42000 0.01200* 岩藻糖 碳水化合物 2.34 1.52 1.55 <0.00001* 0.00450* 0.02600* 富马酸 二羧酸 0.65 0.62 1.05 0.01000* 0.06100 0.81000 半乳糖醇 醇和多元醇 2.90 1 2.90 0.02100* 1 0.08900 半乳糖胺 碳水化合物 0.68 0.59 1.14 0.17000 0.00058* 0.56000 半乳糖 碳水化合物 0.78 0.59 1.32 0.19000 0.01800* 0.17000 半乳糖醛酸 羟基酸 0.61 0.71 0.87 0.05000 0.04400* 0.52000 氨基葡萄糖 氨基糖苷类 3.22 1.25 2.59 0.27000 0.79000 0.27000 葡萄糖 碳水化合物 0.53 0.61 0.88 0.01600* 0.04900* 0.56000 葡萄糖醛酸盐 碳水化合物 0.53 0.62 0.86 0.01300* 0.03800* 0.51000 戊二酸 二羧酸 0.79 0.49 1.61 0.16000 0.00260* 0.00750* 甘油醛 醇和多元醇 0.88 0.68 1.30 0.50000 0.04600* 0.22000 甘油酸 羟基酸 1.20 0.84 1.43 0.10000 0.21000 0.02000* 甘油 醇和多元醇 0.45 0.68 0.66 0.00007* 0.09800 0.03700* 高丝氨酸 氨基酸 9.43 2.95 3.20 <0.00001* <0.00001* 0.00007* 低牛磺酸 氨基酸 2.53 2.61 0.97 0.01600* 0.01400* 0.90000 次黄嘌呤 嘌呤和嘌呤衍生物 3.49 6.80 0.51 0.00007* 0.00001* 0.08900 肌醇 醇和多元醇 0.77 0.65 1.18 0.01800* 0.02400* 0.30000 异亮氨酸 氨基酸 0.88 0.66 1.33 0.52000 0.02700* 0.17000 曲酸 羟基酸 2.90 1.74 1.67 0.00260* 0.02200* 0.13000 苹果酸 二羧酸 0.69 0.62 1.10 0.00210* 0.04700* 0.63000
N个 ‐α‐乙酰基‐ 我 赖氨酸 氨基酸 0.59 0.55 1.07 0.07000 0.03500* 0.79000
N个 乙酰基 d日 ‐氨基葡萄糖 碳水化合物 1.16 0.79 1.47 0.43000 0.17000 0.01500* O‐磷酸乙醇胺 酰基磷酸盐 2.43 1.05 2.33 0.00250* 0.85000 0.01400* 鸟氨酸 氨基酸 0.56 0.58 0.98 0.00700* 0.01400* 0.89000 香精酸 嘧啶及其衍生物 3.35 1.51 2.22 0.00008* 0.03400* 0.00260* 草酸盐 二羧酸 1.20 0.77 1.55 0.15000 0.09200 0.01300* 泛酸盐 氨基醇 0.50 0.47 1.07 0.00470* 0.00087* 0.70000 腐烂 多胺 14.01 13.63 1.03 0.04700* 0.04700* 0.95000 鼠李糖 碳水化合物 2.80 1.37 2.05 <0.00001* 0.08700 0.01600* 核糖 碳水化合物 0.42 0.42 1 0.00120* 0.00150* 1 核糖 碳水化合物 0.65 0.57 1.13 0.01600* 0.01万* 0.43000 肌氨酸 氨基酸 10.44 2.08 5.01 <0.00001* 0.00075* <0.00001* 山梨醇 醇和多元醇 0.62 0.71 0.86 0.04100* 0.08100 0.49000 丁二酸(或醛) 二羧酸 0.53 0.63 0.85 0.03600* 0.09800 0.55000 塔格糖 碳水化合物 2.73 1.95 1.40 0.00030* 0.00630* 0.18000 反式-4-羟基-L-脯氨酸 氨基酸 4.30 2 2.15 <0.00001* 0.00011* 0.001万* 尿酸 嘌呤和嘌呤衍生物 0.73 0.37 1.95 0.03300* 0.00039* 0.00200* 木糖醇 醇类和多元醇 0.45 0.52 0.86 0.00160* 0.00620* 0.42000
代谢产物分析 软件 480个细胞表达截断 空气污染指数 和全长 空气污染指数
为了调查 空气污染指数 在细胞内代谢物水平上进行突变,使用表达截短APC和全长APC的SW480细胞。 在免疫组织化学检查中,SW480细胞中全长APC的表达导致β-catenin在细胞膜中的定位(图 A) ●●●●。 SW480细胞中截短APC蛋白的表达和SW480转染体中全长APC蛋白表达也可以通过Western blotting进行确认(图 B) ●●●●。 从SW480细胞和SW480转染体中提取低分子量代谢物,共检测到75种代谢物(图 ,表S3)。 在这些检测到的代谢物中,64种代谢物在APC组织中共享 最小值/+ 小鼠和SW480细胞(图 A) ●●●●。 在表达截短APC的SW480细胞中,与SW480转染剂中观察到的相比,23和8种代谢物的水平分别显著增加和减少(表 ). 这些结果表明 空气污染指数 突变导致细胞内环境中代谢物水平的改变。
表3 代谢产物在 软件 480个大肠癌细胞表达截断 空气污染指数 以及表示全长的 空气污染指数
化学类别 折叠诱导
P(P) ‐价值 截短/全长APC 截短与全长APC 1,5‐水力发电‐ d日 葡萄糖醇 碳水化合物 3.1500 0.03200* 1,6-无水葡萄糖 碳水化合物 1.7500 0.02900* 2-氨基庚二酸 二羧酸 3.0100 0.00088* 2-羟基吡啶 羟基酸 1.4900 0.03000* 6-羟基烟酸 芳香酸 0.3900 0.02500* 乙酸 酮酸 6.3100 0.00005* 丙氨酸 氨基酸 1.4800 0.00100* 阿糖醇 醇和多元醇 0.5200 0.04100* 天门冬氨酸 氨基酸 3.7400 0.00200* 天冬氨酸 氨基酸 1.8700 0.01200* 柠檬酸+异柠檬酸 三羧酸 2.7600 0.00077* 肌酐 氨基酮类 2.2500 0.00120* 胱硫醚 氨基酸 3.9600 0.00046* 富马酸 二羧酸 2.1000 0.00920* 乙醇酸 羟基酸 1.6300 0.00089* 古尔科诺-1,4-内酯 碳水化合物 2.1800 0.00009* 肌醇 醇和多元醇 0.4600 0.00002* 曲酸 羟基酸 2.4900 0.01500* 苹果酸 二羧酸 5.3300 <0.00001* 中赤藓糖醇 醇和多元醇 0.7200 0.00200* 烟酰胺 环胺 0.7400 0.01000* 烟酸 氨基酸 0.0017 <0.00001*
N个 ‐甲基乙醇胺 氨基醇 1.3000 0.03500* 脯氨酸 氨基酸 0.4800 0.00006* 腐烂 多胺 1.7200 0.00087* 焦谷氨酸 氨基酸 2.9600 0.00021* 丙酮酸+草酸 酮酸 1.8400 0.04700* 核糖醇 醇和多元醇 0.2400 0.00001* 丁二酸(或醛) 二羧酸 18.4600 0.00008* 塔格糖 碳水化合物 1.6900 0.00530* 胸腺嘧啶 嘧啶及其衍生物 2.5800 0.00020*
裸鼠移植瘤血清代谢物分析 HT(高温) ‐29或 软件 480个单元格 人类上皮性大肠腺癌HT‐29细胞表达截短的 空气污染指数 基因。 23 裸鼠皮下植入HT-29细胞、表达截短APC的SW480细胞和表达全长APC的SW480转染体。 植入肿瘤扩大后,处死小鼠并取其血液。 HT-29细胞和SW480细胞移植裸鼠血清中分别检测到95和84种代谢物(表S4和S5)。 在HT‐29细胞植入小鼠的血清中,与相应的对照小鼠相比,16和17种代谢物的水平分别显著升高和降低(表 ). 此外,与全长APC相比,在表达截短APC的SW480细胞中,7种和4种代谢物的水平分别显著增加和降低(表 ).
表4 血清水平显著改变的代谢物 HT(高温) ‐29细胞移植裸鼠
化学类别 折叠感应
P(P) ‐价值 HT‐29‐植入小鼠/对照 HT‐29植入小鼠与对照组 2-氨基乙醇 氨基醇 0.77 0.00026* 乙酸 酮酸 0.54 0.00066* 乙酰水杨酸 水杨酸盐类 1.84 0.02800* 天冬氨酸 氨基酸 1.39 0.03000* β‐丙氨酸 氨基酸 0.68 0.00930* 柠檬酸+异柠檬酸 三羧酸 0.73 0.00260* 瓜氨酸 氨基酸 1.59 0.00140* 富马酸 二羧酸 0.47 0.00015* 葡萄糖 碳水化合物 0.88 0.04200* 甘油酸 羟基酸 0.78 0.00410* 甘油 醇和多元醇 0.75 0.00001* 海马体 氨基醇 1.68 0.02000* 组氨酸 氨基酸 1.45 0.00710* 同型半胱氨酸 氨基酸 0.64 0.03100* 肉桂酸氢盐 芳香酸 1.94 0.01800* 次黄嘌呤 嘌呤和嘌呤衍生物 0.38 0.02500* 异亮氨酸 氨基酸 1.48 0.00014* 乳酸 羟基酸 0.84 0.00530* 赖氨酸 氨基酸 1.20 0.02100* 苹果酸 二羧酸 0.44 0.00009* 鸟氨酸 氨基酸 2 0.00029* 苯丙氨酸 氨基酸 1.52 0.00031* 脯氨酸 氨基酸 1.62 0.00780* 丙酮酸+草酸 酮酸 0.58 0.00021* 核糖 碳水化合物 0.63 0.00007* 核糖 碳水化合物 0.55 0.00023* 丝氨酸 氨基酸 1.37 0.03100* 丁二酸(或醛) 二羧酸 0.62 0.00310* 塔格糖(或psicose) 碳水化合物 2.11 0.00090* 苏氨酸 氨基酸 1.76 0.00210* 反式-4-羟基-L-脯氨酸 氨基酸 1.59 0.02400* 尿素 氨基酮类 0.88 0.04200美元* 缬氨酸 氨基酸 1.40 0.00053*
表5 血清中检测到的代谢物 软件 480个截断单元格 空气污染指数 和 软件 480个全长转染体 空气污染指数 植入裸鼠体内
化学类别 折叠诱导(SW480细胞移植裸鼠)
P(P) ‐价值 突变/全长 全长/控制 突变/控制 突变与完整 完全与控制 突变与对照 2-羟基吡啶 羟基酸 0.35 1.77 0.62 0.0190* 0.04600* 0.0540 丙氨酸 氨基酸 1.02 0.72 0.74 0.8500 0.00800* 0.0440* 阿糖醇 氨基酸 0.55 3.67 2.01 0.0440* 0.00046* 0.0100* α‐山梨糖(或果糖) 碳水化合物 0.49 1.08 0.52 0.0350* 0.56000 0.0210* 天门冬氨酸 氨基酸 0.81 0.82 0.67 0.2200 0.13000 0.0260* 松果醇 醇和多元醇 1.25 0.67 0.84 0.0170* 0.00180* 0.0880 葡萄糖 碳水化合物 1.23 0.87 1.08 0.0052* 0.07700 0.2400 组氨酸 氨基酸 0.90 0.77 0.69 0.3600 0.00510* 0.0046* 酮异亮氨酸 酮酸 1.18 0.63 0.75 0.3300 0.00300* 0.0390* 乳酸 羟基酸 1.01 0.70 0.70 0.9100 0.00290* 0.0110* 月桂酸 脂肪酸 1.02 1.09 1.11 0.5900 0.02900* 0.0021* 赖氨酸 氨基酸 0.89 0.82 0.73 0.2700 0.03400 0.0032* 苹果酸 二羧酸 0.75 0.89 0.66 0.2600 0.49000 0.0690 正辛酸 脂肪酸 0.42 1.82 0.77 0.0140* 0.06600 0.6700 丙酮酸+草酸 酮酸 0.89 0.76 0.68 0.4100 0.08000 0.0480* 鼠李糖 碳水化合物 2.07 0.57 1.18 0.0340* 0.16000 0.6100 核糖醇 醇和多元醇 0.27 1.70 0.46 0.0180* 0.12000 0.0970 核糖 碳水化合物 0.66 1.34 0.88 0.0019* 0.03500* 0.4800 丁二酸(或醛) 二羧酸 0.87 0.83 0.72 0.3700 0.21000 0.0480* 塔格糖 碳水化合物 1.15 0.75 0.86 0.0380* 0.34000 0.6300 牛磺酸 氨基酸 0.65 1.86 1.21 0.0420* 0.02500* 0.5700 乌拉西尔 嘧啶及其衍生物 1.11 0.69 0.76 0.0640 0.00310* 0.0220* 木糖 碳水化合物 0.99 0.43 0.43 0.9700 0.02100* 0.0360*
由以下因素引起的氨基酸水平变化 空气污染指数 基因突变 检测小鼠血清、肠组织和SW480细胞氨基酸组成的变化。 在我们的实验条件下,在APC的组织和血清中检测到18种氨基酸 最小值/+ SW480细胞移植裸鼠的小鼠和血清。 HT-29细胞移植裸鼠血清中检测到17种氨基酸,SW480细胞中检测到14种氨基酸(表 , ,S1–S5)。 APC患者血清中10种氨基酸水平显著升高 最小值/+ 小鼠比相应的对照小鼠,但血清中的色氨酸水平在APC中 最小值/+ 小鼠仅显著低于对照小鼠(表 ). 此外,与对照组小鼠相比,HT‐29细胞移植裸鼠的17种氨基酸中有10种氨基酸的血清水平显著升高,并且没有氨基酸显示出显著降低(表 ). 植入带有截短APC和全长APC的SW480细胞的小鼠的血清氨基酸水平没有显著变化。 相反,植入表达截短APC或全长APC的SW480细胞的裸鼠血清中的四种氨基酸水平显著低于对照裸鼠(表 ). 在肠组织中,APC非息肉组织中大多数氨基酸的水平 最小值/+ 小鼠高于相应对照小鼠和APC息肉 最小值/+ 老鼠(表 ). 在表达截短APC的SW480细胞中,大多数氨基酸的水平与表达全长APC的SW480细胞相似或略有增加(表 ). APC息肉中半胱氨酸+胱氨酸的水平 最小值/+ 小鼠明显低于APC非息肉组织中的小鼠 最小值/+ 小鼠和相应对照小鼠的正常肠道组织(表 ).
表6 确定的血清中的主要代谢物 空气污染指数
最小值/+ 小鼠和 软件 480只细胞移植裸鼠
路径和化学类 代谢物 折叠感应(APC 最小值/+ 老鼠) 折叠诱导(SW480细胞移植裸鼠) 空气污染指数 最小值/+ 小鼠/野生小鼠 截短APC/全长APC 全长APC/控制 截断APC/控制 糖酵解 葡萄糖 1.16 1.23* 0.87 1.08 果糖-6-磷酸 0.63 未注明日期。 未注明日期。 未注明日期。 丙酮酸+草酸 1.05 0.89 0.76 0.68 乳酸 1.18 1.01 0.70** 0.70** 三羧酸循环 柠檬酸+异柠檬酸 1.12 0.97 0.96 0.93 丁二酸 1.08 0.87 0.83 0.72* 富马酸 0.76 0.83 0.92 0.76 苹果酸 0.84 0.75 0.89 0.66 氨基酸(必需) 组氨酸 2.04* 0.90 0.77** 0.69** 异亮氨酸 1.39 1.31 0.79 1.04 赖氨酸 3.08*** 0.89 0.82* 0.73** 蛋氨酸 1.26 1.11 0.87 0.96 苯丙氨酸 1.34* 1.12 0.87 0.97 苏氨酸 1.31 1.16 0.82 0.95 色氨酸 0.37* 0.93 1.26 1.17 缬氨酸 1.34* 1.17 0.85 1 氨基酸(非必需) 丙氨酸 2.01*** 1.02 0.72** 0.74* 天门冬氨酸 1.98** 0.81 0.82 0.67* 天冬氨酸 1.08 0.78 1.25 0.97 半胱氨酸+胱氨酸 1.79*** 1.08 0.90 0.98 谷氨酸 0.72 0.70 1.31 0.92 谷氨酰胺 1.35* 1 0.82* 0.81 甘氨酸 1.18 1.06 0.86 0.92 脯氨酸 2.68*** 0.98 0.82 0.81 丝氨酸 1.25 0.99 0.88 0.88 酪氨酸 1.46** 0.94 0.87 0.82 单糖类 阿洛斯 0.50 未注明日期。 未注明日期。 未注明日期。 阿拉伯糖 1.21 0.75 1.14 0.86 果糖 0.60*** 1.03 1.18 1.21 岩藻糖 0.85 未注明日期。 未注明日期。 未注明日期。 半乳糖 0.78** 未注明日期。 未注明日期。 未注明日期。 氨基葡萄糖 1.78** 未注明日期。 未注明日期。 未注明日期。 葡萄糖 1.16 1.23* 0.87 1.08 葡萄糖醛酸盐 0.65*** 1.04 0.92 0.95 古尔科诺-1,4-内酯 1.25 未注明日期。 未注明日期。 未注明日期。 甘露糖 1.21* 0.97 0.90 0.87 鼠李糖 未注明日期。 2.07* 0.57 1.18 核糖 0.28*** 0.66** 1.34* 0.88 核糖 未注明日期。 0.52 1.11 0.57 塔格糖 未注明日期。 1.15* 0.75 0.86 木质果糖 0.58** 未注明日期。 未注明日期。 未注明日期。 木糖 1.87 0.99 0.43* 0.43* 酒精 2-氨基乙醇 0.95 0.95 0.93 0.88 阿糖醇 0.27*** 0.55* 3.67*** 2.01* 肌醇 1.13 0.90 1.03 0.93 Lyxose(或xlylose) 1.52 未注明日期。 未注明日期。 未注明日期。 核糖醇 0.45*** 0.27* 1.69 0.46 木糖醇 0.42*** 0.88 1.10 0.96 核糖核酸酶 腺嘌呤 2.01*** 未注明日期。 未注明日期。 未注明日期。 胸腺嘧啶 3.20** 未注明日期。 未注明日期。 未注明日期。 乌拉西尔 1.74*** 1.11 0.69** 0.76*
表7 已确定肠组织中的主要代谢物 空气污染指数
最小值/+ 小鼠和 软件 480个单元格
路径和化学类 代谢物 折叠诱导(APC的肠组织 最小值/+ 老鼠) 折叠诱导(SW480细胞) 息肉/控制 息肉/非息肉 非息肉/对照 截短APC/全长APC 糖酵解 葡萄糖 0.53* 0.61* 0.88 1.29 果糖-6-磷酸 3.67* 1.32 2.78* 未注明日期。 丙酮酸+草酸 1.41 1.15 1.23 1.84* 乳酸 0.96 0.79 1.22 0.88 三羧酸循环 柠檬酸+异柠檬酸 8.18 4.60 1.78* 2.76*** 丁二酸 0.53* 0.63 0.85 18.46*** 富马酸 0.65* 0.62 1.05 4.61*** 苹果酸 0.69** 0.63* 1.10 5.33*** 氨基酸(必需) 组氨酸 0.93 0.69 1.35 未注明日期。 异亮氨酸 0.88 0.66* 1.33 0.87 赖氨酸 0.77 0.64 1.20 0.70 蛋氨酸 0.78 0.75 1.04 未注明日期。 苯丙氨酸 0.87 0.73 1.18 1 苏氨酸 1.01 0.74 1.36 0.97 色氨酸 0.92 0.75 1.23 1.49 缬氨酸 1.01 0.74 1.36 0.93 氨基酸(非必需) 丙氨酸 0.91 0.77 1.18 1.48** 天门冬氨酸 1.01 0.79 1.27 3.74** 天冬氨酸 1 0.76 1.32 1.87* 半胱氨酸+胱氨酸 0.44** 0.44*** 0.99 未注明日期。 谷氨酸 0.96 0.77 1.25 2.10** 谷氨酰胺 1.13 0.86 1.32 未注明日期。 甘氨酸 1.10 0.80 1.37 0.83 脯氨酸 0.95 0.77 1.24 0.48*** 丝氨酸 0.99 0.77 1.28 1.49 酪氨酸 1.05 0.79 1.34 1.21 单糖 阿拉伯糖 0.92 0.70 1.31 未注明日期。 果糖 1.82** 1.27 1.43* 1.09 岩藻糖 2.34*** 1.52** 1.55* 未注明日期。 半乳糖 未注明日期。 0.78 0.59* 1.32 氨基葡萄糖 3.22 1.25 2.59 未注明日期。 葡萄糖 0.53* 0.61* 0.88 1.29 葡萄糖醛酸盐 0.53* 0.62* 0.86 未注明日期。 古尔科诺-1,4-内酯 未注明日期。 未注明日期。 未注明日期。 2.18*** 甘露糖 0.84 0.75 1.13 未注明日期。 鼠李糖 2.80*** 1.37 2.05* 未注明日期。 核糖 0.42** 0.42** 1 0.99 核糖 0.65 0.57 1.13 0.80 塔格糖 2.73*** 1.95** 1.40 1.69** 木糖 0.53 0.56 0.95 未注明日期。 酒精 2-氨基乙醇 0.83 0.79 1.05 0.85 肌醇 0.77* 0.65* 1.18 0.46*** Lyxose(或xlylose) 0.57 0.56 1.01 未注明日期。 核糖醇 0.84 0.80 1.05 0.24*** 木糖醇 0.45** 0.52** 0.86 未注明日期。 核酸酶 腺嘌呤 1.95* 1.65 1.18 0.87 胞嘧啶 1.12 0.93 1.19 未注明日期。 胸腺嘧啶 1.28 0.98 1.32 2.58*** 乌拉西尔 1.27 1.02 1.24 1.01
与三羧酸相关的代谢物水平的变化( TCA公司 )由以下因素引起的循环 空气污染指数 基因突变 评估APC突变引起的TCA循环中代谢物水平的变化。 在我们的实验条件下,检测到柠檬酸+异柠檬酸、琥珀酸、富马酸和苹果酸。 在APC的息肉组织中 最小值/+ 小鼠的柠檬酸和异柠檬酸水平高于非息肉组织和对照小鼠(表 ). 在表达截短APC的SW480细胞中,所有这些TCA循环相关代谢物的水平均显著高于表达全长APC的SW480细胞(表 ),表示 空气污染指数 突变可能导致TCA循环相关代谢物水平增加以获得更多能量 最小值/+ 小鼠和SW480细胞移植裸鼠的血清TCA循环相关代谢物水平与对照小鼠相比没有显著变化(表 ). 相反,与对照小鼠相比,HT-29细胞移植裸鼠血清中所有这些代谢物的水平均显著降低(表 ).
扩散的变化 软件 480个用代谢物处理的细胞 接下来,我们评估代谢产物的水平是否因 空气污染指数 突变影响肿瘤增殖。 APC息肉病变中脯氨酸、阿拉伯糖醇、肌醇、核糖醇、异亮氨酸、2-羟基丁酸和3-羟基丙酸的水平趋于降低 最小值/+ 小鼠和表达截短APC的SW480细胞。 APC息肉病变中肌氨酸水平显著升高 最小值/+ 小鼠,在表达截短APC的SW480细胞中趋于增加(表 , 、S2、S3)。 因此,研究了用三种不同浓度的每种代谢物处理过的SW480细胞的生长速度。 在表达全长APC的SW480细胞中,添加1 mM肌醇显著提高了其增殖率(图 A) ●●●●。 添加1或10 mM核糖醇显著降低表达截短APC的SW480细胞的增殖率(图 B) ●●●●。 添加50μM肌氨酸显著促进表达截短APC的SW480细胞的生长速度(图 E) ●●●●。 在每个浓度下,2-羟基丁酸和3-羟基丙酸对SW480细胞增殖都有类似的影响(图 C、 D)。 此外,L-脯氨酸(0.6-1.8 mM)、阿拉伯糖醇(0.1-10 mM)和异亮氨酸(0.6-18 mM)对细胞生长速度没有显著影响(数据未显示)。 这些结果表明,一些代谢产物的水平被 空气污染指数 突变调节肿瘤环境和增殖。
靶向代谢物对细胞生长速率的影响 软件 480个结直肠癌细胞和 软件 480个转染体。 软件 480个细胞以5×10的速度生长 4 /在96孔板中放置24小时,然后暴露于指示浓度的肌醇(A)、核糖醇(B)、2-羟基丁酸(C)、3-羟基丙酸(D)和肌氨酸(E)。 24小时后,评估细胞生长速度。 数据显示为平均值± 标准偏差 , n个 =3–10。 统计显著性分析使用 S公司 学生的 t吨 检验,概率水平0.05被用作显著性标准* P(P) < 0.05. L-脯氨酸(0.6-1.8 mM)、阿拉伯糖醇(0.1-10 mM)和异亮氨酸(0.6-18 mM)对细胞生长速率没有显著影响(数据未显示)。
讨论 获得有关Wnt通路异常激活机制的新见解 空气污染指数 突变,我们使用 在体外 和 体内 实验。 在肠道组织中, 空气污染指数 伴随Wnt途径激活的突变似乎会引起各种代谢物水平的改变。 在APC中 最小值/+ 小鼠的组织学表现与人类大肠腺瘤相同(图 C) ,观察到息肉和非息肉区域代谢产物的差异(表 ). APC中各种代谢物的血清水平 最小值/+ 与相应的对照小鼠相比,小鼠发生了显著变化(表 ,S1)。 此外,在植入HT‐29细胞和SW480细胞的裸鼠中,与对照裸鼠相比,各种代谢物的血清水平显著改变(表 , )、和 在体外 表达截短APC的SW480细胞与表达正常APC的细胞之间的比较表明,这两种细胞类型之间的代谢物水平存在差异(表 ). 这些结果表明 空气污染指数 肠组织和/或肠上皮细胞的突变通过Wnt通路的激活引起代谢组的改变。
正如肿瘤微环境诱导能量代谢途径发生许多变化以获得足够的能量用于细胞增殖这一概念所预期的那样,参与细胞内TCA循环后期阶段的中间产物水平,包括琥珀酸、富马酸和苹果酸, 表达截短APC的SW480细胞明显高于表达全长APC的SW480转染细胞(表 , ). 平山 等 . 17 结果表明,三种TCA代谢物(琥珀酸、富马酸和苹果酸)在大肠肿瘤组织中的水平显著升高,癌细胞积极使用富马酸呼吸可能为富马酸与琥珀酸的积累提供了一个可行且有趣的解释。 一些寄生虫和细菌能够在厌氧条件下通过产生富马酸合成ATP,富马酸接受丁二酸的电子。 24 这一过程称为富马酸呼吸,在APC截短的SW480细胞中观察到的TCA循环中间产物水平的变化模式也表明富马酸的呼吸。 相反,在APC的息肉区域,这些TCA循环中间产物的水平没有显著增加 最小值/+ 小鼠(即腺瘤)。 研究表明,一种驱虫药,二甲酸吡维酮,是富马酸呼吸抑制剂,抑制了人类结肠癌细胞系WiDr和人类胰腺癌细胞系PANC-1的生长。 25 这些发现表明 空气污染指数 突变引起能量代谢途径的改变,这种调节可能导致大肠癌治疗策略的发现。
氨基酸谱对于理解 空气污染指数 突变和随后的Wnt途径激活。 平山 等 . 17 据报道,除谷氨酰胺外,大多数氨基酸在结直肠癌组织中的水平显著高于正常结肠组织,这表明结直肠癌与氨基酸之间存在关系。 在这项研究中,APC的非息肉组织中大多数氨基酸的水平往往较高 最小值/+ 与对照组小鼠的正常组织相比(表 ). APC息肉组织中的氨基酸水平 最小值/+ 小鼠也往往低于非息肉组织中的小鼠(表 ,S2)。 这些结果表明 空气污染指数 突变是结直肠癌发生的第一步,会引起氨基酸谱的变化,这种变化可能会导致息肉的形成。 导致氨基酸水平变化的原因之一是 空气污染指数 突变可能是自噬引起的。 自噬是一个分解代谢过程,通过溶酶体机械降解细胞自身成分,通过蛋白质降解产生肽和氨基酸。 自噬途径在大肠肿瘤组织中下调, 26 而在 第53页 研究发现,饥饿会削弱自噬通量,导致LC3过度积累,最终导致细胞凋亡。 27 因此,必须对氨基酸谱和自噬之间的相互关系进行研究,以详细了解结直肠癌。
在代谢产物分析中,植入HT-29细胞、SW480细胞和SW480转染剂的小鼠血清中的乳酸水平显著降低(表 , , ). 这些结果与之前使用结直肠癌患者临床样本进行的研究中的观察结果不同。 16 结直肠癌和其他癌症患者的血清乳酸水平高于健康志愿者。 11 , 28 然而,转移性结直肠癌患者的血清乳酸水平较低。 29 转移性结直肠癌患者的糖异生可能掩盖了癌症末期葡萄糖的厌氧异化, 30 人结直肠癌异种移植模型小鼠的情况可能与转移性结直肠癌患者相似。 此外,可以证实,植入表达截短APC的SW480细胞的裸鼠血清和表达全长APC的SW480转染子的血清在代谢物谱方面存在差异(表 )这表明体内肿瘤的存在会导致血清代谢组的改变。 尽管SW480细胞和转染SW480的裸鼠血清中代谢物的数量差异显著,但血清代谢组中的一些有趣变化是明显的。 SW480细胞移植裸鼠的血清阿糖醇和核糖醇水平显著低于SW480转染裸鼠,这些现象与SW480和SW480转基因裸鼠的细胞内水平变化相似(表 , ). 此外,核糖醇可以影响APC截短的SW480细胞的增殖(图 B) ●●●●。 这些结果表明,APC突变导致肿瘤细胞中核糖醇水平降低可能导致肿瘤细胞增殖。
代谢是细胞内发生的一系列化学反应,以维持细胞的生存、生长和分裂,这表明肿瘤微环境可能会引起代谢的许多变化,以获得更多能量。如上所述,利比特醇被认为是影响肿瘤细胞增殖的一种代谢物。 核糖醇降低表达 空气污染指数 突变,但不影响表达全长APC的SW480转染体的生长(图 B) ●●●●。 贝洛 等 . 31 揭示了5‐ o个 1,4-烷基亚氨基-1,4-二脱氧核糖醇作为癌细胞生长的抑制剂具有活性,研究表明其抑制活性取决于烷基侧链的长度,尽管核糖醇本身的抗癌活性尚未得到研究。 相反,1mM肌醇显著增加了表达全长APC的SW480转染子的增殖率(图 A) ●●●●。 以前有报道称结肠息肉中的肌醇水平显著降低,糖酵解可能在早期肿瘤发生中起关键作用。 32 因此,肌醇对肿瘤细胞的作用可能导致糖酵解和癌细胞生长的上调。 在每种浓度下,2-羟基丁酸和3-羟基丙酸对SW480细胞的增殖都产生了类似的影响(图 C、 D)。 这些结果可能是由于2-羟基丁酸和3-羟基丙酸的细胞毒性,并且这种作用与 空气污染指数 尽管到目前为止还没有关于细胞毒性的报道,但细胞发生了突变。 在这项研究中,我们观察到肌氨酸的有趣行为 N个 氨基酸甘氨酸的甲基衍生物。 斯里库马尔 等 . 10 研究表明,在前列腺癌向转移的过程中,肌氨酸水平显著升高,并且可以在尿液中非侵袭性检测到。 在我们的研究中,我们发现APC患者血清肌氨酸水平显著升高 最小值/+ 小鼠比相应的对照小鼠(表 )在APC的息肉组织中显著高于非息肉组织 最小值/+ 老鼠(表 ). 用50μM肌氨酸处理表达截短APC的SW480细胞,可显著提高其生长速度( P(P) =0.043,图 E) ●●●●。 在之前的一项研究中,接触25、50和100μM的人前列腺癌细胞系LNCaP细胞表现出上调HER2/neu mRNA表达,50μM时效果最强, 17 在暴露于50μM肌氨酸的细胞中观察到细胞内肌氨酸浓度增加。 10 因此,癌细胞可能在较小的浓度范围内受到肌氨酸的调节。 据报道,在前列腺癌细胞中,肌氨酸水平可能参与HER2/neu的调节 33 它们与带有表皮生长因子和两个卵泡抑素基序2的跨膜蛋白的抑癌活性相关, 34 尽管肌氨酸与人类结直肠癌的关系尚待证实。 总之,肌氨酸和相关分子可能有潜力作为早期结直肠癌的生物标志物 空气污染指数 突变,可以作为新的治疗干预的靶点。
总之,我们分析了细胞和组织的代谢组学状态 空气污染指数 基因突变,发现 空气污染指数 该基因可能调节氨基酸相关途径和其他能量相关代谢途径。 也有人认为某些代谢物可能会影响癌细胞的增殖。 这项代谢组学研究将有助于发现早期癌症的新生物标记物和癌症特异性治疗的发展,并且这项研究的结果增加了我们对结直肠癌的了解。
支持信息
表S1。 血清中检测到的代谢物 空气污染指数
最小值/+ 小鼠和野生型小鼠。
表S2。 在组织中检测到的代谢产物 空气污染指数
最小值/+ 小鼠和野生型小鼠。
表S3。 在中检测到的代谢物 软件 480个截断单元格 空气污染指数 和全长 空气污染指数 .
表S4。 血清中检测到的代谢物 HT(高温) ‐29细胞移植裸鼠。
表S5。 血清中检测到的代谢物 软件 480个截断单元格 空气污染指数 ‐或全长 空气污染指数 植入裸鼠。
致谢 本研究得到了日本教育、文化、体育、科学和技术部(发给T.Y.、M.Y.和T.A.)全球COE计划(下一代信号转导医学教育和研究全球卓越中心)研究员以及农业部的资助, 日本林业和渔业(开发分析和评估功能农产品和功能食品的基本技术)(致M.Y.)。
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