图3。

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避孕药和乳酸杆菌优势和集群。(A) 阴道微生物群中的前20个细菌属以相对丰度作为类群柱状图绘制,并在未服用激素避孕药的性工作者之间进行比较(月经周期的增殖期,N个=22),关于口服避孕药(N个=14)或DMPA(N个=22). 每个条形图代表一名女性的阴道微生物群。如图所示,每种颜色代表不同的细菌属。的种类乳酸杆菌以灰色/图案表示。阴道微生物群按相对丰度从左到右的降序排列乳酸杆菌.女性乳酸杆菌-利用相对丰度的几个不同切点评估各组间的优势VMB(表1). 在所选的最高截止时间(≥98%乳酸杆菌),有明显更多的女性患有乳酸杆菌-NH(增殖期)和OCP组中占优势的VMB多于DMPA组,这表明雌激素水平高与乳酸杆菌的大量存在相关,支持我们的结果,即DMPA组女性香农多样性增强(图1C、 D)。星号表示已解决到家庭级别。(B) PCoA根据Bray–Curtis差异矩阵证明了阴道微生物群在操作分类单元(OTU)水平上的β多样性。阴道微生物群不是通过避孕方法进行聚类,而是根据前面描述的CST进行聚类(Ravel等人,2011年),由于乳酸杆菌阴道微生物群中。性工作者占主导地位克氏乳杆菌(CST I)用蓝色圈出,以内陆乳杆菌(CST II)为黄色,阴道菌群高度多样的女性(CST IV)为绿色圆圈。轴代表特征值,这是一个度量,其大小表示PCoA轴中捕获的变化量。(C) 根据Bray–Curtis差异计算聚类树状图,并用于可视化阴道微生物群的聚类。使用间隙统计观察到三个簇(图S5A)通常,前面描述的CST在树状图中聚集在一起。CST I(蓝色),克氏乳杆菌优势;CST II(黄色),内陆乳杆菌优势;CST IV(绿色),高度多样化。星号表示已分解为细菌属。