细胞生物学杂志。2018年12月3日;217(12): 4106–4123.
第条
PP2A-B55促进细胞有丝分裂后核膜重构果蝇属
,1 ,1,2 ,1 ,三 ,1,2 ,1 ,三和1,2
海瑟姆·梅森
1加拿大魁北克省蒙特利尔市蒙特利尔大学免疫学与癌症研究所
文森特·布德劳
1加拿大魁北克省蒙特利尔市蒙特利尔大学免疫学与癌症研究所
2加拿大魁北克省蒙特利尔市蒙特利尔大学生物芯片与生物决策部门
达米恩·加里多
1加拿大魁北克省蒙特利尔市蒙特利尔大学免疫学与癌症研究所
穆罕默德·布鲁
三加拿大安大略省温莎市温莎大学生物系
Myreille Larouche公司
1加拿大魁北克省蒙特利尔市蒙特利尔大学免疫学与癌症研究所
2加拿大魁北克省蒙特利尔市蒙特利尔大学生物芯片与生物决策部门
保罗·马多克斯
1加拿大魁北克省蒙特利尔市蒙特利尔大学免疫学与癌症研究所
文森特·阿尔坎鲍尔
1加拿大魁北克省蒙特利尔市蒙特利尔大学免疫学与癌症研究所
2加拿大魁北克省蒙特利尔市蒙特利尔大学生物芯片与生物决策部门
1加拿大魁北克省蒙特利尔市蒙特利尔大学免疫学与癌症研究所
2加拿大魁北克省蒙特利尔市蒙特利尔大学生物芯片与生物决策部门
三加拿大安大略省温莎市温莎大学生物系
文森特·布德劳和保罗·S·马多克斯目前的演讲地点是北卡罗来纳州教堂山北卡罗来那大学生物系。
2018年4月3日收到;2018年8月17日修订;2018年9月5日接受。
- 补充资料
补充材料(PDF)
GUID:FD722E37-69A9-4BEC-9824-AA968C9BABB3
表S1-S3(邮政编码)
指南:711C2BB2-75C2-49BF-B7D5-E466705D327E
当有丝分裂结束时,多种蛋白质被去磷酸化。虽然磷酸酶PP2A-B55促进了这一过程,但其关键底物和功能尚不清楚。Mehsen等人在果蝇属这表明PP2A-B55在包层改造及其BAF脱磷过程中发挥了重要作用。
摘要
当分裂细胞退出有丝分裂,子细胞进入间期时,许多蛋白质必须去磷酸化。蛋白磷酸酶2A(PP2A)及其B55调节亚单位在这一转变中起着关键作用,但其底物的特性及其去磷酸化如何促进有丝分裂的退出尚不清楚。我们在年进行了母体效应筛查黑腹果蝇鉴定在细胞周期中与PP2A-B55/Tws起作用的基因。我们发现,Tws和核膜(NE)成分水平降低的卵子通常无法发育,伴随着减数分裂和合胞体有丝分裂后的NE缺陷。我们的机械研究使用果蝇属细胞表明,PP2A-Tws通过去磷酸化BAF促进有丝分裂退出过程中的核膜重组(NE),并表明PP2A-Tws靶向额外的NE成分,包括Lamin和Nup107。这项工作建立了果蝇属作为进一步剖析NER分子机制的有力模型,并提示PP2A-Tws在完成减数分裂和有丝分裂中的其他作用。
结果
PP2A-Tws相互作用物的母体效应遗传筛选
为了确定细胞周期中与PP2A-Tws协同作用的基因,我们在果蝇属我们利用了这样一个事实,即女性减数分裂和第一个胚胎细胞周期对细胞周期机制中的遗传改变很敏感。卵子发生和早期胚胎发生依赖于母体沉积的mRNA和蛋白质(). 从母体效应致死突变体中鉴定出几个编码细胞周期调节器或效应器的基因(格洛弗,1989年). 我们使用的苍蝇是杂合的,有一个强的低形态等位基因tws公司(tws公司P(P)) (Uemura等人,1993年). 这些苍蝇可以存活和繁殖,但对与PP2A-Tws协同作用的基因的部分功能丧失敏感。我们假设一个等位基因的缺失是母体效应合成致死的基因tws公司P(P)/+背景可能与PP2A-Tws在细胞周期中共同作用(). 类似地,我们之前在tws公司作为杂合增强子全球水资源扫描,编码Gwl的组成活性形式,Gwl是一种对抗PP2A-Tws的激酶(Wang等人,2011年).
PP2A Tws相互作用者的母体效应第二位点非实现屏幕。(A)卵子减数分裂的完成和早期胚胎发生果蝇属依赖于母体提供的mRNA和蛋白质。(B)屏幕的设计。基因缺失(缺陷[英国国防部])与突变的等位基因结合tws公司(tws公司P(P))或mts公司(mts公司XE-2258型)在一个十字架上。两者的杂合性tws公司P(P)(或mts公司XE-2258型)或英国国防部(或突变)允许存活和生育,但两者的杂合性导致雌性卵无法孵化。(C)该筛查中确定的基因可能在细胞周期中作用于(X)上游、(Y)下游或与(Z)PP2A-Tws平行。(D)主要结果概述。被发现与基因相互作用的特定基因的名称tws公司和mts公司在与发现的缺陷相对应的数据点上显示。
我们通过收集第二和第三染色体上的缺失进行筛选,这些缺失大多来自Drosdel等基因缺陷试剂盒(Ryder等人,2007年). 其中大多数是大的基因组缺失,它们总共覆盖了近70%的基因组。每条线都与tws公司P(P)/TM6B(TM6B)要生成的行Df/+、twsP(P)/+接受生育测试的女性。删除,当与tws公司P(P),导致孵化率低于50%。与屏幕平行行波管P(P),我们同样筛选了微管星(mts公司XE-2258型),编码PP2A的催化亚单位(Wassarman等人,1996年). The genetic interactors oftws公司和mts公司仅部分重叠,表明突变等位基因mts公司还可使依赖于除Tws以外的调节亚单位的PP2A依赖功能的卵子或胚胎致敏。毫不奇怪,删除发现mts公司与…互动tws、,和删除揭开tws公司与…互动百万吨可能是因为同时将Tws和Mts的水平减半会进一步降低PP2A-Tws全酶的水平。主要结果概述如所示完整的数据集如表S1所示。
通过重叠缺失的精细定位,然后对包含在未发现的基因组区间中的候选基因进行测试,使我们能够识别出一个等位基因突变与一个突变等位基因结合的单个基因tws公司或百万吨母体效应会显著降低胚胎的存活率(图S1 a)。正如所料,我们恢复了tws公司和马球,编码有丝分裂激酶(Wang等人,2011年). 发现两者之间存在强烈的相互作用tws公司和循环B3,编码后期所需的有丝分裂细胞周期蛋白B3(袁和奥法雷尔,2015年). 有趣的是,我们还发现tws公司和层粘连蛋白(林;Dm公司0),编码层粘连蛋白,层粘连蛋白质是核膜的一种结构成分,在有丝分裂退出时,NE围绕其组装(Schellhaus等人,2016年).
PP2A-Tws和Lamin减少的鸡蛋和胚胎会导致NE缺陷和流产发育
我们假设tws公司和层粘连蛋白可能反映了PP2A-Tws在有丝分裂退出期间NER中的作用。为了确认tws公司和层粘连蛋白,我们测试了这两个基因的不同等位基因。三个低形态等位基因tws公司所有这些基因都增强了层粘连蛋白按以下强度顺序:行波管aar1级>tws公司P(P)>tws公司原子吸收率2反过来,所有三个等位基因层粘连蛋白测试的增强等位基因tws公司按以下强度顺序:兰姆K2(K2)≈兰姆答25>兰姆04643(). 为了探索观察到的致死性的细胞基础,我们检测了0至2小时龄的胚胎兰姆K2(K2)/+;tws公司P(P)/+母亲。蛋白质印迹证实,母亲对tws公司P(P)和兰姆K2(K2)突变产生的胚胎Tws和Lamin水平较低(). 免疫荧光显示,大多数正在进行有丝分裂发育的胚胎都有严重缺陷(). 细胞核通常位置错误,大小和形状异常。中心体经常与细胞核分离(在). 细胞质中可见游离的染色质团,通常附着在NE片段上,好像被切碎了一样。所有这些表型都可能是由于NE的弱点或缺陷所致兰姆K2(K2)/+; tws公司P(P)/+母亲也表达GFP-Polo作为有丝分裂结构的标记(Moutinho-Santos等人,1999年)揭示了细胞核/中心体单元的解体导致进一步的无序化,包括纺锤体融合和不均匀的细胞核间距(视频1和2)。胚胎由tws公司P(P)/+或兰姆K2(K2)/+突变体只表现出轻微的发育缺陷,例如偶尔中心体脱离细胞核(和S2)。
PP2A-Tws和Lamin之间的协作是合胞体胚胎发育所必需的。(A)不同等位基因之间的遗传相互作用tws公司和兰姆对所示基因型雌性胚胎的孵化率进行评分。误差条代表SEM。***,P<0.0001,双尾t吨测试。(B)胚胎的蛋白质印迹显示蛋白质水平如何受到母体基因型的影响。(C)通过对α-管蛋白(绿色)、γ-管蛋白和层粘连蛋白(红色)以及DNA(DAPI,蓝色)的免疫荧光显示胚胎中的表型。来自的胚胎兰姆K2(K2)/+; tws公司P(P)/+雌性,观察到几个缺陷:异常核分布(左)、形态和大小异常的间期核、中心体分离(黄色箭头)和断裂核(红色箭头)。比例尺,20µm。(D)所示基因型胚胎在不同细胞周期阶段观察到的游离中心体的定量。(E)所示基因型全球胚胎发育的量化。误差线代表SEM。*,P=0.0165;**,0.0021<P<0.0027;***,P<0.0001,双尾t吨测试。
尽管主要缺陷普遍存在于兰姆K2(K2)/+; tws公司P(P)/+在皮层检测到有丝分裂核的胚胎中,我们发现大多数卵子都没有达到这个阶段(). 因此,我们在减数分裂早期就研究了潜在的早期缺陷。正常情况下,卵母细胞在第一次减数分裂中期停滞,直到被母亲产卵。排卵触发了第一次减数分裂的完成,第二次减数分裂紧随其后,两个纺锤体在一个极点连接在一起。在第二次减数分裂结束时,四个单倍体细胞核在减数分裂间期的去凝聚染色质周围聚集一个NE。如果卵子已经受精,那么最里面的核通常会成为雌性原核,并且在第一次有丝分裂发生之前与雄性原核结合。其他三个细胞核最终聚集在一起并经历NE分解(NEB),染色质浓缩并与微管阵列结合为极体(). 如果卵子没有受精,那么所有四个分裂后的细胞核都会聚集成一个极体。我们收集了0至20分钟龄的卵子/胚胎,并在固定后使用允许深度染色的方案进行免疫荧光分析。我们发现兰姆K2(K2)/+;tws公司P(P)/+减数分裂各阶段的卵,频率与单个突变卵相似(). 然而,在来自兰姆K2(K2)/+; tws公司P(P)/+母亲,我们发现拉明染色检测到的NE结构经常缺失或形状不规则(). 这些结果表明,当PP2A-Tws和Lamin水平减半时,成熟后间期细胞核的组装受到影响。使用针对X染色体的FISH,我们发现大多数来自兰姆K2(K2)/+; tws公司P(P)/+母亲形成一个包含至少一条X染色体的合子核,这表明女性原核有助于合子的形成(数据未显示)。因此,虽然NE形成受到影响,但原核并置仍然可能发生,这表明胚胎发育失败主要是由于早期有丝分裂减数分裂后发生的缺陷。
PP2A-Tws和Lamin在减数分裂中为NER合作。收集鸡蛋0到20分钟,在甲醇中固定,并对α-管蛋白(蓝色)、DNA(绿色)和拉明(红色)进行染色。(A–D)来自的代表性图像兰姆K2(K2)/+或tws公司P(P)/+鸡蛋。(A)减数分裂后期纺锤体II。(B和C)减数分裂后间期;图中显示了三个核,每个核周围都有NE。(D)减数分裂完成后形成极体。(东-西)来自的代表性图像兰姆K2(K2)/+;tws公司P(P)/+双份鸡蛋。(E)减数分裂后期正常纺锤体II。(F和G)几个兰姆K2(K2)/+;tws公司P(P)/+减数分裂后间期的卵子要么有三个细胞核带有微弱且不规则的NE(与B和C相比,为F),要么三个细胞核没有NE(G)。(H)来自兰姆K2(K2)/+;tws公司P(P)/+母亲能够正常完成减数分裂,这表现为极体的形成。(一)鸡蛋来自兰姆K2(K2)/+;tws公司P(P)/+母亲完成减数分裂。观察到的表型分为减数分裂、减数分裂后间期(PMI)或完全减数分裂(以极体的形成为标志)。(J)用可检测的NE定量分析减数分裂后间期卵子的比例。对于I和J中的数据,数据来自两个单独的染色和打分,这两个染色和打评分是在多次收集后立即固定的鸡蛋进行的。比例尺,5µm。
为了探索拉明和PP2A-Tws之间遗传联系的特异性,我们测试了两者之间潜在的遗传相互作用兰姆K2(K2)以及各种磷酸酶亚基的不同突变等位基因(表S2)。只有在兰姆K2(K2)和tws公司或mts公司突变等位基因,表明PP2A-Tws在拉明蛋白中起着特别重要的作用。
拉明中CDK磷酸化共识位点控制其溶解度
基于这些结果,我们假设PP2A-Tws可以去磷酸化层粘连蛋白以促进其在NE的功能。磷酸化对层粘连的调控是复杂的,尚不完全清楚,但其在CDK位点的磷酸化已被证明可以促进不同系统中的层粘连层的分解(Heald和McKeon,1990年;Peter等人,1990年;Machowska等人,2015年). 在果蝇属到目前为止,七个最小CDK基序(S/T-P)中有六个被磷酸化(Machowska等人,2015年). 开始测试CDK位点是否需要磷酸化来传播果蝇属在有丝分裂中,我们将所有7个CDK位点突变为Ala(7A)或Asp(7D)残基(). 然后我们建立了稳定的细胞系,允许RFP-Lamin的诱导表达重量、RFP-Lamin第7章或RFP-Lamin第7天和成像细胞分裂。而RFP Lamin重量在间期定位于NE,在有丝分裂时分散于整个细胞(,顶部;和视频3)。相反,RFP-Lamin第7章在有丝分裂过程中未能扩散,在假定的染色体周围形成一个伸长的肿块,随着细胞分裂,该肿块成功分裂成两个核仁状结构(,底部;和视频4)。这些结果表明,在CDK共有位点的拉明磷酸化是有丝分裂中拉明正常分散所必需的。然而,我们观察到RFP-Lamin第7天也未能在有丝分裂中分散(数据未显示),可能是因为7个天冬氨酸取代并没有完全模拟磷酸化的效果。
拉明CDK磷酸化共识位点的磷酸化可能促进其在有丝分裂中的分散。(A)所有七个最小的CDK磷酸化共有位点,如图Lamin结构所示(Lyakhovetsky和Gruenbaum,2014年),突变为丙氨酸或天冬氨酸残基。星号(*)表示实验观察到的磷酸化位点(Machowska等人,2015年).(B)表达RFP-Lamin的细胞重量或RFP-Lamin第7章在旋转圆盘共聚焦显微镜上拍摄。T型0被定义为细胞分裂时伸长的开始。而RFP-Lamin重量在有丝分裂过程中变得分散,并在6分钟时开始被招募(箭头所示),RFP-Lamin第7章细胞在有丝分裂过程中从不分散。比例尺,5μm。(C)所有CDK共识位点突变为Lamin中的Asp(Myc-Lamin第7天)增加了其溶解度。表达所示蛋白质的稳定细胞系在裂解前按所示进行处理,并将不溶性物质制成颗粒(见材料和方法)。通过Western blot分析组分。(D)来自三个独立实验的可溶和不可溶部分的相对Western blot信号的量化,如B.误差条代表SD.*,P=0.0437,双尾t吨测试。(E)引入一个空等位基因CycB(循环B)(CycB(循环B)2)英寸林K2(K2)/+; tws公司P(P)/+女性拯救她们所生产的胚胎的发育。对指定基因型的雌性胚胎孵化率进行评分。误差条代表SD。**,0.0051<P<0.0095,双尾t吨测试。
为了从生物化学角度测试CDK位点的拉明磷酸化是否促进其在细胞中的扩散,我们制作了表达不同形式Myc-Lamin的细胞。细胞被溶解,提取物被离心,以从含有染色质的不溶性部分(颗粒)中分离出可溶性部分(上清液)。用Western blots分析裂解产物。而40%的Myc-Lamin重量可溶,80%Myc-Lamin第7天在这些条件下是可溶的(). Myc-胺第7章行为类似于Myc-Lamin重量在异步细胞的这些提取物中。这些结果表明,拉明CDK共识位点的磷酸化可能会破坏促进叶片组装的相互作用。用冈田酸(OA)处理细胞,该酸可抑制一系列磷酸酶,包括PP2A,增加Myc-Lamin的溶解度重量与PP2A-Tws促进薄板组装的想法一致(). 然而,Myc-Lamin第7章同样受到OA的影响,这表明Lamin上CDK位点外的磷酸化也可以破坏叶片(见下文)。
最后,我们利用遗传学测试细胞周期蛋白B-CDK1是否对抗PP2A-Tws和胚胎中拉明之间的协同作用。我们发现引入了CycB基因突变等位基因兰姆K2(K2)/+; tws公司P(P)/+女性部分地挽救了生育能力,这表明PP2A-Tws通过去磷酸化细胞周期蛋白B-CDK1位点(可能在拉明上)部分地促进了NER().
PP2A-Tws在有丝分裂退出期间促进Lamin和Nup107向新生核的募集
上述遗传和生化结果表明,PP2A-Tws可能促进有丝分裂末期细胞核上的层粘连蛋白重组。为了测试这个想法,我们生成了一个果蝇属稳定表达GFP-Lamin和mCherry-α-Tubulin的D-Mel2细胞系,并通过RNAi检测Tws缺失对GFP-Lamin.重组的影响。Tws的沉默被Western blot证实(). 在对照细胞(转染了抗细菌卡那霉素抗性基因[KAN]的双链RNA[dsRNA])中,GFP-拉明在后期纺锤体伸长5到10分钟后开始在重整细胞核上富集。相比之下,在Tws缺失细胞中,GFP-Lamin出现较晚,在纺锤体伸长后20至25分钟(). 我们得出结论,PP2A-Tws促进了NER期间拉明的招募。
PP2A-Tws用于在有丝分裂退出期间及时招募Lamin和Nup107以重新组装细胞核。(A)Western blots显示Tws的RNAi缺失。(B和D)表达GFP-Lamin(B)或GFP-Nup107(D)和mCherry-Tubulin的细胞在转染抗Tws或细菌KAN基因的dsRNA后进行实时成像(非靶控)。红色框和黄色箭头表示GFP-Lamin或Nup107-GFP开始重新聚集细胞核。比例尺,5μm。(C和E)定量B和D实验中重组核的GFP-Lamin或GFP-Nup107募集。定量每个时间点重组核固定大小区域的荧光强度。在每种情况下,对29到45个细胞进行定量。阴影区域表示SD。P值来自双尾t吨测试。
我们想知道PP2A-Tws是否专门促进NER中拉明的招募,或者它是否也影响NE的其他成分。我们检测了Nup107,Nup107-Nup160亚复合物的一个成分,其在NE中的招募使核孔复合物组装成核,并不依赖人类细胞中的拉明(Clever等人,2012年;Schellhaus等人,2016年). 此外,人类Nup107在有丝分裂中被磷酸化,并被PP2A-B55有效地去磷酸化(Glavy等人,2007年;Cundell等人,2016年). 至于GFP-Lamin,GFP-Nup107的招募在Tws耗尽后延迟(). 我们还测试了努普107发现它们在基因上与tws公司,比如层粘连蛋白,具有相似的胚胎表型(图S3)。这些结果可以反映PP2A-Tws在Lamin和Nup107的去磷酸化中的作用,以促进其向NE的补充。或者,PP2A-Tws可以去磷酸化Lamin和Nup107上游的一个因子,以促进NER。
PP2A-Tws在有丝分裂退出过程中促进上游因子BAF向新生细胞核的募集
根据上述结果,我们寻找了一种可在NER期间由拉明和Nup107上游的PP2A-Tws调节的蛋白质。我们对BAF产生了兴趣,因为它的人类同源蛋白可能是NER级联中招募的第一个蛋白质(Schellhaus等人,2016年). BAF是一种保守蛋白,在间期与NE的DNA和LEM(LAP2-蛋白质MAN1)域蛋白相互作用(Margalit等人,2007年). 在人类细胞和秀丽线虫,BAF在早期有丝分裂时分散在细胞质中,并在末期重新聚集在DNA上,在DNA上将染色体结合在一起,从而在单个核周围形成NE(Haraguchi等人,2001年;Samwer等人,2017年). 此外,在末期BAF向染色质的募集已被证明依赖于PP2A秀丽线虫和HeLa细胞,尽管所涉及的PP2A的调节亚基的身份尚不清楚(Asencio等人,2012年).
为了检查果蝇属在细胞分裂过程中,我们建立了稳定表达GFP-BAF和mCherry-Tubulin的细胞系。我们发现了果蝇属BAF在间期为核,有丝分裂时分散在细胞内。在有丝分裂退出过程中,GFP-BAF很快被募集到染色质中,在纺锤体伸长4分钟后开始([top]和B;和视频5)。我们测试了BAF的招募是否依赖于PP2A-Tws。在NER期间,Tws耗竭会导致GFP-BAF招募延迟。此外,招聘模式也发生了变化。在对照细胞中,GFP-BAF最初在染色体上强烈招募,但它们仍然出现浓缩(早期),然后GFP-BAF局限于核外周(晚期)。在人类细胞中观察到类似的动力学(Haraguchi等人,2001年,2008). 相反,在Tws缺失的细胞中,GFP-BAF募集立即局限于核外周,从未达到对照细胞中的峰值强度(【底部】和B;和视频6)。我们得出结论,PP2A-Tws促进了BAF在有丝分裂退出期间及时补充到染色体。此外,PP2A Tws似乎是NER开始时BAF向分离染色体强烈募集的早期阶段所需的。PP2A-Tws调节BAF在重组细胞核上的负荷的进一步证据来自我们的观察,Endos的耗竭选择性地抑制PP2A-Tws在早期有丝分裂中的表达(Rangone等人,2011年),推进BAF招募(图S4)。
PP2A-Tws是在有丝分裂退出期间及时募集BAF以重组细胞核所必需的。(A)在用针对Tws或细菌KAN基因的dsRNA转染后(非靶向对照),对表达GFP-BAF和mCherry-Tubulin的细胞进行实时成像。红色框和黄色箭头表示GFP-BAF募集的开始。比例尺,5μm。(B)定量A实验中重组核的GFP-BAF募集。定量每个时间点重组核固定大小区域的荧光强度。对于RNAi KAN和RNAi Tws,分别量化了26和25个细胞。阴影区域表示标准偏差。P值来自双尾t吨测试。
在秀丽线虫有丝分裂中染色质释放BAF是由VRK-1激酶磷酸化BAF触发的(Gorjánácz等人,2007年). 尽管果蝇属众所周知,BAF是体细胞正常细胞周期进展和NE组织所必需的,其在有丝分裂中的调控尚未被探索(Furukawa等人,2003年). 然而,在卵子发生过程中,BAF在前期被NHK-1激酶磷酸化,NHK-1是VRK-1的同源物(Lancaster等人,2007年). 因此,染色体在NE分解之前就与NE分离,形成一种称为核小体的紧密结构。BAF的NHK-1依赖性磷酸化的破坏导致染色体和NE之间持续结合,继而发生减数分裂缺陷和雌性不育(Lancaster等人,2007年). 我们假设NHK-1在磷酸化BAF以触发其在女性减数分裂中从染色质中释放的作用也可能在有丝分裂中起重要作用果蝇属为了测试这一点,我们突变了BAF中三个已知的NHK-1磷酸化位点(Lancaster等人,2007年)转化为丙氨酸残基(BAF3A级; 图S5 A)。GFP-BAF公司3A级与GFP-BAF不同的是,在有丝分裂中保留在染色体上重量表明NHK-1对BAF的磷酸化是BAF在有丝分裂中扩散所必需的(,顶部;视频7和8;和图S5 B)。相比之下,磷酸化GFP-BAF三维与GFP-BAF相比,在有丝分裂退出期间其向染色体的募集有缺陷重量其动力学与GFP-BAF相似重量Tws耗尽后(图S5 C;与). 这些结果表明,PP2A-Tws通过去磷酸化BAF上的NHK-1位点促进BAF在重组细胞核上的募集。
BAF和层粘连蛋白向重组核的募集依赖于BAF去磷酸化。(A和C)表达RFP-Lamin和GFP-BAF细胞的实时成像重量(A) 或GFP-BAF3A级(C) 用dsRNA转染Tws或细菌KAN基因(非靶控)后进行。红色框和黄色箭头表示RFP-拉明开始向分离的染色体募集。白色箭头表示BAF重量招聘。比例尺,5μm。(B和D)A和C实验中RFP-层蛋白募集的量化。在每个时间点对重组核的固定大小区域的荧光强度进行量化。在每种情况下,对20到35个细胞进行定量。阴影区域表示SD。(E)引进一个突变等位基因nhk-1型在里面兰姆K2(K2)/+; 行波管P(P)/+女性拯救她们所生产的胚胎的发育。对所示基因型雌性胚胎的孵化率进行评分。误差线代表SD.**,P=0.0012;***,P<0.0001双尾t吨测试。
接下来,我们测试了BAF在染色体上依赖Tws的募集是否足以募集拉明。在表达GFP-BAF的细胞中重量和RFP-Lamin,我们发现,正如预期的那样,Tws的耗竭延迟了NER期间RFP-Lamins的补充(; 和视频9)。相反,在表达GFP-BAF的细胞中没有观察到拉明募集延迟3A级耗尽Tws(; 和视频10)。这些结果表明,PP2A-Tws对BAF的去磷酸化促进了NER期间拉明的募集。然而,GFP-BAF3A级在整个有丝分裂过程中没有在染色体上保留拉明,这表明拉明的募集不仅仅依赖于BAF去磷酸化,而且可能受到其他机制的调节。上述机制之一可能是PP2A-Tws对拉明的直接去磷酸化作用。
上述结果表明,观察到的行波管和层粘连蛋白在胚胎中,可能部分反映了PP2A-Tws在NHK-1位点BAF去磷酸化中的作用,并且这种去磷酸化是重组NE的层粘连蛋白补充所必需的兰姆K2(K2)/+; tws公司P(P)/+雌性可能会挽救它们的生育能力。有趣的是,引入两个突变等位基因中任一个的单一拷贝nhk-1型在里面兰姆K2(K2)/+; tws公司P(P)/+雌性挽救了它们所产胚胎的生存能力(). 这一结果表明PP2A-Tws在拮抗NHK-1促进女性减数分裂后的NER和合胞体有丝分裂中起着关键作用。
BAF的去磷酸化促进其与拉明的结合
在脊椎动物中,BAF通过多种LEM结构域蛋白与层粘连蛋白结合(Schellhaus等人,2016年). 在人类细胞中,这些相互作用受到NHK-1对BAF磷酸化的负调控(Margalit等人,2007年). 通过共免疫沉淀,我们确认果蝇属BAF与拉明合作。我们使用该分析来研究BAF-Lamin联合是如何调节的(). 用OA治疗细胞可以消除GFP-BAF和Myc-Lamin之间的联系,这与PP2A-Tws在NER期间促进BAF和Lamin之间联系的观点一致(,车道2与车道1)。
BAF和Lamin之间的联系由有丝分裂激酶和磷酸酶调节。(A)如图所示,将稳定表达GFP-BAF和Myc-Lamin的细胞进行不同处理,然后进行针对GFP和Western blots的免疫沉淀(IP)。共免疫沉淀的Myc-Lamin和GFP-BAF之间的比率(三个实验之间的平均值)如下所示。误差条代表SEM。(B)通过转染稳定表达NHK-1-PrA的细胞并进行Western blot,验证了dsRNA对NHK-1的有效性。(C)BAF-层蛋白结合的破坏需要BAF中的NHK-1磷酸化位点(实验如A所示)。
为了测试NHK-1是否对BAF-层粘连进行负调控,我们用抗NHK-1的dsRNA转染细胞(或作为阴性对照的抗KAN)。通过Western blot监测PrA标记的NHK-1的耗竭,验证了dsRNA对NHK-1有效性(). 我们发现沉默NHK-1倾向于促进BAF-Lamin关联((第4车道对第1车道),甚至部分地挽救了OA处理细胞中的这种关联(第5车道对第2车道)。用RO-3306(一种阻止有丝分裂进入的CDK1抑制剂)处理细胞,加强了BAF和Lamin之间的联系,这与NHK-1在有丝分裂中磷酸化BAF的观点一致(). 这些结果表明,在有丝分裂中,BAF–Lamin结合受到NHK-1的负调控。
为了测试OA治疗对BAF–Lamin结合的破坏是否依赖于BAF上NHK-1磷酸化位点,我们使用BAF进行了铜提纯3A级(). 与BAF不同重量在OA治疗(第4车道与第3车道)时,BAF未与Lamin联系3A级即使在OA在场的情况下,也会与拉明合作(6号车道vs 5号车道)。相反,BAF三维即使没有OA治疗,也不能与Lamin结合(泳道7和8)。这些结果表明,NHK-1通过其已知的磷酸化BAF的能力,破坏了BAF-Lamin关联,并且OA敏感性磷酸酶活性,可能包括PP2A-Tws,除了促进BAF早期补充到染色质之外,还抵消了这种磷酸化,促进BAF-Lamin关联。我们没有观察到Tws RNAi后BAF–Lamin关联性下降(数据未显示)。这一结果是意料之中的,因为Tws RNAi只将拉明招募延迟了10-15分钟()和作为果蝇属众所周知,培养中的细胞很难同步,该检测使用异步培养,其中大多数细胞处于间期。
为了探索PP2A-Tws可能在何时何地调节细胞中的BAF,我们使用了近端连接分析(PLA),该分析监测两种蛋白质之间的接近程度,就像它们相互作用时一样。使用稳定表达GFP-BAF和Myc-Tws的细胞系,以及抗GFP和Myc的初级抗体。我们在GFP-BAF和Myc-Tws之间检测到大量PLA病灶(). PLA信号是特异性的,因为它在仅表达GFP-BAF或Myc-Tws或两者都不表达的细胞中未被检测到。此外,如果遗漏任何一种主要抗体,则在表达这两种融合蛋白的细胞中未检测到PLA信号(数据未显示)。有趣的是,在有丝分裂晚期和胞质分裂期,每个细胞的PLA信号焦点数量显著高于间期和早期有丝分裂。此外,病灶主要存在于细胞质中(). 这些结果与PP2A-Tws在细胞质BAF去磷酸化过程中的作用一致,从而在有丝分裂退出期间促进其随后向重组核的募集。
Tws在有丝分裂退出期间与BAF相关,PP2A-Tws使BAF去磷酸化。(A)解放军。左图:用Myc-Tws和GFP-BAF转染的细胞用Myc和GFP抗体(红色病灶)提交给PLA。Myc的免疫荧光平行进行,DNA用DAPI染色。右图:量化每个细胞的PLA病灶。仅表达Myc-Tws或GFP-BAF的细胞作为对照进行分析。误差线代表SEM。*,P=0.0488;**,P=0.0082;***,P=0.0002,双尾t吨测试。比例尺,5μm。(B)PP2A-Tws在体外脱磷酸BAF肽。对Flag-Tws、Flag-Wdb或Flag-GFP进行免疫沉淀,并与指示的磷酸肽孵育不同时间。左图:按照材料和方法中的描述测量磷酸盐释放。误差条代表SD。右:免疫沉淀产物通过蛋白质印迹进行分析。Mts带强度的相对定量显示在印迹下方。所有显示的结果都是在同一(代表性)实验中获得的。误差条表示三倍的SD。(C和D)转染有指示蛋白的细胞进行GFP联合免疫沉淀,然后进行Western blot分析。星号表示免疫沉淀产物中的背景带(可能对应于IgG重链的二聚体)。
我们使用体外测定来测试在Ser5磷酸化的BAF肽的去磷酸化动力学(BAF-pS5;图S5 a)。该位点相当于人类BAF中已知的主要NHK-1位点,其去磷酸化被证明可以促进BAF与NE处DNA和LEM蛋白的结合(Nichols等人,2006年;Lancaster等人,2007年). 作为酶,我们使用通过标记的调节亚单位的免疫沉淀获得的PP2A。我们发现PP2A-Tws可以使BAF-pS5脱磷酸(). 该反应慢于人类PRC1(PRC1-pT481和PRC1-pT602;Cundell等人,2013年). 这一结果是意料之中的,因为已知PP2A-B55酶比其底物中的pSer残基更快地去磷酸化pThr残基(Cundell等人,2016年;Hein等人,2017). 为了进行比较,我们测试了PP2A-Wdb/B56对相同位点的去磷酸化能力,并将反应中PP2A催化亚基(Mts)的数量归一化为通过Western blot定量的活性。与人类细胞的结果一致,PP2A-Wdb能够比PRC1-pT481更好地去磷酸化PRC1-pT 602(Cundell等人,2013年). 在BAF-pS5上检测到PP2A-Wdb的活性很低。这些结果证实,Tws对PP2A在其主要NHK-1位点对BAF的去磷酸化具有特异性。
尽管我们的结果强烈表明BAF是PP2A-Tws的靶点,但如前所述,Lamin和Nup107也可能是其靶点。我们用共免疫沉淀法测试了这些带有GFP标记的蛋白质与Myc-tagged Tws相关的能力。BAF、Lamin和Nup107都与Tws特别相关(). 这些结果表明PP2A-Tws以多种蛋白质为靶点来促进NER。
讨论
与有丝分裂进入的机制相比,调节有丝分裂有序退出和返回间期的分子机制要少得多。此外,虽然已知磷酸酶在促进有丝分裂到间期转变中起着关键作用,但它们对这一过程中各种事件的具体贡献仍基本未知。在这里,我们使用了果蝇属用于搜索和剖析细胞周期中由PP2A-B55/Tws磷酸酶控制的分子事件的系统。第二阶段非补体筛选已用于各种模型生物,以识别功能相关基因(Hawley和Gilliland,2006年). 这项工作建立在第二站点非执行母体效应屏幕的威力之上果蝇属确定细胞周期调控中基因之间的密切协作(White-Cooper等人,1996年;Archambault等人,2007年;Wang等人,2011年).
我们的基因筛查揭示了PP2A-Tws和M期末的NER之间的紧密联系。我们发现,使用母亲的杂合突变同时降低卵子中Tws和Lamin的水平会导致减数分裂II后或启动合胞核分裂的胚胎有丝分裂后NER的主要缺陷。考虑到拉明不是几种细胞类型中的必需蛋白,这一结果令人震惊。低形态的层粘连蛋白突变体发育到成年,尽管在光感受器中表现出核迁移缺陷,并且是雌性不育的(Patterson等人,2004年). 在层粘连蛋白无突变体,神经母细胞在缺乏可检测拉明的情况下继续增殖(Osouda等人,2005年). 在小鼠中,至少在角质形成细胞中,直系B型层粘连对细胞存活和增殖是不必要的;然而,B型层粘连在神经元中是必不可少的(Yang等人,2011年). 一般来说,B型层粘连蛋白在构建细胞核和抵抗细胞核迁移/定位至关重要的细胞内的力方面发挥着关键作用。此类单元格类型包括果蝇属卵子和合胞体胚胎,在融合前原核必须汇聚在一起,核向皮层迁移。
使用培养细胞,我们发现PP2A-Tws促进有丝分裂后几个NE成分的募集,即BAF、Lamin和Nup107。在果蝇属卵子发生时,NHK-1磷酸化BAF促进核小体形成过程中染色质从生发囊中分离(Lancaster等人,2007年). 在这项工作中,我们发现BAF需要NHK-1磷酸化位点在NEB期间从染色质中分离出来,如秀丽线虫(Gorjánácz等人,2007年;Asencio等人,2012年). 我们的遗传、生化和成像结果表明,PP2A-Tws逆转了NHK-1对BAF的磷酸化,以促进其在NER发病时在染色质上的募集(). 这与中的结果一致秀丽线虫这表明了PP2A在这一过程中的作用,尽管BAF中的相关磷酸化位点没有被研究,并且涉及的PP2A适配器亚基也不清楚(Asencio等人,2012年). 最近的研究表明,BAF在后期将染色体结合在一起以促进NE围绕单个核的组装方面发挥着关键作用(Samwer等人,2017年). 我们的研究结果表明,PP2A-Tws使BAF去磷酸化以促进这一功能。我们的结果还表明,NHK-1和PP2A-Tws对BAF磷酸化的调节调节其与拉明形成复合物的能力。在脊椎动物中,已知BAF通过NE的LEM域蛋白与层粘连蛋白相互作用(Schellhaus等人,2016年). VRK1/NHK-1对人BAF的磷酸化降低了其与LEM结构域相互作用的能力(Nichols等人,2006年). LEM域蛋白也被磷酸化,以负向调节其与BAF相互作用的能力X·莱维斯提取物(Hirano等人,2005年,2009). 因此,PP2A-B55可以使LEM蛋白去磷酸化,从而进一步促进其在NER期间与BAF的结合,这种可能性值得研究。
PP2A-Tws在有丝分裂后促进NER作用的模型。随着细胞进入有丝分裂,细胞周期蛋白B-CDK1磷酸化层粘连蛋白(红色)和可能的其他蛋白质,包括Nup107(Nups为黄色),以诱导NEB.NHK-1磷酸化BAF(蓝色),诱导其与染色质分离。当细胞退出有丝分裂时,PP2A-Tws使BAF去磷酸化,诱导其在后期快速募集到浓缩染色质(绿色表示PP2A-Tws激活)。Lamin和Nup107也可能被PP2A-Tws去磷酸化,以促进其在NE中的组装。当NE被重组时,BAF被限制在细胞核的内周。
PP2A-Tws通过诱导BAF在重组细胞核上的募集,可能促进多个下游NE成分的募集。然而,PP2A-Tws可能在NER中有其他目标,可能包括Lamin和Nup107(). 这两种蛋白质都含有多个CDK磷酸化基序,PP2A-B55酶已被证明能有效地去磷酸化许多这样的位点(Mayer-Jaekel等人,1994年;Castilho等人,2009年;Mochida等人,2009年). 此外,我们观察到拉明和Nup107都与Tws相关。我们发现,拉明中所有CDK共有位点的突变阻止了有丝分裂过程中的叶片分解,尽管所有位点的拟磷酸化突变并没有破坏活细胞中的叶片组装,但它增加了拉明在细胞裂解物中的溶解度。拉明上的CDK位点在螺旋区两侧分为两个簇,其中一些位点已被证明对拉明的同型相互作用具有负调控作用(;Machowska等人,2015年). 我们还没有探索在Nup107中突变CDK位点的影响。然而,Nup107在人类细胞有丝分裂退出过程中在多个部位迅速去磷酸化(McCloy等人,2015年)Nup107中至少一个CDK位点的去磷酸化被证明依赖于PP2A-B55(Cundell等人,2016年). 然而,尽管PP2A-B55能够去磷酸化几个CDK位点,但其中许多位点可能主要受体内另一种磷酸酶的调节。此外,最近发现了大量PP2A-B55依赖性非CDK位点的例子(Cundell等人,2016年). PP2A-Tws在NHK-1位点对BAF的去磷酸化进一步证明了这一点,该位点不能是CDK位点,因为它在+1位缺乏脯氨酸残基。然而,由于其带正电荷的氨基酸残基位于位置+2到+4(图S5),该位点类似于最近定义的PP2A-B55共有基序(Cundell等人,2016年)和在+1位缺乏Pro残基但在有丝分裂退出期间迅速去磷酸化的位点的一致模体(McCloy等人,2015年).
总的来说,PP2A-B55似乎以多种蛋白质为靶点,在依赖多种激酶的不同位点对其进行去磷酸化,从而协同促进NER。最近的一项磷酸蛋白质组学研究发现,在有丝分裂退出过程中,NE的几种蛋白质特别容易快速去磷酸化,这一过程可能涉及其他磷酸酶(McCloy等人,2015年). 要彻底剖析起作用的机制,还有许多工作要做。事实上,当PP2A-Tws在细胞培养中沉默时,NER只是延迟而不是完全被阻止,这可能是由于RNAi方法固有的PP2A-Tws的不完全失活所致。或者,其他磷酸酶可以部分补偿PP2A-Tws活性的损失。蛋白磷酸酶4(PP4)可能以这种方式发挥作用,因为它已被证明能使人类细胞中的BAF去磷酸化(Zhuang等人,2014). 此外,蛋白磷酸酶1酶可能有助于果蝇属因为它们通过脊椎动物的多种机制促进这一过程,包括拉明B的去磷酸化(汤普森等人,1997年;de Castro等人,2016年).
我们的筛选结果指出,PP2A-Tws在M期完成过程中的其他功能尚待探索,尽管已确定的一些遗传相互作用可以反映PP2A-Tws与有丝分裂调控无关的作用。我们未发表的初步结果表明行波管和循环B3反映了它们在减数分裂完成过程中的合作(图S1 A)。有趣的是,我们发现了tws公司以及编码核质转运因子的基因。Cse1/CAS的基因突变,将导入蛋白α转运回细胞质以促进其在核导入中的功能tws公司-依赖性胚胎致死率(图S1 A;Tekotte等人,2002年). 相反被禁止的(电子束)编码核出口因子Crm1的tws公司-依赖性胚胎致死率(图S1 B;Collier等人,2000年). 这些结果表明,活性核导入在有丝分裂和/或减数分裂后的NER或间期核建立的其他方面起着重要作用,可能是通过促进关键酶或结构因子的核定位。定义这些因子及其在有丝分裂退出过程中核质转运的调控应该是未来研究的主题。
在这项工作中,我们使用了一种遗传策略来搜索PP2A-Tws在体内细胞周期中的作用。我们发现PP2A-Tws促进NER,并且我们已经开始剖析起作用的机制。这项研究为使用果蝇属从分子水平上更好地理解NER的机理。此外,这将是一个强有力的系统,可以进一步剖析PP2A-Tws和其他磷酸酶在有丝分裂出口协调中的功能。
材料和方法
质粒和诱变
使用网关重组系统(Invitrogen)生成质粒。每个基因的cDNA在pDONOR221进入载体中克隆,然后重组到含有铜诱导(pMT)或组成(pAC5)启动子的目的载体中。生成了以下质粒:pAC5-GFP-Lamin重量,pAC5-Myc-Lamin重量,pAC5-Myc-Lamin第7章,pAC5-Myc-Lamin第7天,pMT-RFP-胺重量,pMT RFP拉明第7章,pMT-RFP-胺第7天,pAC5-mCherry-Tubulin,pMT-GFP-Nup107,pMT-GFP-BAF重量,pMT-GFP-BAF3A级,pMT-GFP-BAF三维pAC5-Myc-Tws、pAC5-GFP-Tws、p AC5-Flag-Tws、pAC 5-Flag-Wdb、pAC5-Flag-GFP和pAC5-NHK-1-PrA。使用制造商描述的QuikChange闪电定点突变试剂盒(Agilent)生成氨基酸替代突变体。表达Lamin突变体的质粒的cDNA由BioBasic产生。
苍蝇培养、基因筛查和生育测试
根据标准程序进行苍蝇培养。在遗传筛查中,使用了417个包含大多数Drosdel缺陷的品系和一些额外的品系(从加拿大蒙特雷亚尔蒙特雷阿尔大学的马丁·勒夫兰索瓦和马克·塞里安获得),涵盖了大多数第二和第三染色体(完整列表见表S1)。每条线都交叉到y w;tws公司P(P)/TM6B(TM6B)或mts公司XE-2258型/青色线。苍蝇杂合子既有缺失也有tws公司P(P)或百万吨XE-2258型根据缺少平衡染色体的情况选择突变,并测试其生育能力(见下文)。表S3列出了本研究中使用的所有突变等位基因、其分子损伤及其起源。从布卢明顿获得了突变蝇系果蝇属Stock Center(印第安纳州布卢明顿)、Aldelaide Carpenter和David Glover(英国剑桥大学)、Hiroyuki Ohkura(苏格兰爱丁堡Wellcome细胞生物学信托中心)或Marc Therrien(加拿大魁北克省蒙特雷大学)。表达GFP-Polo的苍蝇取自Claudio Sunkel(葡萄牙波尔图Celular生物分子研究所)。
对于中所示的生育测试,(左)、S1 B和表S2,每管将3至5只1至4天大的处女与3至5头俄勒冈州R雄性杂交,并在25°C下保存1天。然后将苍蝇转移到含有葡萄汁琼脂和酵母膏的试管中。1天后,苍蝇再次被转移到新的试管中。24h后,计数孵化胚胎的百分比。每次统计大约100个胚胎,这个评分至少重复三次。对于中所示的实验,(右),S1 A和S3,对5至10只单身处女与3至5只俄勒冈州R雄性杂交后代的生育能力进行评分。用于基因筛查(和表S1),三到五只雌性(不一定是处女)与三到五只俄勒冈州R雄性杂交,在连续三天对其生育能力进行评分,并将数字汇总。
胚胎和卵子免疫染色
如图所示的免疫荧光雌鼠在25°C的葡萄汁琼脂上放置胚胎2小时。如前所述,胚胎立即脱绒毛并固定(Archambault等人,2007年). 以下一级抗体用于染色:来自小鼠的抗Lamin Dm0 ADL84.12(1:100;发育研究杂交瘤库),来自大鼠的抗-α-微管蛋白YL1/2(1:50,#6160;Abcam),以及来自小鼠的抗-γ-微管蛋白GTU-88(1:50,#T5326;Sigma)。在4°C下对一级抗体进行过夜培养后,在室温下用与Alexa Fluor 488(1:200;Invitrogen)或Cy3(1:200,Jackson)偶联的二级抗体培养胚胎2小时。DNA用DAPI标记。使用Vectashield(Vector Laboratories)安装胚胎。图像使用带有63倍油物镜的LSM 700共焦显微镜(蔡司)生成,并使用Photoshop进行处理。
用于检查减数分裂(),雌性在琼脂平板上产卵20分钟,然后将卵子脱胆碱并在0.7%NaCl和0.05%Triton X-100的溶液中清洗。然后将鸡蛋固定在1:1的庚烷/甲醇溶液中,然后在100%甲醇中清洗;在90%、70%和50%甲醇中依次复水;并在PBS+0.2%吐温中洗涤。然后用1:100抗拉明ADL 67.10(来自小鼠)(发育研究杂交瘤库)、1:2000大鼠抗α-管蛋白YL1/2(Sigma)和Oligreen(Invitrogen)孵育卵子。使用二级Alexa缀合的抗体(1:1000)。然后使用1,2,3,4-四氢萘(Sigma)将鸡蛋装好。在Olympus FV1000扫描共聚焦显微镜上使用60×水物镜拍摄图像。
果蝇属细胞培养与药物治疗
D-Mel2细胞在添加谷氨酰胺、青霉素和链霉素的Express Five培养基(Invitrogen)中培养。在含有10µg/ml速溶菌素的选择培养基中生成稳定的细胞系。通过添加CuS0诱导铜诱导启动子下转基因的表达4(300µM)置于培养基中至少8 h。对于磷酸酶抑制,细胞在被溶解进行免疫沉淀之前用100 nM OA(Bioshop)处理30 min。为了抑制CDK1,细胞在裂解前用10µM RO-3306(Tocris Bioscience)处理1 h和30 min。
瞬时转染
70%至80%的D-Mel2细胞在六孔板或25cm中汇合2按照制造商的指示,使用X-tremeGene HP DNA转染试剂(Roche)分别用2.5µg或5µg质粒转染烧瓶。在进行分析之前,细胞在25°C下培养24至72小时。对于RNAi,将60-70%融合的细胞置于六孔板中,并用25µg dsRNA转染Tws、NHK-1或Endos,以及Transfast试剂(Promega)。针对细菌耐药基因KAN的dsRNA被用作非目标对照。在分析之前,将细胞在25°C下培养72–96小时。
定时显微镜
使用63倍油物镜和Axiocam 506单相机(蔡司),在荧光显微镜(Axio Observer.Z1;Zeiss)上安装的旋转盘共焦系统(CSU-X1 5000;横河)上对培养细胞和胚胎进行时间荧光成像。
解放军
稳定表达GFP-Tws和Myc-BAF的D-Mel2细胞重量用4%甲醛(Sigma)固定,然后在室温下用来自兔子的抗GFP(1:200;Invitrogen)和来自小鼠的抗Myc 9E10(1:200,Santa Cruz Biotechnology,Inc.)培养细胞1小时。PLA使用制造商描述的Duolink启动试剂盒(Sigma)进行。使用Duolink抗兔+和抗鼠-探针。在扩增步骤中,在室温下用与兔Alexa Fluor 488(1:200;Invitrogen)、小鼠Cy3(1:200,Jackson)和小鼠Alexa Fluor 566偶联的二级抗体培养细胞2小时。DAPI用于DNA染色。使用LSM 700共焦显微镜拍摄图像,并使用Photoshop进行处理。
免疫沉淀和蛋白质印迹
对于每个样本,采集400万到2000万个如上转染的细胞,并在含有蛋白酶抑制剂(1 mM PMSF、10µg/ml抑肽酶和10µg/ml亮氨酸蛋白酶抑制剂)的PBS中清洗。细胞在75mM K-Hepes、pH 7.5、150mM NaCl、1mM DTT、2mM MgCl中裂解2、2 mM EGTA和1%Triton X-100,含上述蛋白酶抑制剂。将裂解液在4°C下以14600 rpm离心10分钟。将澄清的裂解物与来自兔子的抗GFP(Invitrogen)在4°C的轮子上孵育1小时,然后与15至20µl蛋白a结合的Dynabeads悬浮液(Life Technologies)在4℃孵育45分钟。在1 ml裂解缓冲液中洗涤珠4×5 min,并在Laemmli样品缓冲液中直接洗脱,以进行SDS-PAGE。Western blotting中使用的抗体包括兔抗GFP(Invitrogen)、小鼠抗Myc 9E10(Santa Cruz Biotechnology,Inc.)、抗Lamin Dm0(DSHB杂交瘤产品ADL84.12)、鼠抗α-Tubulin DM1A(Sigma)、兔抗Tws(Thermo Fisher Scientific)、兔抗H3(NEB)、,兔抗内毒素(由Thermo Fisher Scientific定制)、小鼠抗Flag M2(Sigma)、过氧化物酶结合纯化兔IgG(Jackson)、过氧酶结合AffiniPure山羊抗小鼠IgG。用于分析突变胚胎的蛋白质水平如上所述,收集俄勒冈州R区和单、双突变雌性的胚胎,并用含有蛋白酶抑制剂的PBS溶液清洗,然后在4°C下以14600 rpm离心10分钟进行粉碎和澄清。在SDS-PAGE之前,使用Bradford蛋白质检测试剂盒(Bio-Rad)对上清液中的蛋白质水平进行定量。对所有样品装载相同质量的总蛋白,并通过免疫印迹分析蛋白质。
磷酸酶测定
收集大约2亿稳定表达Flag-Tws、Flag-Wdb或Flag-GFP的D-mel2细胞,并在4°C下以1500 rpm离心5分钟。将颗粒悬浮在含有蛋白酶抑制剂的TBS中(1 mM PMSF、10µg/ml抑肽酶和10µg/ml亮氨酸蛋白酶)。在含有20 mM Tris-HCl、pH 7.5、150 mM NaCl、2 mM EGTA、0.5%NP-40、1 mM DTT和蛋白酶抑制剂(如上所述)的缓冲液中溶解细胞,并在4°C下在转轮上培养15分钟,然后在4℃下以4600 rpm离心15分钟。将上清液与反标记抗体在4°C的转轮上培养75分钟,再与蛋白G结合的Dynabeads(Life Technologies)培养45分钟。在用作磷酸酶分析的酶源之前,用裂解缓冲液清洗珠子4×5分钟。以下肽被用作底物:BAF-pS5、MSGTpSQKHRNFVAEPMGNK;PRC1-pT481,SKRRGLAPNpTPGKARKLNTTT;PRC1-pT602、LSKASKSDATSGILNSpTNIQS(均由Biobasic合成)。2×反应溶液包含400µM肽、20 mM Tris、pH 7.5、5 mM MgCl21 mM EGTA、20 mMβ-巯基乙醇和1.45 mg/ml BSA。对于磷酸酶反应,将等体积的2×反应溶液和洗涤珠悬浮液混合,并在室温下在96 well板中培养。通过添加90 mM HClO停止反应4通过添加1体积的1 M孔雀石绿溶液,可以发现磷酸盐的释放。然后使用平板读取器(Tecan Infinite 200 PRO)在620 nm波长下测量吸光度。对于中显示的结果从Flag-Tws和Flag-Wdb获得的测量值中减去用Flag-GFP获得的每个时间点的比色测量值。T的值0也从两个系列中减去。通过将获得的最高值固定为1(2小时后与PRC1-pT602肽上的Flag-Tws相关的活性),对所有值进行标准化。此外,通过将与Flag-Wdb相关的活性除以来自Flag-Wdb免疫沉淀/Flag-Tws免疫沉淀复合物的Mts带强度的比值,对反应中存在的PP2A催化亚单位(Mts)的数量进行归一化。
在线补充材料
图S1显示了已鉴定的PP2A Tws的遗传相互作用。图S2显示,来自雌性的胚胎杂合兰姆K2(K2)或tws公司P(P)仅等位基因显示出轻微的发育缺陷。图S3显示,PP2A-Tws和Nup107之间的协作是合胞体胚胎发育所必需的。图S4显示,Endos的耗竭促进了BAF在有丝分裂后重组细胞核上的募集。图S5显示BAF在NHK-1位点的磷酸化控制其在有丝分裂中的定位。表S1列出了基因缺失筛查的完整结果。表S2显示了层粘连蛋白以及编码各种磷酸酶亚基的基因。表S3列出了本研究中使用的突变等位基因、其来源及其分子损伤。视频1显示了WT母亲表达GFP-Polo的胚胎的正常发育。视频2显示了一个表达GFP-Polo的胚胎的异常发育兰姆K2(K2)/+; tws公司P(P)/+母亲。视频3显示稳定表达RFP-Lamin的细胞分裂重量在有丝分裂时分散,在有丝裂退出时重新组装。视频4显示稳定表达RFP-Lamin的细胞分裂第7章这在有丝分裂中并不分散。视频5显示了稳定表达GFP-BAF和转染对照dsRNA抗KAN的mCherry-Tubulin细胞的分裂。视频7显示了一个稳定表达GFP-BAF和RFP-Lamin的细胞分裂,该细胞转染了针对KAN的对照dsRNA。视频8显示了稳定表达GFP-BAF的细胞分裂3A级视频9显示了稳定表达GFP-BAF和转染抗Tws dsRNA的RFP-Lamin细胞的分裂。视频10显示稳定表达GFP-BAF的细胞分裂3A级和RFP-Lamin转染抗Tws的dsRNA。
致谢
我们感谢马丁·勒弗兰索瓦、马克·塞里安、大卫·格洛弗、阿德莱德·卡彭特、大久拉、克劳迪奥·桑克尔和布卢明顿果蝇属航班库存中心。我们感谢V.Archambault实验室成员的评论和讨论。
这项工作得到了加拿大卫生研究院(向V.Archambault提供MOP-13558)和加拿大自然科学与工程研究委员会(向V.Archambault提供402217-2011 RGPIN,向A.Swan提供RGPIN-2017-05839)的支持。H.Mehsen、V.Boudreau、D.Garrido、M.Larouche和V.Archambault持有或持有魁北克省圣公会的奖学金。免疫与癌症研究所部分由加拿大创新基金会和魁北克-桑特费切基金会支持。
作者声明没有竞争性的经济利益。
作者贡献:V.Archambault、H.Mehsen和V.Boudreau设计了该项目。H.Mehsen、V.Boudreau、D.Garrido、M.Bourouh、M.Larouche和A.Swan进行了实验。V.Archambault、A.Swan和P.Maddox监督了这项工作。V.Archam bault,H.Mehsen,A.Swan,V.Boudreau和M.Bourouh撰写了这篇论文。
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