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Oncol Lett公司。2017年10月;14(4): 4396–4402.
2017年7月24日在线发布。 数字对象标识:10.3892/2017年6月661日
预防性维修识别码:PMC5594252
PMID:28943955

p53抑制c-Myc诱导的sirtuin 1表达上调

摘要

Sirtuin 1(Sirt1),一种保守的NAD+依赖性脱乙酰酶是通过热量限制来调节寿命的介质。然而,Sirt1可能会增加患癌症的风险。因此,Sirt1在多种类型的癌细胞中的表达水平选择性升高;然而,这种差异调节的机制在很大程度上仍然未知。本研究表明,癌蛋白c-Myc是Sirt1的直接调节器,仅在没有功能性p53的细胞中解释了Sirt1表达上调的原因。在p53缺陷细胞中,c-Myc的过度表达增加了Sirt1 mRNA和蛋白表达水平及其启动子活性,而c-Myc抑制剂10058-F4则诱导Sirt1基础mRNA和蛋白质表达水平降低。缺失/突变图谱分析显示,c-Myc与Sirt1启动子的保守E-box[-189至−183碱基对(bp)]结合。此外,p53和c-Myc至少共享响应元件,p53的存在可能会阻断c-Myc与Sirt1启动子的结合,从而抑制c-Myc介导的Sirt1激活子活性的上调。本研究表明,Sirt1的表达水平受到癌蛋白c-Myc和抑癌基因p53的严格调控,这有助于更好地理解其在特定条件下的表达调控和肿瘤启动子作用。

关键词:sirtuin 1,c-Myc,p53,肿瘤发生

介绍

Sirtuin 1(Sirt1),一种保守的NAD+依赖性脱乙酰酶参与调节转录沉默和细胞存活,已知通过重要转录因子的脱乙酰化在肿瘤发生中起作用,包括肿瘤蛋白p53(p53)(1),E2F转录因子1(E2F1)(2)和核因子-κB().

尽管Sirt1在肿瘤发生中起着矛盾的作用,但在许多类型的癌细胞中,Sirt1的表达水平增加。Sirt1上调常见于非黑色素瘤皮肤癌,包括光化性角化病、鲍文氏病、鳞状细胞癌和基底细胞癌(4). 低分化小鼠和人类前列腺癌中Sirt1表达水平也显著增加(5)、急性髓细胞白血病(AML)(6)和淋巴瘤(7).

Sirt1的表达水平受癌基因和抑癌基因的差异调节。据报道,p53可抑制PC12神经元癌细胞中Sirt1的表达,并通过叉头盒O3激活的Sirt1转录将其清除(8,9). 研究转化相关的p53敲除小鼠进一步支持了该模型,这些小鼠在许多组织中表达了组成性较高的Sirt1 mRNA表达水平(10).

值得注意的是,另一种作为Sirt1表达水平阻遏物的肿瘤抑制因子癌症1(HIC1)中的高甲基化与Sirt1形成转录抑制复合物,诱导Sirt1转录的抑制(11). Sirt1表达受转录因子E2F1调节,E2F1结合Sirt1启动子内的两个位点。E2F1是响应DNA损伤的Sirt1表达水平的关键激活物(2). 值得注意的是,与Sirt1表达调控相关的大多数已确定转录因子也受到Sirt1脱乙酰化作用的影响,并形成正反馈或负反馈回路以微调细胞命运。

c-Myc是Sirt1脱乙酰的另一种致癌转录因子(12). 目前尚不清楚c-Myc是否参与Sirt1脱乙酰化的反馈回路。在本研究中,发现c-Myc直接与Sirt1启动子的保守E-box(−189至183 bp)结合,并在p53缺陷细胞中诱导其转录。p53通过阻断其与Sirt1启动子的结合来抑制c-Myc介导的Sirt1基因启动子活性的上调。Sirt1的这一新调控将其确定为一类新的c-Myc和p53靶基因的原型,并有助于理解其在某些肿瘤细胞中的作用。

材料和方法

细胞培养、转染和试剂

小鼠胚胎成纤维细胞MEF/3T3、人类胚胎肾293A、人类结直肠癌HCT116、人类骨肉瘤U2OS、人类白血病K562和人类非小细胞肺癌H1299细胞购自美国类型培养收集(弗吉尼亚州马纳萨斯)。所有细胞均保存在添加了谷氨酰胺、青霉素/链霉素和10%胎牛血清(Sigma-Aldrich;Merck KGaA,Darmstadt,Germany)的Dulbecco改良Eagle's培养基(Thermo Fisher Scientific,Inc.,Waltham,MA,USA)中。所有转染均使用脂质体进行®2000(Invitrogen;美国马萨诸塞州沃尔瑟姆赛默飞世尔科学公司),根据制造商的协议。10058-F4购自Sigma-Aldrich(默克KGaA)。

结构和抗体

武汉三银生物科技有限公司(中国武汉)提供了标记的c-Myc和人类流感血凝素标记的p53表达载体。

对于荧光素酶报告子分析,从人类基因组DNA中扩增了Sirt1启动子的不同长度片段,从2852、−200或−102到转录起始位点(+1)。荧光素酶报告基因的引物如下:−2852片段(E1/2/3),5′-GACTCAGTGCAGCACCGTGCT-3′和5′-TTGCTTAGCTCTCCCAACTGCCT-3′;−200片段(E2/3),5′-TTAAGCTCCCCTCGCCCGCCACGT-3′和5′-TCGGTTACCTTCCAACTGCCTCT-3′;−102片段,5′-TTAAGCTTTGGGTTTAAATCTCCCG-3′和5′-ATGGTACTCTCCAACTCTCACTCCTCT-3′。在−200片段中,使用rVISTA2.0确定了两个含有共识“CACGTG”的推定c-Myc结合位点(https://rvista.dcode.org/). 通过将−200片段中的每个“CACGTG”序列更改为“TTTGGG”获得突变启动子结构,并分别命名为E2/突变体(mut)或E3/mut。将所有扩增的启动子片段克隆到限制性内切酶位点内的pGL3-碱性荧光素酶报告子(美国威斯康星州麦迪逊市Promega公司)中Sma公司我和后面的三、 打乱的siRNA(对照)和靶向p53的siRNA购自Thermo Fisher Scientific,Inc.。通过扩增MEF/3T3和H1299细胞获得的cDNA的编码区,并将其亚克隆到pEF-HA载体(Addgene,Inc.,Cambridge,MA,USA)中,可生成指示的过表达结构。使用Lipofectamine用靶向p53的siRNA瞬时转染MEF/3T3和H1299细胞®2000(Invitrogen;Thermo Fisher Scientific,Inc.),根据制造商的协议。

抗-c-Myc(N262;稀释,1:100;分类号sc-500771)、抗人Sirt1(稀释,1:200;分类编号sc-15404)、抗p53(稀释,1:500;分类号sc-126)和抗GAPDH(稀释,1:1500;分类编号sc-47724)抗体购自Santa Cruz Biotechnology,Inc.(美国德克萨斯州达拉斯)。

荧光素酶报告试验

转染后36小时收集H1299细胞。根据制造商的协议(Promega公司),使用双荧光素酶检测系统试剂盒测定细胞启动子活性。pRL-CMV肾小球荧光素酶用作内部对照。

逆转录定量聚合酶链反应(RT-qPCR)

Sirt1的表达水平通过总RNA的RT和qPCR分析确定。根据制造商的协议,使用RNA提取试剂盒(Invitrogen;Thermo Fisher Scientific,Inc.)从K562、293A和MEF/3T3细胞中提取总RNA。根据制造商的协议,使用M-MLV逆转录酶(美国马萨诸塞州伊普斯威奇新英格兰生物实验室公司),通过寡核苷酸dT引物延伸,共逆转录2µg总RNA。使用SYBR-Green Master Mix(Takara Biotechnology,Co.,Ltd.,Dalian,China)对Bio-Rad IQ5循环器(美国加利福尼亚州Hercules市Bio-Rad Laboratories,Inc.)进行qPCR。使用的引物如下:人sirt1、CAG TGG CTG GAA CAG TGA GA(正向)和TCT GGC ATG TCC CAC TAT CA(反向);人类GAPDH、GAG TCA ACG GAT TTG GTC GT(正向)和GAC AAG CTT CCC GTT CTC AG(反向);小鼠sirt1、GTA AGC GGC TTG AGG G(正向)和TTC GGG CCT CTC CGT A(反向);鼠标GAPDH、CGT CCC GTA GAC AAA ATG GT(正向)和GAA TTT GCC GTG AGT GGA GT(反向)。程序如下:95°C处理2分钟,然后在95°C下进行30次变性循环5秒,退火/延伸温度(55/68°C)处理1分钟-ΔΔCq已应用于量化(13).

染色质免疫沉淀(ChIP)

在室温下用1%甲醛处理K562和293A细胞15分钟。在4°C至500–1000 bp的温度下,通过超声剪切5个周期(打开30秒/30秒关闭)的交联染色质,然后使用前面描述的抗cMyc抗体(稀释度为1:100)或非免疫兔免疫球蛋白G(稀释度:1:500;分类号:2729S;Cell Signaling Technology,Inc.,Danvers,MA,USA)作为阴性对照物用于IP。免疫沉淀复合物通过蛋白A Sepharose珠收集(Upstate Biotechnology,Inc.,Lake Placid,NY,USA)。使用人类端粒酶逆转录酶(hTERT)或Sirt1启动子引物,使用DNA聚合酶(Takara Biotechnology,Co.,Ltd.)通过PCR扩增免疫沉淀染色质。引物如下:hTERT,5′-AGGCCGCTCCCAGTGTC-3′和5′-CGTGCCAGCGCAGCACCTC-3′;Sirt1 E2/3,5′-GGAGCGGTAGACGCACACA-3′和5′-CTTCCAACTGCCTCTCTGG-3′;Sirt1 E1:5′-AGGCCAAGTCATTTCCTTCC-3′和5′-ACCTTTGACGTGGAGTTTG-3′。程序如下:95°C 5分钟,然后在95°C下变性5秒,退火/延伸温度(55/68°C)1分钟,最后延伸68°C 10分钟。通过2%琼脂糖凝胶电泳分离得到的PCR产物。

DNA介导沉淀

如前所述,DNA-蛋白复合物被交联,染色质DNA被超声剪切。用HeLa细胞裂解物(美国马萨诸塞州剑桥市Abcam)孵育来自人类Sirt1启动子222(5′-CCCCAGGCGGAGCGGTAGAGACGCGCGCGCCAGCGCCCCCGCGCCGCCCCTCCGCCCGCGCAG-3′)或来自对照276(5′-CGCCACACACAAGAGGAAGGCGCCGCGCCGCCGCGCGCGGCCAG-3’)的总共4µg生物素化双链寡核苷酸和30µl链霉亲和素琼脂糖珠(BioVision,Inc.,Milpitas,CA,USA)在4°C下搅拌2小时。链霉亲和素琼脂糖珠与DNA探针特异结合。通过在4°C下以700×g离心10分钟使混合物成丸,并用PBS洗涤三次。结合蛋白通过随后的western blotting进行分析。

蛋白质印迹

用含有蛋白酶抑制剂混合物的放射免疫沉淀分析缓冲液(Santa Cruz Biotechnology,Inc.)对细胞进行裂解。Bicinchonic acid蛋白质检测试剂盒(Invitrogen;Thermo Fisher Scientific,Inc.)用于测定细胞的蛋白质浓度。共电泳40µg蛋白质,并用10%SDS-PAGE分离。将蛋白质转移到聚偏氟乙烯(PVDF)膜上(Invitrogen;Thermo Fisher Scientific,Inc.)。在37°C下使用封闭缓冲液封闭PVDF膜1 h后,将印迹与抗C-Myc(稀释,1:100)、抗Sirt1(稀释,1:200)、防p53(稀释,1:500)和抗GAPDH(稀释,1/500)抗体在4°C下孵育12 h。然后用TBS-Tween-20缓冲液洗涤PVDF膜,并与辣根过氧化物酶缀合的抗小鼠IgG(稀释液,1:100;目录号sc-358914;Santa Cruz Biotechnology,Inc.)在37°C下孵育1小时。根据制造商的协议,使用增强型化学发光试剂盒(中国海门贝尤泰姆生物技术研究所)和凝胶成像系统(中国上海富力科技有限公司)进行免疫复合物检测。GAPDH作为内对照蛋白。使用Image J软件版本1.47(美国马里兰州贝塞斯达国立卫生研究院)通过密度测定法对条带进行分析。

统计分析

所有统计分析均使用SPSS 17.0版(SPSS公司,美国伊利诺伊州芝加哥)进行。所有分析重复三次,数据表示为平均值±标准偏差。使用Student t检验对两组进行比较。三组之间的比较基于单向方差分析。当差异显著时,采用SNK-q检验方法进行组间比较。P<0.05被认为表明存在统计学上的显著差异。

结果

c-Myc上调p53缺陷细胞Sirt1蛋白表达水平

为了确定c-Myc对Sirt1表达水平的影响,c-Myc在各种细胞系中过度表达,包括K562、H1299、U2OS和293A。与对照组相比,c-Myc的过度表达显著增加了K562和H1299细胞中Sirt1的蛋白表达水平(图1A; P<0.05);然而,在U2OS和293A细胞中,未观察到伴随c-Myc过度表达的Sirt1蛋白表达水平的增加。K562和H1299细胞缺乏p53,而在U2OS和293A细胞中,p53表达(1416). 这意味着p53参与了c-Myc对Sirt1表达水平的调节。

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p53抑制c-Myc介导的Sirt1蛋白表达水平的上调。(A) 左侧显示转染c-Myc表达载体的K562、H1299、U2OS和293A细胞。右侧面板显示了使用GAPDH表达作为内部对照的K562、H1299、U2OS和293A细胞Sirt1蛋白表达水平的定量(Student’s t检验;n=3;P<0.05)。误差条表示平均值±标准误差。(B) 左侧显示用c-Myc表达载体转染的p53野生型或敲除型MEF/3T3。右侧面板显示了使用GAPDH表达水平作为内部对照的p53野生型或敲除MEF/3T3中Sirt1蛋白表达水平的定量(Student’s t检验;n=3;P<0.05)。(C) 左侧面板显示p53+/+或p53−/−用指定浓度的10058-F4处理24小时的MEF/3T3和HCT116细胞。右图显示了p53对Sirt1蛋白表达水平的定量+/+或p53−/−MEF/3T3和HCT116细胞以GAPDH表达水平作为内部对照(SNK-q检验;P<0.05)。用western blotting分析A、B和C的细胞裂解物。Sirt1,sirtuin 1;p53,肿瘤蛋白p53*P<0.05**P<0.01。

为了进一步证实p53和c-Myc在Sirt1表达调控中的作用,c-Myc在p53野生型和敲除MEF/3T3细胞中过表达。与之前的研究一致(17)与野生型MEF/3T3s相比,p53敲除的MEF/3T3s中Sirt1的蛋白表达水平显著增加(图1B). 正如预期的那样,强制表达c-Myc显著上调了p53中Sirt1的蛋白表达水平−/−MEF/3T3细胞(P<0.05),但对野生型MEF/3T3细胞中Sirt1表达水平无影响(图1B). 此外,c-Myc抑制剂10058-F4治疗大大降低了p53中Sirt1蛋白的表达水平−/−MEF/3T3和p53−/−HCT116细胞(对于两种细胞系,25µM和50µM 10058-F4分别为P<0.05和P<0.01),但在p53中没有+/+MEF/3T3和p53+/+HCT116细胞(图1C). 上述结果表明,c-Myc可能是Sirt1表达水平的阳性调节器,而p53则抑制调节。

c-Myc上调p53缺陷细胞Sirt1 mRNA表达水平

为了进一步探讨c-Myc对Sirt1转录的调节作用以及p53参与c-Myc向Sirt1上调的潜在机制,通过qPCR实验性调节p53野生型或缺陷型细胞的c-Myc活性来检测Sirt1 mRNA表达水平的变化。c-Myc过度表达导致p53缺陷的K562细胞中Sirt1 mRNA表达水平增加(图2A,左侧面板)。一直以来,10058-F4治疗诱导K562细胞中Sirt1 mRNA表达水平下调(右图)。相反,c-Myc的过度表达或10058-F4治疗均未改变293A细胞中Sirt1的mRNA表达水平,Sirt1表达p53(图2B). 随后,本研究检测了p53野生型或敲除小鼠原代MEF/3T3细胞中Sirt1的mRNA表达水平。p53中Sirt1的mRNA表达水平显著升高−/−在p53缺失的情况下,MEF/3T3s和c-Myc的过度表达诱导了Sirt1 mRNA表达水平的进一步增加(图2C,左侧面板)。此外,10058-F4损害了p53敲除中Sirt1的mRNA表达水平,但在p53野生型MEF/3T3中没有(图2C,右侧面板)。结果表明,p53可能影响c-Myc对Sirt1启动子的反式激活能力。

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p53抑制c-Myc介导的Sirt1 mRNA水平的上调。(A) 用c-Myc表达载体转染K562细胞或用10058-F4处理。(B) 293A细胞转染c-Myc表达载体或10058-F4处理。(C) 用C-Myc表达载体转染p53野生型或敲除型MEF/3T3或用10058-F4处理。从A、B和C细胞中提取RNA,并进行定量聚合酶链反应分析。Sirt1,sirtuin 1;p53,肿瘤蛋白p53。

p53抑制c-Myc与Sirt1启动子的结合

为了进一步阐明p53介导的抑制c-Myc对Sirt1的反式激活能力的机制,本研究首先使用在线程序(rVISTA2.0)预测了人类Sirt1启动子中假定的c-Myc结合元件。在人类Sirt1启动子5′侧翼区共鉴定出三个潜在的c-Myc结合元件,共有序列CACGTG,分别命名为E1、E2和E3(图3A). 然而,当将人类与小鼠和奶牛的同类进行比较时,E1在不同物种之间并不保守。相反,E2和E3在不同类型的物种中高度保守。本研究假设E2和E3是c-Myc的反应元件,而不是E1。

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p53阻断c-Myc与Sirt1启动子的结合。(A) 人类、小鼠和奶牛Sirt1启动子序列近端核心区的比对。下划线的碱基表示p53结合位点,大写碱基表示推定的c-Myc结合位点。(B) 将转录起始位点上游含有2852、200或102 bp的人Sirt1启动子报告质粒分别与pcDNA 3.1或c-Myc表达载体共转染到H1299细胞中36 hc-Myc表达载体。(D) HeLa核提取物与含有人类Sirt1启动子E2盒或276(222上游50 bp)的生物素化寡核苷酸222和链霉亲和素琼脂糖珠孵育。沉淀的络合物通过western印迹分析。(E) 将Sirt1启动子报告质粒与c-Myc和p53表达载体共同转染H1299细胞。B、C和E的相对荧光素酶活性表示为三份样品的平均值±标准偏差,是三个独立实验的代表。(F) 在K562和293A细胞中进行染色质免疫沉淀分析,以检测Sirt1启动子E2和E1位点上c-Myc的募集。hTERT启动子作为阳性对照。Sirt1,sirtuin 1;bp,碱基对;mut,突变体;hTERT,人端粒酶逆转录酶;p53,肿瘤蛋白p53*P<0.05**P<0.01。

为了验证这种可能性,进行了双重荧光素酶分析,以评估Sirt1启动子−2852、−200和−102的截断缺失结构的活性。与全长Sirt1启动子(−2852;图3B)而截断到−200却没有,这表明启动子的近端区域(−200到−102)对启动子的活性很重要。c-Myc的过度表达显著上调了全长和−200截断Sirt1启动子的活性,与对照组相比增加了2倍(图3B; P<0.05);然而,近端区域(−200到−102)的缺失消除了c-Myc依赖的反式激活(图3B). 这些结果表明c-Myc通过E2或E3而不是E1反式激活Sirt1启动子。

为了进一步确定c-Myc在人Sirt1启动子上的确切反应元件,生成了Sirt1基因启动子的E2或E3点突变,其中单个c-Myc结合位点发生突变。如所示图3C(P<0.05),与截断野生型Sirt1启动子−200相比,E2点突变显著降低了c-Myc对Sirt1基因启动子活性的诱导,而c-Myc激活E3/mut的水平与截断野生类型Sirt1蛋白启动子−-200相似。结果提示E2可能是c-Myc的反应元件。

随后,DNA介导的沉淀试验证实了这一结果。生物素化双链寡核苷酸222(Sirt1启动子序列包含E2)或276(222上游50 bp,用作阴性对照)与HeLa核提取物和链霉亲和素琼脂糖珠浆料孵育,沉淀物通过western blotting分析。如所示图3D,c-Myc结合到探针222而不是276,而阴性对照GAPDH没有结合到两个探针。这进一步证明E2是c-Myc的结合位点。

值得注意的是,E2位点是先前确定的对p53反应的元件的一部分(10). 在p53缺失或存在的情况下,重叠的两个元素可能在c-Myc对Sirt1的差异调节作用中发挥作用。在本研究中,c-Myc和p53表达质粒(−200)与Sirt1启动子报告质粒共同转染到p53缺陷的H1299细胞中。如所示图3Ep53的过度表达降低了Sirt1启动子的活性,并消除了启动子的c-Myc依赖性激活,这表明p53在转录水平上抑制了Sirt2的c-Myc-依赖性上调。

基于上述结果,我们假设p53和c-Myc在Sirt1启动子上共享≥1个响应元件。p53的结合可能阻断c-Myc在其反应元件上的募集。因此,对K562和293A细胞进行了ChIP分析。结果表明,在p53缺陷的K562细胞中,含有E2的Sirt1启动子片段与内源性c-Myc共沉淀,而在表达p53的293A细胞中没有沉淀(图3F). 与荧光素酶检测结果一致,K562或293A细胞中c-Myc的DNA沉淀物中不存在E1。hTERT启动子扩增为阳性对照。综上所述,这些结果表明,p53抑制了c-Myc在Sirt1启动子上的结合,从而阻断了由c-Myc介导的Sirt1表达水平的上调。

讨论

先前的研究表明,Sirt1的表达受到某些转录因子的严格调控,包括p53、HIC1和E2F1(2,10,11). 本研究表明,当p53缺失时,c-Myc可诱导Sirt1转录。c-Myc诱导反应元件与Sirt1启动子的p53结合位点位于同一位置。因此,p53通过阻断c-Myc与Sirt1启动子的结合来抑制c-Myc介导的Sirt1表达上调。

肿瘤抑制因子p53在抑制细胞生长和增殖中起着关键作用,而癌蛋白c-Myc反过来调节p53相关的生理和病理过程。众所周知,p53和c-Myc之间存在负相关(18). 然而,抑制p53和c-Myc的确切机制尚未完全理解。早期报道表明p53直接抑制c-Myc的转录(19)而c-Myc通过p19ARF抑制p53表达水平,形成反馈回路(20). c-Myc p53抑制的另一种转录后机制涉及microRNA(miR)−145(21). p53诱导miR-145表达,随后在蛋白水平抑制c-Myc(21). 本研究结果提示了p53抑制c-Myc功能的新机制;p53和c-Myc竞争结合到同一反应元件,并反向调节Sirt1的表达水平。由于本研究没有检测到p53表达细胞中Sirt1启动子上c-Myc的结合,因此p53似乎与结合位点具有更强的亲和力。值得注意的是,Sirt1并不是第一个被p53和c-Myc以类似方式调控的靶点。据报道,c-Myc对cyclinB1启动子的最佳诱导仅在p53同时失活时发生(22).

在某些类型的人类癌症中经常发生c-Myc癌基因失控或p53活性丧失(23). 本研究结果表明,c-Myc过度表达影响了p53缺陷细胞中Sirt1启动子上c-Myc的反式激活能力,从而提高了Sirt1的表达水平。c-Myc过度表达和p53功能丧失可能导致肿瘤细胞中Sirt1的表达水平升高,因为Sirt1高表达的细胞,包括AML、鳞状细胞癌和弥漫性大B细胞淋巴瘤,显示出c-Myc过表达(2426)和p53功能丧失(27). c-Myc和p53对Sirt1表达水平的调节促使本研究将Sirt1作为介导c-Myc致癌功能的靶点。

综上所述,本研究的结果表明,Sirt1的表达水平直接受c-Myc和p53的调控,但相反。p53通过阻断Sirt1启动子上的c-Myc募集来抑制Sirt1基因启动子的激活。本研究揭示了一种调节Sirt1表达的新网络,并进一步阐明了肿瘤抑制因子和启动因子的平衡。

致谢

本研究得到了国家自然科学基金(批准号81402319)和北京新星计划(批准号Z161100004916133)的支持。

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