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EMBO J。1990年8月;9(8): 2351–2359.
预防性维修识别码:PMC552258
PMID:2196171

H-ras p21在1.35 A分辨率下三磷酸构象的精细晶体结构:GTP水解机制的含义。

摘要

与缓慢水解的GTP类似物GppNp络合的H-ras癌基因蛋白p21的晶体结构已在1.35 A分辨率下测定。211个水分子被构建成电子密度。对于6 a到1.35 a之间的所有数据,结构已被细化到19.8%的最终R因子。核苷酸和镁离子的结合位点被高度详细地揭示。对于氨基酸残基61-65的延伸,由于多重构象,主链原子的温度因子是16.1A2平均值的四倍。在其中一种构象中,Gln61的侧链与水分子接触,水分子被完美地定位为攻击GTP磷酸γ的亲核分子。基于这一观察,我们提出了GTP水解的机制,主要涉及Gln61和Glu63作为水在线攻击的激活物种。Thr35、Gly60和Lys16残基的氢键促进了亲核置换。还提出了GAP的速率增强机制。

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文章来自欧洲分子生物学组织由以下人员提供自然出版集团