图2
通用上皮-间充质转化(EMT)信号的推导及应用
圆形图显示了一般EMT特征:卵巢(蓝色)、乳腺(紫色)、肺(绿色)、结肠直肠(黄色)、膀胱(红色)和胃(橙色)癌特异性EMT特征重叠。
链接表示重叠基因(红色=间充质,绿色=上皮)。
内环上的热图显示了根据微阵列(SAM)折叠变化的显著性分析、错误发现率、受体操作特征(ROC)和每个癌症特异性EMT特征中的基因样本数计算的重量(红色=高,蓝色=低重量)。
在最外面的环上,基因由扁虱表示,并根据每种癌症类型从SAM折叠变化最高到最低排列。
选定的基因被标记。
EMT得分(平均值±SEM;
年
-轴),如使用ssGSEA和来自Prat的信号预测的乳腺癌分子亚型
等
(
2010
)非激光捕获微区(非LCM)队列(
n个
= 3,992;
上面板)和LCM队列(
n个
= 417;
下部面板)。
曼·惠特尼
U型
-测试
P(P)
-给出了每个子类型的二进制比较值。
颜色代码:栗色、基色;
黄色,Claudin-low;
淡蓝色,鲁米纳-A;
深蓝色,Luminal-B;
橙色,ERBB2+;
绿色,正常。
N.A,不适用。
请注意,没有
P(P)
-该值可用于下部面板中的Claudin-low和Normal-like子类型,因为
n个
< 3.