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2014年9月11日在线发布。 数字对象标识:10.15252/emm.201404208年

图1

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癌症特异性上皮-间充质转化(EMT)信号的推导与应用
  1. 一个六步方案,说明肿瘤特异性EMT信号的生成。请注意,肿瘤和细胞系有其自身的肿瘤特异性EMT特征。(右上角面板)样本富集分数(ES)条形图上的红色和绿色条分别表示为构建BinReg EMT特征选择的类间充质(Mes)和类上皮(Epi)样本。(右中面板)微阵列(SAM)/接收器操作特征(ROC)分析的EMT特征热图。彩色条显示了细胞系或肿瘤样本的EMT表型概率,从大多数Epi到大多数Mes排序。红色和绿色条表示为SAM/ROC分析选择的Mes和Epi样本。(右下面板)Mes(红色)和Epi(绿色)基因集的经验累积分布函数图。
  2. 乳腺癌细胞系EMT评分点图(平均值±SEM)(n个=34)具有纺锤状和非纺锤状形态。曼·惠特尼U型-测试P(P)-显示值。
  3. 雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)和Epi(CDH1、ERBB2、CK19)以及Mes(CK5、VIM、CDH2)标记物(黑色=低,红色=高,白色=无数据)的免疫组织化学染色热图。乳腺癌细胞系(n个=39)根据EMT得分从Epi最多到Mes最多对齐,如条形图所示。点图是-日志10P(P)-双样本Kolmogorov–Smirnov检验的值。任意阈值P(P)<0.001用于定义Epi、中间和Mes细胞系。乳腺癌细胞系微阵列和亚型来自GSE16795(Hollestelle,2010). 子类型颜色代码:蓝色,发光;栗色,基色。

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