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EMBO Mol Med.2014年10月;
6(10): 1279–1293.
2014年9月11日在线发布。
数字对象标识:
10.15252/emm.201404208年
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癌症特异性上皮-间充质转化(EMT)信号的推导与应用
一个六步方案,说明肿瘤特异性EMT信号的生成。
请注意,肿瘤和细胞系有其自身的肿瘤特异性EMT特征。
(右上角面板)样本富集分数(ES)条形图上的红色和绿色条分别表示为构建BinReg EMT特征选择的类间充质(Mes)和类上皮(Epi)样本。
(右中面板)微阵列(SAM)/接收器操作特征(ROC)分析的EMT特征热图。
彩色条显示了细胞系或肿瘤样本的EMT表型概率,从大多数Epi到大多数Mes排序。
红色和绿色条表示为SAM/ROC分析选择的Mes和Epi样本。
(右下面板)Mes(红色)和Epi(绿色)基因集的经验累积分布函数图。
乳腺癌细胞系EMT评分点图(平均值±SEM)(
n个
=34)具有纺锤状和非纺锤状形态。
曼·惠特尼
U型-
测试
P(P)
-显示值。
雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)和Epi(CDH1、ERBB2、CK19)以及Mes(CK5、VIM、CDH2)标记物(黑色=低,红色=高,白色=无数据)的免疫组织化学染色热图。
乳腺癌细胞系(
n个
=39)根据EMT得分从Epi最多到Mes最多对齐,如条形图所示。
点图是
-
日志
10
P(P)
-双样本Kolmogorov–Smirnov检验的值。
任意阈值
P(P)
<0.001用于定义Epi、中间和Mes细胞系。
乳腺癌细胞系微阵列和亚型来自GSE16795(Hollestelle
等
,
2010
).
子类型颜色代码:蓝色,发光;
栗色,基色。
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