美国国家科学院院刊。1984年9月；81(17): 5291–5295.
Alu重复序列启动子的独特序列组织和功能编程。
摘要
含有人类Alu家族重复序列的质粒克隆可以通过HeLa细胞提取物中的RNA聚合酶III高效转录。这产生了三种RNA，所有的RNA都是从重复序列的第一个碱基（+1）开始的。通过研究缺失克隆、亚克隆和拓扑不同DNA模板的转录特性，我们证明：超螺旋DNA模板转录效率是线性或刻痕环状DNA分子的3-5倍；转录复合物中延伸到-30到-85位置的5'侧翼区域的连续DNA螺旋是发生起始的绝对必要条件（这种相互作用不涉及特定DNA序列的识别）；与腺病毒VAI RNA和tRNA基因类似，α1珠蛋白基因的Alu重复序列3'（指定为3'-α1 Alu）包含一个分裂的基因内启动子：一个前元件（位置+4至+37）和一个后元件（位置+70至+82）。然而，与其他RNA聚合酶Ⅲ依赖基因相比，Alu重复序列的启动子以独特的方式发挥作用。仅后启动子元件就足以和必要实现准确启动。前启动子元件本身并不启动转录，它的存在将转录效率提高了10到20倍。此外，起始位点和后启动子元件之间的距离，而不是前启动子元件之间的距离，保持恒定。这些结果表明，该Alu家族重复序列的启动子至少由两个功能不同的域组成：决定启动准确性的“定向元件”（后启动子元件）和主要负责转录效率的“增强元件”（前启动子元件”）。
全文
全文可用作原始打印版本的扫描副本。获取完整文章（2.4M），或单击下面的页面图像逐页浏览。PubMed链接也可用于选定的引用.
选定的引用
这些参考文献在PubMed中。这可能不是本文的完整参考文献列表。
- Ciliberto G、Castagnoli L、Cortese R.RNA聚合酶III转录。当前最高开发生物。1983;18:59–88.[公共医学][谷歌学者]
- Thimmappaya B、Weinberger C、Schneider RJ、Shenk T。腺病毒VAI RNA是在感染后后期高效翻译病毒mRNA所必需的。单元格。1982年12月；31（第3部分第2部分）:543–551。[公共医学][谷歌学者]
- Brown DD和Gurdon JB。当注射到非洲爪蟾卵母细胞中时，克隆的5S DNA单重复单元直接精确转录5S RNA。美国国家科学院院刊。1978年6月；75(6):2849–2853. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Birkenmeier EH，Brown DD，Jordan E.非洲爪蟾卵母细胞的核提取物，可准确转录5S RNA基因。单元格。1978年11月；15(3):1077–1086.[公共医学][谷歌学者]
- Weil PA、Segall J、Harris B、Ng SY、Roeder RG。在用纯化DNA模板重建的系统中，通过RNA聚合酶III对真核基因进行忠实转录。生物化学杂志。1979年7月10日；254(13):6163–6173.[公共医学][谷歌学者]
- 吴国杰。腺病毒DNA体外定向5.5S RNA转录。美国国家科学院院刊。1978年5月；75(5):2175–2179. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Sakonju S，Bogenhagen DF，Brown DD。5S RNA基因中心的控制区域指导转录的特异性启动：I.该区域的5'边界。单元格。1980年1月；19(1):13–25.[公共医学][谷歌学者]
- Bogenhagen DF，Sakonju S，Brown DD。5S RNA基因中心的一个控制区指导转录的特异性启动：II。该地区的3'边界。单元格。1980年1月；19(1):27–35.[公共医学][谷歌学者]
- Engelke DR、Ng SY、Shastry BS、Roeder RG。纯化转录因子与5S RNA基因内部控制区的特异性相互作用。单元格。1980年3月；19(3):717–728.[公共医学][谷歌学者]
- Pelham HR，Brown DD。一种可以结合5S RNA基因或5S RNA的特定转录因子。美国国家科学院院刊。1980年7月；77(7):4170–4174. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- 本田BM，Roeder RG。5S基因转录因子与5S RNA的关联以及在细胞分化过程中该因子水平的改变。单元格。1980年11月；22（第1部分）：119-126。[公共医学][谷歌学者]
- Fowlkes DM，Shenk T.腺病毒VAI RNA基因的转录控制区。单元格。1980年11月；22（第2部分）：405–413。[公共医学][谷歌学者]
- Guilfoyle R，Weinmann R。腺病毒VA RNA转录的控制区。美国国家科学院院刊。1981年6月；78(6):3378–3382. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Kressmann A、Hofstetter H、Di Capua E、Grosschedl R、Birnstiel ML。非洲爪蟾的tRNA基因包含至少两个促进转录的位点。核酸研究。1979年12月11日；7(7):1749–1763. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Koski RA，Clarkson SG，Kurjan J，Hall BD，Smith M.酵母SUP4 tRNATyr基因座的突变：体外突变基因的转录。单元格。1980年11月；22（第2部分）：415–425。[公共医学][谷歌学者]
- Sprague KU、Larson D、Morton D.5'侧翼序列信号是家蚕丙氨酸tRNA基因在同源体外转录系统中的活性所必需的。单元格。1980年11月；22（第1部分）:171–178。[公共医学][谷歌学者]
- Carrara G、Di Segni G、Otsuka A、Tocchini-Valentini GP。酵母tRNA-Leu3基因3'半的缺失并不能解除体外的启动子功能。单元格。1981年12月；27（2第1部分）：371–379。[公共医学][谷歌学者]
- DeFranco D，Sharp S，Söll D。果蝇赖氨酸tRNA2基因5'侧翼区域所含调控序列的鉴定。生物化学杂志。1981年12月10日；256(23):12424–12429.[公共医学][谷歌学者]
- Galli G，Hofstetter H，Birnstiel ML。真核生物tRNA基因中的两个保守序列块是主要的启动子元件。自然。1981年12月17日；294(5842):626–631.[公共医学][谷歌学者]
- Hofstetter H，Kressman A，Birnstiel ML。真核tRNA基因的分裂启动子。单元格。1981年5月；24(2):573–585.[公共医学][谷歌学者]
- Sharp S，DeFranco D，Dingermann T，Farrell P，Söll D。真核生物tRNA基因转录的内部控制区域。美国国家科学院院刊。1981年11月；78(11):6657–6661. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Ciliberto G，Traboni C，Cortes R.真核生物tRNA基因分裂启动子两组分之间的关系。美国国家科学院院刊。1982年3月；79(6):1921–1925. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Dingermann T，Burke DJ，Sharp S，Schaack J，Söll D。果蝇tRNAArg基因的5个侧翼序列控制其在果蝇细胞提取物中的体外转录。生物化学杂志。1982年12月25日；257(24):14738–14744.[公共医学][谷歌学者]
- Hall BD、Clarkson SG、Tocchini-Valentini G.真核转移RNA基因的转录启动。单元格。1982年5月；29(1):3–5.[公共医学][谷歌学者]
- Allison DS，Goh SH，Hall BD。酵母tRNAtyr基因的启动子序列。单元格。1983年9月；34(2):655–664.[公共医学][谷歌学者]
- Ciliberto G，Raugei G，Costanzo F，Dente L，Cortese R.RNA聚合酶Ⅲ转录的基因启动子中的通用和可互换元件。单元格。1983年3月；32(3):725–733.[公共医学][谷歌学者]
- Dingermann T，Sharp S，Schack J，Söll D。真核生物tRNA基因的稳定转录复合物形成依赖于两个基因内控制区的有限分离。生物化学杂志。1983年9月10日；258(17):10395–10402.[公共医学][谷歌学者]
- Folk WR，Hofstetter H.真核生物tRNMet1基因启动子的详细突变分析。单元格。1983年6月；33(2):585–593.[公共医学][谷歌学者]
- Hipskind RA，Clarkson SG.5’侧翼序列，抑制非洲爪蟾tRNA基因的体外转录。单元格。1983年10月；34(3):881–890.[公共医学][谷歌学者]
- Newman AJ，Ogden RC，Abelson J.tRNA基因在酵母中的转录：基因内启动子中特定碱基替换的影响。单元格。1983年11月；35(1):117–125.[公共医学][谷歌学者]
- Sharp S，Dingermann T，Schaack J，DeFranco D，Söll D.真核tRNA基因的体外转录。I.使用竞争分析法分析对照区。生物化学杂志。1983年2月25日；258(4):2440–2446.[公共医学][谷歌学者]
- 施密德·CW，杰利内克·WR。分散重复序列的Alu族。科学。1982年6月4日；216(4550):1065–1070.[公共医学][谷歌学者]
- Jelinek WR、Schmid CW。真核生物DNA中的重复序列及其表达。生物化学年度收益。1982;51:813–844.[公共医学][谷歌学者]
- Duncan C、Biro PA、Choudary PV、Elder JT、Wang RR、Forget BG、de Riel JK、Weissman SM。RNA聚合酶III转录单位散布在人类非α-珠蛋白基因中。美国国家科学院院刊。1979年10月；76(10):5095–5099. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Pan J，Elder JT，Duncan CH，Weissman SM。人类DNA中散布重复聚合酶III转录单位的结构分析。核酸研究。1981年3月11日；9(5):1151–1170. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Fritsch EF，Shen CK，Lawn RM，Maniatis T。哺乳动物珠蛋白基因簇中重复序列的组织。冷泉Harb Symb Quant生物。1981;45（第2部分）：761-765。[公共医学][谷歌学者]
- Duncan CH，Jagadeswaran P，Wang RR，Weissman SM。散布在人类β样珠蛋白基因中的Alu家族序列的模板和RNA聚合酶III转录物的结构分析。基因。1981年3月；13(2):185–196.[公共医学][谷歌学者]
- Fuhrman SA、Deininger PL、LaPorte P、Friedmann T、Geiduschek EP。真核RNA聚合酶III分析人类Alu家族普遍重复元件的转录。核酸研究。1981年12月11日；9(23):6439–6456. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Shen CK，Maniatis T.人类类α珠蛋白基因簇中Alu家族RNA聚合酶III转录单位的组织、结构和体外转录：狼疮抗-La抗体体外转录物的沉淀。分子应用遗传学杂志。1982;1(4):343–360.[公共医学][谷歌学者]
- Murphy MH，Baralle FE。RNA聚合酶III启动子的定向半合成点突变分析。核酸研究。1983年11月25日；11(22):7695–7700. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Hess JF，Fox M，Schmid C，Shen CK.人类成人α-球蛋白样基因区域的分子进化：Alu家族重复序列和非Alu DNA序列的插入和删除。美国国家科学院院刊。1983年10月；80(19):5970–5974. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Van Arsdell SW、Denison RA、Bernstein LB、Weiner AM、Manser T、Gesteland RF。直接重复位于人类基因组中三个小核糖核酸假基因的侧面。单元格。1981年10月；26（第1部分）：11–17。[公共医学][谷歌学者]
- Jagadeswaran P，Forget BG，Weissman SM。真核生物中短穿插重复DNA元素：RNA pol III转录物反转录产生的转座DNA元素？单元格。1981年10月；26（第2部分）：141–142。[公共医学][谷歌学者]
- Legerski RJ、Hodnett JL、Gray HB、。，假单胞菌BAL 31的Jr胞外核酸酶。三、 使用双链脱氧核糖核酸酶活性作为一种方便的方法的基础，以绘制通过限制性内切酶裂解产生的DNA片段。核酸研究。1978年5月；5(5):1445–1464. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Maxam AM，Gilbert W.DNA测序的新方法。美国国家科学院院刊。1977年2月；74(2):560–564. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Berk AJ，Sharp PA。通过S1内切酶消化杂种的凝胶电泳测定和定位早期腺病毒mRNA。单元格。1977年11月；12(3):721–732.[公共医学][谷歌学者]
- Weaver RF，Weissmann C.通过修改Berk-Sharp程序绘制RNA：15Sβ珠蛋白mRNA前体和成熟10sβ珠蛋白的5'末端具有相同的地图坐标。核酸研究。1979年11月10日；7(5):1175–1193. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Favalo J，Treisman R，Kamen R.多瘤病毒特异性RNA的转录图谱：通过二维核酸酶S1凝胶图谱分析。方法酶制剂。1980;65(1):718–749.[公共医学][谷歌学者]
- Harland RM、Weintraub H、McKnight SL。注射到非洲爪蟾卵母细胞中的DNA转录受模板拓扑结构的影响。自然。1983年3月3日；302(5903):38–43.[公共医学][谷歌学者]
- Klemenz R、Stillman DJ、Geiduschek EP。酿酒酵母蛋白质与真核tRNA基因启动子区的特异性相互作用。美国国家科学院院刊。1982年10月；79(20):6191–6195. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Lassar AB、Martin PL、Roeder RG。III类基因的转录：起始前复合物的形成。科学。1983年11月18日；222(4625):740–748.[公共医学][谷歌学者]
- Struhl K。酵母his3启动子包含至少两种不同的元素。美国国家科学院院刊。1982年12月；79(23):7385–7389. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- McKnight SL，Kingsbury R.真核蛋白编码基因的转录控制信号。科学。1982年7月23日；217(4557):316–324.[公共医学][谷歌学者]
文章来自美国国家科学院院刊由以下人员提供美国国家科学院
