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2013年4月3日在线发布。 数字对象标识:10.1093/nar/gkt214

表5。

对准器在映射未过滤人类基因组生成的模拟读取中的性能(保留重复区域)

校准器艺术
石匠
我们的模拟器
时间(分钟)
收入(%)科目(%)收入(%)科目(%)收入(%)科目(%)
子引线81.597.988.896.188.59817
子阅读-f 10084.497.791.59691.397.919
子阅读-f 20085.597.692.595.992.497.821
子阅读-f 30086.197.593.195.892.997.722
鲍蒂287.695.295.295.395.79683
BWA公司87.197.295.595.778.696.4497
诺沃利尼89.897.393.597.1140

Art和Mason模拟器分别生成了10万个100 bp的读取,我们的模拟器生成了1000万个101 bp的读取。”-Subread的f'选项指定删除无信息子读取的阈值。例如,“-f 100”表示参考基因组中出现100次或更多次的子读取被删除。运行时间是使用我们的模拟数据测量的。