图4

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Atg1/ULK1定位于酵母和哺乳动物的自噬体。(一个)呈指数级增长密码7Δ细胞在SD-N培养基中饥饿4h,裂解并将提取物分离为细胞质(S)和5000膜颗粒分数。用(+)或不使用(−)TX-100处理颗粒,离心,并用抗Atg1、抗Pep12和抗Pgk1抗体进行免疫印迹分析上清液(S)和颗粒(P)组分。(B类)呈指数级增长密码7Δatg1处表达野生型Atg1或Atg1-VE突变蛋白的Δ细胞在SD-N中饥饿4h,裂解并将提取物分离为细胞质(S)和膜(P)部分。用抗Atg1、抗Pgk1和抗Ape1抗体对组分进行western blotting分析,并量化颗粒组分中Atg1与Ape1的比率,并将其表示为与野生型细胞的比率。(C类)用GFP-GABARAP和HA-ULK1共同转染HEK293细胞,饥饿2h,然后免疫染色HA(红色)和WIPI2(白色)。箭头标记假定的自噬体,这三种标记均为阳性。巴=10μm。(D类)用野生型HA-ULK1或DFP突变体转染稳定表达GFP-LC3的HEK293细胞,饥饿2h后进行HA和WIPI2免疫染色。使用Imaris软件对70多个细胞(两个实验中的一个)的HA-ULK1和WIPI2斑点数进行计数,并绘制为ULK1与WIPI2点状细胞的比率***表示具有统计显著性P(P)-值<0.0001。展示了两个独立实验中的一个。(E类)表达野生型HA-ULK1或DFP突变体的HEK293细胞中HA-ULK1和WIPI2斑点数的量化。细胞按上述方法处理,并使用Imaris软件计算斑点数。典型的免疫荧光图像如所示补充图S3F.***和*表示P(P)-值分别小于0.0001或0.0158。图:可以使用补充数据.