A sequence assembly and editing program for efficient management of large projects.

S Dear; R Staden

doi:10.1093/nar/19.14.3907

核酸研究。1991年7月25日；19(14): 3907–3911.

数字对象标识：10.1093/nar/19.14.3907

预防性维修识别码：项目经理328482

PMID：1861983

用于大型项目高效管理的序列汇编和编辑程序。

S亲爱的和R斯塔登

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摘要

我们描述了一个用于管理大型和小型项目的序列汇编和编辑程序。它被用于对完整的cosmids进行排序，并大大减少了处理数据所需的时间。除了处理传统衍生序列外，它还可以使用从Applied Biosystems，Inc.373A和Pharmacia A.L.F.荧光测序仪获得的数据。读数是自动组合的。所有编辑都是使用鼠标操作的连续编辑器执行的，该编辑器在屏幕上显示对齐的序列及其轨迹。编辑器可以用于单个重叠群或连接重叠群，允许沿着对齐的序列快速移动。插入、删除和替换可以在单个对齐的读数中进行，全局更改可以通过编辑共识进行。记录所有更改。单击鼠标按钮将显示覆盖当前光标位置的轨迹，从而可以快速解决问题。另一个函数会自动将光标移动到下一个未解析的字符。编辑器还提供了注释序列的工具。典型的注释包括标记用于行走或标记位点的引物的位置，例如在测序过程中造成问题的按压。图形显示有助于评估进度。

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选定的引用

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文章来自核酸研究由以下人员提供牛津大学出版社