P3和P21股骨头软骨数据集的标准化蛋白计数的全局表示为三个错误发现率。每个数据点MA图中表示P3和P21软骨中蛋白质的相对丰度。两个轴都是对数2转换,其中水平轴表示光谱计数的乘积垂直轴表示光谱计数的比率。这个实线灰色线代表相等的丰度灰色虚线代表丰度的2倍差异。在A–C,的黑色数据点代表丰度有显著差异的蛋白质。提供的重要蛋白质数量q个0.001、0.01和0.05的值阈值分别为74、146和282。D类,两个生物复制(P3复制R1和R2)的代表性图,以显示蛋白质的零分布,即那些在数量上没有实际差异的。