介导自噬的膜载体的工作定义酵母中已经确定了吞噬细胞组装位点的Atg(自噬相关)蛋白募集顺序[18]最近在哺乳动物细胞中的研究结果表明,这种层次结构是保守的[17]. 根据现有的实验数据,可以使用一些蛋白质开始从分子上定义各种自噬体中间产物。以下标记蛋白的分布如下:Atg14L是参与自噬的磷脂酰肌醇-3-激酶复合物的一个亚单位[60]. FIP200与ULK1/2、Atg13、Atg101联合进入ULK1/2复合体[61]. DFCP-1(双FYVE蛋白1)可以代表标记蛋白,使我们能够区分ω体和吞噬体[30]. Atg12、Atg5和Atg16形成一个复合物,例如Atg12-5-16,主要定位于吞噬细胞,但Atg16L可能在自噬中起更早的作用[41]. 脂化LC3(例如LC3-II)和Lamp-1(溶酶体相关膜蛋白1)是自噬晚期细胞的特征良好的标记蛋白。请注意,LC3-II存在于两性体/自噬体的内部,对溶酶体水解酶敏感,而Lamp-1是一种完整的膜蛋白,对这些水解酶具有抗性。缩写:Atg,自噬相关;DFCP1,双FYVE蛋白1;LAMP1,溶酶体相关膜蛋白1。