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基因发育。2011年11月1日;25(21): 2291–2305.
数字对象标识:10.1101/编号173039.111
PMCID公司:PMC3219233型
PMID:22056672

Nkx2.2阻遏物复合物调节胰岛β细胞规格并防止β-至-α细胞重新编程

为了确定细胞命运是如何决定和维持的,Sussel及其同事研究了维持β细胞特性的内源性调节途径。他们表明,胰腺β细胞可以通过单个转录因子Nkx2.2的突变重新编程,从而抑制α细胞特异性因子Arx。本文对细胞特异性DNA甲基化事件、基因调控和细胞重编程之间的体内联系提供了新的见解。

关键词:胰岛发育、β细胞重编程、Nkx2.2、DNMT3a、转录抑制、DNA甲基化

摘要

细胞分化程序的调控需要转录和表观遗传网络之间的复杂相互作用。阐明负责建立和维持细胞命运身份的主要分子事件,将对细胞谱系如何被指定和维持提供重要见解,并将提高我们在体外再现细胞分化事件的能力。在本研究中,我们证明Nkx2.2是包括DNMT3a、Grg3和HDAC1的胰腺β细胞中大阻遏复合物的一部分。小鼠内源性Nkx2.2 tinman(TN)结构域的突变消除了Nkx2-2和Grg3之间的相互作用,并破坏了β细胞规范。此外,我们证明Nkx2.2优先招募Grg3和HDAC1到甲基化Aristaless同源盒基因(阿尔克斯)β细胞中的启动子。Nkx2.2 TN突变导致阿尔克斯在β细胞中,引起β-到-α-细胞转分化。相应的DNMT3a的β-细胞特异性缺失也足以引起Arx依赖性的β-至α-细胞重编程。值得注意的是,随后移除阿尔克斯在Nkx2.2的β细胞中TNmut/TNmut公司突变小鼠恢复β-到-α-细胞转化,表明Nkx2.2对甲基化阿尔克斯β细胞中的启动子是维持β细胞特性所必需的主要调节事件。

关键词:胰岛发育、β细胞重编程、Nkx2.2、DNMT3a、转录抑制、DNA甲基化

在发育中的胚胎中,细胞命运是通过转录因子的调节激活和抑制来实现的,转录因子作为中介物对诱导信号的分泌作出反应。细胞命运的获得是通过一系列曾经被认为是不可逆的分化步骤来完成的。然而,最近对多个系统的研究表明,去分化和转分化是发育程序和再生范式中常用的机制(Tsonis等人,2004年;Mirsky等人,2008年;Jopling等人,2010年,2011). 通过表达转录因子将体细胞重新编程为多能干细胞的能力也证明了不需要中间去分化步骤的直接重新编程的可行性(高桥和山中2006;Boland等人,2009年). 继这一突破之后,出现了许多组织重编程的例子,包括成纤维细胞转分化为功能性心肌细胞或多系造血祖细胞(Ieda等人,2010年;Selvaraj等人,2010年;Szabo等人,2010年).

与大多数其他发育系统类似,发育中胰腺的谱系决定和细胞规范涉及一系列有组织的事件,这些事件由适时的外源信号组成,调节转录网络的层次结构(2009年吉特斯). 此外,最近的研究利用已知的胰岛转录网络将非胰腺或外分泌组织转分化为内分泌细胞。胰腺转录因子不同组合的异位表达——包括Pdx1页,Ngn3号机组,神经元D,美国金融管理局、和新x6.1-促进肝胰腺β细胞重编程(Chan等人,2003年;Kojima等人,2003年;Song等人,2007年;Delisle等人,2009年;Nagaya等人,2009年;Gefen-Halevi等人,2010年). 同样,成人胰腺腺泡细胞中一组特定转录因子的异位表达导致腺泡-β-细胞转换(Zhou等人,2008). 最近的研究也表明,胚胎和成年胰腺中不同胰岛细胞类型之间存在以前未被重视的可塑性。α-细胞特异性转录因子Aristaless同源盒基因的错误表达(阿尔克斯)胎儿中的β细胞足以引起aβ-到-α-细胞转化(Colombat等人,2007年). 此外,Thorel等人(2010年)已有研究表明,β细胞减少>90%的小鼠能够通过上调α细胞中的β细胞因子来补充丢失的β细胞,从而诱导α-到-β细胞转分化。最近,表观遗传操作也证明了DNA甲基化和组蛋白修饰在维持β细胞特性和驱动胰岛细胞分化中的重要性(Haumaitre等人,2009年;Dhawan等人,2011年). 这些突破性的研究强调了使用重新编程方法产生新来源胰岛细胞的潜力。

同源域转录因子Nkx2.2是决定胰岛细胞命运和腹侧神经管细胞模式所必需的(Sussel等人,1998年;Briscoe等人,1999年). 以前已经证明,Nkx2.2通过与辅加压素Groucho-4(Grg4)的相互作用,作为转录阻遏物调节腹侧神经模式(Muhr等人,2001年). 这种相互作用由一个称为tinman(TN)域的基序介导,该基序与转录阻遏物engrailed中的雕刻同源-1域的核心区域具有序列同源性,Grg/TLE蛋白通过该基序相互作用(Lints等人,1993年;Smith and Jaynes 1996年;Jimenez等人,1997年). 在发育中的胰腺中,Nkx2.2似乎起到转录阻遏物或激活物的作用,这取决于时间或细胞特异性环境(Watada等人,2000年;Cissell等人,2003年;Raum等人,2006年;Doyle和Sussel 2007;Doyle等人,2007年;Anderson等人,2009年).

为了进一步研究Nkx2.2在发育胰腺中的调节作用及其对Grg相互作用的依赖性,我们制作了在内源性TN结构域高度保守的氨基酸替换的小鼠Nkx2.2个基因(Nkx2.2TNmut/TNmut公司). 在本研究中,我们证明了Nkx2.2和Grg3之间的体内相互作用需要TN结构域,并且在两个独立的发育阶段需要与Grg蛋白的相互作用。在胚胎第13.5天(E13.5),在二次转变开始期间,Nkx2.2 TN结构域对于β-细胞与ɛ-细胞的命运决定是必要的。随后,在β细胞形成后,Nkx2.2 TN结构域通过抑制α细胞决定簇来维持β细胞特性阿尔克斯在该分析中,我们确定虽然Nkx2.2存在于α和β细胞中,但当启动子处于高甲基化状态时,它优先结合β细胞中α-细胞特异性因子Arx的启动子。此外,我们证明Nkx2.2存在于与新生甲基转移酶Dnmt3a和阻遏辅因子Grg3的复合物中。在β细胞环境中,Nkx2.2优先招募Grg3和HDAC1到阿尔克斯启动子抑制阿尔克斯转录。Nkx2.2和Grgs在小鼠体内的相互作用被破坏导致异位表达阿尔克斯在β细胞中,并足以在胚胎发育和成人中引起β-到-α细胞的重编程。我们通过移除阿尔克斯特别是在Nkx2.2中TNmut/TNmutβ细胞,可以阻止β-到-α-细胞的转化。这些体外和体内联合研究阐明了细胞特异性DNA修饰和转录调控事件是如何结合起来建立和维持胰岛β细胞特性的。

结果

Nkx2.2 TN结构域的突变破坏了Nkx2.2.和Grg3辅阻遏物之间的体内相互作用,并导致成年Nkx2-2糖尿病TNmut/TNmut公司老鼠

在胰腺中,Grg2和Grg3与Nkx2.2共存(Doyle等人,2007年;Hoffman等人,2008年),Grg3通过保守的TN结构域与Nkx2.2相互作用(Doyle等人,2007年). 为了确定Nkx2.2和Grg蛋白之间的物理相互作用是否对适当的胰岛发育和/或功能是必要的,我们构建了表达Nkx2-2突变等位基因的小鼠,该等位基因在TN结构域(Nkx2.2.)的核心序列中含有氨基酸替换TNmut/TNmut公司) (图1A). 使用等位基因特异性引物监测突变等位基因的存在(图1B; 材料和方法)。杂合Nkx2.2TNmut公司/+和纯合Nkx2.2TNmut/TNmut公司小鼠出生时胰腺形态和组织学基本正常(图1C、D; 数据未显示)。重要的是,TN结构域的突变似乎不会影响Nkx2.2毫米Nkx2.2中的mRNA或蛋白质稳定性TNmut公司/+和Nkx2.2TNmut/TNmut公司小鼠(图1E、F; 数据未显示);然而,我们证实TN结构域的突变足以消除内源性Nkx2.2–Grg3相互作用(图1G). Nkx2.2TNmut/TNmut公司小鼠出生后存活,但雄性小鼠在3.5周龄时开始出现明显的高血糖(补充图1A、B)。6周时,雄性和雌性Nkx2.2TNmut/TNmut公司在喂食和禁食的条件下,老鼠患有严重的糖尿病,生育能力受损(图2A; 补充图1C)。Nkx2.2TNmut/TNmut公司小鼠不能存活超过8周。6周龄Nkx2.2的组织学分析TNmut/TNmut公司胰腺显示,胰岛细胞总数没有变化,但突变胰岛比野生型同卵双胞胎对照组小且更杂乱(图2B、C、F). 与Nkx2.2的表型一致−/−形成较少α和无β细胞的小鼠,Nkx2.2TNmut/TNmut公司胰岛分泌胰岛素的β细胞较少(图2D). 然而,令人惊讶的是,产生胰高血糖素的α细胞的数量似乎增加了(图2E). Nkx2.2TNmut/TNmut公司小鼠在δ-、胰多肽(PP)或腺泡细胞群中没有任何明显缺陷(数据未显示)。

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Nkx2.2 TN域突变破坏了Nkx2.2-Grg3相互作用。()重组酶介导的盒式交换(RMCE)用于敲除Nkx2.2 TN结构域中的氨基酸替换。突变以红色显示(B类)基因分型时,使用等位基因特异性引物区分野生型和突变等位基因。(C类)出生时,Nkx2.2TNmut/TNmut公司与野生型小鼠相比,胰腺大小和形态正常(n个= 3). (D类)野生型和突变型胰腺的H&E染色切片显示内分泌和腺泡形态正常(n个= 3). (E类)定量PCR证明Nkx2.2个突变株中整个胚胎胰腺(E18.5)的转录水平没有变化(n个= 5). (F类)P0幼崽的Nkx2.2蛋白水平没有变化。拉明B1用作负荷控制(n个= 5). (G公司)出生时从整个胰腺共免疫沉淀Grg3和Nkx2.2表明Nkx2-2中两种蛋白质之间的相互作用丧失TNmut/TNmut公司小鼠(n个= 3).

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Nkx2.2个TNmut/TNmut公司小鼠患糖尿病。()Nkx2.2个TNmut/TNmut公司小鼠在进食和禁食状态下出现高血糖(n个= 5). (B类,C类)6周龄时对野生型和突变型胰岛进行胰岛素和胰高血糖素免疫染色。6周龄时,Nkx2.2TNmut/TNmut公司小鼠的胰岛较小,β细胞较少,α细胞较多(n个= 3). (D类F类)4周龄时β细胞和α细胞的定量显示β细胞显著减少,α细胞显著增加,而胰岛总数量没有变化(n个= 3). (*)P(P)< 0.05; (***)P<0.001。

适当的胰岛细胞发育需要Nkx2.2 TN结构域

大多数内分泌细胞谱系的初级诱导需要Nkx2.2;单位:Nkx2.2−/−胚胎中,ghrelin表达细胞的形成消耗了所有β细胞以及大多数α和PP细胞(Sussel等人,1998年). 确定Nkx2.2中观察到的受损胰岛结构和异常胰岛细胞比率TNmut/TNmut公司成年小鼠是由胚胎发育期间出现的胰腺缺陷引起的,我们评估了Nkx2.2中内分泌细胞的形成TNmut/TNmut公司胚胎。与Nkx2.2不同−/−E9.5、Nkx2.2已经显示内分泌细胞分化表型的胚胎TNmut/TNmut公司胚胎在E12.5时α和β细胞数量没有明显缺陷(图3A-C). 与细胞定量一致,在胰高血糖素胰岛素Nkx2.2之间的基因表达TNmut/TNmut公司胚胎及其野生型同胞(图3L). 然而,到了E13.5,在二次转变开始时,β细胞数量和胰岛素表达减少,相应的ɛ细胞数量和胃饥饿素表达式(图3L; 补充图1D–F、I、J)。在E15.5,在内分泌细胞分化的高峰期间,胰岛素分泌β细胞的数量仍然显著减少,相应地胰岛素(插入1ins2(英寸2))基因表达(图3D、E、H、L; 数据未显示)。β细胞数量的减少似乎不是由于凋亡,如胰岛素生成细胞群或胰腺其他部位caspase3表达缺失所示(补充图2A-D)。此外,ɛ-细胞数和胃饥饿素基因表达随着β细胞的丢失而增加,这表明与Nkx2.2相似−/−等位基因,细胞是以牺牲β细胞群为代价形成的(图3F–H、L). 这些表型持续到妊娠末期(图3I–L).

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Nkx2.2个TNmut/TNmut公司小鼠的胰岛素表达降低,胰高血糖素和ghrelin表达增加。(A–L)Nkx2.2中胰岛素、胰高血糖素和ghrelin表达细胞的特征TNmut/TNmut公司小鼠(n个= 3–5). (C类,L(左))E12.5时,激素阳性细胞的数量和表达没有改变。(D类H(H),L(左))按E15.5,Nkx2.2TNmut/TNmut公司小鼠的ɛ细胞数量增加,α细胞数量略有增加,β细胞数量减少。(I–L型)到E18.5,胰高血糖素数量显著增加,而胰岛素和ghrelin数量分别保持减少和增加。(*)P(P)< 0.05. 箭头表示胰高血糖素/胰岛素在E类J.

令人惊讶的是,与Nkx2.2相比−/−表型,α细胞数量和胰高血糖素Nkx2.2中的基因表达TNmut/TNmut公司E18.5胰脏(图3I–L). α细胞的增加似乎不是由过度复制引起的,因为我们在α细胞群扩张之前或期间没有检测到增殖的胰高血糖素阳性细胞(补充图2E-H)。虽然α和ɛ单激素阳性细胞的数量增加,但这与胰高血糖素的增加无关+胃饥饿素+共存人群(未显示数据)。相反,尽管β细胞总数减少,但我们确实观察到胰岛素和胰高血糖素共存的细胞数量增加(图3E、J,插图)。在整个妊娠期,PP和生长抑素水平在Nkx2.2中保持不变TNmut/TNmut公司胰腺,外分泌组织形态、腺泡细胞数量或外分泌酶基因表达无明显变化(图3L; 未示出的数据)。

Nkx2.2中胰岛细胞特异性转录因子的表达受到干扰TNmut/TNmut公司胰腺

有趣的是,Nkx2.2TNmut/TNmut公司表型与Nkx2.2中观察到的表型有很大不同−/−胚胎。虽然不太严重的β细胞和β细胞表型可归因于TN结构域的突变,Nkx2.2功能比无效等位基因的降低更为温和,但由此导致的α细胞数量的增加更难解释。开始描述可能导致Nkx2.2的潜在分子变化TNmut/TNmut公司内分泌细胞表型,当胰岛素和ghrelin细胞群发生明显变化时,我们在E14.5评估了几个胰腺发育标记物的表达。类似于Nkx2.2−/−小鼠,表达Pdx1页E14.5不变,我们看到Ngn3号机组尽管内分泌祖细胞没有明显减少(图4A;Anderson等人,2009年; 数据未显示)。与Nkx2.2相比−/−老鼠,新x6.1E14.5的表达没有显著下调(图4A).

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Nkx2.2 TN域突变导致阿尔克斯β细胞的错误表达和β-到-α细胞的重新编程。()E14.5时胰岛细胞特异性转录因子的表达(n个= 5). (B类)到E18.5,β细胞因子减少,而α细胞因子增加,反映了与这些细胞类型相关的变化(n个= 5). (C类)Nkx2.2个TNmut/TNmut公司小鼠的阿尔克斯E15.5中的表达式,在胰高血糖素表达和α细胞数(n个= 5). (D类,E类)Arx数量增加+细胞和更多Arx+/胰高血糖素Nkx2.2中的单元格TNmut/TNmut公司E15.5时,当阿尔克斯首先观察到该表达式。(F–I型)在E15.5和持续妊娠期间,Arx在Nkx2.2的β细胞群中表达错误TNmut/TNmut公司老鼠。(J,K(K))使用β-细胞特异性Ins:Cre和Rosa26:番茄报告基因,在Nkx2.2中经常检测到β-细胞衍生胰高血糖素阳性细胞TNmut/TNmut公司老鼠。(L(左))β-细胞衍生α细胞表达Arx(n个= 3). (*)P(P)< 0.05; (**)P(P)< 0.01. 箭头输入E类指示Arx+/胰高血糖素细胞。箭头输入G公司,、和K(K)表示共阳性细胞。箭头输入L(左)表示三阳性细胞。

到E18.5时,胰岛谱系特异性因子的表达改变与观察到的由TN结构域突变引起的胰岛细胞比率的变化完全一致。与β细胞数量减少一致,Pdx1页,神经元D、和美国金融管理局显著降低了E18.5(图4B). 或者,α-细胞标记物阿尔克斯Irx2显著升高了E18.5,增加了阿尔克斯表达接近野生型水平的70倍(图4B).MafB公司表情没有出现变化;然而,这可能是由于以下事实MafB公司在胚胎发生期间在α和β细胞群中表达;损失MafB公司-β细胞的表达将通过增加MafB公司-表达α细胞。4周龄时,MafB在野生型和Nkx2.2的α细胞中表达TNmut/TNmut公司小鼠(补充图3)。

有趣的是,尽管α和β细胞特异性基因表达水平的总体变化与Nkx2.2中观察到的α和β-细胞数量的变化很好地对应TNmut/TNmut公司胚胎中,我们可以检测到α-细胞转录因子的表达增加了三到四倍阿尔克斯在E15.5时,胰高血糖素的数量显著增加之前+单元格(图4C). 确定增加的细胞来源阿尔克斯表达,我们进行免疫荧光分析以关联阿尔克斯不同胰腺人群的表达。在E15.5中,我们观察到在Nkx2.2中不同时表达胰高血糖素的Arx表达细胞数量大幅增加TNmut/TNmut公司(图4D、E). 令人惊讶的是,在发育的同一阶段,我们开始观察到一些胰岛素分泌细胞在体外表达阿尔克斯(图4F、G). 到妊娠结束时,Nkx2.2TNmut/TNmut公司胰腺含有Arx+,胰岛素+β细胞和Arx+,胰高血糖素+α细胞,而野生型窝鼠胰腺显示Arx和胰岛素的互斥表达。(图4H、I、L).

Nkx2.2 TN结构域的突变导致β-到-α-细胞转化,原因是阿尔克斯β细胞内

以前的研究表明阿尔克斯胚胎中的β细胞足以将β细胞转化为α细胞(Collombat等人,2007年). 因为我们观察到阿尔克斯表达式和Arx+在α-细胞数量显著增加之前,我们假设Nkx2.2 TN结构域的突变可能导致E15.5处的胰岛素分泌细胞的异常去表达阿尔克斯启动β细胞转分化为α细胞的基因。为了验证这个假设,我们生成了Nkx2.2TNmut/TNmut公司携带Ins:Cre转基因的小鼠(埃雷拉2000)以及Rosa26:番茄或Rosa26:LacZ报告基因等位基因(索里亚诺1999;Madisen等人,2010年)让我们能够追踪突变的β细胞。而Rosa26报告基因的表达仅限于对照组中胰岛素表达人群Nkx2.2+/+;Ins:Cre;Rosa26:LacZ/番茄岛(图4J; 补充图4A、B),我们检测到Rosa26:Nkx2.2中2%以上的胰高血糖素表达细胞中的番茄报告基因表达TNmut/TNmut公司;Ins:Cre;Rosa26:LacZ/出生后第0天的番茄胰岛(P0)(图4K、L; 补充图4C,J)。许多胰高血糖素和番茄双阳性细胞共表达Arx,这支持了以下观点阿尔克斯在缺乏功能性Nkx2.2的β-细胞衍生胰高血糖素表达人群中上调(图4L). 与β细胞在Nkx2.2中被重新编程为α细胞命运的发现一致TNmut/TNmut公司在小鼠体内,可以检测到一些β细胞转录因子的表达,包括Pdx1、MafA和Nkx6.1,这些细胞正处于转化为表达胰高血糖素的α细胞的过程中(补充图4D-I)。Nkx2.2中胰岛素和胰高血糖素共表达人群TNmut/TNmut公司胰腺也可能代表这种过渡人口(图3E、J). 应该注意的是,无法检测到番茄与ghrelin的共染色,这表明与α细胞谱系相比,观察到的ɛ细胞的增加并不是由于β细胞重新编程所致(补充图4K,L)。

自Nkx2.2以来TNmut/TNmut公司幼崽出生时没有代谢表型,但随着年龄的增长,β细胞不断丢失,血糖越来越高,我们希望确定出生后的动物是否继续发生β-到-α细胞的转化。对于此分析,我们生成了Nkx2.2TNmut/TNmut公司携带Pdx1:CreER转基因的小鼠(Gu等人,2002年)和Rosa26:番茄报告基因。为了避免可能与高血糖环境相关的结果,我们在显性高血糖发作之前用三苯氧胺诱导了3周龄小鼠(补充图1)。三苯氧胺诱导五天后,我们可以检测Nkx2.2中胰高血糖素生成α细胞中番茄报告基因的表达TNmut/TNmut公司; Pdx1:CreER;Rosa26:番茄岛(n个=3),表明出生后β-至α-细胞重编程继续发生(补充图5A–D)。对照Nkx2.2中,胰高血糖素表达和番茄报告基因表达相互排斥TNmut公司/+; Pdx1:CreER;Rosa26:番茄室友服用他莫昔芬。Nkx2.2个TNmut/TNmut公司; Pdx1:CreER;Rosa26:如预期的那样,未接受他莫昔芬治疗的番茄胰岛缺乏番茄报告基因表达(补充图5E,F)。

Nkx2.2直接结合并抑制β细胞中甲基化的Arx启动子

鉴于阿尔克斯Nkx2.2中的表达式TNmut/TNmut公司β细胞,Nkx2.2和Grg3之间相互作用的破坏可能干扰阿尔克斯β细胞中的启动子。确定是否阿尔克斯是Nkx2.2的直接靶点,我们对阿尔克斯用于识别转录起始位点上游~1.4 kb处高度保守的Nkx2.2结合位点的启动子(补充图6A;Hill等人2011). 胰岛细胞系中该区域的染色质免疫沉淀(ChIP)和Nkx2.2抗体表明,内源性Nkx2-2通常占据胰岛细胞的该区域阿尔克斯α和β细胞中的启动子,尽管βTC6细胞中的结合显著增强(图5A). 此外,Grg3和HDAC1优先被招募到阿尔克斯β细胞中的启动子,支持Nkx2.2可能招募Grg3来抑制阿尔克斯β细胞群中的表达。进一步分析阿尔克斯启动子揭示了保守的Nkx2.2结合位点周围存在CpG岛,如果甲基化,也可能有助于阿尔克斯抑制β细胞。相应地,Nkx2.2结合区的亚硫酸氢盐分析阿尔克斯启动子识别β与α细胞的差异甲基化模式;这个阿尔克斯启动子在β细胞中高度甲基化(图5B). 自从DNA甲基转移酶Dnmt3a被证明在发育过程中对建立甲基化模式很重要,并通过与转录因子的相互作用促进位点特异性甲基化(Hervuet等人,2009年),我们研究了Dnmt3a是否也存在于阿尔克斯发起人。与Dnmt3a在细胞特异性调节阿尔克斯启动子甲基化,Dnmt3a占据阿尔克斯β细胞特异性启动子(图5A). 此外,联合免疫沉淀分析表明,标记的Dnmt3a可以与Nkx2.2形成蛋白质复合物,但不能与其他β细胞因子(如Pax4和Isl1)形成蛋白复合物(图5C). Grg3和HDAC1也是这个复合物的一部分,这表明Dnmt3a和Nkx2.2合作促进阻遏物复合物向阿尔克斯β细胞中的启动子。有趣的是,对于Nkx2.2和Dnmt3a之间的直接相互作用而言,Nkx2.2TN结构域似乎是不可或缺的(补充图6B),这表明这两个因素通过另一个Nkx2.2.结构域和/或通过复合体中的其他蛋白质相互作用。

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Nkx2.2直接抑制阿尔克斯βTC6细胞而非αTC1细胞。()Nkx2.2、Grg3、HDAC1和Dnmt3a在阿尔克斯βTC6细胞中的启动子(n个= 3). (B类)Nkx2.2结合区亚硫酸氢盐序列分析和量化阿尔克斯在分离的β和α细胞中的位点(−1660到−1463碱基对[bp]和−1374到−1162)。(C类)利用Flag-Dnmt3a构建物转染的Min6细胞上的Flag标记抗体进行免疫沉淀,并利用Flag标签、Nkx2.2、Grg3、HDAC1、Pax4和Isl1抗体进行Western blotting,以协同免疫沉淀分析Dnmt3a与Nkx2。(D类)Nkx2.2诱导2.5 kb区域的阿尔克斯启动子与αTC1细胞中的荧光素酶融合。Nkx2.2抑制阿尔克斯βTC6细胞启动子活性3.5倍(n个= 4). (E类)3个月龄婴儿典型胰腺切片的免疫染色Dnmt3a型飞行/飞行(对照)和Ins:Cre:Dnmt3a型飞行/飞行胰岛素和胰高血糖素的室友。(F类)3个月大的代表性胰腺切片保险公司:Cre:Dnmt3a型飞行/飞行:Rosa26:LacZ公司动物胰高血糖素免疫染色左边面板和具有β-半乳糖苷酶活性(LacZ)的胰高血糖素覆盖层正确的面板。这个插入标记一个放大的代表区域,显示一些LacZ和胰高血糖素双标记细胞(白色箭头)。(***)P(P)<0.001与αTC;(#)P(P)< 0.05; (###)P(P)<0.001与IgG. (**)P(P)<0.01与β细胞B类. (***)P(P)<0.001与阿尔克斯启动子D类.

为了研究Nkx2.2是否特异性抑制阿尔克斯在β细胞启动子中,我们亚克隆了阿尔克斯位于转录起始位点上游的启动子进入pGL3碱性无启动子荧光素酶报告载体。pGL3的共转染-阿尔克斯Nkx2.2个转化为αTC1细胞系导致显著诱导阿尔克斯转录活性,而pGL3的共转染-阿尔克斯Nkx2.2个βTC6细胞系诱导65%的转录抑制(图5D). 这些数据表明Nkx2.2抑制阿尔克斯β细胞通过与Dnmt3a和Grg3的相互作用以及HDAC1优先招募到阿尔克斯β细胞中的启动子。这些发现与体内结果一致,表明Nkx2.2 TN结构域对于Grg3的募集和维持对Grg3表达的抑制至关重要阿尔克斯在β细胞群中。

Dnmt3a的β-细胞特异性缺失也会导致β-到-α-细胞转化

鉴于Dnmt3a在阿尔克斯β细胞中的启动子及其在Nkx2.2、Grg3和HDAC1阻遏复合物中的存在,我们希望确定Dnmt3a是否对适当的胰岛细胞类型维持至关重要,类似于Nkx2.2。有趣的是,Dnmt3a(Ins:Cre;Dnmt3 a)β细胞特异性缺失的小鼠飞行/飞行)现象复制Nkx2.2TNmut/TNmut老鼠;α细胞增加,β细胞相应减少(图5E). 此外,Ins:Cre中的遗传谱系追踪;Dnmt3a型飞行/飞行;Rosa26:LacZ小鼠证明了与Dnmt3a型导致β-到-α-细胞转分化,类似于Nkx2.2TNmut/TNmut公司小鼠(图5F).

从Nkx2.2中移除ArxTNmut/TNmut公司β细胞足以阻止β细胞重新编程,但无法恢复β细胞成熟和功能

确定是否抑制阿尔克斯在β细胞中足以防止Nkx2.2TNmut/TNmut公司β-到-α-细胞重编程表型,我们杂交了Ins:Cre;阿尔克斯飞行/飞行小鼠(埃雷拉2000;Marsh等人,2009年)到Nkx2.2TNmut/TNmut公司产生小鼠的背景,以去除体外表达的阿尔克斯特别是来自Nkx2.2TNmut/TNmut公司β细胞。野生型小鼠通常不表达阿尔克斯β细胞,相应地,Ins:Cre;阿尔克斯飞行/飞行小鼠发育成正常的胰岛,与野生型小鼠无明显区别(补充图7A)。或者,删除阿尔克斯来自Nkx2.2的β细胞TNmut/TNmut公司老鼠回来了阿尔克斯到野生型表达水平,证实阿尔克斯其表达主要是由于其在β细胞中的异位表达(图6G). 此外,移除阿尔克斯从Nkx2.2TNmut/TNmut公司β细胞使胰高血糖素mRNA水平和α细胞数量正常化(图6B、D、F、G). Nkx2.2中β细胞的谱系追踪TNmut/TNmut公司;Ins:Cre;阿尔克斯飞行/飞行小鼠没有发现任何β细胞衍生的胰高血糖素表达细胞(图6J、K),建议删除阿尔克斯足以阻止β-至α-细胞的转分化。另一方面,β细胞缺失阿尔克斯不足以恢复E18.5和成年Nkx2.2的β细胞数量或胰岛素表达TNmut/TNmut公司; Ins:Cre;阿尔克斯飞行/飞行小鼠仍处于高血糖状态(图6A、C、E、G–I). 这表明TN结构域调节额外的Nkx2.2靶点,这些靶点负责β细胞的形成、维持和功能。同样,高ghrelin水平不受阿尔克斯来自Nkx2.2TNmut/TNmut公司突变的β细胞,证明阿尔克斯-胚胎发生过程中ɛ-细胞与β-细胞的命运选择也需要独立的Nkx2.2 TN结构域功能(图6G).

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β-细胞特异性损失阿尔克斯在Nkx2.2中TNmut/TNmut公司老鼠救援胰高血糖素阿尔克斯表达式。(A–F)胰岛素和胰高血糖素激素阳性细胞的特征(n个= 3). (G公司)野生型激素转录水平,Nkx2.2TNmut/TNmut公司,和Nkx2.2TNmut/TNmut公司;Ins:Cre;阿尔克斯飞行/飞行小鼠(n个= 5). (H(H))7周龄雄性和雌性小鼠的喂食血糖水平(n个= 5). ()野生型Nkx2.2中β细胞占胰腺总面积百分比的定量TNmut/TNmut公司和Nkx2.2TNmut/TNmut公司;Ins:Cre;阿尔克斯飞行/飞行老鼠。(J,K(K))使用β-细胞特异性Ins:Cre和Rosa26:番茄报告基因,在Nkx2.2中未检测到β-细胞源性ghrelin阳性细胞TNmut/TNmut公司突变小鼠(n个= 3). (*)P(P)< 0.05; (**)P(P)< 0.01; (***)P(P)<0.001与野生型相比。(#)P(P)<0.05相对于Nkx2.2TNmut/TNmut公司.

调查Ins:Cre;Dnmt3a型飞行/飞行表型也依赖于阿尔克斯,我们测试了Dnmt3a型阿尔克斯可以挽救β-到-α-细胞的转分化过程。siRNAs靶向Dnmt3a型,阿尔克斯或将这两个基因的组合转染到Min6细胞中。与Ins类似:Cre;Dnmt3a型飞行/飞行小鼠,击倒Dnmt3a型在Min6细胞中导致β-到-α-细胞重编程:胰岛素,Pdx1页、和Pax4型减少,同时上调胰高血糖素,阿尔克斯、和MafB公司.siRNA组合敲除阿尔克斯具有Dnmt3a型能够阻止α和β细胞标记物表达的相应改变,表明与Nkx2.2类似,Dnmt3a介导的重编程依赖于Arx错误表达(补充图7B)。

讨论

转录抑制因其在决定谱系和细胞规格方面的作用而受到广泛重视,因为众所周知,抑制机制是许多组织和生物体中细胞承诺的关键调节器(格雷等人,1995年;格雷和莱文1996;Laslo等人,2006年;Jepsen等人,2007年;Rajasekhar和Begemann,2007年;李和戴维森2009;Nishi等人,2009年). Nkx2.2被证明是一种转录阻遏物,通过与辅抑制因子Grg4的相互作用来调节腹侧神经模式(Muhr等人,2001年). Nkx2.2在发育中的胰腺中作为转录阻遏物的能力也已被证明(Doyle等人,2007年). Grg2和Grg3,而不是Grg4,在胰腺中与Nkx2.2共存,也可以通过grucho相互作用TN结构域与Nkx2.2相互作用(Doyle等人,2007年;Hoffman等人,2008年). 在本研究中,我们突变了Nkx2.2 TN结构域,以确定Grg介导的Nkx2-2阻遏物活性在发育胰腺中的作用。我们证明,Nkx2.2 TN结构域的突变消除了体内Nkx2-2和Grg3蛋白之间的相互作用,这足以导致从β细胞向ɛ细胞谱系的转变。此外,由于α-细胞调节器的β-细胞特异性去表达,许多剩余的β细胞被重新编程为α细胞阿尔克斯引人注目的是,似乎阿尔克斯是Nkx2.2维持β细胞命运的主要下游靶点;移除阿尔克斯来自Nkx2.2TNmut/TNmut公司β细胞似乎完全抑制了β向α细胞的转化。

与Nkx2.2相关的表型TNmut/TNmut公司提示胰腺内两个不同的过程需要TN域介导的功能:胰岛细胞的初级命运决定和β细胞特性的维持。最初,TN领域似乎会影响Ngn3的能力+与β细胞相比,内分泌祖细胞分化为ɛ细胞,与我们在Nkx2.2中观察到的类似−/−-使鼠标无效。细胞命运选择调控中的一个拟议缺陷得到了以下观察结果的支持:β-细胞和ɛ-细胞比率的相应改变发生在第二次转变开始时,这标志着第一次主要的β-细胞分化。此外,我们证明ghrelin生成细胞的增加并不是由于β细胞群的重新编程,因为我们没有观察到来源于谱系标记的β细胞群(补充图4L)的ghrelin细胞。尽管Nkx2.2TNmut/TNmut公司和Nkx2.2−/−小鼠的ɛ细胞数量增加,β细胞相应减少,Nkx2.2的表型更为显著−/−小鼠,在所有发育阶段都没有β细胞。与Nkx2.2相关的较轻表型TNmut/TNmut公司小鼠可能表明,Nkx2.2和Grgs之间的相互作用没有完全中断,残留活性足以形成少量β细胞。或者,Nkx2.2蛋白的其他结构域可能在胰腺发育的初级过渡阶段负责β细胞的形成,这与Nkx2-2中没有β细胞表型一致TNmut/TNmut公司E12.5之前的小鼠(图3A-C). 第三种可能性是,额外的Nkx2.2蛋白结构域可以补偿TN结构域活性的丧失,从而在整个发育过程中形成少量β细胞。这些可能性并非相互排斥,将在未来的研究中探讨,以更全面地了解Grg介导的Nkx2.2功能调节在β细胞谱系决定中的作用。

Nkx2.2 TN结构域在维持能够在Nkx2-2中形成的β细胞方面也发挥着独特的作用TNmut/TNmut公司老鼠。我们表明,到E18.5时,β细胞的额外减少对应于α细胞数量的意外增加。与我们观察到的β细胞与β细胞比率的早期变化不同,直到妊娠结束,我们才观察到α细胞数量的显著增加。观察到α细胞基因在胰岛素分泌人群中开始外显表达,结合β细胞系追踪分析,表明许多α细胞来源于胰岛素分泌细胞。这意味着Nkx2.2在β细胞内发挥作用,以维持其细胞特性并防止转分化为α细胞命运。有趣的是,在Nkx2.2中TNmut/TNmut公司在小鼠中,我们没有观察到所有β细胞对Arx失调的即时和同时重新编程。相反,转分化事件随着时间的推移逐渐发生,并在出生后的动物中继续发生。这表明,除了激活α-细胞谱系诱导物(如Arx)外,还必须发生一些额外的(可能更具抵抗力的)细胞事件,如全局染色质重塑,才能启动重编程。来自Nkx2.2的FACs纯化β细胞群的进一步表观遗传分析和基因表达谱分析TNmut/TNmut公司在转分化中期的小鼠可能阐明了β-细胞决定特征,必须克服这些特征才能实现β-到-α-细胞的重新编程。

有趣的是,Nkx2.2TNmut/TNmut公司小鼠与Nkx2.2也有显著差异−/−与PP-和α-细胞形成有关的表型。与Nkx2.2不同−/−PP细胞减少约50%的小鼠,Nkx2.2中的PP细胞数量或PPY表达没有明显变化TNmut/TNmut这表明PP-cell的形成不受TN结构域功能的调节。更令人困惑的是与Nkx2.2相关的意外α细胞表型TNmut/TNmut公司老鼠。我们之前证明了Pdx1:Nkx2.2hdEnR阻遏物衍生物足以完全拯救Nkx2.2中的α细胞数量−/−小鼠(Doyle等人,2007年)表明Nkx2.2阻遏物功能足以形成α细胞。然而,去除Nkx2.2 TN阻遏物结构域似乎不会对任何发育阶段的α细胞数量产生负面影响,相反,我们观察到α细胞数量增加。这可能表明Grg依赖性阻遏对于α细胞谱系规范来说是不必要的,或者Nkx2.2蛋白的其他区域可以补偿这种相互作用的损失和/或提供另一种抑制活性的机制。我们目前正在探索Nkx2家族的定义域,即保守的NK2-SD结构域,如之前所建议的那样,可能对体内Nkx2.2阻遏物活性有贡献(Watada等人,2000年). 现在,这里的数据让我们更好地理解了Nkx2.2 TN结构域在通过抑制β细胞的表达来维持β细胞特性方面以前未曾预料到的作用阿尔克斯β细胞中的启动子。Nkx2.2中不会显示此功能−/−小鼠,因为没有可用于重新编程的β细胞。这一意想不到的结果不仅开始阐明Nkx2.2在不同胰岛细胞类型和不同发育阶段的不同功能,而且还强调了生成低形态和/或区域特异性等位基因对理解体内蛋白质功能的细微差别的有用性。

我们的研究还再次强调了维持适当监管阿尔克斯不同类型胰岛细胞的表达。以前的研究表明阿尔克斯对于确定α-和PP-细胞谱系至关重要(Collombat等人,2003年,2005,2007). 中断阿尔克斯导致α细胞数量减少,同时β和δ细胞相应增加(Collombat等人,2003年). 或者,错误表达阿尔克斯β细胞内足以将β细胞转化为α或PP细胞(Collombat等人,2007年). 有趣的是,尽管我们重述了β-到-α-细胞重编程现象阿尔克斯在β细胞中,我们无法检测到PP表达的显著变化。可能的是阿尔克斯由Nkx2.2 TN突变引起的对α细胞的命运是足够的,但不足以转化为PP-cell的命运。这与研究结果一致,研究表明转录因子的蛋白表达水平和剂量要求对控制胰岛细胞发育和胰岛细胞命运选择很重要(Fujitani等人,2006年;Wang等人,2009年). 或者,Nkx2.2 TN结构域的移除可能会影响其他下游效应器,这些效应器可能会起到对抗Arx对PP命运的调节作用。

转录因子的差异表达可以实现组织和细胞特异性基因调控;然而,当一种因子在一种以上的细胞类型中表达时,将需要更高阶的调节来控制细胞和/或启动子特异性的调节。差异启动子调控可以通过细胞特异性辅因子相互作用或在DNA可及性水平上实现,或两者兼而有之。在Nkx2.2的情况下,我们证明它优先结合阿尔克斯β细胞中的启动子,尽管Nkx2.2在α和β细胞中都有表达和功能。Nkx2.2的差异结合能力可能受甲基化状态的影响阿尔克斯围绕Nkx2.2共识结合位点的启动子,可能由Dnmt3a诱导的DNA修饰促进。这些因子在维持β细胞特异性方面的协同作用阿尔克斯Dnmt3a和Nkx2.2 TN突变小鼠的β细胞特异性缺失所显示的类似重编程表型支持了抑制和β细胞特性。因此,差异DNA甲基化和Dnmt3a在阿尔克斯启动子为Nkx2.2结合在阿尔克斯β细胞中的启动子。然而,Dnmt3a也在α和β细胞中表达,表明其优先招募到阿尔克斯β细胞中的启动子也必须依赖于β细胞特异性因子。Nkx6.1可能是介导Dnmt3a向β细胞特异性招募的候选基因阿尔克斯启动子,我们能够证明Nkx6.1也存在于阿尔克斯β细胞中的启动子(补充图6)。需要进行进一步研究,以确定阿尔克斯启动子与蛋白质募集和DNA甲基化有关,以启动和维持阿尔克斯在β细胞中。

因为我们还可以检测到Nkx2.2绑定到阿尔克斯α细胞中的启动子,尽管处于较低水平,但Nkx2.2介导的抑制阿尔克斯β细胞内也依赖甲基结合蛋白和Nkx2.2之间的组合效应。Dhawan等人(2011年)证明甲基结合蛋白MeCP2也与甲基化的阿尔克斯β细胞中的启动子。甲基结合蛋白已被证明可以将组蛋白脱乙酰酶复合物(如NuRD)连接到甲基化的DNA上(Zhang等人,1999年). 此外,序列特异性转录因子可以促进这些阻遏物复合物的募集(Kehle等人,1998年;Liang等人,2008年;Fu等人2011). 由于Nkx2.2优先招募Grg3和HDAC1加入阿尔克斯在β细胞的启动子中,Nkx2.2可能与甲基结合蛋白合作招募组蛋白去乙酰化酶并实现对阿尔克斯由于阿尔克斯β细胞的表达对于维持β细胞的特性至关重要,这些机制的结合很可能是协同抑制阿尔克斯并保持β细胞的完整性(如图7A所示)。此外,考虑到Nkx2.2和Grg3在阿尔克斯α细胞中的启动子(图5A)和Nkx2.2介导的诱导阿尔克斯在α细胞中(图5D),我们不能排除Nkx2.2和Grg3可能促进阿尔克斯在α细胞中。虽然Grgs通常被描述为协同抑制剂,但最近的一项研究表明,Grg3在脂肪生成过程中既能作为激活剂又能作为阻遏剂发挥作用(Villanueva等人,2011年).

血统特异性基因表达模式依赖于转录因子、辅因子和DNA可及性之间的复杂相互作用。当单个因子在发育过程中以及在独特的细胞类型中具有不同的功能时,这个过程变得更加复杂。我们的分析强调了内分泌胰腺内谱系承诺的复杂调节,并提请注意需要解剖每个调节因子的细胞特异性功能,以充分了解谱系规范和维持。携带Nkx2.2 TN结构域破坏的小鼠的表型表明,Nkx2.2Grg介导的阻遏物活性控制着两个发育阶段(图示于图7B)(1)Grg介导的Nkx2.2阻遏对β细胞与α细胞的早期结合不是必需的,但对在二次转变开始时形成的β和ɛ细胞的正确平衡是必需的。(2) 这种相互作用介导的功能对于通过防止β细胞异位表达来维持β细胞的特性也至关重要阿尔克斯在β细胞中。这强调了理解在谱系承诺决策中辅因子的时空调控的重要性,并强调了表观遗传和转录因子相互作用对进一步调控启动子占用的潜在重要性。我们的研究,以及Dhawan等人(2011年),表明Nkx6.1、Nkx2.2、Dnmt3a和MeCP2收敛于阿尔克斯在β细胞中特异性启动子招募组蛋白修饰物(分别为HDAC1和PRMT6),以沉默阿尔克斯表达式(图示于图7). 进一步了解单个启动子上胰岛细胞特异性转录网络的精确分子事件将有助于制定有效的方案,以诱导和维持来自替代细胞来源(如胚胎干细胞或诱导的多能干细胞)的适当内分泌谱系承诺,用于治疗糖尿病。

保存图片、插图等的外部文件。对象名为2291fig7.jpg

Nkx2.2调节模型阿尔克斯β细胞中的启动子。()我们的数据,结合研究Dhawan等人(2011年),支持一种模型,其中由Nkx2.2、Grg3和Dnmt3a组成的阻遏物复合物优先将HDAC1募集到阿尔克斯沉默促进者阿尔克斯在胰腺β细胞中特异性表达,以阻止β向α细胞转化。我们还可以检测到与该启动子区域结合的Nkx6.1的存在,这可能导致Nkx2.2/Dnmt3a复合物的细胞特异性募集阿尔克斯发起人。自Nkx2.2起TNmut/TNmut公司小鼠不再保持Nkx2.2/Grg3相互作用,Grg3和HDAC1不再被招募到阿尔克斯启动子,允许异位表达阿尔克斯在β细胞中。尚不清楚Nkx2.2是否TNmut/TNmut公司小鼠影响Dnmt3a的募集和随后的甲基化阿尔克斯发起人。(B类)Grg3介导的Nkx2.2阻遏控制胰腺发育的两个发育阶段。我们首先观察到Nkx2.2中E13.5处β和ɛ细胞的适当规格的畸变TNmut/TNmut当小鼠的ɛ细胞数量增加而β细胞受损时。剩下的β细胞接着转分化为α细胞。这种转分化在E18.5中是明显的,并在出生后继续发生。

材料和方法

生成Nkx2.2TNmut公司老鼠

Nkx2.2 TN域突变体TNmut公司)使用两步重组介导的盒式交换(RMCE)技术生成小鼠(Chen等人,2011年)在内源性Nkx2.2位点插入氨基酸替换。为了做到这一点,我们首先设计了一个Nkx2.2 loxed盒式接收器(Nkx2.2生命周期评价)使用中描述的策略和质粒的等位基因Chen等人(2011)(L Arnes、K Leclerc、JM Friel、SB Hipkens、MA Magnuson和L Sussel正在准备中)。其次,生成Nkx2.2TNmut公司然后,我们制作了一个基础交换Nkx2.2靶向载体,其中包含一个5.1-kb基因组(129-S6)DNA片段,包含两个Nkx2-2编码外显子。使用QuikChange site-directed Mutagenesis kit(Stratagene)对TN结构域进行PCR介导的定点突变,以取代保守的TN结构核SVKD12–15含有四个丙氨酸残基的氨基酸和不变亮氨酸(L17)缬氨酸,一种同样疏水的氨基酸。我们还引入了一个SalI限制位点用于基因分型。所有突变均通过DNA测序进行验证。Nkx2.2TNmut交换载体用于使用含有Nkx2.2的小鼠胚胎干细胞进行RMCE生命周期评价等位基因。使用双重正负选择策略来识别经过盒式磁带交换的克隆(Chen等人,2011年)经DNA PCR证实。阳性克隆通过Southern blot分析进一步分析是否存在新的SalI限制位点。Nkx2.2个TNmut公司/+将胚胎干细胞注射到C57Bl/6小鼠交配获得的囊胚中,然后转移到假孕C57B1/6小鼠。将雄性嵌合体培育至C57Bl/6J雌性小鼠,并使用Nkx2.2等位基因特异性引物对agouti后代进行PCR基因分型,以区分野生型和Nkx2.2TNmut公司等位基因(图1B):oKL6(FWD,野生型),GTCAAGGACATCTTGGACCTTCCG;oKL1(前轮驱动,Nkx2.2TNmut公司),TTTGCAGCAGCGGCAATC;和oKL5(REV、野生型和Nkx2.2TNmut公司),在ccgggatgggaccttggacatta。随后通过与FlpE小鼠交配移除FRT侧翼潮霉素盒(罗德里格斯等人,2000年). 生成Nkx2.2的所有过程TNmut公司这些老鼠得到了范德比尔特大学动物保护和使用委员会的批准。

动物保养

所有小鼠均在瑞士黑(Taconic)背景下饲养,并根据哥伦比亚大学机构动物护理和使用委员会的批准协议进行饲养和治疗。Nkx2.2的基因分型TNmut公司使用Nkx2.2等位基因特异性引物(如上所述)对小鼠和胚胎进行检测。Arx基因分型flox/flox公司小鼠、Ins:Cre小鼠、Rosa26:Tomato小鼠、Rosa 26:LacZ小鼠和Pdx:CreER小鼠按前述方法进行(埃雷拉2000;Gu等人,2002年;Marsh等人,2009年;Madisen等人,2010年).

免疫组织化学

组织在4%PFA中固定4小时或过夜,在冷PBS中清洗,在30%蔗糖中培养,并冷冻保存。在7μM切片上进行免疫荧光。使用的抗体列表见补充表1。荧光图像是通过尼康Eclipse 80i显微镜、Q图像相机和ImagePro软件(媒体控制论)获得的。使用Zeiss LSM 510立式相机(针孔=1)拍摄共聚焦图像。为了量化目的,在整个胰腺的每四个部分(E12.5和eE13.5)和每八个部分(EI5.5)手动计数野生型的染色细胞(n个=3)和突变(n个= 3). 对于E18.5的动物,每八个切片计数一次的染色细胞数除以胰腺总面积。所有值均表示为平均值±SEM。使用双尾学生的未配对进行统计分析t吨-测试。P(P)< 0.05.

RNA分析

从各个胚胎年龄(RNeasy,Qiagen)的整个胰腺组织中分离出总RNA,并使用SuperScript III试剂盒(Invitrogen)和随机六聚体引物制备cDNA。使用200 ng cDNA、PCR主混合(Eurogentec)和TaqMan探针(ABI按需检测)进行定量PCR。使用的引物清单见补充表2。所有基因均归一化为亲环素B,并用ABI棱镜软件进行定量。n个所有小鼠种群均≥4。所有值均表示为平均值±SEM。使用双尾学生的未配对进行统计分析t吨-测试。P(P)< 0.05.

炸薯条

α-TC1和β-TC6细胞在15厘米的培养皿中生长至~80%的融合度,并根据ChIP IT Express试剂盒(Active Motif)进行甲醛交联。使用Diagnode BioRupter(8分钟至30秒开/关)通过超声波破碎交叉连接的染色质。将三微克小鼠α-Nkx2.2(发育研究杂交瘤库[DSHB])、兔子α-TLE3(圣克鲁斯生物技术)、家兔α-HDAC1(圣克鲁兹生物技术),兔子α-Nkx6.1(β细胞生物联合会)或小鼠α-IgG(AbCam)添加到剪切后的染色质中。让抗体/染色质复合物在4°C下首尾旋转过夜。使用ChIP-grade蛋白G磁珠(细胞信号)拉下抗体/染色质复合物。对染色质进行洗涤、洗脱和反向交联,然后进行蛋白酶处理。然后使用SYBR绿色荧光和以下引物对染色质片段进行定量PCR分析:Arx(FWD)、TCCTCCACCATTGAGGGTA;和(修订版),GCAACTTGAGGGGTACAGA。所有值均表示为平均值±SEM。使用双尾学生的未配对进行统计分析t吨-测试。P(P)< 0.05.

免疫共沉淀和Western

使用核复合物Co-IP试剂盒(Active Motif)对P0小鼠幼鼠的切除胰腺进行核提取。核提取物来自五只野生型或五只突变动物。在4°C下,将一个五微克的核提取物和5μg的兔抗TLE3(Santa Cruz Biotechnologies)、兔α-Dnmt3a(Santa Cruz Bintechnologics)、小鼠α-Nkx2.2(DSHB)或兔抗IgG(Chemicon)在4℃下培养过夜,并端对端旋转。使用蛋白G DynaBeads(Invitrogen)拉下蛋白质/抗体复合物。清洗、洗脱蛋白质/抗体复合物,并在NuPAGE Novex 10%Bis-Tris凝胶(Invitrogen)上运行。将蛋白质转移到硝化纤维素膜上(GE Healthcare),并使用小鼠抗Nkx2或兔α-Dnmt3a进行探测。为了进行免疫沉淀控制,对膜进行剥离、清洗,并用用于初始免疫沉淀的抗体进行重制。

荧光素酶分析

要生成阿尔克斯-荧光素酶报告子,一个2.5kb的片段阿尔克斯用以下引物从小鼠尾部基因组DNA中PCR扩增转录起始位点上游的基因组区域:oRS18(FWD),ACGCGTTGCACCTCTCTTACAGTGTGTATAA;和第19版(修订版),AGATCTGGGCTCAGAGAGCGGACCT。将MluI和BglII位点分别并入5′端和3′端,以便于使用MluI与BglII克隆位点克隆到pGL3碱性无启动子荧光素酶报告载体中。所得质粒通过DNA测序进行验证。如前所述,使用双荧光素酶报告分析系统(Promega)对αTC1和βTC6细胞系进行荧光素素酶分析(Hill等人,2010年).

他莫昔芬治疗Pdx:CreER;R26R:番茄小鼠

Pdx:CreER通过每48小时向3周龄小鼠腹腔注射5毫克他莫昔芬(Sigma)诱导,持续4天。第五天,如上文所述,采集胰腺并固定在多聚甲醛中,并对指示激素进行免疫染色。

体外siRNA-介导的敲除

击倒Dnmt3a型,阿尔克斯、和Dnmt3a型+阿尔克斯根据制造商的说明,在OPTI-MEM培养基中,通过使用Lipofectamine 2000(Invitrogen)转染特定靶向小抑制RNA或干扰对照(Dharmacon Research,Inc.),在Min6细胞中进行。每3天用适当的siRNAs或加扰对照物转染Min6细胞(平均转染效率,65%–80%),并在转染后4天采集样本,如图所示。使用TRI试剂(MRC)从细胞中分离RNA,并按照制造商的说明用DNase(Ambion)处理。使用1微克RNA通过寡核苷酸T启动法,使用SuperScript III逆转录酶(Invitrogen)制备单链cDNA。实时RT-PCR是使用Fast SYBR Green Master Mix(Applied Biosystems)和7900HT Fast Real-time PCR设备(AppliedBiosystes)进行的。每个转录物的表达水平均归一化为看家基因亲环素所示的每个实时PCR实验是来自至少三个独立实验的代表。RT-PCR引物见补充表2。

鸣谢

我们感谢Catherine Lee May(CHOP)和Jeffrey Golden(CHOP阿尔克斯-floxed小鼠和Kanako Miyabayashi(日本福冈九州大学)用于提供Arx抗体。我们感谢Jonathon Hill在阿尔克斯发起人。我们感谢Lori Zeltser博士和Stephanie Padilla博士对原稿的批判性阅读,感谢Kathy D.Shelton女士组装基因靶向载体,感谢Vanderbilt转基因/ES细胞共享资源的工作人员对胚泡微注射实验的专业表现。这项工作得到了NIH拨款DK0272504(给L.S.)、DK082590(给L.S和J.P.)、丹麦042502(给M.A.M.)、乌克兰072473(给M.M.)和丹麦068763(给A.B.)的支持。哥伦比亚大学DERC(P30 DK63608)和CTSA赠款提供了额外支持。

脚注

本文有补充材料。

文章在线:http://www.genesdev.org/cgi/doi/10.1101/gad.173039.111.

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文章来自基因与发育由以下人员提供冷泉港实验室出版社