细胞干细胞。作者手稿;PMC 2011年11月5日发布。
以最终编辑形式发布为:
预防性维修识别码:PMC2987635型
NIHMSID公司:美国国立卫生研究院242689
弗里德里希共济失调诱导的多能干细胞模型代际GAA•TTC三重重复不稳定性
,1 ,1 ,1 ,1 ,2 ,2,三 ,2 ,4和1,5
谢尔曼·库
1斯克里普斯研究所分子生物学系和再生医学中心,加利福尼亚州拉霍亚托里松树北路10550号,邮编92037
伊丽莎白·索拉尼
1斯克里普斯研究所分子生物学系和再生医学中心,加利福尼亚州拉霍亚托里松树北路10550号,邮编92037
埃里卡·坎波
1斯克里普斯研究所分子生物学系和再生医学中心,加利福尼亚州拉霍亚托里松树北路10550号,邮编92037
伊丽莎白·A·托马斯
1斯克里普斯研究所分子生物学系和再生医学中心,加利福尼亚州拉霍亚托里松树北路10550号,邮编92037
古尔莎阿尔顿
2斯克里普斯研究所化学生理系,地址:10550 N.Torrey Pines Road,La Jolla,CA 92037
路易丝·洛朗
2斯克里普斯研究所化学生理学系,10550 N.Torrey Pines Road,La Jolla,CA 92037
三加利福尼亚州圣地亚哥加利福尼亚大学生殖医学系
珍妮·洛林
2斯克里普斯研究所化学生理学系,10550 N.Torrey Pines Road,La Jolla,CA 92037
马雷克·纳皮埃拉拉
4德克萨斯大学M.D.安德森癌症中心,生物化学和分子生物学系,德克萨斯州休斯顿霍尔科姆大道1515号,邮编77030
M.戈特斯菲尔德-乔尔
1斯克里普斯研究所分子生物学系和再生医学中心,加利福尼亚州拉霍亚托里松树北路10550号,邮编92037
1斯克里普斯研究所分子生物学系和再生医学中心,加利福尼亚州拉霍亚托里松树北路10550号,邮编92037
2斯克里普斯研究所化学生理学系,10550 N.Torrey Pines Road,La Jolla,CA 92037
三加州大学圣地亚哥分校生殖医学系
4德克萨斯大学M.D.安德森癌症中心,生物化学和分子生物学系,德克萨斯州休斯顿霍尔科姆大道1515号,邮编77030
- 补充资料
1
GUID:BCDBB93F-7247-4040-B31A-E406C87D77FE
总结
遗传性神经退行性疾病Friedreich共济失调(FRDA)是由GAA•TTC三重重复序列在第一内含子内的过度扩张引起的FXN公司基因,编码线粒体蛋白frataxin。长GAA•TTC重复导致受影响个体异染色质介导的基因沉默和frataxin丢失。我们报道了通过转录因子重编程从FRDA患者成纤维细胞中衍生出诱导多能干细胞(iPSCs)。FXN公司iPSC中保持着基因抑制,反映人类疾病的全球基因表达特征也一样。GAA•TTC在中唯一重复FXN公司在iPSC中,表现出与患者家属类似的重复不稳定性,在这些患者家属中,他们随着年龄的离散变化而扩张和/或收缩。错配修复酶MSH2与其他三重重复序列疾病的重复不稳定性有关,在多能性细胞中高度表达FXN公司内含子1和shRNA沉默MSH2型阻止重复膨胀,为FRDA中的重复膨胀提供了可能的分子解释。
结果
从FRDA患者成纤维细胞衍生iPSCs
两名FRDA患者(NIGMS Coriell Cell Repository中的GM03816和GM04078)的原代成纤维细胞通过转录因子过度表达重新编程(Takahashi等人,2007年),并选择和扩增具有ES/iPS形态的菌落(). qRT-PCR分析表明我们的FRDA iPSC系确实是多功能的()并保持对FXN公司信使核糖核酸(). 此外,整合的转基因重编程因子在iPSC中的表达被沉默(图S1A,在线提供),完全重新编程的标志(Lowry等人,2008年).
FRDA iPSC的特性(一个)GM03816 FRDA成纤维细胞(左)、GM03816iPSCs(中)和H1 hESCs(右)的图像。比例尺=0.5 mm。
(B类)GM03816-iPS4显示出与H1-hESCs类似的多能性mRNAs表达。GM03816成纤维细胞,白色条;GM03816 iPSC,浅灰色;H1 hESCs,深灰色。mRNA水平标准化为GAPDH公司误差条=重复测量的SEM。
(C)标志性镇压FXN公司与未受影响的H1细胞系相比,GM03816成纤维细胞和GM03816-iPS4细胞系中的mRNA。误差线=重复测量的SEM。
(D)多能性标记的GM03816-iPS4和H1-hES染色(对比增强)。相位对比度(灰色);核染色(蓝色);多能性标记染色(绿色和红色)如彩色文本标签所示。Tra1–60和Tra1–81,表面标记;SSEA-3和-4,阶段特异性胚胎抗原;Oct4,转录因子。比例尺=0.25 mm。
(E)FRDA iPSCs与未受影响的iPSC/ESC、人体组织和细胞系的微阵列分析。红色表示上调,绿色表示下调。未受影响的iPS/ESC,红色突出显示;FRDA iPSC,黄色;未受影响的人体组织,蓝色;人类细胞系,灰色。另请参见图S1和表S1-S3.
FRDA iPSCs的多功能标记物免疫染色(SSEA3和SSEA4;Oct4;Tra1-60和Tra1-81)也被发现与H1 ESCs相似(). 基因分型FXN公司基因GAA•TTC重复序列和细胞遗传学分析表明,iPSCs确实来源于FRDA成纤维细胞,并且核型正常(和S1B级)ChIP实验证实异染色质组蛋白标记靠近FXN公司GAA•TTC重复(Al-Mahdawi等人,2008年;Herman等人,2006年;Rai等人,2008年) (图S1C至E). 最后,畸胎瘤分析显示体内分化能力(图S1F),为FRDA iPSC的多能性提供了额外的证据。
GAA•TTC重复长度分析(一个)PCR分析FXN公司细胞系、患者淋巴细胞和FRDA iPSC中的GAA•TTC重复长度。DNA长度标记以bp表示。通道如下(从左到右):左侧面板:未受影响的GM15851和GM15850 FRDA淋巴母细胞;FRDA患者D淋巴细胞;GM03816 FRDA成纤维细胞;GM03816衍生iPS线1–4;无DNA控制(阴性)。中面板:GM04078 FRDA成纤维细胞;GM04078衍生iPSC(GM0478-iPS1)。右侧面板:GM03813 SMA成纤维细胞和两个相应的iPSC系(GM03813-iPS1和-iPS-2)。
(B)PCR产物FXN公司FRDA患者携带者父母的GAA•TTC重复区。左面板(从左到右):母细胞成纤维细胞和三个相应的iPSC株。右侧面板(从左到右):父代成纤维细胞和一个相应的iPSC系。
(C类)GAA•TTC在FRDA(GM03816-和GM04078-衍生)和SMA(GM031813-衍生)成纤维细胞和两个iPSC系中的两个不相关遗传位点重复。还显示了GM15851 FRDA淋巴母细胞的PCR产物。
(D类)FXN公司GAA•TTC重复长度PCR测量。从左至右:FRDA成纤维细胞(GM03816)、早期传代的FRDA iPSC(iPS6早期)和第15代的三个FRDA iPSC单集落样本(iPS6晚期a–c)。
FRDA iPSCs的全局mRNA表达谱
四个FRDA iPSC系(两个来自GM03816,两个来自于GM04078)与一组未受影响的iPSCs、hESCs和各种人类组织和细胞系的全球基因表达谱的层次聚类表明,我们的iPSC系与其他iPS/ESCs属于同一簇,尽管是在一个单独的、不同的子集中(). 我们将这种差异归因于我们的FRDA iPSCs和其他iPS/ESCs之间的5-7%的全球表达差异,而在其他iPS/ECS之间只观察到2-3%的内部差异,这种差异可能反映了FRDA遗传背景的疾病性质。此外,使用FRDA iPSCs中顶级差异表达基因的注释、可视化和集成发现数据库(DAVID)进行功能注释聚类,确定了与线粒体功能、DNA修复和DNA损伤反应相关的基因组(表S1). DNA修复也出现在我们的数据集中,是一个重要的GO类别(表S2)与最近对FRDA患者的研究一致(Haugen等人,2010年). 其他重要的GO类别与细胞周期、蛋白质修饰/泛素化、脂质代谢和碳水化合物生物合成有关,所有这些以前都与FRDA患者的功能改变有关(科波拉等人,2006年;Haugen等人,2010年). 全球microRNA分析也表明FRDA iPSCs表达许多与多能性相关的miRNAs,但也发现了明显的差异,这可能也是由于FRDA发病机制所致(图S1G-H和表S3).
FRDA iPSC中的GAA•TTC重复扩增
PCR分析FXN公司GAA•TTC重复序列在iPSC细胞系中表现出重复不稳定性()供体成纤维细胞中未见这种现象(数据未显示)。未受影响的(GM15851)和FRDA(GM15850)淋巴母细胞以及无关患者DNA的PCR产物也显示出来进行比较。在所有情况下,观察到FRDA iPSCs的两个等位基因都有明显的扩增(以下给出了一些警告)。对第二名患者(GM04078)iPSCs的PCR分析同样显示重复扩增(,中间面板),确认了该观察的一般性质。相反,野生型FXN公司非FRDA iPSC对照中的等位基因大小不变(; 右侧面板,GM03813脊髓性肌萎缩iPSCs)和非疾病未影响的iPSCs(数据未显示)。由于PCR检测的等位基因模糊性,PCR带的移位可能代表两个等位基因的扩增或一个等位蛋白的收缩和另一个的扩增。因此,iPSCs是从第三个FRDA患者的携带者父母中产生的,并进行PCR分析,显示父母致病性等位基因重复扩增(). 野生型FXN公司如预期的那样,等位基因没有扩增,表明致病性中存在性别中立的不稳定性FXN公司等位基因。与体细胞一样,GAA•TTC重复序列在两个不相关的基因座上扩增(2q36,16个重复;4q31.1,30个重复(Rindler等人,2006年))在我们的iPSC和它们相应的三个供体成纤维细胞之间保持不变()尽管这些位点位于Alu元素,与FXN公司内含子1。总之,数据表明FXN公司基因是其特定重复扩展(也许还有其长度)的结果,并不是整个人类基因组中的普遍现象。此外,我们发现FRDA iPSC中GAA•TTC重复长度在培养过程中随时间变化().
重复不稳定性的分子基础
先前的报告表明,HD和DM1(强直性肌营养不良I型)转基因小鼠的CAG•CTG和CTG•CAG体细胞和代际重复不稳定性中分别存在MMR酶MSH2、MSH3和MSH6(综述于(Dion和Wilson,2009年)). 其他研究表明氧鸟嘌呤-DNA糖苷酶OGG1与躯体不稳定有关(Kovtun等人,2007年). 在FRDA iPSCs中,mRNA表达分析显示MSH2型与供体成纤维细胞相比(). 无差异MSH3型然而,mRNA被发现,并且OGG1公司在iPS/ESCs中发现了mRNA。Western blotting进一步显示,与FRDA成纤维细胞相比,FRDA iPSCs和H1 ESCs中MSH2蛋白相应增加(). ChIP分析显示,与未受影响的iPSC株系相比,FRDA iPSCs中GAA•TTC重复序列下游MSH2和MSH3的占有率增加,但与未受感染的iPSC系相比,其上游MSH2与MSH3占比没有增加FXN公司转录起始位点也不是GAA•TTC重复序列的直接上游(). 在所调查的任何地区,均未发现MSH6占用率的差异。
MSH2型FRDA iPSC的表达和定位(A) MSH2型,MSH3级、和OGG1公司GM03816成纤维细胞(白色)、两个GM03816iPSC系(iPS4,中灰色;iPS6,深灰色)和H1细胞(浅灰色)中的mRNA水平。级别标准化为GAPDH公司误差条=重复测量的SEM。
(B)MSH2蛋白的Western blot。从左到右:GM03816成纤维细胞、两个GM03816iPSC系(4和6)和H1-hESCs。GAPDH和L13a是装载控制装置。
(C)MSH2、MSH3和MSH6在FXN公司基因1254 bp上游的转录起始位点(−1254),上游(向上GAA)和下游(向下GAA)的GAA•TTC重复扩增(用ChIP测量)。IP恢复是相对于FXN公司内含子2(转录起始位点下游11482 bp)。误差线=独立实验的SEM(MSH2,n=4;MSH3和MSH6,n=2)。
为了进一步研究MSH2在重复不稳定性中的作用,将慢病毒shRNA构建物整合到单个克隆扩增的FRDA iPSCs中(以限制重复长度异质性),并检测GAA•TTC重复长度(总结为). 如所示,稳定表达MSH2型-与打乱的shRNA相比,靶向shRNA实现了相对较高水平的mRNA和蛋白质敲除。此外,我们验证了MSH2型沉默不影响多能性(图S2A). 经过八次传代后,重复长度PCR分析表明MSH2型与打乱的shRNA相比,击倒导致显著较小的大等位基因(). 然而,根据汇总数据,与图1所示的单点数据相反,较小的等位基因没有观察到统计学意义.shRNA沉默MSH2型在FRDA成纤维细胞中,重新编程也产生了类似的结果(图S2). 总之,这些数据表明MSH2参与GAA•TTC重复不稳定性。
shRNA沉默MSH2型在FRDA iPSC中(A)消声实验示意图。
(B) MSH2型靶向和干扰shRNA-表达FRDA iPSCs的mRNA水平。mRNA水平标准化为GAPDH公司误差条=重复测量的SEM。
(C)利用打乱的shRNA和靶向shRNA对FRDA iPSCs中MSH2蛋白进行Western blot。GAPDH,负载控制。
(D)MSH2蛋白的密度分析归一化为前一组的GAPDH。
(E)GAA•TTC重复序列长度的PCR预筛选(启动iPSC)和转导后8代,无shRNA(无shRNA)、干扰shRNA(干扰)和shRNAMSH2型(目标明确)。注:数据来自单点数据,不代表汇总数据(面板G)。
(F)面板E中乙二醇染色琼脂糖凝胶的信号强度痕迹。凝胶迁移越高,PCR条带越小。
(G)汇总GAA•TTC重复长度数据。请参见补充实验程序用于重复长度的定量。
另请参见图S2.
实验程序
细胞培养
成纤维细胞在37°C和5%CO下生长2MEM中含有10%FBS(Lonza)、2 mM谷氨酰胺、1%NEAA、20 mM HEPES和1%抗生素-抗真菌(均来自Invitrogen)。ES/iPSC在37°C和5%CO下生长2在D-MEM/F12中使用γ射线照射的MEF(GlobalStem)和20%敲除血清替代物、1 mM谷氨酰胺、1%NEAA、15 mM HEPES、0.1 mMβ-巯基乙醇(均来自Invitrogen)、20 ng/mL碱性FGF(Stemgent),每五至七天手动传代一次。在DMEM中用10%FBS(Lonza)、2 mM谷氨酰胺、20 mM HEPES和1%NEAA(均来自Invitrogen)培养Phoenix细胞。
原代成纤维细胞的分离
5–7天后,用纤维母细胞培养基在玻璃盖玻片下用纤维连接蛋白(fibronectin)对分离处理的皮肤活检进行皮肤外植体培养。建立后,按上述方法培养原代皮肤成纤维细胞。根据批准的人体试验方案,在洛杉矶加利福尼亚大学进行了活检。
iPSC的衍生
遵循之前的方法,但有轻微偏差(Park等人,2008b). 连续三天每天转导供体成纤维细胞,最后一次转导后4-6天,将细胞重新移植到MEF上。从第二天开始,每天给细胞注射ES培养基。在转导后21至28天之间采集菌落。
慢病毒shRNA转导
将FRDA iPSC与慢病毒进行两次慢病毒转导,并在37°C下使用5µg/mL聚brene过夜。然后对细胞进行扩增,并在DR4耐药MEF(GlobalStem)上进行6天的嘌呤霉素选择(0.4µg/mL)。
免疫细胞化学
将细胞固定在4%多聚甲醛中,并用0.1%Triton X-100(全部在PBS中)透化。一级抗体在4°C下培养过夜,二级抗体在室温下培养一小时,然后用DAPI进行核染色(参见补充实验程序用于抗体)。
核酸提纯
制造商称,使用RNeasy Plus Mini试剂盒(Qiagen)纯化总RNA。通过苯酚/氯仿萃取纯化基因组DNA,然后用异丙醇沉淀在总细胞裂解缓冲液中制备的细胞裂解物(100 mM Tris,5 mM EDTA,0.2%SDS,0.2 M NaCl,200µg/mL蛋白酶K,pH 8)。
PCR和定量RT-PCR
制造商表示,对于GAA•TTC重复长度PCR,使用了Phusion聚合酶(新英格兰生物实验室)。制造商称,定量RT-PCR分析使用qScript一步法SYBRGreen qRT-PCR试剂盒(Quanta Biosciences)进行。所有多功能标记的引物均如所述(Park等人,2008b).FXN公司,MSH2型,MSH3级,OGG1型、和GAPDH公司引物描述见补充实验程序使用ΔΔCT方法分析相对qRT数据(Livak和Schmittgen,2001年). 使用与上述试剂盒相同的试剂盒和先前描述的逆转录病毒转录特异性引物,通过绝对qRT-PCR检测逆转录病毒转基因(Takahashi等人,2007年). (请参见补充实验程序.)
西方分析
在聚丙烯酰胺凝胶中电泳全细胞提取物(50 mM Tris pH 7.4,150 mM NaCl,10%甘油,0.5%Triton X-100,蛋白酶抑制剂;罗氏),并转移到硝化纤维素膜上。一级抗体孵育过夜,二级抗体在室温下孵育一小时。使用HRP结合二级抗体和增强化学发光检测信号(SuperSignal West Pico,Thermo Scientific)。(请参见补充实验程序用于抗体。)
染色质免疫沉淀
首先用1.5 mM二硫代双琥珀酰亚胺丙酸盐(DSP)交联细胞,然后用1%甲醛交联。随后的ChIP程序如所述(Herman等人,2006年)MSH2抗体(Santa Cruz)。使用引物进行qPCR分析FXN公司启动子、GAA•TTC重复序列上游区域和重复序列下游区域如所述(Herman等人,2006年). 其他引物列于补充实验程序.
微阵列分析
根据制造商的要求,使用MirVana RNA提取试剂盒(Ambion)进行RNA纯化,使用TotalPrep试剂盒(Ambion)标记,并与Illumina HT12阵列杂交。然后对数据进行过滤、规范化和分层聚类(Eisen等人,1998年). 与一组未受影响的iPSC相比,差异表达的基因使用错误发现率校正的Student t检验进行检测,显著性水平为α财务总监< 0.01. 然后使用注释、可视化和集成发现数据库(DAVID(Dennis等人,2003年;Huang等人,2009年))显著性水平为α财务总监< 0.01.
致谢
我们感谢S.Perlman(加州大学洛杉矶分校)提供的皮肤活检,感谢I.Singec、J.Clark和C.Desponts提供的宝贵建议和指导。此外,我们感谢V.Lukiyanchuk的病毒专业知识、K.Clinerman的兽医协助以及C.Lynch的微阵列分析。这项工作得到了美国国家神经疾病和中风研究所(NIH)、弗里德雷希共济失调研究联盟(FARA)、英国共济失调协会(GoFAR)、爱尔兰弗里德雷奇共济失调学会(Friedreich’s Ataxia Society Ireland)和复制品公司(马萨诸塞州沃尔瑟姆)对J.M.G.的支持,也得到了来自脊髓肌萎缩家族(到s.K.)的研究金的支持。L.C.L.得到了美国国立卫生研究院WRHR K12职业发展奖和哈特维尔基金会的支持,G.A.和J.F.L.得到了CIRM(CL1-00502、RT1-01108、TR1-01250)、美国国立卫生研究院(R21MH087925)、Millipore基金会和Esther O'Keefe基金会的支持。M.N.得到了国家共济失调基金会和FARA“凯尔·布莱恩特翻译研究奖”的支持
参考文献
- Al-Mahdawi S、Pinto RM、Ismail O、Varshney D、Lymperi S、Sandi C、Trabzuni D、Pook M。Friedreich共济失调GAA重复扩增突变在人类和转基因小鼠脑组织和心脏组织中诱导了可比的表观遗传变化。人类分子遗传学。2008;17:735–746.[公共医学][谷歌学者]
- Al-Mahdawi S、Pinto RM、Ruddle P、Carroll C、Webster Z、Pook M.Friedreich共济失调YAC转基因小鼠中GAA重复不稳定性。基因组学。2004;84:301–310.[公共医学][谷歌学者]
- Bidichandani SI,Ashizawa T,Patel PI。Friedreich共济失调中GAA三重重复序列的扩增干扰转录,可能与异常的DNA结构有关。美国人类遗传学杂志。1998;62:111–121. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Campuzano V、Montermini L、Molto MD、Pianese L、Cossee M、Cavalcanti F、Monros E、Rodius F、Duclos F、Monticelli A等。Friedreich共济失调:由内含子GAA三联体重复扩增引起的常染色体隐性疾病。科学。1996;271:1423–1427.[公共医学][谷歌学者]
- Coppola G、Choi SH、Santos MM、Miranda CJ、Tentler D、Wexler EM、Pandolfo M、Geschwind DH。frataxin缺陷小鼠的基因表达谱分析:微阵列证据表明,在未检测到神经退行性变的情况下,表达发生了显著变化。神经生物学疾病。2006;22:302–311. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- de Biase I,Chutake YK,Rindler PM,Bidichandani SI。Friedreich共济失调的表观遗传沉默与CTCF(CCCTC-binding factor)和反义转录的耗竭相关。公共科学图书馆一号。2009;4:e7914–e7914。 [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Dennis G、Sherman BT、Hosack Da、Yang J、Gao W、Lane HC、Lempicki Ra。DAVID:用于注释、可视化和集成发现的数据库。基因组生物学。2003;4:第3页至第3页。[公共医学][谷歌学者]
- 迪翁五世,威尔逊·JH。扩增三核苷酸重复序列的不稳定性和染色质结构。2009:297. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Ditch S、Sammarco MC、Banerjee A、Grabczyk E.Progressive GAA。人类细胞系中TTC重复扩增。公共科学图书馆遗传学。2009;5:e1000704-e1000704。 [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Dragileva E、Hendricks A、Teed A、Gillis T、Lopez ET、Friedberg EC、Kucherlapati RS、Edelmann W、Lunetta KL、MacDonald ME等。亨廷顿病敲除小鼠的代际和纹状体CAG重复不稳定性涉及不同的DNA修复基因。神经生物学疾病。2009;33:37–47. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Eisen MB、Spellman PT、Brown PO、Botstein D.全基因组表达模式的聚类分析和显示。美国国家科学院院刊。1998;95:14863–14868. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Gottesfeld JM。影响Friedreich共济失调转录的小分子。药物治疗学。2007;116:236–248. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Haugen AC、Di Prospero Na、Parker JS、Fannin RD、Chou J、Meyer JN、Halweg C、Collins JB、Durr A、Fischbeck K等。Friedreich共济失调患者外周血细胞基因表达和DNA损伤的改变:病理学细胞模型。PLoS遗传学。2010;6:e1000812。 [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Herman D、Jenssen K、Burnett R、Soragni E、Perlman SL、Gottesfeld JM。组蛋白脱乙酰酶抑制剂逆转Friedreich共济失调的基因沉默。自然化学生物。2006;2:551–558。[公共医学][谷歌学者]
- Huang DW、Sherman BT、Lempicki Ra。利用DAVID生物信息学资源对大基因列表进行系统和综合分析。自然协议。2009;4:44–57.[公共医学][谷歌学者]
- Iyer RR,Wells RD。大肠杆菌中三重重复序列的扩增和删除发生在DNA复制的主导链上。生物化学杂志。1999;274:3865–3865.[公共医学][谷歌学者]
- Kim HM、Narayanan V、Mieczkowski PA、Petes TD、Krasilnikova MM、Mirkin SM、Lobachev KS。酵母中GAA区的染色体脆性取决于重复取向,需要错配修复。Embo J。2008;27:2896–2906. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Kovtun IV,Liu Y,Bjoras M,Klungland A,Wilson SH,McMurray CT。OGG1在体细胞中启动年龄依赖性CAG三核苷酸扩增。自然。2007;447:447–452. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Kramer PR,Pearson CE,Sinden RR。人类突变子错配修复细胞系中强直性肌营养不良和脆性X基因座三重重复序列的稳定性。人类遗传学。1996;98:151–157.[公共医学][谷歌学者]
- Livak KJ,Schmittgen TD.使用实时定量PCR和2(-Delta Delta C(T))方法分析相关基因表达数据。方法。2001;25:402–408.[公共医学][谷歌学者]
- Lowry WE、Richter L、Yachechko R、Pyle AD、Tchieu J、Sridharan R、Clark AT、Plath K。从皮肤成纤维细胞生成人诱导的多能干细胞。美国国家科学院院刊。2008;105:2883–2888。 [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Miranda CJ、Santos MM、Ohshima K、Smith J、Li L、Bunting M、Cossee M、Koenig M、Sequeiros J、Kaplan J等。Frataxin敲除小鼠。FEBS信函。2002;512:291–297。[公共医学][谷歌学者]
- Mirkin SM。可扩展DNA重复序列与人类疾病。自然。2007;447:932–940.[公共医学][谷歌学者]
- Orr HT,Zoghbi HY。三核苷酸重复障碍。神经科学年鉴。2007;30:575–621.[公共医学][谷歌学者]
- Park I-H、Arora N、Huo H、Maherali N、Ahfeldt T、Shimamura A、Lensch MW、Cowan C、Hochedlinger K、Daley GQ。疾病特异性诱导的多能干细胞。细胞。2008年a;134:877–886. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Park I-H、Zhao R、West JA、Yabuuchi A、Huo H、Ince TA、Lerou PH、Lensch MW、Daley GQ。用特定因子将人体体细胞重新编程为多能性。自然。2008年b;451:141–146.[公共医学][谷歌学者]
- Pianese L、Cavalcanti F、De Michele G、Filla A、Campanella G、Calabrese O、Castaldo I、Monticelli A、Cocozza S。父母性别对FRDA基因GAA动态突变的影响。美国人类遗传学杂志。1997;60:460–463. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Rai M、Soragni E、Jenssen K、Burnett R、Herman D、Coppola G、Geschwind DH、Gottesfeld JM、Pandolfo M。HDAC抑制剂纠正Friedreich共济失调小鼠模型中的frataxin缺乏。请给我一个。2008;三:e1958。 [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Rindler PM、Clark RM、Pollard LM、De Biase I、Bidichandani SI。哺乳动物细胞中的复制再现了基因组GAA三重重复序列体细胞不稳定性的地方特异性差异。核酸研究。2006;34:6352–6361. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Savouret C、Brisson E、Essers J、Kanaar R、Pastink A、te Riele H、Junien C、Gourdon G.DNA修复缺陷小鼠的CTG重复不稳定性和大小变化时间。EMBO杂志。2003;22:2264–2273. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Shishkin Aa、Voineagu I、Matera R、Cherng N、Chernet BT、Krasilnikova MM、Narayanan V、Lobachev KS、Mirkin SM。Friedreich共济失调GAA在酵母中重复的大规模扩增。分子细胞。2009;35:82–92. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Takahashi K、Tanabe K、Ohnuki M、Narita M、Ichisaka T、Tomoda K、Yamanaka S。通过确定的因子从成人成纤维细胞诱导多能干细胞。细胞。2007;131:861–872.[公共医学][谷歌学者]
- Urbach A,Bar-Nur O,Daley GQ,Benvenisty N.人类胚胎干细胞和诱导多能干细胞对脆性X综合征的差异建模。细胞干细胞。2010;6:407–411. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Wells RD.DNA三联体和弗里德里希共济失调。法赛布·J。2008;22:1625–1634.[公共医学][谷歌学者]
- Zhao J,Jain A,Iyer RR,Modrich PL,Vasquez KM。错配修复和核苷酸切除修复蛋白在DNA序列间交联的识别中起协同作用。核酸研究。2009;37:4420–4429. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]