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眼科学。作者手稿;PMC 2011年8月1日发布。
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美国国立卫生研究院:美国国家卫生研究院164813
PMID:20381870

老年性黄斑变性的地理萎缩和基因型研究进展

迈克尔·克莱恩,医学博士,1 弗雷德里克·费利斯,III,医学博士,2 彼得·弗朗西斯、医学博士、博士,1 安妮·林布拉德,博士, 艾米丽·周瑜(Emily Y.Chew),医学博士,2 萨拉·哈蒙,博士,4泽格·欧特,博士4,5

摘要

目的

确定基因型是否与年龄相关性黄斑变性(AMD)患者的地理萎缩(GA)增长率相关。

设计

随机对照临床试验参与者的前瞻性分析。

参与者

年龄相关眼病研究(AREDS)114名参与者中的114只眼。

方法

对患有GA的AREDS患者的眼底照片进行评估,这些患者的DNA样本来自于AREDS参与者,在至少2年的时间内拍摄了一系列照片,根据GA累积面积的变化来确定进展情况。所有眼底照片均进行扫描、数字化,并对GA面积进行纵向中央分级。评估了GA进展与先前确定的AMD相关遗传变异的关系。

主要成果衡量指标

基因型频率和GA累积面积的变化。

结果

114只眼睛的地理萎缩平均增长率为1.79毫米2/年(范围=0.17–4.76 mm2/年)。生长速率和基因型之间没有关联CFH公司,指挥与控制,C3类,APOE公司、和TLR3级基因。对于单核苷酸多态性(SNP)rs10490924LOC387715/ARMS2,与纯合子非风险基因型相比,经初始病变大小调整和未调整的GA生长率与纯合型风险基因型(未经调整的p值=0.002;Bonferroni校正的p值=0.014)和等位基因关联(Bonferrini校正的p值=0.011)显著相关。对地理萎缩进展的其他测量指标(从中央凹外遗传性关节炎进展到中央遗传性关节病,以及在最初患有单侧遗传性关节癌的患者中发展为双侧遗传性关节瘤)的分析表明,进展与LOC387715/ARMS2/HTRA1基因型。

结论

根据数字化系列眼底照片计算出的GA生长率与眼底病变的变异无关CFH公司,指挥与控制,C3类,APOE公司、和TLR3级基因。LOC387715/ARMS2/HTRA1基因型,尽管这一发现没有得到GA进展次级指标分析的支持。需要在其他种群中复制以建立关联。

在西方世界,与年龄相关的黄斑变性(AMD)是视力损害的主要原因,在一些国家,这种疾病占法定失明病例的一半。1AMD导致的视力下降通常由一种或两种晚期疾病引起:(1)“湿性”或新生血管性AMD,或(2)晚期“干性”AMD,即地理萎缩(GA)。大多数新生血管性AMD患者使用抗血管生成药物治疗是有益的。4,5然而,目前还没有有效的治疗GA的方法,据以人群为基础的研究报告,大约45%的晚期AMD病例发生了GA。6一些研究评估了与AMD发病率、发病率和进展相关的眼部、全身和环境风险因素。616在这些研究中,年龄、吸烟、体重指数(BMI)、家族史、视网膜特征(包括水肿和色素改变)与晚期AMD的新生血管和地理萎缩形式之间的相关性最强。最近,基因变异也被证明是两种晚期AMD的强烈危险因素1731以及中晚期AMD的进展。32

然而,关于遗传风险因素与已经确定的晚期AMD,特别是GA的进展之间的关系,目前几乎没有信息。本研究的主要目的是确定基因型是否与已确定的GA的进展有关,这是由GA区域的生长速率决定的。

方法

所有与年龄相关的眼病研究(AREDS)参与者(包括遗传学辅助研究参与者)均获得了书面同意。每个参与的诊所都获得了机构审查委员会的批准。

定义

在本研究中,GA被定义为发生在黄斑区(定义为以中央凹为中心的直径3000微米的圆圈)的1个或多个视网膜色素上皮色素脱失的锐边界区域,通常为圆形,根据立体彩色眼底摄影的定义,脉络膜下血管的可视化通常可见。中央GA是指涉及中央凹的GA,由立体眼底照片上的视网膜血管结构和色素改变决定。

患者群体

本研究的所有受试者都是AREDS的参与者,这是一项前瞻性多中心临床试验,旨在评估抗氧化剂和锌对AMD进展的影响。33,34在基线研究访视时,每个人的年龄在55岁至80岁之间,并签署了知情同意书,以参与该研究,该同意书已得到参与中心机构审查委员会的批准。2年后,所有参与者都在AREDS入口处拍摄了双眼立体眼底照片,此后每年间隔长达14年。

本研究的参与者代表了为研究GA的生长特征而选择的参与者的子集。35在该研究中,AREDS阅读中心选择符合以下两个标准之一的患有地理萎缩的AREDS参与者的照片进行数字化和分级:(a)1只或两只眼睛进入AREDS时,中心凹中心1500微米范围内的GA=>0.5 DA,以及(b)进入AREDS时没有GA,但在随访期间,在双眼中央凹中心1500微米范围内,GA=>0.5 DA。在满足任一标准后,排除在GA诊断时出现新生血管性AMD的眼睛,共有181名参与者的251只眼睛可用于研究。所有随后的研究访问照片都进行了数字化、分级和评估。

在这181名参与者中,114人包括符合以下标准并被纳入本研究的个人子集:(1)DNA样本的可用性;(2) 最小初始累积损伤尺寸=>2 mm2(0.75个椎间盘区域),之所以选择,是因为这种大小和更大的病变随时间呈线性增长率;(3)最少随访2年,以便有足够的观察期。每个人选择一只眼睛进行评估。如果只有1只眼睛出现GA,则确定为研究眼睛。如果两只眼睛都出现GA,则随机选择1只眼睛作为研究眼睛。

此外,选择无AMD(N=448)的AREDS参与者作为对照组,对本研究中评估的遗传变异进行关联分析。该对照组被定义为双眼无丘疹或小于5个小丘疹(最小直径<63微米)。

照片的数字化和分级

该过程在其他地方有详细描述。35简而言之,威斯康星大学眼底阅读中心(威斯康星麦迪逊)对照片进行了数字化和评估。所有AREDS中心的所有研究照片均使用相同的相机系统拍摄(蔡司30度FF2、FF3或FF4)。使用尼康Coolscan 4000胶片扫描仪以500像素/英寸的分辨率对图像进行扫描,并将其导入图像查看器和纹理软件包(Topcon IMAGEnet),使用计算机平面测量法确定和量化GA面积。GA的增长表示为累积GA面积的增加(mm2每年)。这些图像由4名评分员进行评估,10%的子集由至少2名评分员重新评分。此外,Doheny图像阅读中心(加利福尼亚州洛杉矶)对来自19只眼睛的87张照片进行了独立评分,两个阅读中心得出的结果相似。35

基因分型

基因分型是在deCODE Genetics(冰岛雷克雅未克)使用Taqman基因分型平台(加利福尼亚州福斯特市应用生物系统公司)和PreventionGenetics公司(威斯康星州马什菲尔德)进行的。该分析包括6个基因中的7个单核苷酸多态性(SNPs),此前报道与补体因子H中的AMD:rs1061170相关(CFH公司),rs10490924英寸LOC387715/ARMS2/HTRA1,补码成分2中的rs9332739(指挥与控制),补码成分3中的rs2230199(C3类),载脂蛋白E中的rs7412和rs429358(APOE),toll样受体3中的rs3775291(TLR3级). 由于存在高度连锁不平衡的证据,我们认为LOC387715号SNP(rs10490924)作为rs11200638 SNP的替代品HTRA1型以及LOC 387715号indel变量。22,25,36

统计分析

年增长率(mm2)在随访期间对所有研究眼睛进行了计算。该生长速率被视为一个连续变量,并进行分析以确定所研究的6个基因的GA生长与基因型的关系。

如前所述,这些参与者不需要对以下变量进行调整,每个变量都不重要:年龄、性别、BMI、治疗分配和吸烟。35为了确定教育状况和家族史是否影响本研究人群的GA增长率,我们进行了线性回归。这两个变量都不是增长的重要预测因素。因此,只有基线GA面积是后续生长的显著预测因子,在评估基因型对GA生长的影响之前,我们通过拟合回归模型调整了初始GA面积。将回归模型的残差加回总平均值,以产生每个个体的调整表型值。通过单因素方差分析评估基因型间GA生长速率平均值的差异。7个遗传变异中每一个的未经调整的平均值是在表1和等位基因频率表2调整和未调整GA增长的结果相似,并给出了调整分析的显著性水平。

表1

年龄相关性黄斑变性相关基因中单核苷酸多态性的基因型频率关系(CFH、LOC387715、C2、C3、APOE、,TLR3级)以及地理萎缩的进展(平均增长率,mm,2每年)

基因型N=114例114眼平均值标准误差p值Bonferroni调整的p值
CFH公司TT公司161.740.256
1061170卢比计算机断层扫描471.840.1460.701
科科斯群岛411.990.1510.381
LOC387715号GG公司331.510.159
10490924卢比燃气轮机491.840.1400.131
TT公司242.340.2020.0020.014
指挥与控制GG公司1111.910.095
rs9332739CG公司21.380.9000.461
C3类科科斯群岛481.870.128
2230199卢比CG公司541.830.1490.871
GG公司122.260.2830.221
APOE公司科科斯群岛871.850.101
7412卢比计算机断层扫描262.090.2280.271
APOE公司科科斯群岛941.950.106
429358卢比计算机断层扫描191.660.1830.241
TLR3级GG公司541.850.144
3775291卢比AG公司461.920.1410.721
AA公司92.140.3060.431
没有必要对以下变量进行调整:年龄、体重指数(BMI)、教育程度、治疗、性别、吸烟和家族史,这些变量均无显著性差异。

表2

年龄相关性黄斑变性相关基因单核苷酸多态性等位基因频率的关系(CFH、LOC387715、C2、C3、APOE、,TLR3级)和地理萎缩的进展(平均增长率,mm2,每年)

阿勒N=114例114眼平均值标准误差p值Bonferroni调整的p值
CFH公司T型791.780.103
1061170卢比C类1291.960.0830.171
LOC387715号G公司1151.650.088
10490924卢比T型972.090.1020.0010.011
指挥与控制G公司2241.910.063
rs9332739C类21.580.9890.621
C3类G公司1501.840.074
2230199卢比C类781.990.1160.271
APOE公司C类2001.880.065
7412卢比T型262.100.2180.261
APOE公司C类2071.920.066
429358卢比T型191.660.1870.241
TLR3级G公司1541.890.079
3775291卢比641.960.1110.641
没有必要对以下变量进行调整:年龄、体重指数(BMI)、教育程度、治疗、性别、吸烟和家族史,这些变量均无显著性差异。

功率计算采用以下假设:114个个体的样本量,每个SNP三个基因型,组间方差0.20 mm2/年,组内方差为0.95毫米2/年。

对地理萎缩队列(N=114)和对照组(N=448)中所选遗传变异的频率进行关联分析。在我们的研究中,对6个基因的7个变体中的每一个进行了基因型和等位基因频率、比值比和显著性水平的计算。

从非中央政府到中央政府,从单边政府到双边政府

使用Cox比例风险模型,并根据年龄、BMI、吸烟状态、性别和初始病变大小,从整个AREDS人群中选取参与者,对GA进展率的这些间接测量值及其与基因型的关系进行分析。为了分析从非中心性到中心性GA的进展情况,纳入了基线时患有非中心性GA或在随后的研究访问中发展为非中心性GA的AREDS参与者的眼睛,并评估其以后进展为中心性GA。对于双侧病例,只纳入了1只眼睛(最初受影响的眼睛)。同样,为了分析从单侧GA到双侧GA的进展情况,所有基线时患有任何单侧GA的AREDS参与者或在随后的研究访问中患有1只眼GA的ARED参与者都被纳入并评估了另一只眼的GA发展情况。

结果

共有114名患者符合研究标准,并进行了分析。登记时的平均年龄为69.4岁(范围=56–80岁)。共有45名男性和69名女性。20例患者中,有一只眼有GA,另一只眼出现红肿,10例患者中有一只眼睛有GA,而另一只眼睛出现脉络膜新生血管(CNV),75例患者中的两只眼睛都有GA,两只眼睛都没有CNV。。

在比较GA队列(N=114)和“无AMD”对照组(N=448)时,基因型和GA的存在与CFH公司(rs1061170),LOC387715号(rs1040924),C3类(rs2230199),以及指挥与控制(rs9332739)。APOE公司(rs7412和rs429358)和TLR3级(rs3775291)基因型。有关更多信息,请访问表3(网址:http://aaojournal.org).

表3

年龄相关性黄斑变性相关基因(CFH、LOC387715、C2、C3、APOE和TLR3)中单核苷酸多态性的比值、置信区间和P值在患有地理萎缩(N=114)的年龄相关性眼病研究参与者和无年龄相关性黄疸变性的年龄相关性眼病研究对照组中(N=448)

基因SNP类型N个b条基因型OR(CI)c(c)基因型P值等位基因OR(CI)d日等位基因P值
CFH公司
1061170卢比
通用航空公司1077.36 (3.87 –13.97)<0.00012.77 (2.042–3.77)<0.0001
无AMD437
位置387715
10490924卢比
通用航空公司1066.01 (3.48–10.38)<0.00013.67 (2.67–5.05)<0.0001
无AMD436
指挥与控制
2230199卢比
通用航空公司113--0.23 (0.07–0.75)0.0134
无AMD447
C3类
rs9332739
通用航空公司1146.22 (2.79–13.85)<0.00012.5 (1.81–3.45)<0.0001
无AMD448
APOE公司
7412卢比
通用航空公司112--1.37 (0.84–2.22)0.256
无AMD447
APOE公司
429358卢比
通用航空公司113--0.61 (0.37–0.99)0.062
无AMD443
TLR3级
3775291卢比
通用航空公司1141.55 (0.77–1.67)0.1491.22 (0.896–1.67)0.233
无AMD448
双眼小于5个小酒肿(直径<63微米)
b条基因型参与者数量
c(c)风险纯合子与非风险纯合儿。对于C2和APOE,用于计算基因型优势比的小等位基因纯合子频率不足。
d日等位基因比值比(置信区间)

114名GA患者的114只眼进行了生长测定。他们的中位随访时间为6年。平均随访时间为6.4年,标准差为2.7年,范围为2至11年。地理性萎缩的平均增长率为1.79毫米2/年(区间=0.17~4.76),增长率呈正态分布。三组患者的基线病变大小均无显著差异位置387715/臂2/HTRA1SNP基因型。

我们的功率计算表明,在对多重测试进行调整后,在p=0.05的显著性水平上,检测到基因型与生长率的临床相关关联的可能性为80%。除了LOC387715/ARMS2/HTRA1。对于该基因,GA生长率与纯合风险基因型(2.34mm)显著相关2/年)与纯合非风险基因型(1.51mm2/年)。未调整的p值=0.002。经Bonferroni校正后,基因型p值为0.014。对于等位基因关联,该基因的Bonferroni校正p值为0.011

在至少一次研究检查中,243名非中央型GA患者的243只眼中,非中央型GA患者的视力与视力之间没有显著相关性LOC387715/ARMS2/HTRA1基因型和在随后的检查中进展为中央GA(RR=1.13[0.68–1.88]p=0.63)。在178名接受过至少一次研究检查的单侧GA患者中LOC387715/ARMS2/HTRA1在随后的检查中进展为双侧GA(RR=0.61[0.32–1.15]p=0.13)。

讨论

先前的研究表明,AMD患者眼中GA的平均生长速率在1.3至2.8 mm之间2每年个体间差异较大12,35,3740这些研究均未发现系统性或环境风险因素,包括年龄、性别、BMI、吸烟和系统性高血压,这些因素可能是导致这些诱导内差异的原因。然而,据报道,眼部特征可能有助于预测未来GA生长的特征。有利于增加GA生长率的因素包括较大的初始病变大小35(病变小于2.0 mm2与单焦点GA相比,多焦点GA的生长速度较慢。40此外,由于双侧病例双眼GA增长率的高度一致性,12,35,40了解1只眼睛的GA生长特征可以为其他眼睛的生长提供信息。最后,据报道,眼底自身荧光模式与GA患者的疾病进展有关。12

关于遗传风险因素,关于基因型和眼部GA区域生长与公认GA的潜在关联的信息很少。最近的一份报告描述了一项对99名双侧GA患者的研究,平均随访时间为3.0年。研究人员发现变异与CFH公司(Y402H),ARMS2系统(A69S),和C3类(R102G)与GA的存在有关,但与GA的进展无关。41

在规划这项研究时,我们假设,由于某些AMD易感基因先前已被证明可以预测从中度AMD到晚期AMD的进展,32这些或其他基因可能与已经确定的晚期AMD(特别是GA)的进展有关,这是合理的。因此,我们的目标是确定已知的AMD相关遗传变异是否也与GA生长率有关。

并非所有选择的易感性变体都与我们队列中GA的存在显著相关。我们发现GA的存在与CFH、C2、C3和LOC387715/ARMS2/HTRA1基因型有显著相关性,而与APOE和TLR3没有相关性。由于之前报告的结果相互矛盾,与TLR3变异体缺乏关联并伴有GA并不完全出乎意料。30,31,42

关于GA的生长,我们发现GA的进展与CFH公司,指挥与控制,C3类,APOE公司、和TLR3级基因。只有rs10490924(A69S)变体LOC387715/ARMS2/HTRA1基因座显示与GA进展相关的证据(表1和2)。2). 自从眼睛LOC387715/ARMS2/HTRA1非风险基因型(GG)显示GA平均增长1.51mm2/年,而那些具有纯合风险基因型(TT)的患者的GA平均增长率为2.34mm2/年,纯合风险基因型个体的GA生长率比非风险基因型高54%。

这个LOC387715/ARMS2/HTRA110q26位点与晚期AMD的风险以及进展为两种类型的晚期AMD密切相关。20,21,23,32,4345目前,该位点特定基因的身份仍不确定。最近,有证据表明有2个基因处于高连锁不平衡状态,即LOC387715/ARMS2HTRA1型作为最有可能的候选人。2527,36,45

在这两个基因的情况下,存在与AMD以及GA进展相关的生物学合理性。LOC387715/ARMS2人类视网膜中检测到mRNA,并编码一种蛋白质,当在哺乳动物细胞中表达时,该蛋白质似乎定位于线粒体外膜。25与rs10490924(A69S)变异体相关的线粒体功能改变可能通过多种机制,包括能量代谢改变和凋亡途径激活,增加AMD和GA进展的易感性。HTRA1型编码视网膜中表达的丝氨酸蛋白酶,可能是细胞外基质降解的关键调节剂。启动子区与rs11200638变异体相关的该蛋白表达的改变可能影响AMD患者Bruch膜和视网膜色素上皮的重塑,43和GA的进展。

虽然我们的研究发现LOC387715/ARMS2/HTRA1通过对GA累积面积的系列测量确定的基因型和GA进展,我们无法从评估GA进展的两个间接指标的额外分析中找到支持:从非中央到中央的GA进展和从单侧到双侧的GA进展。对于这些分析,我们没有发现与LOC387715/ARMS2/HTRA1基因型。这可能是因为与直接评估连续变量(GA区域)的变化相比,GA进展的这些间接测量的敏感性较低,无法证明其效果。

我们的发现表明,GA进展与参与补体调节的基因变异之间缺乏关联,这可能被视为证据,证明以补体系统为靶点的药物在治疗已确立的GA方面的潜在疗效,对于已知基因变体与AMD之间的因果关系知之甚少,而且在基因组水平上缺乏关联并不排除以补体系统为靶点的治疗方法通过其对生化细胞过程的影响而具有潜在疗效。

总之,我们发现GA的进展与CFH公司,指挥与控制,C3类,APOE公司、和TLR3级基因。我们发现,在名义上有统计学意义的证据表明,rs10490924(A69S)变异与LOC387715/ARMS2GA进展次要指标分析不支持的基因。需要复制此发现以建立关联。

鸣谢

本研究得到了马里兰州贝塞斯达国立卫生研究院国家眼科研究所R01-EY12203(MLK)的合同和资助,中国科学基金资助30730057(JO),俄勒冈州健康与科学大学凯西眼科研究院纽约预防失明研究(PJF,MLK)资助,马里兰州Owings Mills(PJF)与凯西眼科研究所黄斑变性基金会(MLK与PJF。作者对本文所讨论的任何材料或产品均无专有权益。

脚注

没有作者有任何财务/冲突利益需要披露。

出版商免责声明:这是一份未经编辑的手稿的PDF文件,已被接受出版。作为对客户的服务,我们正在提供这份早期版本的手稿。手稿在以最终可引用的形式出版之前,将经过编辑、排版和校对结果证明。请注意,在制作过程中可能会发现可能影响内容的错误,适用于该期刊的所有法律免责声明均适用。

工具书类

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