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《公共科学图书馆·生物》。2010年6月;8(6):e1000412。
2010年6月29日在线发布。 数字对象标识:10.1371/journal.pbio.1000412
预防性维修识别码:项目经理2893951
PMID:20613859

改进生物科学研究报告:ARRIVE动物研究报告指南

在过去十年中,生物科学期刊的数量大幅增加,许多期刊填补了反映新学科和新技术的专门领域。开放获取期刊的出现彻底改变了出版过程,最大限度地提高了研究数据的可用性。然而,大量证据表明,在许多领域,生物医学研究的报告往往不足,导致人们认为,即使科学是可靠的,在许多情况下,出版物本身也“不符合目的”也就是说,相关信息的不完整报告有效地使许多出版物作为政策或临床和科学实践的信息工具价值有限[1][21].最近对临床研究的一项审查表明,在研究过程的所有阶段,都存在相当大的财政资源累积浪费,包括由于报告不力而无法使用的出版物造成的浪费[22]这个问题不太可能局限于临床研究[2][14],[16][20].

因此,未能描述研究方法并适当报告结果,对整个研究过程和参与研究者的声誉都有潜在的科学、道德和经济影响。动物研究是最具争议的科学领域之一,尤其如此。据我们所知,迄今为止对已发表的动物研究进行的最大和最全面的审查,突出了报告使用动物进行研究的方式中的严重遗漏[5]这项由英国政府资助的科学组织国家研究动物替代、改良和减少中心(NC3Rs)委托进行的调查发现,在所评估的271篇随机选择的文章中,只有59%陈述了研究的假设或目标,以及所用动物的数量和特征(即物种/品系、性别和年龄/体重)。大多数被调查的论文没有报告使用随机(87%)或盲法(86%)来减少动物选择和结果评估中的偏见。只有70%的使用统计方法的出版物对其进行了全面描述,并对结果进行了精确性或可变性度量[5]这些发现令人担忧,并与近年来发表的许多研究领域的评论一致,包括临床研究[2][22].

良好的报告对于同行评审和为未来研究提供信息至关重要

长期以来,科学同行的审查一直是出版过程“质量控制”的支柱。就方法的详细程度和关键结果的呈现而言,实验的报告方式对同行评审过程至关重要,事实上,用于指导未来研究的知识库的后续效用和有效性也至关重要。因此,研究界有责任确保他们的研究文章包含所有相关信息,以便进行深入的评论,并避免重复研究和进行多余的实验。理想情况下,科学出版物应提供足够的信息,使知识渊博的读者能够理解所做的事情、原因和方式,并评估研究的生物学相关性以及研究结果的可靠性和有效性。还应该有足够的信息来重复实验[23]因此,问题是如何确保研究出版物中包含所有相关信息。

使用报告指南可显著提高报告质量

对已发表研究的评论所提供的证据表明,许多研究人员和同行评审员将受益于关于研究文章中应提供哪些信息的指导。随机对照临床试验的CONSORT声明是针对这一需求制定的首批指南之一[24],[25]自出版以来,越来越多的主流期刊支持CONSORT,作为其作者指南的一部分[26],[27]因此,有令人信服的证据表明,CONSORT提高了临床试验报告的质量和透明度[28],[29].

在CONSORT之后,已经制定了许多其他指南,目前有90多个可用于报告不同类型的健康研究,其中大多数是在过去十年中发表的(见http://www.equator-network.org和参考文献[30],[31]). 还制定了指南,以改进其他特定生物科学研究领域的报告,包括代谢组学和基因表达研究[32][37]一些组织支持改进报告的案例,并建议使用报告指南,包括国际医学期刊编辑委员会、科学编辑委员会、出版伦理委员会和纳菲尔德生物伦理学委员会[38][41].

改进动物实验报告——ARRIVE指南

目前,大多数生物科学期刊在描述动物研究时,几乎没有或根本没有提供报告信息的指导[42][50]我们的审查发现,在271篇被评估的期刊文章中,有4%的文章没有在方法或结果部分报告使用的动物数量[5]报告动物数量对于评估实验结果的生物学和统计意义或重新分析数据至关重要,如果要重复实验方法,也很有必要。改进这些和其他细节的报告将最大限度地提高从每只动物和每次实验中获得的信息的可用性和效用,防止将来不必要地使用动物。为了解决这一问题,我们发起了一项倡议,制定动物研究报告指南。该指南称为ARRIVE(研究中的动物:报告在体内实验),以CONSORT声明为基础进行开发[24],[25].

ARRIVE指南包括20个项目的清单,其中描述了报告使用动物进行研究的所有科学出版物应包含的最低信息,例如所用动物的数量和具体特征(包括物种、品系、性别和遗传背景);住房和畜牧业细节;以及实验、统计和分析方法(包括用于减少偏差的方法的细节,如随机化和盲法)。清单中的所有项目都包括在内,以促进高质量、全面的报告,从而对所做的工作和发现的问题进行准确的批判性审查。

共识和协商是准则制定过程的基石[51]为了最大限度地发挥其效用,ARRIVE指南是在与科学家、统计学家、期刊编辑和研究资助者协商后制定的。我们召集了一个专家工作组,由来自多个学科的研究人员和统计人员以及来自自然细胞生物学,科学类,实验动物、和英国药理学杂志(请参阅确认)。在2009年6月的一次为期一天的会议上,工作组商定了一套准则草案的范围和广泛内容,然后将其用作与科学界进行更广泛协商的基础,包括研究人员、赠款持有人和包括医学研究理事会在内的主要生物科学资助机构的代表,威康信托基金会、生物技术和生物科学研究委员会以及皇家学会(参见表1). 关于项目内容和措辞的反馈已纳入最终版本的清单中。鼓励并寻求关于指南内容效用的进一步反馈。

表1

咨询了资助机构。
生物科学研究资助机构名称
医学研究委员会
生物技术和生物科学研究理事会
威康信托
英国皇家学会
医学研究慈善协会
英国心脏基金会
帕金森病学会

到达指南(参见表2)可以应用于使用实验动物进行生物科学研究的任何领域,固有原则不仅适用于报告比较实验,也适用于其他研究设计。实验动物是指在研究实验室或正式测试环境中进行实验程序的任何种类的动物。该指南并非强制性或绝对规定性的,也不是标准化或正式化报告结构。相反,它们提供了一个检查表,可用于指导作者编写供出版的手稿,并由参与质量保证同行评审的人员使用,以确保完整性和透明度。

表2

动物研究:报告在体内实验:ARRIVE指南。
项目建议
标题 1尽可能准确简明地描述文章的内容。
摘要 2准确总结研究背景、研究目标(包括所用动物物种或品系的详细信息)、关键方法、主要发现和研究结论。
简介
背景 a.包括足够的科学背景(包括对以往工作的相关参考),以理解研究的动机和背景,并解释实验方法和理由解释所使用的动物物种和模型如何以及为什么能够解决科学目标,以及在适当的情况下,研究与人类生物学的相关性。
目标 4清楚描述研究的主要和任何次要目标,或正在测试的特定假设。
方法
道德声明 5说明伦理审查许可的性质、相关许可证(例如《1986年动物[科学程序]法案》)以及涉及研究的动物护理和使用的国家或机构指南。
研究设计 6对于每个实验,给出研究设计的简要细节,包括:a.实验组和对照组的数量。b.在分配动物进行治疗(例如,随机程序)和评估结果(例如,如果做了,描述谁被蒙蔽了眼睛以及什么时候)时,为最大限度地减少主观偏见的影响而采取的任何步骤。c实验单位(例如单个动物、组或动物笼)。时间线图或流程图有助于说明如何进行复杂的研究设计。
实验程序 7对于每个实验和每个实验组(包括对照组),提供所执行的所有程序的精确细节。例如:a.如何(例如,药物配方和剂量、给药部位和途径、使用的麻醉和镇痛[包括监测]、手术程序、安乐死方法)。提供所使用的任何专业设备的详细信息,包括供应商。b.何时(例如,一天中的某个时间)。c.何处(例如,家庭笼子、实验室、水迷宫)。d.为什么(例如,选择特定麻醉剂的理由、给药途径、所用药物剂量)。
实验动物 8a.提供所用动物的详细信息,包括物种、品系、性别、发育阶段(例如,平均或中位年龄加年龄范围)和体重(例如,中位体重加体重范围)。b提供进一步的相关信息,如动物来源、国际菌株命名法、基因改造状态(例如敲除或转基因)、基因型、健康/免疫状态、药物或试验、先前程序等。
住房和畜牧业 9提供以下详细信息:a.住房(例如,设施类型,例如,无特定病原体(SPF);笼或外壳类型;垫层材料;笼子同伴数量;鱼类的鱼缸形状和材料等)。b.饲养条件(例如,鱼类的繁殖计划、光/暗循环、温度、水质等、食物类型、食物和水的获取、环境富集)。c.在实验之前、期间或之后进行的与韦尔法尔有关的评估和干预。
样本大小 10a.指定每个实验中使用的动物总数和每个实验组中的动物数量。b.解释动物数量是如何决定的。提供所使用的任何样本量计算的详细信息。c.如果相关,请说明每个实验的独立重复次数。
将动物分配到实验组 11a.详细说明如何将动物分配到实验组,包括随机化或配对(如有)。b.描述不同实验组中动物的治疗和评估顺序。
实验结果 12明确定义评估的主要和次要实验结果(如细胞死亡、分子标记物、行为变化)。
统计方法 13a.提供每次分析所用统计方法的详细信息。b.指定每个数据集的分析单位(例如单个动物、动物组、单个神经元)。c.描述用于评估数据是否符合统计方法假设的任何方法。
结果
基线数据 14对于每个实验组,在治疗或测试之前报告动物的相关特征和健康状态(例如,体重、微生物状态和药物或测试)(此信息通常可以制成表格)。
分析的数字 15a.报告每次分析中每组动物的数量。报告绝对数(例如10/20,而不是50%)b.如果分析中未包括任何动物或数据,请解释原因。
结果和估计 16报告所进行的每项分析的结果,并对精度进行测量(例如,标准误差或置信区间)。
不良事件 17a.给出每个实验组中所有重要不良事件的详细信息。b.描述为减少不良事件而对实验方案进行的任何修改。
讨论
解释/科学含义 18a.解释结果,考虑研究目标和假设、当前理论和文献中的其他相关研究。b.评论研究局限性,包括任何潜在的偏见来源、动物模型的局限性以及与结果相关的不精确性c.描述您的实验方法或发现对研究中使用动物的替代、改进或减少(3R)的任何影响。
通用性/翻译 19评论这项研究的发现是否以及如何可能转化为其他物种或系统,包括与人类生物学的任何相关性。
基金 20列出所有资金来源(包括拨款编号)和资助者在研究中的角色。
Schulz等人(2010年)[24].

改进报告将最大限度地提高已发表研究的产出

制定这些指南是为了通过优化有关实验设计、实施和分析的出版物中提供的信息,最大限度地利用动物进行研究。对动物研究的系统综述进一步说明了对此类指南的需要,这些研究旨在评估各种药物和干预措施在动物模型中的疗效[8],[9],[13],[52][55]精心设计和报告的动物研究是构建此类系统综述的基本组成部分。审查发现,在许多情况下,除了在审查中评估的个别研究中使用的动物模型的局限性外,报告遗漏也是对所比较的药物和干预措施的疗效得出任何有用结论的障碍[2],[3].

推动使用动物报告研究的改进需要作者、期刊编辑、同行评审员和资助机构的共同努力。没有单一的简单或快速解决方案,但ARRIVE指南提供了一种实用的资源来帮助这些改进。该指南将同时在几家领先的生物科学研究期刊上发表[56][60]出版商已经认可了这些指南,在出版后将其纳入《作者须知》杂志。NC3R将继续与期刊编辑合作,扩大采用指南的期刊范围,并与科学界一起尽可能广泛地传播指南(网址:http://www.nc3rs.org.uk/ARRIVE).

致谢

NC3R感谢所有贡献者为制定指南所提供的专业知识和建议。我们特别感谢NC3R报告指南工作组其他成员的贡献(请注意,为这些指南做出贡献的工作组成员和作者是以个人身份提供建议的,他们的意见不一定代表与其相关的组织的政策):英国伦敦帝国理工学院流行病学和公共卫生系David Balding教授;科林·邓恩博士编辑实验动物(英国皇家医学会出版社);Stella Hurtley博士,高级编辑科学类; 伊恩·麦格拉思教授主编英国药理学杂志(威利·布莱克威尔出版社);以及英国伦敦大学学院精神药理学系Clare Stanford博士。我们还要感谢NC3R赠款持有人、医学研究理事会、生物技术和生物科学研究理事会、威康信托基金会、帕金森病学会、,英国心脏基金会及其赠款持有者和提供指南反馈的资助委员会成员;以及凯瑟琳·查普曼博士和维奇·罗宾逊博士(均为NC3R)对手稿的帮助。

缩写

到达研究中的动物:报告在体内实验
NC3R国家研究动物替代、改良和减少中心

脚注

提交人声明,不存在相互竞争的利益。

该项目由国家研究动物替代、改良和减少中心(NC3R)发起、资助和领导。

工具书类

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