美国国家科学院程序。1989年5月；86(10): 3728–3732.
基因组测序揭示了活性启动子中的5-甲基胞嘧啶游离结构域和预先施加的甲基化模式的扩散。
摘要
先前的研究表明，与腺病毒2型（Ad2）DNA晚期E2A启动子帽位点相关的+24、+6和-215位的三个5'-CCGG-3'序列的甲基化与其活性呈负相关。在本研究中，我们使用基因组测序方法检测5’-CG-3'序列中的5-甲基-2'-脱氧胞苷（m5dC）残基，而不是5’-CCGG-3'（Hpa II）位点。整合Ad2 DNA的晚期E2A启动子的基因活性所需的约180个碱基对区域内所有5'-CG-3'序列的甲基化模式在携带该启动子处于激活或非激活状态的细胞系中测定。在细胞系HE1和uc2中，晚期E2A启动子是活性的，并且+24和-160位之间的所有13个5’-CG-3’序列都是非甲基化的。在HE2细胞系中，相同的启动子被永久关闭，所有5'-CG-3'序列在两条链中都被甲基化。因此，在晚期E2A启动子中约180个碱基对的区域内，这些细胞系的反向相关性是完美的。在细胞系mc23和mc40中分析了相同的启动子片段，其中晚期E2A启动子-氯霉素乙酰转移酶（CAT）基因构建物在体外5'-CCGG-3'甲基化和随后的转染后被基因组固定。在mc23细胞系中，预先施加的甲基化模式是稳定的，CAT基因是不活跃的。基因组测序证实了5'-CCGG-3'序列中存在m5dC，并揭示了甲基化沿着整个启动子向邻近的5'-CG-3'顺序扩散。其中一些位点被半甲基化。在细胞系mc40中，120个整合拷贝中的几个在+24和+6位脱甲基，但启动子在-50位上游的一些拷贝中甲基化。细胞株mc40表达CAT基因。
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- Maniatis T、Goodbourn S、Fischer JA。诱导和组织特异性基因表达的调节。科学。1987年6月5日；236(4806):1237–1245.[公共医学][谷歌学者]
- Doerfler W.DNA甲基化——真核生物基因表达的调控信号。维罗尔将军。1981年11月；57（第1部分）：1–20。[公共医学][谷歌学者]
- Doerfler W.DNA甲基化和基因活性。生物化学年度收益。1983;52:93–124.[公共医学][谷歌学者]
- Langner KD、Weyer U、Doerfler W.腺病毒E1区对哺乳动物细胞原核基因表达的反式作用：对5'-CCGG-3'甲基化的抵抗。美国国家科学院程序。1986年3月；83(6):1598–1602. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Weisshaar B、Langner KD、Jüttermann R、Müller U、Zock C、Klimkait T、Doerfler W.通过E1A（13S）功能对2型腺病毒甲基化激活晚期E2A启动子的重新激活。分子生物学杂志。1988年7月20日；202(2):255–270.[公共医学][谷歌学者]
- Knebel-Mörsdorf D，Achten S，Langner KD，Rüger R，Fleckenstein B，Doerfler W.通过人类巨细胞病毒的强增强剂重新激活2型腺病毒甲基化抑制晚期E2A启动子。病毒学。1988年9月；166(1):166–174.[公共医学][谷歌学者]
- Saluz HP，Jiricny J，Jost JP。基因组测序揭示了重叠的雌二醇/糖皮质激素受体结合位点的特异性DNA去甲基化动力学与鸟类卵黄原蛋白mRNA合成速率之间的正相关。美国国家科学院程序。1986年10月；83(19):7167–7171. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Razin A，Szyf M，Kafri T，Roll M，Giloh H，Scarpa S，Caroti D，Cantoni GL。胞嘧啶取代5-甲基胞嘧啶：分化过程中短暂DNA脱甲基的可能机制。美国国家科学院程序。1986年5月；83(9):2827–2831. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Kruczek I，Doerfler W.在腺病毒12型启动子控制下哺乳动物细胞中氯霉素乙酰转移酶基因的表达：启动子甲基化对基因表达的影响。美国国家科学院程序。1983年12月；80(24):7586–7590. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Knebel D，Doerfler W.N6-甲基脱氧腺苷在特定位点的残基降低了腺病毒12型DNA E1A启动子的活性。分子生物学杂志。1986年5月20日；189(2):371–375.[公共医学][谷歌学者]
- Langner KD、Vardimon L、Renz D、Doerfler W。启动子和5'区三个5'C-C-G-G3'位点的DNA甲基化使2型腺病毒E2a基因失活。美国国家科学院程序。1984年5月；81(10):2950–2954. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Dobrzanski P，Hoeveler A，Doerfler W.在无细胞转录系统中通过腺病毒启动子的序列特异性甲基化进行失活。《维罗尔杂志》。1988年11月；62(11):3941–3946. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Müller U，Doerfler W.地鼠细胞基因组中非甲基化或5'-CCGG-3'甲基化腺病毒晚期E2A启动子cat基因构建的固定：基因表达和甲基化模式的稳定性。《维罗尔杂志》。1987年12月；61(12):3710–3720. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Kuhlmann I，Achten S，Rudolph R，Doerfler W。人腺病毒12型在仓鼠中诱导肿瘤：腺病毒12诱导肿瘤细胞中病毒基因组的丢失与肿瘤形成相一致。EMBO J。1982;1(1):79–86. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Kuhlmann I，Doerfler W.仓鼠肿瘤细胞病毒基因组的丢失和整合腺病毒12型DNA甲基化模式的非随机改变。《维罗尔杂志》。1983年9月；47(3):631–636. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Lichtenberg U，Zock C，Doerfler W。外源DNA整合到哺乳动物基因组中可能与插入位点的低甲基化有关。病毒研究。1988年11月；11(4):335–342.[公共医学][谷歌学者]
- Waalwijk C，弗拉维尔RA。MspI是hpaII的一种异裂殖体，可裂解未甲基化和甲基化的hpaII位点。核酸研究。1978年9月；5(9):3231–3236. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Church GM，Gilbert W.基因组测序。美国国家科学院程序。1984年4月；81(7):1991–1995. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Cook JL，Lewis AM.，Jr《宿主对腺病毒2转化仓鼠胚胎细胞的反应》。癌症研究。1979年5月；39(5):1455–1461.[公共医学][谷歌学者]
- Vardimon L，Doerfler W.腺病毒2型转化仓鼠细胞中病毒DNA的整合模式。分子生物学杂志。1981年4月5日；147(2):227–246.[公共医学][谷歌学者]
- 巴卜拉尼安R，EGGERS HJ，TAMM I.脊髓灰质炎病毒诱导细胞损伤机制的研究。I.脊髓灰质炎病毒在培养细胞中诱导的代谢和形态改变之间的关系。病毒学。1965年5月；26:100–113.[公共医学][谷歌学者]
- Sutter D，Westphal M，Doerfler W.12型腺病毒转化仓鼠细胞基因组中病毒DNA序列的整合模式。单元格。1978年7月；14(3):569–585.[公共医学][谷歌学者]
- Schulze-Lefert P，Dangl JL，Becker-AndréM，Hahlbrock K，Schulz W.体内可诱导DNA足迹定义了欧芹查尔酮合成酶基因紫外光激活所需的序列。EMBO J。1989年3月；8(3):651–656. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Amasino RM。聚乙二醇加速核酸杂交速率。分析生物化学。1986年2月1日；152(2):304–307.[公共医学][谷歌学者]
- Alwine JC，Kemp DJ，Stark GR.琼脂糖凝胶中特定RNA的检测方法，通过转移到二氮苯氧基甲基帕帕并与DNA探针杂交。美国国家科学院程序。1977年12月；74(12):5350–5354. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Gorman CM，Moffat LF，Howard BH。哺乳动物细胞中表达氯霉素乙酰转移酶的重组基因组。分子细胞生物学。1982年9月；2(9):1044–1051. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Wienhues U，Doerfler W.缺乏证据表明生产性感染中父母和新合成的2型腺病毒DNA甲基化。《维罗尔杂志》。1985年10月；56(1):320–324. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Ohmori H，Tomizawa JI，Maxam AM。DNA序列中5-甲基胞嘧啶的检测。核酸研究。1978年5月；5(5):1479–1485. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Miller JR、Cartwright EM、Brownlee GG、Fedoroff NV、Brown DD。非洲爪蟾卵母细胞5S DNA的核苷酸序列。二、。GC-rich区域。单元格。1978年4月；13(4):717–725.[公共医学][谷歌学者]
- Maxam AM，Gilbert W.用碱基特异性化学裂解法对末端标记DNA进行测序。方法酶制剂。1980;65(1):499–560.[公共医学][谷歌学者]
- 鸟AP。富含CpG的岛和DNA甲基化的功能。自然。1986年5月15日；321(6067):209–213.[公共医学][谷歌学者]
- Johansson K、Persson H、Lewis AM、Pettersson U、Tibbetts C、Philipson L。经2型腺病毒转化的仓鼠细胞中的病毒DNA序列和基因产物。《维罗尔杂志》。1978年9月；27(3):628–639. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Vardimon L、Neumann R、Kuhlmann I、Sutter D、Doerfler W。腺病毒转化和感染细胞中的DNA甲基化和病毒基因表达。核酸研究。1980年6月11日；8(11):2461–2473. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- 腺病毒2型转化仓鼠细胞中的Esche H.病毒基因产物。《维罗尔杂志》。1982年3月；41(3):1076–1082. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
- Southern PJ，Berg P.在SV40早期区域启动子的控制下，利用细菌基因将哺乳动物细胞转化为抗生素耐药性。分子应用遗传学杂志。1982;1(4):327–341.[公共医学][谷歌学者]
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