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冷泉Harb Perspect生物。2010年3月;2(3):a000539。
数字对象标识:10.1101/cshperspect.a000539
PMCID公司:项目经理2829960
PMID:20300205

核封套

摘要

核膜(NE)是一种高度调节的膜屏障,将真核细胞的细胞核与细胞质分隔开来。它含有大量与染色质组织和基因调控有关的不同蛋白质。尽管核膜能够实现复杂水平的基因表达,但在细胞分裂方面也存在挑战。为了让有丝分裂纺锤体接触染色质,后生动物的细胞核必须在有丝分裂期间完全解体,从而需要在每个细胞分裂结束时重建核室。在这里,我总结了我们目前对NE在细胞周期中动态重塑的理解。

每次细胞分裂时,核膜都会破裂。激酶如Cdk1有助于分解孔复合物,而微管产生破坏膜本身的力。

NE是真核细胞的标志,是一个高度组织化的双层膜,包裹着核基因组(风筝1913). 早期电子显微镜(EM)图像显示,内(INM)和外核膜(ONM)与内质网(ER)连续(沃森1955). 尽管NE和ER之间存在脂质连续性,但ONM和INM都由不同的蛋白质组组成,这些蛋白质组通常不在ER中富集(Hetzer等人,2005年)(表1). 这个第一该组由约30种不同的多肽组成,称为核孔蛋白或Nups,形成约40–70 MD核孔复合物(NPC)(Tran和Wente 2006;D’Angelo和Hetzer 2008). NPC是水通道,具有八倍的旋转对称性,外径约100 nm,中心转运通道直径40 nm,通过该通道,核质和细胞质之间发生蛋白质、RNA和核糖核蛋白复合物的双向交换(Beck等人,2004年;Beck等人,2007年;Terry等人,2007年). Nups的一个子集稳定地嵌入NE中,形成支架结构或NPC核心(Rabut等人,2004年;D'Angelo等人,2009年)被认为可以稳定高度弯曲且在能量上不利的孔隙膜(Alber等人,2007年;Boehmer等人,2008年). 该核心包括Nup107/160复合物(酵母中的Nup84复合物)和Nup205复合物(酵母菌Nup170),它们共同构成整个NPC的~50%(图1)(Brohawn等人,2009年). 与该支架相连的是外周Nup,其中许多含有富含苯丙氨酸-甘氨酸(FG)的重复序列,这些重复序列建立了一个通透性屏障,并介导通过NE的活性、受体依赖性转运(彼得斯2009). A类第二NE蛋白组,特异定位于INM(图1)(Schirmer和Gerace 2005). 尽管这些>60个完整膜蛋白(也称为NE跨膜蛋白或NETs[Schirmer等人,2003年])其中一些与层粘连蛋白(见下文)和染色质的相互作用,如层粘连B受体(LBR)、层粘连多肽(LAP)1、LAP2、emerin和MAN1(Akhtar和Gasser 2007;Dorner等人,2007年;Schirmer和Foisner 2007). 越来越清楚的是,INM蛋白在染色质组织、基因表达和DNA代谢等核功能中发挥着重要而多样的作用(Mattout等人,2006年;海森和福内罗德2007;Reddy等人,2008年). 重要的是,INM蛋白的不当定位和功能与许多人类疾病有关,这在过去十年中引起了人们对NE生物学的极大兴趣(Vlcek和Foisner 2007;Worman和Bonne 2007;Neilan 2009年)。

保存图片、插图等的外部文件。对象名为cshperspect-NUC-000539_F1.jpg

NE的拓扑结构。内膜和外膜(分别为INM和ONM)由ER腔或核周间隙(PNS)分隔。核膜与NE蛋白和染色质相互作用。INM蛋白将NE连接到染色质和叶片。ONM蛋白提供了从细胞核到细胞骨架的连接。层粘连蛋白B受体(LBR)与B型层粘连以及染色质相关异染色质蛋白1(HP1)与核心组蛋白相互作用。LEM(lamina-associated protein 2[LAP2],emerin,MAN1)结构域家族(粉红色)的成员与lamins结合,并通过屏障-自整合因子(BAF)与染色质相互作用。SUN蛋白(SUN 1和2)与ONM中的nesprins相互作用,从而形成所谓的LINC复合物,与细胞质中的肌动蛋白和中间丝建立连接。Nurim是一种功能未知的多通道膜蛋白。蛋白质组学方法已经鉴定了约60种假定的跨膜蛋白(NETs),其中大多数仍然没有特征化。

表1。

NE蛋白列表。

NPC公司印度国家标准ONM公司拉明
第35页伦敦银行同业拆借利率Nesprin-3/Net35型拉明A
第37页第1圈Syne/Myne/Nesprin 1号拉明B1
编号43第2b圈Nesprin-2a和b层粘连蛋白B2
数字50埃梅林Syne/Nesprin-2G公司拉明C
编号54手动1样品1
编号58/45努里姆
编号62净8
编号75净38
数字88净56
编号96*LEM2/净25
核98*净9
编号107净32
编号133净37
编号153太阳1
编号155太阳2号
编号160LUMA公司
核188~60 NET
编号205
编号214
编号358/RanBP2
第13R节
Seh1号机组
第121页
钕氯离子
第210页
Tpr公司
雷1
阿拉丁
Nlp1/hCG1

核孔复合体(NPC)含有~30个核孔蛋白(Nups)*Nup98和Nup96被合成为一种单一的多肽,该多肽被自动蛋白水解裂解产生Nup98或Nup96。内核膜蛋白:层粘连蛋白B受体(LBR)、层粘连相关蛋白(LAP)、核膜跨膜蛋白(NET)**超过60个NET没有指定功能。外核膜(ONM):包含核膜蛋白(syne)、纺锤体相关膜蛋白1(Samp1)的精蛋白重复序列。层压板:层压板A和层压板C是选择性剪接的产物。

A类第三的NE蛋白类特异性存在于ONM中(图1). 这种多样的完整膜蛋白组共享一个小的KASH(Klarsicht,ANC-1,Syne Homolgy)结构域,该结构域已被证明与NE周质空间内内核膜的Sad1p/UNC-84(SUN)结构域蛋白相互作用(斯塔尔和韩2003;Wilhelmsen等人,2006年). 其他两种相关的ONM蛋白,即核膜蛋白重复序列(nesprin)-1和-2,已被证明通过其氨基末端肌动蛋白结合域(ABD)与肌动蛋白细胞骨架直接相互作用(Wilhelmsen等人,2005年). 这些ONM蛋白与核定位有关,核定位对细胞极化、原核迁移和融合组织等过程至关重要(Fridkin等人,2009年). 此外,ONM和INM蛋白在核周间隙形成“桥”,可能参与在~50 nm的均匀距离处分离两个NE膜小叶(Voeltz和Prinz 2007). 这些管腔蛋白桥可以在细胞骨架和染色质之间建立物理连接,这可能与转录、复制和DNA修复机制有关(Tzur等人,2006年;Stewart等人,2007年). 这个最终的NE蛋白组构成层,层是由a型和B型层压板组成的中间丝网(Gruenbaum等人,2000年). 尽管已经证明椎板对核稳定性至关重要,尤其是在暴露于机械力的组织中,如肌肉纤维(Cohen等人,2008年)很明显,层粘连蛋白在染色质功能和基因表达中也起主要作用(Gruenbaum等人,2005年;Dechat等人2008;Reddy等人,2008年). 与INM蛋白类似,层粘连蛋白的突变与多种人类疾病有关(Mounkes等人,2003年;Muchir和Worman 2004;Mattout等人,2006年)和衰老(Gruenbaum等人,2005年;Scaffidi和Misteli 2006)强调NE蛋白网络对正常细胞功能的关键作用。

总之,NE在保护基因组免受细胞质成分影响方面发挥着关键作用,但也代表着一种高度专业化的膜,为染色质和细胞骨架提供锚定位点(安吉洛和赫策2006)。

分裂细胞中NE的重塑

虽然在所有真核生物中都可以发现膜包裹的核ge-nome,但在“低等”真核生物(如酵母和丝状真菌)和后生动物(即“高等”真核动物)之间,NE的细胞周期依赖性动力学存在重大差异。前者经历封闭的有丝分裂,纺锤形微管可以在细胞核内形成,也可以穿透完整的核膜(海伍德1978;拜尔斯1981;Ribeiro等人,2002年). 相反,后生动物细胞的NE在细胞分裂过程中完全解体,使有丝分裂纺锤体能够接触染色体(Kutay和Hetzer 2008). 因此,每个分裂细胞都必须改造NE并重新建立核室的身份(Hetzer等人,2005年;Anderson和Hetzer 2008b;Guttinger等人,2009年)。

增殖细胞中的NE重塑是一个高度动态的过程,涉及大量的分子因素(图2,,3).). 在G2期间期结束时,细胞核已经复制了它们的基因组,使NPC的数量增加了一倍,并增加了NE的表面积。周围的ER网络与NE连续,但不富含NE蛋白。有丝分裂的进入,即前期,以NE分解(NEBD)和核质分隔的丧失为标志(伯克和埃伦伯格2002). 在NEBD和早期后期之间,当染色体在中期板中排列并随后分离时,染色质基本上不含膜(Puhka等人,2007年;Anderson和Hetzer 2008a). 在这些细胞周期阶段,大多数可溶性NE蛋白分布在细胞质中,跨膜NE蛋白位于有丝分裂内质网(Ellenberg等人,1997年;Anderson和Hetzer 2007;Puhka等人,2007年)(图2). 在后期,内质网膜开始与染色质团重新结合并迅速包围染色质团(Anderson和Hetzer 2008a). Nups的一个子集的染色质缔合、染色质的去凝聚和新NPC的组装与NE的形成同时发生(Anderson和Hetzer 2008c). 在细胞分裂结束时,NE被改造成一个封闭的膜屏障,通过选择性的核质转运重建核室(Dultz等人,2008年). 在其形成后,NE扩张并经历细胞周期进展和转录所必需的额外结构变化,包括新NPC的组装(Winey等人,1997年;D'Angelo等人,2006年)(图3)。

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网元故障示意图。在G2,细胞核完成了DNA复制和NPC复制。NE(深绿色)与ER网络(绿色)相连,包裹着染色体(蓝色)。NPC(红色/蓝色)调节核运输。当细胞进入有丝分裂期时,NPC分解,NE被重新吸收到由小管组成的ER中。NPC组分分散在细胞质中,NE蛋白被分割成ER(绿色虚线)。中心体(橙色圆点)向NE移动,微管(紫色)参与NE的破裂。中期,NPC组分的一个子集与动粒相关,纺锤体形成。在这个阶段,中期板上的染色体没有膜。

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两个子细胞之一分离染色体周围NE重组示意图。在后期,内质网膜与染色质相关(红色箭头),核穿孔蛋白子集与染色质有关。额外的膜小管和NE蛋白被招募到染色质表面并介导NE扁平化。在这个阶段,大多数NE蛋白从内质网中清除。在后期/末期早期,封闭的NE形成,孔隙逐步组装。一旦孔隙具备运输能力,NE扩张,细胞进入G1。

分解细胞核

哺乳动物细胞的活细胞成像显示,NEBD在前期几分钟内迅速发生(Lenart等人,2003年),以逐步的方式发生。最初的事件之一是核电站选择性地失去核动力(Terasaki等人,2001年;Dultz等人,2008年;Katsani等人,2008年). Nup98,动态NPC组件(Griffis等人,2002年)在其他NPC组件之前释放,NPC组件会同步拆卸(Dultz等人2008). Nups的集体扩散也可以在果蝇属,表明孔隙拆卸在进化上是保守的(Katsani等人,2008年). 生化证据表明NPC分解成稳定的亚复合物,而不一定分解成单个多肽(米勒和福布斯2000;Harel等人2003b;Walther等人,2003a)这可能会稳定核穿孔蛋白,并允许NPC在有丝分裂结束时更快地重组。不幸的是,我们对拆卸的鼻咽癌成分的生化性质没有一个清晰的描述。最近的证据表明,在有丝分裂期间,一些核孔成分以蛋白酶体依赖的方式去颗粒化,这一过程可能会调节总孔数。此外,在同一研究中,Nup43在有丝分裂的Nup107/160复合体中缺失,因此在间期似乎与其对应物不同(Chakraborty等人,2008年)。

KINASES在NE分解中的作用

NPC的拆卸对于NEBD的早期阶段至关重要,例如破坏渗透屏障和允许分子流入,这被认为是进一步拆卸步骤的关键。例如,像细胞周期蛋白依赖性激酶1(Cdk1/CycB1)这样的蛋白激酶可能需要接触INM和层粘连蛋白以进行适当的有丝分裂调控(Wu等人,1998年). 这与NPC被渗透后,层粘连的大部分分解发生的想法是一致的(Lee等人,2000年;Beaudouin等人,2002年). 随着叶片被破坏,许多INM蛋白失去锚定并释放到内质网(Ellenberg等人,1997年;Yang等人,1997年;Puhka等人,2007年;Anderson等人,2009年a;Lu等人,2009年)。

NEBD期间的一个关键事件是NE蛋白的过度磷酸化,这被认为是破坏蛋白质复合体和/或在激活参与这一过程的因子中发挥作用。NEBD中涉及多种激酶,如Cdk1/CycB1、蛋白激酶C(PKC)、Nima和Aurora A(Collas 1999年;伯克和埃伦伯格2002;Gong等人,2007年;Portier等人,2007年). 关键激酶似乎是Cdk1,它磷酸化层粘连蛋白和Nups,包括Nup107/160复合物、Nup93亚复合物、Nup53、Nup98、Ndc1和gp210(Guttinger等人,2009年). INM蛋白的分解,如Lap2α、β和LBR,似乎依赖于Cdk1(Courvalin等人,1992年;Dechat等人,1998年;Dreger等人,1999年). 其他几种激酶已被证明参与NEBD,包括PKC(Goss等人,1994年),极光A(Portier等人,2007年)和polo-like激酶(PLK1)(Chase等人,2000年); 然而,他们的目标仍有待确定。拉明B是NEBD期间PKC的唯一已知靶点(Goss等人,1994年)。

在这种情况下,值得一提的是,有丝分裂闭合的生物体中的NPC也会部分分解。例如,在巢状曲霉,14个核素被释放,留下一部分NPC,允许Cdk1/cyclin B复合体进入(Osmani等人,2006年). 这种部分分解需要激酶Nima和Cdk1(De Souza等人,2004年). 因此,NPC在有丝分裂期间的结构重组可能是所有真核生物共同的进化保守特征。

NEBD期间的膜动力学

最近发现核膜积极参与了这一过程,这揭示了NEBD的一个有趣方面。在线虫中工作秀丽隐杆线虫表明网织红细胞的耗竭和GTPase Rab5抑制NEBD(Audhya等人,2007年). 网织红细胞是膜相关蛋白家族的一部分,该家族与一类独特的膜结合蛋白(如DP1)一起被证明可将内质网小管化(Voeltz等人,2006年). 这些结果表明,内质网的主动重塑可能是NEBD的关键步骤。两种核孔蛋白也参与了这一过程;然而,它们的作用仍不明确。就在NEBD发生之前,跨膜核孔蛋白gp210在NE处以磷酸化形式富集(Galy等人,2008年). gp210促进NPC和叶片分解的机制尚待确定。Nup153是核篮的一个动态组成部分,其耗竭抑制NEBD,并显示其招募COPI复合体,该复合体介导从高尔基体到内质网的逆行运输到NE(Liu等人,2003年). Nup153和COPI复合体在这一过程中扮演的角色尚待阐明。

新数据表明,脂质合成本身可能在NE动力学中发挥作用。脂蛋白的敲除,脂蛋白是一种保守的磷脂酸(PA)磷酸酶,催化PA去磷酸化生成二酰甘油(DAG)(Siniossoglou 2009年)导致NEBD缺陷、异常染色体分离和不规则核形态秀丽线虫有趣的是,线虫Lpin-1的下调是NEBD晚期核片分解所必需的,这表明Lpin-1需求似乎与Lpin-1对外周内质网的影响是分离的(Golden等人,2009年;Gorjanacz和Mattaj,2009年)。

虽然磷酸化显然是NEBD中的一个关键事件,但NE与微管的相互作用被认为会产生机械力,协助在动力蛋白介导的过程中破坏核膜,可能还有叶片(Beaudouin等人,2002年;Salina等人,2002年;Muhlhausser和Kutay,2007年). 这一过程也可能涉及小GTPase Ran,它已被证明在NEBD期间调节微管动力学,可能揭示Ran的另一种潜在的有丝分裂功能(Muhlhausser和Kutay,2007年). 然而,应该记住,在体外没有微管的情况下也可能发生核解体(Lenart等人,2003年),表明NE的动态依赖性中断可能不是必需的。

有丝分裂过程中NE组分的结构和功能

如上所述,染色体在中期和后期之间基本上是无膜的。EM和荧光显微镜提供了令人信服的证据,证明NE被重新吸收到ER中(Ellenberg等人,1997年;Anderson和Hetzer 2007;Anderson和Hetzer 2008a;Anderson等人,2009年a;Lu等人,2009年). 例如,活细胞中的荧光延时显微镜显示,NE蛋白如核孔蛋白gp210、Ndc1和Pom121被分割成有丝分裂内质网(Ellenberg等人,1997年;Puhka等人,2007年). 同样,在有丝分裂期间,在内质网中也可以发现INM蛋白(Puhka等人,2007年). 然而,有丝分裂内质网的拓扑结构仍然存在争议。电子断层扫描对内质网的三维建模表明,有丝分裂内质网仍然是一个完整的膜小管网络,基本上没有片状结构(Puhka等人,2007年). 最近的数据支持了这一点,表明ER在有丝分裂期间在小管和薄片之间振荡的固有倾向被用于有丝分裂,并影响NE在有丝细胞分裂期间的命运秀丽线虫(Audhya等人,2007年). 然而,来自线虫和哺乳动物细胞的令人信服的数据挑战了完全管状内质网的观点,并表明内质网主要由膜片组成。例如,研究表明,中期HeLa细胞的粗面内质网似乎完全是池状的,并集中在细胞皮层,通常沿着质膜的轮廓分布(McCullough和Luccq 2005). 在一项使用活细胞三维重建的研究中,ER似乎完全由池形成,并且观察到很少的小管(Lu等人,2009年). 秀丽线虫(Poteryaev等人,2005年). 确定ER和拆卸的NE组件的确切性质仍然是未来的关键目标,因为这对NE形成具有重要意义。

NE蛋白具有有丝分裂功能

尽管内质网膜的动态组织尚不清楚,但很明显,分解的去甲肾上腺素组分在有丝分裂中发挥着关键作用。例如,多聚体Nup107-160复合物,其在界面对孔组装和功能至关重要(D'Angelo等人,2006年)和Nup358,显示了修饰RanGAP(Ran的GTPase激活蛋白)的SUMO E3连接酶活性(Joseph等人,2002年;Pichler等人,2002年),都可以在有丝分裂中与动粒结合检测到。此外,还发现ELYS/MEL-28和Nup107-160具有纺锤体极和近端微管(Loioice等人,2004年;Galy等人,2006年;Rasala等人,2006年). 这种关联在果蝇属表明Nups在动粒功能中的作用是一个相对较晚的进化事件(Katsani等人,2008年). 然而,在哺乳动物细胞中,Nup107-160复合体的缺失扰乱了双极纺锤体的形成(Orjalo等人,2006年),并抑制Nup358向微管结合动粒的募集(Salina等人,2003年;Joseph等人,2004年). 最近研究表明,Nup358的驱动蛋白结合域(KBD)与驱动蛋白-1,KIF5B/KIF5C相关。有趣的是,KBD在存在微管的情况下刺激KIF5B的ATP酶活性,从而增加其活性(Cho等人,2009年)。

Nup107-160复合体可能在动粒中具有独立的作用,因为在爪蟾体外纺锤组装试验中,Nup358/SUMO-RanGAP复合物与动粒细胞无关(Arnaoutov和Dasso 2005). 由于mNup133(mNup107-160成员)和CENP-F(动粒蛋白)相互作用,该功能可能与动力蛋白伴侣Nde1和Nde1l有关,它们也结合CENP-F(Vergnolle and Taylor 2007年;Zuccolo等人,2007年)。

其他NE蛋白在细胞周期和有丝分裂进程中的其他作用也有报道。层粘连蛋白B是一种V型中间丝蛋白,也是核膜的一种成分,其耗尽也会导致有丝分裂纺锤体缺陷(郑和蔡2006). 有趣的是,纺锤体相关的层粘连蛋白B似乎存在于膜质基质样网络中,并似乎以动力学依赖的方式促进纺锤体微管的组织(Tsai等人,2006年;Ma等人,2009年). 尽管关于层粘连B的纺锤体基质功能的机械细节尚待确定,但这些结果有助于NE结构成分在有丝分裂中发挥作用的新范式的形成。最近发现的纺锤体相关膜蛋白1(Samp1)进一步支持了这一观点,该蛋白在间期定位于内核膜,特别定位于有丝分裂纺锤体的极区(Buch等人,2009年). Samp1表达缺失导致中心体与NE分离,表明其在功能上与细胞骨架相连。这为有丝分裂内质网膜与纺锤体之间存在相互作用提供了证据。

重建秩序:新英格兰的改革

NE的形成已经在各种无细胞系统、细胞类型和生物体中进行了研究(伯克和埃伦伯格2002;Hetzer等人,2005年;Anderson和Hetzer 2008c). 由于膜通常是脆弱的结构,在细胞分级和固定过程中很容易被破坏,因此很容易看出从不同系统获得的数据是如何导致有时相反的模型的假设的。关于NE是如何形成的,基本上有两种不同的观点:(1)通过囊泡融合和(2)通过将ER重塑为NE片。

根据生化数据和EM观察,最初提出NE片段进入NE囊泡(Collas和Courvalin 2000). 这个想法来源于无细胞系统,主要是爪蟾海星和果蝇属(Lohka和Masui 1983年;纽波特1987). 青蛙蛋提取物的优点是含有大量拆卸的NE成分(纽波特和斯潘1987)通过混合染色质来源、细胞质和细胞膜,细胞核可以在~60分钟内在试管中组装。这些人工核能够进行核质转运、DNA复制以及NEBD(Sheehan等人,1988年;甘特和威尔逊1997;Hetzer等人,2002年). 囊泡融合是NE形成的主要机制,这一观点得到了GTPγS(一种不可水解的GTP类似物)阻止NE形成并导致组装中间体被染色质结合囊泡覆盖的研究结果的进一步支持(Boman等人,1992年;Hetzer等人,2001年). 有趣的是,小GTPase Ran的耗尽模拟了GTPγS添加的效果(Hetzer等人,2000年;张和克拉克2000). 因为Ran交换因子RCC1(Ohtsubo等人,1989年)与染色质稳定相关,有人提出染色质周围产生高水平的RanGTP,为染色质相关过程(如NE形成和NPC组装)提供空间信号(Bilbao-Cortes等人,2002年;Hetzer等人,2002年;Hutchins等人,2004年). 随后发现,Ran释放核转运受体Importinβ(Nachury等人,2001年;Harel等人2003年a;哈雷和福布斯2004)从而触发NPC组装(Harel等人2003年a;Walther等人2003年b). 闭合NE的形成可能需要类似的机制,但Importinβ的靶点仍然未知。证实了体外数据,证明Ran是NE形成所必需的秀丽线虫(Askjaer等人,2002年)和酵母(Ryan等人,2003年)。

尽管鸡蛋提取物为研究内质网和NE重构提供了一个独特的实验系统,但重要的是要认识到组装反应是由分离的膜启动的,这些膜处于高度碎片化的状态,并不代表有丝分裂内质网的完整体内组织。最近的证据表明,在体外,完整的NE也可以从预先形成的ER中形成(Anderson和Hetzer 2007). 引人注目的是,预成型内质网的核组装对融合抑制剂(如GTPγS、ATPγS或抑制AAA-ATP酶p97功能的抗体)不敏感。此外,对内质网小管形成至关重要的因素,如ATP(德雷尔和拉波波特2000)和网状子(Voeltz等人,2006年),只有在ER网络组织之前添加时才能阻止核组装(Anderson和Hetzer 2007). 结果有力地支持了ER是NE膜来源的观点。根据这一观点,观察到融合抑制剂对核组装的抑制以及SNARE蛋白在NE形成中的作用可能是阻断ER重建的间接作用(Baur等人,2007年)。

尽管这些实验表明NE可以在体外从ER网络形成,但它们并没有解决NE如何在完整细胞中形成的问题。完整细胞的高分辨率成像显示,内质网小管在NE形成早期接触染色质。接触后不久,可以观察到ER膜快速覆盖染色质(Anderson和Hetzer 2007). 最近的数据表明,内源性神经递质跨膜蛋白浓度是核组装的速率限制。由于NE的形成还受到减慢NE形成的内源性ER型网织红蛋白水平的影响,这些发现表明网织红细胞及其膜弯曲活性与NE蛋白之间存在着一场拔河,NE蛋白促进了膜的附着和在染色质周围扩散(Anderson和Hetzer 2008a). 导致片状NE形成的大规模膜重组事件涉及功能多样的NE蛋白群,它们在有丝分裂期间相互协作,将膜栓接到染色质表面,从而推动NE的形成(Anderson等人,2009年b). 最近的研究发现,一些INM蛋白的DNA结合活性是体外NE形成所必需的(Ulbert等人,2006年)在体外无蛋白固定化DNA上有效形成的膜片支持了这一观点。此外,NE的形成似乎还涉及几个INM蛋白与染色质因子结合的能力。例如,已经表明,与异染色质结合蛋白1(HP1)结合的整合INM蛋白LBR是体外靶向和锚定NE膜至染色质所必需的(Collas等人,1996年;Pyrpasopoulou等人,1996年). 以类似的方式,屏障-自整合因子(BAF),一种染色质结合蛋白(Segura-Totten等人,2002年)最近研究表明,其激酶Vrk通过向染色质招募LEM域蛋白,在NE形成中发挥直接作用(Gorjanacz等人,2007年). Vrk似乎是这一过程中的关键调节因子,因为BAF磷酸化减少了染色质结合和与LEM结构域蛋白(如emerin)的相互作用(本特森和威尔逊2004;Hirano等人,2005年). 因此,NE的形成可能涉及分布在有丝分裂内质网的跨膜NE蛋白与重组染色质之间的复杂相互作用。

染色质在NE建造中的作用

最近对无细胞核组装系统的研究表明,最初的ER/染色质接触是通过小管末端介导的。在第二步中,这些束缚的内质网小管通过DNA结合NE特异性膜蛋白重组为扁平的核膜片(Ulbert等人,2006年;Anderson和Hetzer 2007). 在细胞中,内质网似乎主要是池性的(Lu等人,2009年)因此,在体内,预先存在的膜很可能直接与染色质表面相连。这与网织红蛋白过度表达延迟NE形成的发现一致,而网织红细胞的敲除加速NE形成(Anderson和Hetzer 2008a)。

在NE形成期间,染色质经历了一系列构象变化,从NE形成之前的后期最大染色质致密状态开始(Mora-Bermudez等人,2007年)间期转录和复制活性去凝聚。后期致密化需要驱动蛋白样DNA结合蛋白(Kid),它确保在后期形成紧密的染色体簇,并将分离的染色质团适当包围在单个细胞核中(Ohsugi等人,2008年). 有趣的是,Kid加载到后期染色体上依赖于Importinβ(Tahara等人,2008年)增加了由该转运受体调节的有丝分裂过程的数量。

最近,有一个令人信服的案例表明,NE形成和染色质去凝聚在机械上存在联系。与膜融合有关的六聚ATP酶Cdc48/p97(Kondo等人,1997年)和泛素依赖过程(Ye等人,2003年)从染色质中提取Aurora B,导致其失活和随后的染色质去凝聚。有趣的是,Cdc48/p97的抑制阻止了NE的形成,这表明NE的生成需要染色质去凝聚(斋月等,2007年)可能是通过开放染色质结构。很容易推测,这种开放的染色质结构为INM蛋白提供了结合位点,从而驱动NE的形成。

伴随着NE对染色质的包覆,NPC在重组细胞核中组装。这个令人着迷的蛋白质自组装的例子是由NPC蛋白质的一个子集逐步补充到染色质中来协调的(Dultz等人,2008年)在确定这一过程是如何发生的方面取得了一些进展。一种称为Mel-28/ELYS的蛋白质,在秀丽线虫对于参与原核形成的因素,对Nup107/160复合物与染色质的结合至关重要(Rasala等人,2006年;Franz等人,2007年). 因为Mel-28/ELYS包含一个AT-hook域(Kimura等人,2002年)一种可能的情况是,这一步骤是通过与DNA直接结合来实现的。有趣的是,RanGTP刺激了Mel-28/ELYS的招募(Franz等人,2007年)可能是通过从Nup107/160/ELys成分之一释放Importinβ(Hetzer等人,2005年). 尽管其他核孔蛋白也参与了孔组装,但其确切作用仍有待确定。例如,最近研究表明,Nup53和Nup155的复合物对线虫和脊椎动物中NE的形成至关重要(Franz等人,2005年;Hawryluk-Gara等人,2008年); 然而,膜相关Nup53如何协调染色质、膜和可溶性Nup155之间的相互作用尚不清楚。

一组核穿孔蛋白已被证明对孔组装至关重要(Hetzer等人,2005年)最大的亚复合物是Nup107/160复合物,其耗尽导致无NPC核膜(Harel等人2003b;Walther等人,2003a). 在脊椎动物中,两种跨膜核孔蛋白也被证明参与NE形成,即Ndc1和POM121(Mansfeld等人,2006年;Stavru等人,2006年;Anderson等人,2009年b). 第三种已知的跨膜Nup,gp210,并不是在所有细胞类型中都表达,因此不太可能是孔隙组装所必需的(埃里克森等人,2004年). 虽然这些支架Nup的分子作用尚不清楚,但POM121和Nup107/160复合物之间存在着有趣的联系,核膜的形成实际上可能是通过一个不太了解的检查点与孔组装联系在一起的,Nup107-160复合物通过该检查点“感知”核膜(Antonin等人,2005年)。

重塑NE相间

为了使细胞正确地进行多个细胞分裂,在间期NPC的数量加倍(Maul等人,1972年). 目前尚不清楚这种增加是否仅仅反映了下一个分裂周期子细胞双孔的必要性,或者NPC数量的增加是否对间期细胞周期进展(例如有效复制或转录)很重要。相间核孔组装特别有趣,因为NPC的形成发生在NE两侧(D’Angelo等人,2006年). 因此,问题出现了,双层膜之间的通讯机制是什么?有趣的是,Nup133是Nup107/160复合体的一个成员,包含一个类似ALPS的基序,包括一个两亲性α-螺旋结构域,该结构域已被证明在体外起到了膜曲率传感器的作用(Drin等人,2007年). 在NE形成期间,该结构域可能参与将Nup107/160复合物靶向膜。根据这个想法的预测,膜孔是在Nup107/160被招募之前形成的。尽管INM和ONM在哺乳动物细胞中的融合仍然很难实现,但在酵母中破译这一过程已经取得了重大进展。

基因研究酿酒酵母揭示了一个蛋白质-蛋白质相互作用的网络,似乎可以启动鼻咽癌的形成。核孔蛋白Nup59/53和完整的孔膜核孔蛋白Pom152和Pom34将Nup170和第三个完整的膜核孔素Ndc1连接到NE的新组装位置(Onischenko等人,2009年). 此外,Nup170及其同源物Nup157的缺失导致NPC样结构在INM和细胞质病灶中积聚,而不是正确定位于跨越NE的核孔。有趣的是,酵母网织红细胞和Yop1不仅显示与Poms的遗传相互作用,而且似乎在新的NPC的形成中发挥着重要作用(Dawson等人,2009年). 与Nup170的耗竭类似,在没有网织红细胞的情况下,NPC-like中间体也以异常的方式在NE的INM和ONM中积累。目前的想法是,由三个跨膜核孔蛋白Pom152、Pom34和Ndc1组成的复合体通过连接或并列ONM和INM来标记一个新的组装位点,这与NPC大会从东北两侧进行的观察一致(D'Angelo等人,2006年). 根据这个想法,Nup53/59和网织红细胞Yop1/Dbp1被招募到核膜上,并通过单主题膜插入域插入到膜的外叶中,诱导或稳定膜的局部弯曲。然而,这一观点最近在理论上受到了质疑,认为网织红细胞诱导的是膜的正曲率(例如,引起小管的凸面),而不是负曲率,这很可能发生在NPC组装过程中。相反,有人提出网织红细胞可能参与参与NE形成的负曲率诱导蛋白的局部富集(安东宁2009). 跨膜核孔蛋白、网织红细胞或未知机制是否在NPC组装过程中诱导INM和ONM融合仍是一个悬而未决的问题。

在间期,NE显著膨胀,因此需要额外的核膜和蛋白质供应。通过破坏细胞核与外周内质网的连接来阻止体外细胞核膨胀(D'Angelo等人,2006年)表明膜通过与内质网小管的连接进入ONM。INM的生长需要膜组件通过NPC处ONM的融合位点。目前的观点是,一旦INM蛋白通过与叶片或染色质的相互作用到达INM,它们就会被保留下来。后生动物如何靶向INM蛋白尚不清楚。一种模型表明,ATP驱动的核穿孔蛋白相互作用的改变可能会使膜蛋白穿过鼻咽癌(Ohba等人,2004年). 在酵母中,完整的INM蛋白已被证明与特定的核孔蛋白和转运受体直接相互作用,以促进其通过NPC(King等人,2006年). 到间期结束时,NE在蛋白质组成上发生了重大变化,并在有丝分裂开始时分解,从而在两个子细胞中开始新的生命周期。

在间期,NE与细胞骨架的连接必须承受外力。最近的工作表明SUN和KASH结构域蛋白在这一过程中起着关键作用(Adam 2001年). KASH域蛋白与细胞质中的中心体/SPB或细胞骨架元件相互作用,并与INM中的SUN域蛋白结合,将NE连接到细胞核外部的结构。核纤层可以在后生动物中发挥作用,将力分布在更大的区域(Stewart等人,2007年)(2007年Roux和Burke)。

总结性意见

NE因其在屏蔽核基因组与细胞质成分和介导核质转运方面的作用而广为人知。人们对其在细胞分裂中的动态行为及其在遗传物质分布中的作用知之甚少。此外,很明显,NE可能会积极控制基因组的组织,并直接调节基因表达。这为未来的研究活动提供了一些有趣的机会。例如,大多数NE蛋白-染色质相互作用的性质仍不明确,许多INM蛋白以组织特异性方式表达。这就提出了一个重要的问题,即NE成分是否是决定细胞命运的关键因素。如果NE蛋白控制染色质组织,那么NE形成和核组织之间有联系吗?换句话说,在后期/末期建立的NE-chromatin接触点是否维持在间期?由于许多NE蛋白与大量疾病相关,这些问题的答案可能会对人类健康产生直接影响。

致谢

我要感谢我实验室的成员,特别是Maximiliano D'Angelo、Roberta Schulte和Jesse Vargas对手稿的批判性阅读。这项工作得到了国家普通医学科学研究所(奖项编号R01GM073994)的支持。

脚注

编辑:David Spector和Tom Misteli

有关核心的其他观点,请访问www.cshperspectives.org

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文章来自冷泉港生物学展望由以下人员提供冷泉港实验室出版社