EM断层扫描显示OPA1缺失线粒体中的多个基质。（A和B）传统薄片的电子显微照片显示，A中右下角的线粒体和B中左下角的线粒体中似乎包含多个基质区室。（C和D）根据分段电子断层图计算的三维模型视图。两者都显示线粒体至少有两个单独的基质室。外层膜呈半透明蓝色。（C）中的线粒体包含一个大的基质室，由一个呈白色的内界膜包围，其中一个大嵴呈红色，一个小嵴呈黄色，另外三个单独的膜室呈红色、洋红和绿色，与本节内的内界薄膜不相连；一个较小的单独矩阵隔间在顶部呈现为绿松石色。D中的线粒体包含一个较小的基质室，底部呈绿松石色，较大的基质室呈白色。后者包含另一个由红色和黄色的双层膜包围的大隔间。
