细胞生物学杂志。2006年9月25日;174(7): 1035–1045.
第条
IFT颗粒在秀丽线虫驱动蛋白II和OSM-3马达协同作用下的纤毛
,1 ,1 ,1 ,2 ,三,4 ,1 ,1 ,2 ,三,4和1
潘晓宇
1加州大学戴维斯分校遗传与发展中心分子与细胞生物学系,邮编95616
广硕欧
1加利福尼亚大学遗传与发展中心分子和细胞生物学科,加利福尼亚州戴维斯市戴维斯分校,邮编:95616
Gul Civelekoglu-Scholey公司
1加州大学戴维斯分校遗传与发展中心分子与细胞生物学系,邮编95616
奥利弗·布拉克
2加拿大不列颠哥伦比亚省伯纳比西蒙·弗雷泽大学分子生物学和生物化学系
尼古拉斯·F·恩德斯
三霍华德·休斯医学研究所和4加利福尼亚大学细胞和分子药理学系,加利福尼亚州旧金山市,邮编94107
李涛
1加利福尼亚大学遗传与发展中心分子和细胞生物学科,加利福尼亚州戴维斯市戴维斯分校,邮编:95616
亚历克斯·莫吉尔纳
1加利福尼亚大学遗传与发展中心分子和细胞生物学科,加利福尼亚州戴维斯市戴维斯分校,邮编:95616
米歇尔·勒鲁
2加拿大不列颠哥伦比亚省伯纳比西蒙·弗雷泽大学分子生物学和生物化学系
罗纳德·D·维尔
三霍华德·休斯医学研究所和4加利福尼亚大学细胞和分子药理学系,加利福尼亚州旧金山市,邮编94107
乔纳森·斯科利
1加利福尼亚大学遗传与发展中心分子和细胞生物学科,加利福尼亚州戴维斯市戴维斯分校,邮编:95616
1加利福尼亚大学遗传与发展中心分子和细胞生物学科,加利福尼亚州戴维斯市戴维斯分校,邮编:95616
2加拿大不列颠哥伦比亚省伯纳比西蒙·弗雷泽大学分子生物学和生物化学系
三霍华德·休斯医学研究所和4加利福尼亚大学细胞和分子药理学系,加利福尼亚州旧金山市,邮编94107
收到日期:2006年6月1日;2006年8月25日接受。
- 补充资料
【补充材料索引】
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摘要
纤毛的组装和功能秀丽隐杆线虫神经元依赖于两个驱动蛋白-2马达(异源三聚体驱动蛋白-II和同二聚体OSM-3-驱动蛋白)的作用,这两个马达协同作用,沿着微管(MT)加倍移动相同的鞭毛内转运(IFT)粒子。使用竞争性体外MT滑动分析,我们表明纯化的驱动蛋白II和OSM-3在没有任何额外调节因子的情况下协同产生类似于纤毛的运动。定量建模表明,这可能反映出一种交替动作机制,其中电机轮流沿MT移动,或一种机械竞争,在这种机制中,电机以协调一致的方式沿着MT移动,而慢速电机对快速电机施加阻力,反之亦然。在Bardet-Biedl综合征(BBS)蛋白和IFT运动突变体中进行的体内转运分析支持运动协调的机械竞争模型,在该模型中,IFT运动对IFT颗粒施加BBS蛋白依赖性张力,控制构建纤毛基础的IFT通路。
介绍
睫状体是一种基于微管(MT)的纳米机器,在运动、感觉感知和信号传递方面发挥着不同的作用,其功能障碍导致睫状体疾病(罗森鲍姆和威特曼,2002年;斯科利,2003;Pan等人,2005年;Badano等人,2006年;斯科利和安德森,2006年). 纤毛是由鞭毛内运输(IFT)马达构建和维持的,该马达将纤毛前体与称为IFT颗粒的蛋白质复合物(由亚复合物IFT-A和-B组成;科尔等人,1998年)从基底体到并入纤毛的部位(斯科利,2003). 了解IFT的机制以及这一过程中的缺陷如何导致睫状体疾病是目前人们非常感兴趣的话题。
一种可能反映IFT缺陷的睫状体病是Bardet-Biedl综合征(BBS),这是一种遗传异质性疾病,其特征是具有多效性表型,包括躯干肥胖症、色素性视网膜病、多指畸形、肾畸形、学习障碍、生育力低下和厌食症(Beales,2005年). 11个BBS基因的突变被认为会导致基底体或纤毛的缺陷,这可能是导致这种疾病的重要因素(Ansley等人,2003年;Blacque等人,2004年;Badano等人,2006年). 在秀丽隐杆线虫BBS蛋白控制在感觉神经元上构建纤毛的IFT马达,因此,秀丽线虫感觉纤毛是一个很有吸引力的模型,可以用来研究IFT的机制以及BBS蛋白在纤毛生物发生和疾病中的作用(Ou等人,2005年).
秀丽线虫双通道睫状体轴突由两个结构域组成:一个起始段(称为中段)包含从1μm长过渡区延伸的4μm长MT双链(一个修饰的基底体,也称为近段)它们共同构成纤毛基础和由2.5μm长MT单峰组成的远端(Perkins等人,1986年). 我们之前已经证明,组装这些感觉纤毛的IFT颗粒是通过两个称为驱动蛋白-II和OSM-3的顺行IFT马达的协调作用移动的,这两个马达都是驱动蛋白-2家族的成员(科尔等人,1993年;Shakir等人,1993年;Lawrence等人,2004年;斯诺等人,2004年). 这些电机具有冗余功能,可以沿着初始段移动相同的IFT粒子,并构建纤毛基础,其中一个电机对这一功能来说是不可或缺的(斯诺等人,2004年;Evans等人,2006年). 然后,在涉及OSM-3沿着这些远端单线运动的过程中,OSM-3单独在纤毛核心的远端延伸单线MT(Perkins等人,1986年;斯诺等人,2004年;Evans等人,2006年).
在这项研究中,我们关注的是驱动蛋白II和OSM-3是如何在功能上协调,以沿着角纹通道纤毛的起始段移动相同的IFT颗粒的。IFT比率见osm-3、klp-11、和kap-1型突变体表明,驱动蛋白II单独以0.5μm/s的速度沿着MT移动,而OSM-3单独以1.3μm/s移动。这也表明,野生型纤毛初始段(0.7μm/s)的中间运输速度是由两个马达的作用引起的(斯诺等人,2004年;Ou等人,2005年),但尚未使用体外运动试验测试纯化马达的MT运动速度。
一个相关的问题是BBS蛋白如何促进驱动蛋白-2马达的功能协调。在秀丽线虫BBS-1、-2、-3、-5、-7和-8被证明是纤毛蛋白(Blacque等人,2004年)其中,突变动物中BBS-7和-8功能的丧失导致了睫状体远端的缺失和感觉缺陷(Blacque等人,2004年). 使用体内转运分析,我们观察到,在野生型动物中,IFT颗粒亚复合物IFT-A和-B与驱动蛋白II和OSM-3以0.7μm/s的单一速率沿着起始段一起移动。然而论坛-7/-8突变体、驱动蛋白II和IFT-A以0.5μm/s的速度一起移动,而OSM-3-驱动蛋白和IFT-B以1.3μm/s速度作为一个独特的复合物移动。这表明BBS-7/-8蛋白通过将亚复合物IFT-A和-B保持在一起并稳定IFT颗粒的完整性来协调IFT(Ou等人,2005年). 这为探索BBS蛋白促进驱动蛋白II和OSM-3运动协调的机制提供了一个独特的系统。
The power of秀丽线虫作为一个解决这些问题的系统,如果体内IFT的延时显微镜检测将得到加强(Orozco等人,1999年)可以通过体外运动试验进行补充(Vale等人,1985年),但由于天然驱动蛋白-2马达的低丰度,这项研究尚未进行(Signor等人,1999年). 在这里,我们已经开始使用纯化的重组体进行体外检测秀丽线虫驱动蛋白II和OSM-3。
在本研究中,我们结合体内和体外驱动蛋白II和OSM-3的运动测定来确定(1)在纤毛中观察到的协同运动是否仅是马达的固有特性,还是取决于其他纤毛因子;(2) 两个IFT驱动蛋白合作移动IFT颗粒以冗余组装纤毛基底的机制是什么,运动合作是否有助于纤毛基底中IFT颗粒的分离论坛突变体;以及(3)我们是否能够开发出运动协调的定量模型,用于解释运动的体内和体外速度。结果阐明了两个相同极性的IFT电机合作沿纤毛移动IFT粒子的机制。
结果
纯化的驱动蛋白II和OSM-3的运动性
产生中间转运速率的运动协调是否是运动的固有特性,或者是否需要额外的睫状辅因子,可以使用纯化的驱动蛋白II和OSM-3混合物进行竞争性体外运动分析来解决这个问题。因为很难从秀丽线虫(Signor等人,1999年),我们使用杆状病毒和大肠杆菌过度表达和纯化重组驱动蛋白II(见下一段)和OSM-3的系统(; 参见第页的Imanishi等人。931我们寻求了这些制剂以体内实验预测的速率驱动运动的条件(斯诺等人,2004年).
重组体的制备和表征秀丽线虫驱动蛋白II和OSM-3。(A) Sf9细胞高速上清液(左)、塔龙柱洗脱液(中)和Sephacryl S-300纯化驱动蛋白II(右)的SDS凝胶。(B) 纯化驱动蛋白II和OSM-3的SDS凝胶。(C和D)在标准MT滑动分析中,驱动蛋白II–(C)和OSM-3(D)驱动的MT运动与[Mg-ATP]的双倒数图。(E) 在标准分析条件下,由驱动蛋白II(圆形)、OSM-3(方形)和OSM-3–G444E(三角形)驱动的MT滑动速度,但K浓度不同2-管道。误差条表示标准偏差。(F和G)在蔗糖密度梯度(F)和凝胶过滤柱(G)上,KLP-11、KAP-1和KLP-20亚基在KLP-11/KLP-20/KAP-1摩尔化学计量比为1.0:1.17:0.89的条件下以单分散异三聚体络合物(S值=9.8;Rs=7.1 nm;天然分子量=287 kD)洗脱(也显示了蛋白质标准峰位置)。
纯化的驱动蛋白II在蔗糖梯度上表现为单分散、异源三聚体复合物()和凝胶过滤柱()由1 mol的KLP-11、KLP-20和KAP-1亚单位组成,天然分子量为287 kD(补充材料和图S1,可在http://www.jcb.org/cgi/content/full/jcb.200606003/DC1). 这些流体力学性质与天然驱动蛋白II全酶的流体力学性质非常相似秀丽线虫提取物(Signor等人,1999年). 在MT滑行试验中,驱动蛋白II驱动的运动符合Michaelis-Menten动力学,其核苷酸图谱与驱动蛋白-1非常相似(科恩等人,1989年),表明Mg-ATP是驱动蛋白-2马达的首选底物(、补充材料和图S2)。
表一。
重组体动力学参数概述秀丽线虫驱动蛋白II和海胆驱动蛋白-1
基质或抑制剂 | 重组秀丽线虫驱动蛋白II | 海胆驱动蛋白-1 |
---|
Mg-ATP公司 | K(K)米=0.28±0.05毫伏最大值=0.26±0.01μm/s | K(K)米=0.063±0.034毫伏最大值=0.56±0.10μm/s |
管理-GTP | K(K)米=5.5毫伏最大值=0.058μm/s | K(K)米=1.9±0.8毫伏最大值=0.43±0.08μm/s |
Mg-ADP公司 | 竞争抑制剂K我=0.042毫米 | 竞争抑制剂K我=0.156±0.052毫米 |
Mg-ATP–γ-S一
| 竞争抑制剂K我=0.31米 | 竞争抑制剂K我=0.014±0.003毫米 |
圆周率 | 竞争抑制剂K我=4.4毫米 | 未知 |
Mg-AMPPCP公司 | 抑制剂-非竞争性抑制剂 | 抑制剂-非竞争性抑制剂 |
镁AMPPNP | 抑制剂-非竞争性抑制剂 | 抑制剂-非竞争性抑制剂 |
在标准条件下(在含有80 mM管道的BRB80中)进行的MT滑动分析中,我们观察到纯化的驱动蛋白II和OSM-3均根据Michaelis-Menten动力学使用Mg-ATP(). 然而,驱动蛋白II单独以0.3μm/s的最大速率移动MT,而OSM-3单独以0.7μm/s移动MT。虽然两个马达驱动的相对运动速率与体内转运分析一致,但在体外观察到的实际速率大约比在体内观察到的低两倍。因此,我们寻求支持体内观察到的转运速率的体外试验条件,并发现通过降低K2-观察到管道缓冲液浓度,其速率与体内试验预测的速率非常相似(; 另请参阅下一节)。
重组OSM-3是在活性同二聚体状态下纯化的,但当在抗体涂层表面上进行检测时,它显示出自动抑制并驱动低MT滑动速度(0.3μm/s),并且它可以通过甘氨酸残基444突变为谷氨酸而被激活(斯诺等人,2004年;Imanishi等人,2006年). 为了控制这种潜在的并发症,我们比较了野生型OSM-3在抗体涂层表面或直接涂层在盖玻片上驱动的MT滑动与不同Pipes浓度下的OSM-3–G444E突变蛋白的MT滑动()并观察到直接吸附的OSM-3和OSM-3–G444E均支持MT以1.1和0.97μm/s的相似速率滑动。我们得出的结论是,在我们的标准滑动试验中,直接吸附在盖玻片上会激活自抑制OSM-3,激活程度与诱变相同,因此,下一节中讨论的野生型OSM-3和OSM-3–G444E的试验均指活性状态。
纯化的驱动蛋白II和OSM-3–驱动蛋白相互作用,在MT滑动分析中产生中等运动率
基于上述结果,我们分析了在野生型OSM-3的45 mM管道和OSM-3–G444E的25 mM管道存在的情况下,由纯驱动蛋白II与OSM-3摩尔比不同的混合物驱动的基于MT的运动速度(和). 在这些优化条件下,驱动蛋白II仅以~0.5μm/s的速度移动,而OSM-3(野生型或G444E突变型)仅以~1.1μm/s移动(,,和视频1;可在获取http://www.jcb.org/cgi/content/full/jcb.200606003/DC1)与体内驱动蛋白II(0.5μm/s)和OSM-3(1.3μm/s(斯诺等人,2004年;Ou等人,2005年). 此外,这两种马达的混合物显示出中等的运动速率,其速率随摩尔比呈非线性变化,并且在OSM-3摩尔分数介于0.6和0.8之间时复制0.7μm/s的体内速率(,和视频1)。这表明,运动的中间速度,就像沿着纤毛初始段观察到的速度一样,可以通过驱动蛋白II和OSM-3之间的简单功能性相互作用产生,而不需要额外的纤毛因子,例如运动调节器、作为货物与马达结合的IFT颗粒的存在、,上覆的睫状膜,或纤毛特异性轴突MT双倍体,用作马达的轨道。
表二:。
野生型OSM-3和OSM-3–G444E突变体与驱动蛋白II竞争运动分析中的MT滑动速度
参数 | 每次分析的值 |
---|
Kinesin-II和OSM-3 | | | | | | | | | | | |
激肽-II(μM) | 0 | 0.29 | 0.56 | 1 | 1.67 | 2.50 | 3.33 | 4 | 4.44 | 4.71 | 5 |
OSM-3(微米) | 5 | 4.71 | 4.44 | 4 | 3.33 | 2.50 | 1.67 | 1 | 0.56 | 0.29 | 0 |
OSM-3的摩尔分数(%) | 100 | 94 | 89 | 80 | 67 | 50 | 33 | 20 | 11 | 6 | 0 |
平均速度(μm/s) | 1.075 | 0.998 | 0.906 | 0.705 | 0.615 | 0.540 | 0.476 | 0.415 | 0.347 | 0.348 | 0.343 |
标准偏差(μm/s) | 0.148 | 0.083 | 0.069 | 0.052 | 0.047 | 0.025 | 0.030 | 0.051 | 0.039 | 0.036 | 0.052 |
MT计数 | 55 | 63 | 57 | 74 | 59 | 74 | 63 | 58 | 53 | 49 | 30 |
Kinesin-II和OSM-3–G444E | | | | | | | | | | | |
Kinesin II(μM) | 0 | 0.29 | 0.56 | 1 | 1.67 | 2.50 | 3.33 | 4 | 4.44 | 4.71 | 5 |
OSM-3–G444E(微米) | 5 | 4.71 | 4.44 | 4 | 3.33 | 2.50 | 1.67 | 1 | 0.56 | 0.29 | 0 |
OSM-3–G444E的摩尔分数(%) | 100 | 94 | 89 | 80 | 67 | 50 | 33 | 20 | 11 | 6 | 0 |
平均速度(μm/s) | 0.973 | 0.995 | 0.869 | 0.754 | 0.684 | 0.603 | 0.564 | 0.537 | 0.493 | 0.490 | 0.488 |
标准偏差(μm/s) | 0.162 | 0.180 | 0.159 | 0.204 | 0.077 | 0.096 | 0.086 | 0.052 | 0.078 | 0.076 | 0.043 |
MT计数 | 55 | 66 | 66 | 68 | 73 | 71 | 61 | 66 | 71 | 50 | 67 |
两个顺行IFT驱动蛋白的功能协调模型
驱动蛋白II和OSM-3协同驱动MT运动的中间速率取决于它们的摩尔比,这一观察结果可以用两种模型来解释,如补充材料中详细描述的那样。在第一个模型,即交替动作模型中,我们建议电机按顺序动作,以便由OSM-3驱动的快速步或几次快速步与驱动蛋白II执行的慢速步或慢速步交替(图S3 a,可在http://www.jcb.org/cgi/content/full/jcb.200606003/DC1). 两个电机的周期性切换将平均,以产生在体外和沿纤毛观察到的中等运动速度。在第二个模型,即机械竞争模型中,电机以协调一致的方式同时工作,运动较慢的驱动蛋白II对速度较快的OSM-3施加阻力,而速度较快的OSM-3拉动驱动蛋白-II并使其加速(图S3 B)。我们开发了定量交互作用和机械竞争模型,从中我们导出了运动速度与两个电机摩尔分数(补充材料)之间的关系式。我们观察到,通过合理的参数调整,从两个模型导出的方程与MT滑动速度与OSM-3摩尔分数曲线图中的数据点非常吻合()因此,这两个模型可以解释滑动分析数据和沿野生型纤毛观察到的IFT颗粒转运速率,klp-11型、和锇-3动物(见讨论)。因此,从我们的定量建模中得出的一个重要结论是,交替动作和机械竞争模型都非常合理,但这种分析本身并不能让我们决定交替动作或机械竞争是更可能的运动协调机制。
然而,交替作用和机械竞争模型确实对缺乏BBS蛋白和驱动蛋白II或OSM-3的双突变体中IFT颗粒的转运做出了明确的预测(论坛;klp-11型,论坛;kap-1型,或bbs;锇-3突变体)。让我们考虑一下为什么IFT粒子亚复合物A和B在野生型中以0.7μm/s的速度沿纤毛的初始段一起移动,而在论坛突变体,IFT-A明显被驱动蛋白II以0.5μm/s的速度移动,而IFT-B被OSM-3以~1.1–1.3μm/s移动(Ou等人,2005年). 我们假设BBS蛋白稳定完整的IFT颗粒,因此在论坛功能缺失突变体。虽然这种离解可能是被动的,但我们推断,如果低速电机对快速电机施加阻力,则它可能是一个主动过程,由驱动蛋白-II和OSM-3电机协同作用对IFT粒子施加的应力导致IFT粒子一起移动,反之亦然,如机械竞争模型(补充材料)。这种应力不能像在交替作用模型中那样由电机顺序作用产生,因为在任何时候只有一种类型的电机会移动颗粒(补充材料)。此外,如果在论坛单个突变体需要驱动蛋白II和OSM-3之间的机械竞争,其中一个运动和BBS蛋白功能的丧失,如论坛;驱动蛋白-2双突变体,应防止IFT颗粒离解。基于这些论点,交替动作模型预测论坛;驱动蛋白-2突变体,IFT颗粒将被动分解为IFT-A和-B,其中只有一个沿着纤毛移动(). 另一方面,机械竞争模型预测,在没有竞争发动机协同作用对IFT颗粒施加张力的情况下,IFT颗粒应保持完整().
显示BBS蛋白对抗驱动蛋白II和OSM-3之间的机械竞争以维持IFT颗粒完整性的模型。(A) 演示两个模型预测的不同表型bbs-;发动机双突变体。交替动作模型预测bbs-;klp-11型双突变体,IFT-A不能被驱动蛋白II或OSM-3-驱动蛋白移动,也不会进入纤毛,因此IFT-A会在截断纤毛的末端形成聚集体,模仿IFT-A突变体的表型。另一方面,在bbs-;锇-3双突变体IFT-B不能被驱动蛋白II或OSM-3移动,睫状体长度减少。相比之下,机械竞争模型预测bbs-;klp-11型或bbs-;锇-3双突变体,两个马达之间不会有机械竞争,也不会通过IFT颗粒施加阻力,因此即使没有BBS蛋白,IFT颗粒也可以维持在单个复合物中,并且a和B亚复合物将显示相同的运输曲线。(B) 测试预测的运输分析结果摘要(). 在野生型(WT)中,BBS蛋白通过对抗驱动蛋白II和OSM-3之间的机械竞争来维持IFT颗粒的完整性。在bbs-7/-8单个突变体,驱动蛋白II和OSM-3之间的机械竞争不能被BBS蛋白抵消,因此IFT颗粒分解为亚复合物A和Bbbs-7/-8;驱动蛋白II或bbs-7/-8;锇-3双突变体,不产生机械竞争,所以IFT颗粒不离解,而是由驱动蛋白II或OSM-3单独移动。
通过体内转运试验测试模型论坛;驱动蛋白-2双突变体
我们通过分析IFT和检测睫状体表型来测试上述模型预测bbs-7/-8;klp-11型和bbs-7/-8;锇-3双突变体。具体地说,我们用CHE-11 GFP标记IFT-A和CHE-2 GFP或OSM-6 GFP,制作了双突变株来追踪IFT-B。在野生型动物中,正如我们之前所证明的那样,CHE-11 GFP和CHE-2中GFP沿着感觉纤毛的起始段和远端移动相同(),但在bbs-7频道单个突变体(),IFT粒子A和B分离并分别移动(Ou等人,2005年). 然而,重要的是bbs-7/-8;klp-11型双突变体(;、视频2和4;可在获取http://www.jcb.org/cgi/content/full/jcb.200606003/DC1),CHE-11|GFP进入远端节段并以与CHE-2|GFPs或OSM-6|GFP-s相同的速度运动,这是OSM-3驱动蛋白沿起始和远端节段快速运动的特征。在bbs-7/-8;锇-3双突变体(;,以及视频3和5),CHE-2|GFP和OSM-6}GFP都进入剩余的初始片段,并被驱动蛋白II以其特有的缓慢速度移动。
IFT颗粒亚复合物A和B在bbs-7频道单身和bbs-7频道或bbs-8;驱动蛋白-2双突变体。沿感觉纤毛分布的IFT-A亚复合物(CHE-11|GFP)和-B亚复合物的显微照片(A、B、E、G、I和K中的CHE-11}GFP;C、D、F、H、J和L中的CHE-2|GFP-以及M–O中的OSM-6|GFP.)。E–O(右)中的Kymograph图和相应图显示了代表沿初始段(M和M′)和远端段(D和D′)运动轨迹的对角线。箭头指向初始直径段连接。在野生型(wt)动物(A和C)中,CHE-11|GFP和CHE-2}GFP沿起始和远端节段移动相同。在bbs-7频道突变体(B和D)、IFT-A和-B分离,CHE-11|GFP仅在起始段内移动,CHE-2|GFP沿起始段和远端段移动。在klp-11;bbs-7频道或论坛-8双突变体CHE-11、CHE-2、GFP和OSM-6沿着起始段和远端(E、F、I、J和M)以OSM-3驱动蛋白的快速运动。在osm-3;bbs-7频道或论坛-8双突变体CHE-11、CHE-2、GFP和OSM-6在剩余的起始片段(G、H、K、L和N)中以驱动蛋白II的缓慢速率移动。OSM-6|GFP以OSM-3的快速速度移动klp-11型突变体(O)。与中不同论坛单个突变体,IFT颗粒是稳定的,在bbs-7频道或bbs-8;驱动蛋白-2双突变体。
表三。
顺行运动 | | 平均速度
|
---|
| 应变 | 初始段 |
n个
| 远端段 |
n个
|
---|
| | μ米/秒
−1
| | μ米/秒
−1
| |
IFT-A公司 | | | | | |
CHE-11|GFP | 野生型一
| ∼0.70 | | ∼1.30 | |
|
bbs-7频道或论坛-8
一
| ∼0.50–0.60 | | 无 | |
|
bbs-7;锇-3
| 0.56 ± 0.06 | 103 | 无 | |
|
bbs-8;锇-3
| 0.52 ± 0.05 | 110 | 无 | |
|
bbs-7;klp-11型
| 1.27 ± 0.16 | 103 | 1.34 ± 0.17 | 107 |
|
bbs-8;klp-11型
| 1.26 ± 0.19 | 101 | 1.34 ± 0.19 | 104 |
IFT-B公司 | | | | | |
CHE-2|GFP | 野生型一
| ∼0.70 | | ∼1.30 | |
|
bbs-7频道或论坛-8
一
| ∼1.10–1.30 | | ∼1.30 | |
|
bbs-7;klp-11型
| 1.30 ± 0.18 | 107 | 1.35 ± 0.18 | 102 |
|
bbs-8;klp-11型
| 1.22 ± 0.17 | 110 | 1.28 ± 0.16 | 104 |
|
bbs-7;锇-3
| 0.51 ± 0.07 | 105 | 无 | |
|
bbs-8;锇-3
| 0.55 ± 0.06 | 102 | 无 | |
OSM-6|GFP | 野生型b条
| ∼0.70 | | ∼1.30 | |
|
锇-3
b条
| ∼0.50 | | 无 | |
|
klp-11型
| 1.28 ± 0.15 | 107 | 1.33 ± 0.15 | 106 |
|
bbs-7频道
| 1.18 ± 0.17 | 104 | 1.32 ± 0.19 | 101 |
|
bbs-7;锇-3
| 0.55 ± 0.07 | 109 | 无 | |
|
bbs-7;klp-11型
| 1.28 ± 0.16 | 100 | 1.22 ± 0.17 | 101 |
因此,我们观察到以下情况:(1)bbs-7/-8;klp-11型和bbs-7/-8;锇-3双突变体的表型与klp-11型和锇-3突变体。特别是bbs-7/-8;klp-11型双突变体几乎有全长纤毛,这与klp-11型突变体和论坛-7/-8;锇-3双突变体有截短的纤毛,类似于锇-3突变体。(2) 不同于bbs-7/-8单个突变体,在bbs-7/-8;klp-11型和bbs-7/-8;锇-3双突变体,IFT颗粒保持完整,IFT-A和-B亚复合物以相同的速度一起移动,这分别是OSM-3或驱动蛋白II的特征(和).
这些结果支持了机械竞争模型的预测(). 因此,我们建议在野生型秀丽线虫,IFT颗粒通过驱动蛋白II和OSM-3沿着感觉纤毛移动——驱动蛋白共同作用,移动较慢的驱动蛋白-II对移动较快的OSM-3施加阻力,而移动较快的OSM-3则倾向于拉动移动较晚的驱动素-II(). 这产生了一种机械竞争,转化为IFT颗粒之间的张力,导致它们在没有BBS蛋白的情况下分离(,论坛突变体)。因此,BBS-7和-8蛋白通过稳定IFT-A和IFT-B的结合来对抗这种张力并保持IFT颗粒的完整性(,野生型[WT])。相反,在bbs-7频道或-8单一突变体,这种稳定性丧失,运动依赖性应激使亚复合物A和B解离,亚复合物A和B分别被驱动蛋白II或OSM-3移动(). 在论坛;驱动蛋白-2然而,双突变体中,剩余的运动蛋白-2运动缺乏其拮抗性伴侣,因此不存在将IFT-A与IFT-B分离所需的压力。因此,IFT颗粒通过驱动蛋白II或OSM-3-驱动蛋白单独沿着纤毛完整移动(,论坛;klp-11型和论坛;锇-3).
讨论
BBS蛋白在IFT颗粒稳定性和运动协调中的作用
在这个模型中,BBS蛋白通过维持驱动蛋白II–IFT-A与OSM-3–IFT-B的结合来协调马达,否则由于两个马达施加的张力(例如论坛突变体)。在滑动分析中,不需要BBS蛋白,因为盖玻片在相邻的驱动蛋白II和OSM-3蛋白之间形成物理连接。我们的模型假设IFT亚复合物A和B通常相互作用形成单个IFT颗粒复合物,该颗粒复合物通过驱动蛋白II和OSM-3沿着野生型纤毛移动(它们可能分别沿着MT A和B亚纤维移动;Ou等人,2005年). 然而,尽管IFT颗粒从莱茵衣藻鞭毛(可能缺乏BBS蛋白)以16-S复合物的形式沉淀,它们也可以通过改变溶液条件来分离,这增加了IFT-a和-B在体内通常作为单独的复合物存在的可能性(科尔等人,1998年;秦等,2004). 例如,我们之前的数据可以解释,如果在野生型中,驱动蛋白II–OSM-3–IFT-A和驱动蛋白II–OSM-3–IFT-B的单独复合物沿着纤毛的初始段以相同的速度移动,需要BBS蛋白将OSM-3连接到驱动蛋白II–IFT-B复合物上,并将驱动蛋白II连接到OSM-3–驱动蛋白II复合物上(Ou等人,2005年). 然而,这预示着论坛;驱动蛋白II和论坛;锇-3双突变体IFT-A和-B根本不会沿着纤毛移动,这与我们的IFT分析不一致。还需要更多的工作来确定IFT-A和-B在体内正常相互作用形成单一转运复合物。
虽然在同时使用驱动蛋白II和OSM-3进行纤毛发生的系统中,BBS蛋白似乎是稳定IFT颗粒所必需的,但在驱动蛋白Ⅱ单独起作用的生物体中(例如,C.莱因哈迪),缺乏双电机依赖的机械竞争,因此IFT颗粒应在论坛突变体和BBS蛋白可能不需要。事实上,BBS-7/-8蛋白在C.莱因哈迪鞭毛(Pazour等人,2005年)虽然在交配过程中,它们有可能与OSM-3一起进入鞭毛并拉长远端单核细胞(Mesland等人,1980年). 在脊椎动物中,OSM-3同源物KIF17需要靶向纤毛的环核苷酸门控通道(Jenkins等人,2006年). 此外,在秀丽线虫感觉纤毛存在于各种生物中(例如人类[Moran等人,1982年]和青蛙嗅纤毛[里斯,1965年])和环状核苷酸门控通道聚集在后纤毛远端段的一个区域(Flannery等人,2006年). 有趣的是,BBS基因敲除小鼠(BBS-1、-2和-4)特异性地失去了嗅纤毛的远端,从而导致嗅觉障碍(Kulaga等人,2004年;Mykytyn等人,2004年;Nishimura等人,2004年). 因此,BBS蛋白可能对包含纤毛的远端节段的IFT有特殊贡献,其中使用了两个顺行IFT马达。IFT电机之间的BBS蛋白依赖性机械竞争,于秀丽线虫感觉神经元,可能与某些脊椎动物中类似的两区纤毛的组装有关,而这一过程中的缺陷可能是BBS的基础。
与其他运动协调系统的相关性
反极性有丝分裂MT马达之间的拮抗竞争已被广泛讨论(Sharp等人,2000年),相同极性电机之间的功能交互也有先例。例如,在肌肉中,较慢的自行车跨线桥会对较快的自行车桥产生阻力,从而减缓肌肉缩短的最大速度(Warshaw等人,1990年). 还表明,电机可以通过在电机驱动的MT滑动方向上施加的力来加速(Coppin等人,1997年). 此外,我们提出的机制的生物物理合理性得到了实验的支持,在这些实验中,具有不同速度的正向驱动蛋白马达被证明在运动测定中相互作用以产生中等速度,包括驱动蛋白-1和-5(Crevel等人,2004年)以及混合的Kif3A和Kif3B同二聚体(张和汉考克,2004). 引人注目的研究张和汉考克(2004)阐明了不同的Kif3A和Kif3B运动域如何在加工型驱动蛋白-II全酶中合作,但驱动蛋白-1与驱动蛋白-5之间的竞争以及Kif3A-Kif3B同源二聚体之间的竞争不太可能反映真实的体内相互作用。据我们所知,我们的研究首次揭示了不同的、相同极性的基于MT的细胞内运输运动全酶之间的竞争运动性,这些酶在体内可以协同工作。
该系统不同于存在于黑素小体上的驱动蛋白II和细胞质动力蛋白之间的受控协调(Rogers等人,1997年)和其他货物(Kural等人,2005年)顺行和逆行运动的同时激活和抑制(反之亦然)有助于顺行和顺行方向的交替跑步(Mallik和Gross,2004年). 这里提出的相同极性IFT马达的独特机械竞争可能代表了另一种普遍的方式,即马达被协调和控制,以在真核细胞内产生细胞内运输的相干网络。
模型预测
定量机械竞争模型做出了可测试的预测。例如,驱动蛋白II和OSM-3的空载速度,和,但它们的失速力比γ是一个未知的自由参数(补充材料)。通过调整γ并将所得曲线与滑动试验数据进行比较,我们发现当OSM-3与驱动蛋白-II失速力之比为
这表明驱动蛋白II和OSM-3在类似的力下失速,这可以在未来的实验中进行测试。我们还可以通过结合(1)失速力比(γ=0.98),(2)两个电机的空载速度来估算IFT粒子上OSM-3和驱动蛋白II的摩尔比(和)和(3)由两个电机的协同作用驱动的IFT颗粒传输速度(v(v)
货物=0.72μm/s,得出C=1.25)。这导致了以下预测:在体内,OSM-3的摩尔分数为α≈0.45,反映了纤毛初始段内IFT颗粒上两个马达的近似等摩尔比。对孤立的马达-IFT颗粒复合物的分析可以让我们测试这一预测。
总的来说,这项工作阐明了两个顺行IFT马达如何合作,以介于每个马达单独的自由滑动速率之间的速率沿着轴丝的初始段移动IFT颗粒,从而在树突末端建立纤毛基础秀丽线虫感觉神经元。
材料和方法
Sf9细胞重组驱动蛋白Ⅱ的纯化
感染含有这三个基因的杆状病毒的Sf9细胞klp-11型,klp-20型、和kap-1型编码驱动蛋白II的蛋白表达了足够数量的相应亚单位,从而能够以单分散的活性状态高效地纯化异源三聚体复合物(). 为此,PCR扩增包含KAP-1、KLP-11和KLP-20的cDNA序列(GenBank/EMBL/DDBJ登录号。NM_001026075号,NM_171407、和NM_064777分别插入Gateway载体pDONR221(Invitrogen)并克隆到目标载体pDEST8(Invit罗gen)中,并根据制造商的说明生成重组杆状病毒。然后将感染细胞在27°C下培养3天,然后再收获。
将来自400 ml培养物的细胞颗粒悬浮在80 ml冰镇裂解缓冲液中,该缓冲液含有50 mM管道,pH 7.0,300 mM NaCl,1 mM MgCl21 mM 2-巯基乙醇和不含EDTA的蛋白酶抑制剂混合物(罗氏),并以每平方英寸1000磅的速度两次通过法国压力机。细胞裂解液在15000下离心30分钟克和4°C。根据制造商的说明,使用泰龙亲和珠(BD Biosciences)纯化上清液。用含有80 mM管道、pH 6.9、200 mM NaCl、1 mM MgCl的凝胶过滤柱缓冲液对泰龙纯化蛋白进行透析21 mM EGTA、1 mM DTT和0.1 mM ATP。在凝胶过滤缓冲液中的柱(Sephacryl S-300HR;GE Healthcare)上进一步纯化驱动蛋白-II复合物,并用Centriprep 30K(Amicon)超滤浓缩。这个简单的塔龙柱亲和性程序,随后是Sephacryl S-300凝胶过滤色谱,每400 ml起始材料常规产生2 mg高纯度驱动蛋白II(和图S1 A)。我们估计,我们需要从4000升混合阶段蠕虫培养物(即10000倍以上的起始材料)开始,以同等数量纯化驱动蛋白II(Signor等人,1999年).
运动性分析
如前所述,在21°C下进行MT运动试验(科恩等人,1989年). 对每个数据点测量了10–60 MT的速度。
荧光显微镜
如前所述对IFT进行分析(斯诺等人,2004年;Ou等人,2005年). 将GFP转基因蠕虫用10mM左旋咪唑麻醉,安装在琼脂垫上,并保持在21°C。我们使用配备100×NA 1.35物镜和旋转圆盘共焦头(UltraVIEW;PerkinElmer)的显微镜(IX70;Olympus)采集图像,488氩离子激光器以0.3 s/帧的速度激发2–3分钟。所有图像均使用冷却电荷耦合器件相机(ORCA-ER;哈马松)采集,并且使用MetaMorph软件(Universal Imaging Corp.)创建kymographs和视频。
创建和维护论坛和运动突变动物
转基因动物表达che-11|gfp,che-2|gfp、和osm-6|gfp与bbs-7/osm-12(n1606),bbs-8(nx77)和klp-11(tm324),或渗透压-3(p802)创建双突变体,其基因型通过其染色表型和/或PCR进行确认。
在线补充材料
补充材料提供数据(1)支持净化秀丽线虫驱动蛋白II是一种单分散的异源三聚体复合物,其运动符合迈克尔逊动力学,(2)描述了两个顺行IFT驱动蛋白功能协调的定量模型。图S1显示了Sf9细胞提取物中异源三聚体驱动蛋白II的纯化和流体力学分析。图S2显示了纯化蛋白的运动活性的Michaelis-Menten分析秀丽线虫在存在和不存在核苷酸底物和抑制剂的情况下,运动蛋白II。图S3显示了交替作用和机械竞争模型,解释了驱动蛋白II和OSM-3–驱动蛋白沿感觉纤毛的共同运动。图S4显示了仅使用驱动蛋白II或OSM-3以及两个马达的混合物以及滑动速度与摩尔分数的关系获得的运动分析数据。视频1显示了由纯化的驱动蛋白II、纯化的OSM-3和两种马达的混合物诱导的MT滑翔的体外分析。视频2-5显示了IFT颗粒蛋白沿双突变菌株的感觉纤毛运动的体内转运分析bbs-7(n1606);klp-11(tm324)和bbs-7(n1606);渗透压-3(p802)。在线补充材料可在http://www.jcb.org/cgi/content/full/jcb.200606003/DC1.
致谢
我们感谢W.O.Hancock博士和J.J.Snow博士的有益讨论。
这项工作得到了美国国立卫生研究院(J.M.Scholey和R.D.Vale)和加拿大卫生研究所(M.R.Leroux)的资助。
笔记
X.Pan和G.Ou为本文做出了同等贡献。
本文中使用的缩写:BBS,Bardet-Biedl综合征;IFT,鞭毛内转运;MT,微管。
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