图3

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利用ENCODE拼接阵列识别KAP1结合位点

(A) 使用针对不同KAP1表位的两种抗体(兔多克隆,r-KAP1和鼠单克隆,m-KAP1)在Ntera2细胞中进行ChIP-ChIP分析。使用Tamalpais峰呼程序确定了两个KAP1结合位点(一个位于Enm005顶面板,另一个位于Enr132底面板)[37].

(B) 使用第三个生物复制的扩增子,使用兔KAP1抗体,对ENm005和ENr132区域中两个确定的KAP1结合位点进行PCR分析。与总染色质DNA相比,KAP1和H3me3K9富集。IgG扩增子作为阴性对照进行分析。