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EMBO J。2006年10月18日;25(20): 4888–4896.
2006年10月12日在线发布。 数字对象标识:10.1038/sj.emboj.7601353
PMCID公司:PMC1618090型
PMID:17036054

分裂酵母中微管解聚可驱动染色体极性运动

关联数据

补充资料

摘要

前中期动粒与纺锤体微管相互作用,建立染色体双向定向。在变成双向性之前,染色体经常表现出极向运动(P运动),这通常归因于负向终向、依赖于MT-的马达。在裂变酵母中有三个这样的马达:动力蛋白和两个驱动蛋白14s,Pkl1p和Klpp。这些酶都不是生存所必需的,即使是三重缺失也生长良好。这可能是因为酵母的动粒在有丝分裂开始时通常是并排的,因此在前中期不需要向两极移动染色体。在显著伸长的纺锤中,后期P运动也可能是不必要的。为了验证这一假设,我们分析了动粒-极连接分散的细胞的动粒动力学。在从这种情况下恢复的细胞中,任何或所有这些马达的缺失都不影响极向动粒运动的最大速率,这强烈表明其他因素,如MT解聚,也可以引起这种运动体内然而,定位于动粒的Klpp通过促进动粒纤维的缩短而促进了P运动的有效性。

关键词:β-管蛋白突变体、动力蛋白、电子断层扫描、动粒、驱动蛋白-14

介绍

在有丝分裂期间,姐妹染色单体必须均匀分离,以确保子细胞健康。分离的保真度部分取决于在不同有丝分裂阶段驱动染色体运动的不同因素(麦金托什, 2002;马亚托, 2004). 脊椎动物细胞有丝分裂开始时,动粒与纺锤体极的距离不同。当它们第一次接触极性微管(MT)时,动粒通常与MT的外侧表面相互作用(里德和亚历山大,1990年). 随后沿MT壁发生极向运动(P运动),可能由“负端”电机驱动,如dynein(萨瓦语, 2000;夏普, 2000),尽管驱动蛋白-14家族的马达也有可能做出贡献(田中, 2005). 随后,与动粒相关的MT重新排列,使其正末端嵌入动粒中。此后,动粒运动必然伴随着动粒MT的缩短或伸长,因此MT解聚也可能对动粒P运动产生动力(科什兰, 1988;洛姆比略, 1995;格里修克, 2005).

纺锤体形成过程中动粒-线粒体关联的复杂性和大量参与因素使得很难评估每个可能因素在多细胞真核生物分裂过程中的作用。最近,在芽殖酵母中研究了极性定向染色体运动酿酒酵母通过创造一种人工条件,使一个动粒远离有丝分裂纺锤体(田中, 2005). 在这个系统中,就像脊椎动物有丝分裂一样,一个遥远的动粒通过在MT表面上滑动而向极点移动。来自六种驱动蛋白和一种动力蛋白酿酒酵母只有Kar3p,一种驱动蛋白14,对观察到的运动有贡献。然而,即使在它不存在的情况下,这场运动仍在继续,但它的进程没有那么快(田中, 2005).

在裂变酵母中葡萄裂殖酵母驱动蛋白14家族有两个成员,其中任何一个都可能影响P运动。两者都被证明有助于MT组织,但其确切的有丝分裂功能尚不清楚(皮杜, 1996;特罗塞尔, 2001;卡拉佐-萨拉斯, 2005). Dynein,Dhclp,是这个角色的另一个候选者,尽管它对裂变酵母的营养生长没有贡献(山本, 1999). 为了研究每种负端运动酶在动粒P运动中的作用,我们利用了S.pombe公司β-微管蛋白基因,nda3-KM311(平冈, 1984;神户, 1990). 如同在萌芽酵母中一样,S.pombe公司在核膜内分离其染色体,其三条间期染色体的动粒通常与中心体或“纺锤极体”(SPB)有关(船曳, 1993). 什么时候?nda3-KM311细胞在18°C下生长,线粒体被可逆破坏,动粒经常失去与SPB的连接。在这里,我们表明这些分离的动粒可以被检索,也就是说,它们与一个极重新建立联系,然后是双向的,因此姐妹动粒与从姐妹极生长的MT结合。在检索过程中,即使没有每一个或所有这些电机,P运动也可以快速而有力。这些实验首次证明了这种运动可以发生体内在没有负向马达的帮助下,我们提出它们可以通过MT解聚来驱动。

结果

在MT暂时中断期间,葡萄球菌的有丝分裂动粒经常从SPB上脱落

在20°C下培养10小时,数据采集3细胞失去可见的MT并在染色体高度浓缩的前中期积累(平冈1984年;神户, 1990). 有时,染色体仍聚集在SPB附近(补充图1a和b),但在大约一半的细胞中,浓缩的染色体变得分散,并作为不同大小的DAPI染色物体出现(图1A;补充图1c–g). 重复的SPB也可能分离,尽管很少;一些人保留了与动粒的联系,但其他人则失去了联系。分离的染色体显示出一个带有动粒特异标记Mis12p的单点染色(补充图1d和e)或者,不太常见的是两个较暗的点,它们对应于姐妹动粒(补充图1f). 我们通过对第2染色体上的着丝粒连锁标记进行染色,证实了这些染色体在a-有丝分裂中分散,并代表未分离的姐妹染色单体。正如所料,此标记仅与三个Mis12p点中的一个相关联(补充图1g). 与公布的结果一致(平冈, 1984;神户, 1990)如抗微管蛋白免疫荧光、微管蛋白绿色荧光蛋白(GFP)活细胞成像或电子显微镜(EM)(补充)所示,这些细胞不含MT。因此,当MT缺失时,染色体可能会因热运动而分散。偶尔,这样的运动会导致核膜破碎。随后的有丝分裂很容易出错(补充);因此,我们将动粒P运动的研究重点放在三条染色体都靠近SPB的细胞上,尽管它们的动粒在阻滞期间已经分散。

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成功检索到“丢失”的动粒并进行双向定位。(A类)在18°C时,细胞被聚集在一起的浓缩染色体(“浓缩染色体”)阻止。在许多这样的细胞中,至少有一个动粒失去了与SPB的连接(“失去动粒”),有些细胞分离了SPB。除非另有说明,误差条是平均值的标准误差(s.e.m.),在手稿中处处有95%的置信度。(B类D类)有丝分裂的进展通过固定培养物来监测,培养物在移到32°C后的指定时间取样并进行免疫染色。控制黑圈,pkl1系列Δ-白色圆圈,千帕2Δ-白色方块,dhc1型Δ-黑色方块。(B)和(D)中的数字被标准化为时间0时的百分比。(B) 至少有一个动粒既不靠近SPB,也不位于分离SPB之间的线上的细胞百分比(参见E(a–d)). (C) SPB分离的细胞百分比,所有动粒位于SPB之间的线上,即单向或双向(参见E,e–g公司). (D) 聚集在一起的染色体浓缩的细胞百分比。控制与任一项之间的偏差千帕2Δ或pkl1系列Δ细胞具有统计学意义(P(P)<0.05),但dhc1型Δ和对照细胞无法区分。(E类)在换班后3–10分钟,同步培养的代表性图像得到修复。棒材:2μm。(F类)选定的图像数据采集3细胞从冷块中恢复时,表现出动粒恢复和双向性。

MT聚合后,分离的动粒返回极点并成为双向的

被捕时数据采集3将细胞恢复到32°C,其MT在几分钟内聚合;然后SPB分离,细胞进行有丝分裂(平冈, 1984;神户, 1990). 为了研究纺锤形线粒体“恢复”“丢失的”动粒的过程,我们通过免疫染色分析了这些细胞在有丝分裂过程中的进展(图1). 动粒丢失率迅速下降(τ1/2~10分钟),从最初的81%(图1A和B). 伴随着动粒-SPB的重新结合,位于SPB之间的动粒百分比暂时增加(图1C和E). 在移到32°C大约6分钟后,细胞开始退出有丝分裂(τ1/2~19分钟),根据染色体密集聚集的细胞百分比下降判断(图1D). 到40分钟时,80%以上的细胞已经退出有丝分裂,并成功回收分离的动粒。因此,MT聚合开始后,丢失的动粒首先被拉到分离的极点(图1E(b–d)); 然后它们是双向的,然后进入后期(图1E(e–g)),行为与正常脊椎动物有丝分裂中发现的行为惊人相似。

通过观察带有GFP标记的中心体和着丝粒的活细胞中2号染色体的两极和动粒,验证了这一结论(见材料和方法)。在限制温度下,分离的SPB和动粒经历了看似随机的运动(补充视频1). 动粒经常一分为二,这表明姐妹染色单体的短暂分离,可能是由于热运动和染色质粘弹性。在转换到允许温度后,SPB在2.9±0.3分钟内分离(N个=41). 约7.0±1.7分钟后(N个=30),标记的动粒被拉向其中一个极点(图1F). 双定向(定义为动粒第一次大致位于SPB之间的中间位置)发生6.9±0.7 min(N个=17)动粒到达SPB后。在到达极点之前,动粒经常从其方向旋转,使其现在面向相反的极点。到换班后30分钟,约2/3的细胞出现后期反应。因此,实时成像和免疫荧光的结果完全一致。它们共同证明,失去的动粒可以成功地向两极和双向移动。据推测,在正常有丝分裂过程中也会发生类似的运动,尽管距离更短。

动粒-MT附着的稳定性和随后运动的过程性提高了动粒检索的效率

然后我们询问了这个动粒检索过程的有效性。随着分离的动粒和两极之间距离的增加,回收时间略有增加(补充图2A,红色曲线);在与裂变酵母细胞核直径相当的距离上,回收的动粒较少(补充图2B). 然而,约80%的“丢失”动粒在15分钟内被拉到极点,只要它们分散在极点<1.6μm处。因此,MT捕获和动粒检索在这些距离上是有效的。

将SPB与可回收的动粒连接起来的MT很短,无论是通过抗管蛋白的免疫荧光还是在含有微管蛋白-GFP的活细胞中,都很难对其进行可视化(补充)。为了避免这些困难并获得更多关于动粒检索动力学的信息,我们收集了两极和动粒的三维(3D)坐标。使用自定义计算机程序分析所得数据(见材料和方法)。例如,图2A以2D图像的形式显示相对于极点(绿色圆圈)的连续动粒位置(红色X与线相连),显示在包含这三个对象的平面中。在寒冷(红线)时,动粒运动呈现随机性(补充视频2); 其位置在平均值附近波动,标准偏差(s.d.)为0.318μm。移到32°C大约6分钟后,动粒的运动朝向其中一个极点(图2A,蓝线)。拟合到这部分轨迹的直线的标准差为0.077μm,明显小于根据相同数据拟合到连续随机运动假设(0.544μm)而确定的标准差;这一阶段的运动基本上是线性的。

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初始染色体与MT相互作用的动力学和结构。(A、 B类)在两个对照细胞中,温度变化到32°C之前(红线)和之后(蓝线)的动粒运动轨迹。这些图像显示了包含动粒(红色X)和两个纺锤极的平面内的运动(参见材料和方法)。蓝色箭头指向将这些动粒带到极点的最后运动的开始。紫色箭头表示暂停。动粒和极点的最终位置分别显示为红色和绿色圆圈。网格方格为0.5μm。(C类)层析照片上的切片,由数据采集3细胞在纺锤体形成的早期阶段被冷冻。(D类F类)三个主轴的重建(转移到32°C后冻结3-7分钟),其中一个如(C)所示。从不同极点成核的MT为绿色和红色,纺锤体极点为黄色,核膜为灰色。负号以橙色圆点表示,加号以紫色圆点表示;位于截面之间的端部没有标记。有时,在重建路段以外还有地铁;它们最远端(正端)用绿点标记。棒材:0.1μm。

我们使用这种数据格式来分析动粒-MT附着的持续性和动粒P移动的过程性。如果动粒经常捕获并丢失从相反两极生长的MT,人们会认为动粒的轨迹由向不同两极的分段运动组成。然而,所有持续运动都只指向其中一个极点(图2B). 它们以0.6±0.1μm/min的平均速率发生(范围0.2–2.8μm/min,N个=8),他们很有进取心。动粒连续移动1.0±0.1μm(N个=12),最长不间断运行1.5μm。暂停(图2A和B; 紫色箭头)持续了124±30秒,这可能是由于运动停滞或动粒-MT分离,然后重新捕获造成的。

pombe链球菌的P运动通过起源于极的MT发生,并由动粒依赖机制驱动

我们测量了动粒最终轨迹方向与纺锤轴之间的角度。其范围很广(82±25°;M±s.d。,N个=28),表明在早中期,SPB在广泛的方向上使MT成核,其宽度足以覆盖细胞核中的大多数极近端区域。这一观点不同于已发表的对更成熟的中期纺锤体的描述,后者由一小束MT组成(, 1993). 因此,我们使用电子断层扫描(ET)来检查成形主轴中的MT分布。早中期复制的SPB进入核膜的窗孔(, 1997;乌扎瓦, 2004). 随着纺锤的生长数据采集3从冷区恢复的细胞,SPB最初几乎彼此平行(图2C和D). 他们的分离可能是由少数几个斜向SPB核表面的重叠MT驱动的(补充视频3). 其他MT以不同的方向投射到核质中,这将最大限度地增加它们遇到动粒的机会(仙人掌, 2003). 随着纺锤体的成熟和长度的增加,两极相互对峙,重叠的MT数量增加。然而,仍有许多不同长度的MT向不同方向生长,令人想起脊椎动物纺锤(图2E;补充视频4). 我们没有发现来自两极的MT指向核的同一个极远区域的例子,正如人们在亚甲基四氢叶酸染色体连接期间所预期的那样(马亚托, 2004). 这与丢失的动粒最初只附着在一个极点上的说法一致(在单倍体或合胞体构型中)。然而,由于EM中酵母动粒的对比不足,无法确定确切的附着模式。虽然靠近MTs+末端的一些区域具有结构特征,使其成为动粒候选区域,但这些特征难以量化(补充图3A). 所有这些区域都位于高度张开的MT+末端,这意味着动粒与聚合物末端相互作用,而不是与MT的侧表面相互作用。

在ET重建的所有主轴中(N个=24),每个MT减去末端位于SPB附近(平均距离86±5 nm,N个=70) (补充图3B). 我们没有发现像在某些系统中发生的那样,在动粒启动MT的证据(科德贾科夫, 2003). 至少91%的负端(N个=483)被大致锥形结构覆盖(补充图3C)它类似于芽殖酵母和线虫纺锤体中的γ-微管蛋白环复合体(奥图尔, 1999,2003). 这些结果表明,负MT端与SPB的连接稳定,这与该端MT动力学的明显缺乏一致(马尔拉瓦拉布, 1999). 因此,极相关的驱动蛋白不太可能在S.pombe公司通过破坏MT负端的稳定性,导致P移动(罗杰斯, 2004). 我们得出结论,裂变酵母中的动粒P运动是由MT依赖、动粒相关、负端定向马达和/或MT正端解聚产生的力引起的。

正常动粒回收不需要动力蛋白或Pkl1p

我们用这个实验系统来检验不同负端定向电机的贡献。缺乏Dhc1p、Pkl1p或Klpp基因的菌株数据采集3后台)已按上述方式同步。通过固定细胞的免疫荧光,所有菌株的阻滞总参数相似,表明这些缺失均不影响细胞周期阻滞或动粒散射(图1A). 在动力蛋白缺失菌株中,动粒恢复和双向定向的动力学与对照菌株没有统计学差异(图1B-D). 活细胞成像也显示该菌株的动粒恢复正常(N个=23),尽管平均检索时间略长于对照细胞(补充图4A).

Pkl1p是一个S.pombe公司驱动蛋白14家族的运动;通常沿着主轴发现,在SPB富集(皮杜, 1996). 在有丝分裂进展的初始阶段pkl1系列Δ培养(<5min),动粒恢复、双向定向和有丝分裂退出的动力学与对照菌株没有区别(图1B-D). 然而,在pkl1系列Δ早中期和中期细胞比例过早下降(图1C)这导致后期(5-15分钟;图1B). 有丝分裂退出的轻微进展表明出现了早熟的后期发作(图1D); 显然动粒在pkl1系列Δ细胞,但有丝分裂后期存在缺陷(Grishchuk和McIntosh,准备中的手稿)。

我们已经追踪了5个动粒和极点的三维坐标pkl1系列Δ和6dhc1型Δ单元。极性定向动粒运动的轨迹与对照细胞的轨迹无显著差异(补充图4B和C). 在这些基因型中,动粒向极点移动的开始及其速度的差异几乎与基因型之间的差异一样大(图3A). 我们的结论是,在没有动力蛋白或Pkl1p的情况下,可以发生正常的P运动。

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活细胞染色体检索过程中的运动。(A类,B类)移到32°C后动粒到极点距离随时间变化的轨迹示例(另请参见补充图6). (C类)最后动粒方法斜率的比较千帕2Δ电池1(补充视频5),千帕2Δdhc1型Δ电池(补充视频12),一个控制单元和4个pkl1系列Δ千帕2Δdhc1型Δ单元。

由于动粒运动动力学的异质性增加,Klp2的缺失导致动粒回收延迟

S.pombe公司Klpip是kinesin-14家族的另一个成员;它是已知唯一定位于有丝分裂动粒的负端定向运动(特罗塞尔, 2001).Nda3公司缺乏Klpp的细胞失去动粒的百分比有可复制的增加,这表明Klpp有助于正常的动粒-极附着(图1A). 在这些细胞恢复到32°C后,它们的动粒与SPB重新建立联系的速度明显慢于其他三种基因型的细胞(τ1/220分钟;图1B). 前中期和中期的动粒积累也有延迟(图1C)和减慢的有丝分裂出口(τ1/235分钟;图1D),表明有丝分裂检查点运行正常。

通过跟踪活的有丝分裂klp2型Δ电池(N个=30),我们确定了导致动粒恢复较慢的两个因素。第一,千帕2Δ细胞比对照细胞获得更少的远距离动粒(距离极点1.2μm)(补充图2B). 其次,从较短距离恢复动粒所需的平均时间增加了:11.8±2.9 min千帕2Δ细胞与对照组6.8±1.1分钟(补充图4A). 由于Klp2马达定位于动粒,它可能直接促进P运动。人们会认为,动粒恢复的平均速度较慢是由于动粒运动较慢。然而,动粒运动的直接可视化显示情况并非如此:千帕2Δ动粒得到有效恢复,并以我们观察到的最高速度移动(~3μm/min;补充视频5). 其他动粒的运动被大大延迟,尽管它们最初靠近两极(补充视频6). 因此,在没有Klpp的情况下,动粒细胞仍然可以快速移动,但恢复速度较慢的可能性增加。自从千帕2+基因从这些细胞中被删除(特罗塞尔, 2001),这种行为不能归因于Klpp水平的变化。因此,我们探讨了其他可能性。

Klpp通过刺激动粒纤维缩短和/或阻止其伸长来促进动粒运动的过程性

分析导致运动异质性的机制千帕2Δ细胞,我们追踪了动粒-极距离随时间的变化。一些记录显示了距离不变甚至增加的时期(例如,单元格2-5英寸图3B). 这表明klp2型Δ动粒在MT附着中有缺陷并随机移动,直到出现新的捕获,或者它们的P运动频繁停滞甚至反转。为了区分这些可能性,我们研究了2D动粒轨迹。例如,细胞3中动粒的检索路径可以分为两段(图4A). 最初,轨迹类似于一个圆心位于右极点的圆弧。该模型可通过符合该假设的数据的标准差(0.141μm)进行评估,而基于随机运动的模型的标准差为0.410。如果动粒的运动受到靠近核膜的限制,这种运动可能会在一定程度上发生。或者,动粒可能连接到一个或多个来自右极点的稳定MT。路径的后面部分很好地拟合了一条直接指向该极点的直线(s.d.0.128μm,对于随机拟合0.422,s.d.),与后一个模型一致。然而,这些运动并不是循序渐进的;动粒前后移动,最后到达极点(补充视频7). 这种向后运动可能是由于染色质在其动粒与相关MT分离后反冲造成的,但明显缺乏随机动粒运动,这可能是分离染色体的结果,这表明在提取过程中千帕2Δ动粒与动粒MT保持稳定的附着。通过对来自nda3 klp2Δ细胞有丝分裂进程延迟。所有这些都包含1–2个MT线束,这些线束从主轴轴线分叉,每个线束由2–3个MT(a蓬贝动粒结合2-4MT(, 1993;图4B和C;补充视频8). 虽然在这些断层图中无法定位单个动粒,但这些束中MT加端的位置(通过ET识别)与动粒在提取过程中的位置相似千帕2Δ细胞,通过实时成像观察。总之,这些结果表明千帕2Δ动粒在移到32°C后的早期捕获MT,但它们在P运动中暂停,并经常离开极点。

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Klpp有助于动粒检索。(A类)细胞3动粒恢复的二维轨迹。框架1–50的最佳拟合圆弧(洋红色)(补充视频7); 第51帧至第96帧的最佳线性拟合(蓝色)。层析切片(B类)和3D模型(C类)第页,共页nda3klp2Δ细胞在前中期延迟(移到32°C后冻结15分钟)。(B)中的箭头指向从右极生长的两个MT束中的一个MT。棒:100纳米。(D类)用于控制的每个主轴极的平均MT数数据采集3电池(4极),nda3dhc1型Δ (10),nda3pkl1Δ(6)和延迟nda3klp2Δ电池(6)。(E类)MT加端的ET切片。前五幅图像是从一个控件中采集的数据采集3细胞;其余的都是六点的klp2型Δ单元。正常细胞和突变细胞的正末端的外观都有很大的差异,这使得很难量化差异。通常,正MT端张开(上排),但klp2型Δ细胞通常包含闭塞物(红色箭头)。中间一行的图像可能代表导致聚合行为改变的“疤痕”MT的中间体;最下面的一行显示了一种可能的途径,可以在MT异常时拯救快速缩短,然后再进行MT聚合。条形:100 nm。(F类)MT流明内显示较暗“条”的MT加端的百分比。检查的末端数量:对照68,千帕2Δ 239. (G公司)从nda3 klp2Δdhc1型Δ电池处于后期A.Bar:2μm。

这些细胞无法维持P运动,并且其染色体倾向于转向远离极点的运动,这似乎是其染色体检索延迟的主要原因。例如,细胞4中的动粒(图3B)最初靠近未分离的磁极。在移到32°C后,该动粒立即开始以0.5μm/min的速度离开极点,然后再次移动并双向移动(补充视频9). 在单元格5中(图3B)动粒开始向极点移动,然后突然改变方向并离开(补充视频10). 延迟性心肌病纺锤体的超微结构分析千帕2Δ细胞显示,相对于野生型,每极生长的MT数量略有增加(图4D). 这种差异可能是由于在有丝分裂中花费的时间较长,或者这些细胞中的MT可能表现出MT动力学的改变(Troxell公司, 2001). 对该菌株MT末端的仔细检查表明,它们的原丝倾向于比其他菌株的少张开(图4E). 许多MTs显示闭塞,例如,管腔上的暗“条状物”(图4F). 这些结构可能代表蛋白质物质,可能是困在不断增长的MT中的原丝片段(图4E,灰色箭头)。这种不规则性可能在正常MT动力学过程中出现,形成“疤痕”MT,其解聚受到部分阻碍。当解聚遇到这种异常时,可能需要Klpip来缩短MT;在没有它的情况下,解聚拯救和随后的动粒MT伸长可能更常见。

在缺乏Klpp和dynein以及三重缺失突变体的情况下,P运动的最大速率保持不变

如上所述,在我们的测试系统中,正常动粒恢复不需要Pkl1和dynein电机。进一步检查pkl1系列Δ表型表明,这种运动可能在SPB组织中发挥重要作用(Grishchuk和McIntosh,准备中的手稿)。另一方面,Dhc1p在营养细胞中的表达水平很低,以至于在有丝分裂期间没有检测到(山本, 1999). 有人认为,这种马达在裂变酵母有丝分裂中不起作用,但我们发现,在缺乏动力蛋白的情况下,动粒恢复时间略有增加。此外,Northern分析显示dhc1型营养细胞中的mRNA(West和McIntosh,未发表的观察结果)。因此,我们询问了在缺乏Klpp的情况下动粒运动是否需要动力蛋白的活性。活细胞成像显示,尽管运动中存在明显的异质性,但这种双缺失菌株的动粒仍然恢复。一些千帕2Δdhc1型Δkinetochores未能移动到极点,尽管它们很长时间(70分钟,补充视频11); 其他人最终被找回(补充图2A). 引人注目的是,在这种紧张状态下,仍然可以看到快速的P型运动(图3C;补充视频12). 同样,在后期A中染色体的P运动也没有被取消(图4G;补充视频12). 同样的结果也出现在缺少所有三个电机的应变中(图3C;补充视频13补充图2A). S.pombe公司没有其他已知的负端定向马达(其基因组已完全测序),对这些运动最可能的解释是,与动粒相关的MT的正端解聚可以驱动染色体向极地运动体内.

讨论

确定MT依赖马达和MT解聚在产生染色体运动力中的相对贡献是细胞生物学的一个长期目标(井上菜和鲑鱼,1995年). 事实证明,这项任务很困难,因为有丝分裂在某种程度上依赖于许多依赖于MT-的马达。然而,除驱动蛋白-5外,通过基因缺失、RNAi或抗体介导的抑制作用去除特定运动的有丝分裂表型相对温和,迄今为止,没有运动可以被描述为特定染色体运动的唯一贡献者(参见麦金托什, 2002;马亚托, 2004). 虽然还没有直接证据表明MT解聚驱动染色体向极移体内,实验在体外已经表明,缩短MT可以产生足够大的力来引起这种运动(格里修克, 2005). 染色体检索S.pombe公司在没有Klpp、dynein和Pkl1p的情况下,继续进行快速的极点定向运动,这表明检索过程(以及后期A)的这一重要部分可能是运动依赖性的。在缺乏这种运动的其他合理候选者的情况下,我们认为P运动可以通过动粒MT从其正端解聚来驱动。

然而,很难看出单靠这种机制如何提供确保高保真染色体分离的多功能性和灵活性。动粒捕获在本质上是随机的,但有丝分裂必须在面对许多变量时准确且有利,例如,初始染色体位置、与一个或两个姐妹动粒接触的MT数量以及它们来自的极,最后,以初始MT-动粒相互作用模式(横向或其他)。有丝分裂机制的一个新观点是,尽管马达可以并且在某些系统中确实影响某些有丝分裂运动的速率,但它们更重要的作用可能在于帮助解决偶然出现的困难情况,这要归功于一些关键有丝分裂成分的随机初始排列。

通过结合实时成像、荧光显微镜、ET和动粒轨迹的数学分析信息,我们描述了从MT解聚块中回收后裂变酵母中MT与动粒相互作用的几个重要方面。虽然我们用来施加这种阻滞的遗传背景可能改变了MT动力学的某些方面,但动粒-MT相互作用的总体特征在允许温度下可能是正常的。当所有有丝分裂马达都存在时,寻找和捕获动粒,即使是那些位于正常距离以外的动粒,在S.pombe公司在有丝分裂早期,由SPB核化的MT定向扩散,部分确保了成功捕获。远处的动粒通过1–3 MT稳定地附着在其中一个极上。随后的动粒依赖运动通常强劲且具有过程性,但速度可变,并且可能包含停顿。这种变异性表明,可能需要不同的策略和机制将遥远的动粒移向极点。

SPB近端动粒的捕获和双向定位可以在没有三个负端定向马达的情况下进行(特罗塞尔, 2001). 然而,当动粒与SPB保持一定距离时,系统会受到额外的压力,而马达的输入对染色体分离的成功更为重要。由于动力蛋白或Pklp1p的缺失不会影响P-运动的可测量特征,因此这些马达不太可能在检索过程中直接对染色体运动做出贡献。另一方面,在缺乏动粒相关马达Klpp的情况下,远处的动粒似乎仍稳定地附着在其MT上,但P运动的平均速率降低。我们的数据并不排除Klpip有助于动粒沿MT横向表面运动的可能性,正如其所建议的那样酿酒酵母同源Kar3p(田中, 2005). 然而,它们确实揭示了抑制染色体远离极点运动的一种意想不到的新作用。Kar3p已被证明是一个附加引擎本地化的MT拆卸因子(马多克斯, 2003;斯普鲁尔, 2005;莫尔克, 2006). 如果Klpp在裂变酵母中与动粒相关的MT的正端起着类似的作用,它的缺失可能会导致它们过度生长。端部或附近的异常结构特征千帕2ΔMT(图4E)可能会导致MT解聚救援事件的频率增加,这一过程将促进远离极点的运动。我们认为,Klpp通常通过促进和/或维持动粒MT正端的解聚作用来促进动粒运动的进程。在正常有丝分裂期间,这一功能可能并不重要,但当染色体异常远离纺锤体极时,它就变得有价值了(图5).

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染色体的P移动和双向定向S.pombe。当正常有丝分裂开始时,SPB(绿色卵圆形)靠近动粒(红色圆圈;仅显示一条染色体(蓝色));这种情况可能解释了为什么有丝分裂进程不需要所有三个负端定向马达。在不存在Klp2p的情况下,或在瞬时MT解聚过程中,动粒可以移动到离极点一定距离的地方。它们随后向极点的移动是由MT解聚驱动的,Klp2促进了这一过程。

材料和方法

细胞周期同步和免疫荧光显微镜

S.pombe公司使用标准技术和试剂培养细胞(莫雷诺, 1991). 从随机孢子构建菌株,然后用缺失特异性引物进行PCR筛选。等位基因为空的菌株的完整基因型pkl1系列Δ,klp2Δ和dhc1型Δ如所述补充表1.携带nda3-KM311突变(以下简称nda3)在32°C的YPD(1%酵母提取物、2%蛋白胨、2%葡萄糖)中生长,并在18°C培养8小时。将DAPI细胞固定在4%多聚甲醛中进行免疫染色和染色体染色。主要抗体由I Hagan(抗Sad1,SPB标记)提供;P Silver和J Kahana(抗GFP场景2-GFP)和K Gull(抗微管蛋白TAT1抗体)。HA表位(动粒标记物Mis12-HA,由M Yanagida提供)和核孔蛋白(Mab414)的抗体从BAbCO购买。与Alexa-488或-594结合的次级抗体来自分子探针。使用×100复消色差物镜NA 1.4(蔡司Axioplan II光学显微镜)采集图像z(z)-堆栈(步长0.3μm),并使用Intelligent Imaging Innovations,Inc.(科罗拉多州丹佛市)的软件进行解卷。使用Adobe Photoshop对比最大强度投影并将其排列成数字。

实时成像

使用cen2-GFP构造(补充表1)由A Yamamoto提供(山本和平冈,2003年). 免疫定位cen2-GFP动粒组分Mis12-HA的标记和总是共存或紧邻(例如,参见补充图1g). 用Pcp1p-GFP可视化主轴极(弗洛里, 2002). 将显微镜载物台预冷至14°C,在浸油×100 NeoFluar物镜和浸油冷凝器周围包裹一个定制的金属管水套。将水套管道从14°C切换至32°C浴槽后,1–2分钟内发生温度变化。通过变形金刚(Universal Imaging)控制的Photometrics Cascade 650 CCD相机(Roper Scientific)每15秒采集7–12个平面(步长0.25μm,曝光150 ms)的叠加图像。视频是手动对齐的平均XY投影,以最小化温度突变带来的图像漂移。在除视频1外的所有视频中,在第三帧之后,温度都变为32°C。S.pombe公司核/纺锤经常围绕随机定向的轴旋转,这些2D投影中物体之间视距离的变化不一定反映分离的实际变化,需要进行额外的图像处理以获得图像中物体之间的准确距离。

图像分析

所有计算机程序都是使用MatLab 6.5定制编写的。简单地说,已标记动粒的XYZ坐标和每个时间点的两个极点的XYZ坐标(通过选择每个堆栈中最亮信号的视中心手动收集)被转换,因此其中一个极点始终位于笛卡尔坐标系的中心。The direction of theX(X)-选择轴线穿过第二个极;这个Y(Y)-轴位于包含所有三个对象的平面上。生成的图像显示真实的三维距离。该程序还消除了由阶段漂移或主轴旋转引起的移动。在轨迹中,这些点是四个连续点的移动平均值。

相对长度单位

菌株在18°C下生长,在32°C下培养2–15分钟,通过过滤快速收集,高压冷冻并按说明进行处理(, 1997). 在2%戊二醛和0.1%乙酸铀酰中冷冻取代后,将其嵌入Lowicryl HM20中并切割成200 nm的切片。使用F30电子显微镜(FEI Corp,Hillsboro,OR)获得双轴倾斜序列(倾斜增量1°;倾斜范围±60°),并使用IMOD生成断层图(克雷默, 1996). 数据来自三个独立的实验。每个基因型的纺锤体完全重建和部分重建的数量分别为对照组:2,4;klp1型Δ: 3,7;千帕2Δ: 7,3; dhc1型Δ: 5,0. 完全重建意味着所有MT末端都位于重建的厚截面内,但1-2末端除外,这些末端在生成的模型中用绿点标记。

补充材料

补充信息

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补充图1

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补充图2

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补充图3

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补充图4

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补充图5

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补充图6

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补充图7

单击此处查看。(148K,ppt)

致谢

ET在Boulder实验室进行,用于细胞的3D EM,并得到RR000592 to JRM的支持。M Morphew制备EM样品,并获取细胞的TEM图像数据采集3电池温度为18°C;E O’Toole和该实验室的其他成员帮助进行了数据采集和重建。光学显微镜的温度控制由V Sarbash和F Ataullakhanov建立。菌株和试剂由I Hagan博士、P Silver博士、K Gull博士、Y Hiraoka博士、M Yanagida博士和T Davis博士提供。我们感谢I Spiridonov提供的技术援助,J Becerril帮助我们收集3D坐标,感谢M Molodtsov和F Ataullakhanov提供的用于分析动粒轨迹的软件,感谢M Winey提供的有益讨论。这项工作得到了JRM的GM33787的部分支持。

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文章来自欧洲分子生物学组织由以下人员提供自然出版集团