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分子生物学细胞。2000年9月;11(9): 2973–2985.
数字对象标识:1993年10月1091日/月11.9.2日
预防性维修识别码:项目经理14969
PMID:10982394

水孔蛋白-1拓扑在成熟过程中的重新定向内质网

克里斯·凯泽,监控编辑器

摘要

大多数真核生物多面体膜蛋白的拓扑结构是在内质网(ER)中通过一系列协调易位和膜整合事件。然而,对于人类水通道蛋白水通道AQP1ER膜的四段式跨度拓扑不同于在质膜上形成成熟的六段跨膜结构。在这里,我们使用表位标记的AQP1构建物跟随跨膜(TM)关键内部肽环的定位爪蟾卵母细胞和无细胞系统。该分析表明AQP1ER中的成熟涉及一种新的拓扑重新定向三个内部TM片段和两个肽环。合成后在TMs 4-6中,TM3经历了180度旋转,其中TM3C末端侧翼残基从其最初的细胞溶质定位到内质网腔和N末端侧翼残基从内质网腔逆行移位到胞浆。这些事件将TM3从I型拓扑转换为II型拓扑将TM2和TM4重新定位为符合预测的六段跨度AQP1拓扑。AQP1拓扑重新定向也与从蛋白酶敏感构象到具有蛋白酶抗性的结构水道功能。这些研究表明,最初的蛋白质通过内质网共翻译易位事件建立的拓扑是动态的,可以通过后续折叠和/或成熟。

简介

内质多面体膜蛋白的生物发生网(ER)涉及跨膜(TM)的正确定位螺旋,细胞溶质和管腔肽结构域的协同折叠,以及脂质双层内的螺旋堆积。一个模型预测通过共翻译易位建立蛋白质拓扑以及当核糖体中出现新生链时的整合事件(布洛贝尔,1980年;拉波波特等人。, 1996;约翰逊,1997). 期间这个过程中,信号序列将新生链指向ER,促进核糖体与Sec61易位复合体的结合(translocon),并在ER膜中打开一个大的水通道新生多肽通过它运动(西蒙和布洛贝尔,1991年;克劳利等人。, 1994;Jungnile和Rapoport,1995年;蛾类等人。, 1997). 随后停止传输序列终止易位,关闭易位子,扰乱核糖体-膜连接,并将多肽侧向导入脂质双层(约斯特等人。, 1983;等人。,1996;等人。, 1997;蛾类等人。, 1997). 调节核糖体结合和转座子门控、信号和因此,停止传输序列能够指示延伸的新生链进入胞浆或内质网腔协调多TM的顺序定向和集成段(罗斯曼等人。, 1988;Wessels and Spiess,1988年;利普等人。1989年)。

近年来,很明显,某些自然发生的多面体蛋白质在生物发生中表现出不跟随的变异一个简单的协同翻译模型(Hegde和Lingappa,1997年;约翰逊,1997). 首先,指示N末端易位的信号序列侧翼残基可能导致肽环和/或TM片段(等人。, 1997;奥塔等人。, 1998). 第二,某些地形决定因素终止易位,但未能整合到膜中,表明TM片段可以在完全进入脂质双层前的转座子(音频发生器et(等)阿尔。, 1987;斯卡赫和林加帕,1993年;什考奇等人。,1994;Lin和Addison,1995年;Borel和Simon,1996年). 第三,正确TM段的定位可能需要合成远端C末端肽区,表明最初的易位事件可能不一定决定成熟蛋白质的拓扑结构(威尔金森等人。, 1996). 因此,为了预测拓扑结果的结构决定因素,有必要定义多面体蛋白质通过的不同拓扑学途径获取它们的特定拓扑(Hegde和Lingappa,1997年;约翰逊,1997;比比,1998年)。

此前,我们检测了两种相关蛋白质的生物生成,水通道蛋白-1(AQP1/CHIP28)和水通道蛋白-4(AQP4/MIWC),并表明他们使用明显不同的折叠路径来获得内质网膜的跨膜拓扑结构(什考奇等人。,1994;等人。, 1995). AQP1和AQP4为~70%同源,每个包含六个预测的TM片段,形成生物膜中的水选择性孔(长谷川et(等)阿尔。, 1994;沃克曼等人。, 1996;阿格雷et(等)阿尔。, 1998). 序列截断AQP4融合分析蛋白质显示六段跨膜AQP4拓扑是通过一系列共翻译建立的通过交替信号和停止传输序列(等人。, 1995). 相比之下平行分析表明,拓扑决定因素编码在AQP1协同翻译指导了只有四个TM段的拓扑(什考奇等人。, 1994). 后一项发现尤其出乎意料,因为成熟的AQP1在质膜上含有6个TM段,如最初预测(普雷斯顿和阿格雷,1991年;普雷斯顿等人。, 1994;等人。, 1997;沃尔兹et(等)阿尔。, 1997). 这些结果表明AQP1以错误折叠(即四跨)构象合成在到达质膜之前被降解,或者,AQP1的成熟涉及到一个不寻常的拓扑重新定向实现其六跨拓扑。

确定四跨和我们分析了一系列AQP1结构包含两个单独的易位报告员,并跟踪作为初生链函数的内部TM片段的动态拓扑长度。我们现在表明,AQP1成熟是通过一个复合物进行的折叠路径至少涉及三个不同的步骤:瞬态四跨拓扑的共平移形成,内部TM片段到松散折叠的拓扑重排六跨拓扑结构和跨膜核心的最终压实形成一种抗蛋白酶的构象。因此,这些研究确定了多面体蛋白质生物发生和证明ER膜上的初始蛋白质拓扑是动态,可通过后续折叠和/或成熟。

材料和方法

cDNA构建

质粒pSP64.CHIP28(什考奇等人。, 1994)用作PCR扩增产生myc标记AQP1的模板构造。英国标准时间EII限制位点被插入pSP64.CHIP28的密码子P77和T120具有重叠意义和反义寡核苷酸(等人。1989年). 合成的编码c-myc表位9E10的寡核苷酸(埃文et(等)阿尔。, 1985),具有兼容的5′重叠英国标准时间EII结束连接到这些位点以生成质粒AQP1.P77.myc和AQP1.T120myc(AQP1.T120.myc)。结果序列(通过DNA测序验证)编码以下氨基酸残留物:AQP1.P77.myc LNP-VT-EQKLISEEDL-VT-TLG AQP1.T120.myc SLT-VT-EQKLISEEDL-VT-GNS

其中,VT表示由英国标准时间EII限制性位点,EQKLISEEDL代表myc表位。质粒T120.myc。TM3公司T型,-TM4公司T型,-TM5T型、和-TM6公司T型通过结扎艾娃来自先前描述的CHIP28克隆6、7、,分别为8和9(什考奇等人。, 1994),进入AQP1.T120.myc质粒艾娃I.这些质粒将AQP1编码序列编码为L139、P169、V214或V264,然后是142-残留的C末端片段上述牛催乳素(P)(罗斯曼等人。,1988). myc表位和C末端融合位点的位置在这些结构中,如图所示图1。1.AQP1融合蛋白含有P之前描述了残基R93、V107和L139的报告者(什考奇等人。, 1994). 质粒AQP1.T120.P(含P通过PCR扩增产生与AQP1残基T120融合的报告子pSP64.CHIP28,使用正义寡核苷酸、SP6启动子、,和反义寡核苷酸AAGCGAGGTCACGGAGGTGAT。聚合酶链反应碎片被消化Nco公司我和英国标准时间EII和结扎P报告者上游Nco公司I–英国标准时间EII-消化载体,S.L.ST.gG.P,as如前所述(斯卡赫和林加帕,1994年). 质粒myc。AQP1是通过消化pSP64.CHIP28生成Nco公司我(在ATG起始密码子)并将合成的寡核苷酸与相容物连接编码myc表位的重叠端。由此产生的N端子序列编码残基MEQKLISEEDL-M。

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(A) 初始AQP1四跨ER图拓扑和成熟的六跨质膜拓扑。阴影椭圆代表TM片段,开环代表糖基化位点在残基N42处。弯曲箭头表示预测的180度成熟所需的TM3旋转从四跨到六跨结构。直箭头表示站点和融合蛋白P报告子的拓扑定向指示的截短位点。(B) 表位标记的AQP1方案指示myc和P报告者相对位置的结构。黑色矩形代表myc表位标签和阴影矩形代表P记者。myc标记截断的预测质量显示了多肽。(C) 卵母细胞的透水性(Pf)注入水或编码野生型AQP1、AQP1.T120.myc的cRNA,以及AQP1.P77.循环。结果表示两个独立的实验中,每组6个卵母细胞,平均±SE。

体外转录/翻译

用SP6 RNA聚合酶转录mRNA(新英格兰内切酶,Beverly,MA),在40°C下10μl体积中放置1 h,as如前所述(什考奇等人。, 1994). 小份是立即使用或冷冻在液氮中并储存在−80°C下。转录混合物直接添加到翻译混合物中包含[35S] 蛋氨酸(交易35S-label,ICN Pharmaceuticals,加利福尼亚州欧文)和40%兔网织红细胞裂解物(RRL),并进行翻译在上述条件下,在24°C下放置1小时(斯卡赫,1998年). 犬胰腺微粒体膜的制备(沃尔特和布洛贝尔,1983年)添加到最终浓度A类280=8.0(翻译开始时)。使用卵母细胞膜的实验,200μl等分样品冷冻膜(如下所述制备)被快速解冻,用0.3体积的90 mM KCl、50 mM HEPES(pH 7.1)稀释,并在10,000 ×在4°C下持续10–15分钟。上清液是将其全部移除,然后将颗粒(~2μl体积)直接重悬于18μl的翻译混合物中。翻译然后按照上述方法进行。对于脉冲相位实验,通过添加环己酰亚胺(0.5 mM),样品在24°C下培养指示的时间。

非洲爪蟾卵细胞表达

对于功能研究,质粒线性化巴姆HI和体外转录,转录混合物为直接注入消泡阶段V或VI爪蟾莱维斯所述卵母细胞(Zhang和Verkman,1991年). 对于拓扑和蛋白质分析,50μCi[35S] 蛋氨酸(0.5μl的10×浓缩Tran35S标签[ICN药物])添加到2μl转录混合物中,并且注入第六阶段爪蟾卵母细胞(50 nl/卵母细胞)冰。在18°C的改良Barth溶液中孵育后[MBS;88mM氯化钠、1 mM氯化钾、2.4 mM氯化氢钠,0.82毫米硫酸镁4,0.33毫米钙(NO)2,0.41毫摩尔氯化钙2,10 mM HEPES钠,pH 7.4],卵母细胞在冰上均质,加入10体积0.25 M蔗糖,50 mM醋酸盐、5 mM醋酸盐镁、1.0 mM DTT、50 mM Tris、pH 7.5、,使用特氟隆手持式均质机。在这些条件下,合成放射性标记结构至少需要60-90分钟,并且在最大合成时进行蛋白水解多肽定位于内质网室(我们未发表结果)。对于脉冲相位实验,爪蟾卵母细胞在MBS中培养1.5–3小时,然后在含有2 mM的MBS中追逐防止放射性同位素进一步掺入的蛋氨酸(等人。, 1997)。

卵母细胞透水性

在24–48小时后测定卵母细胞的透水性溶胀试验注射(Zhang和Verkman,1991年)。肿胀的时间过程是根据20倍用蒸馏水稀释细胞外Barth缓冲液。定量成像测量卵母细胞体积,间隔1s。通过循环水浴维持温度控制。卵母细胞透水性(P(f))是根据初始膨胀率[d(V/V0)/dt]由关系:P(f)=[d(伏/伏0)/dt]/[(S/V0)V(V)w个(奥斯曼外面的−奥斯姆在里面],

其中S/V0= 50厘米−1,Vw个= 18厘米/mol和Osm外面的Osm公司在里面=190毫欧。

非洲爪蟾卵母细胞膜的制备

非洲爪蟾制备卵母细胞膜如所述科比尔卡(1990)进行了一些修改。第六阶段爪蟾卵母细胞通过手术获取、解剖和胶原酶处理(IV型,2 mg/ml;Sigma Chemical,圣路易斯,MO)在室温下45分钟。用5体积的90mM KCl,50mM HEPES,pH 7.1。缓冲区被替换为90 mM KCl、50 mM HEPES中40%蔗糖(wt/vol),pH 7.1,等于卵母细胞的体积。所有后续步骤均在0-4摄氏度。将混合物通过,使卵母细胞轻轻破碎18号1.5英寸针10次。然后匀浆3000×离心3分钟.上清液是转移到一个新的试管中,这个过程重复了五次。这个产生的乳白色上清液,含有胞浆和细胞膜,分为200-μl小份,在液氮中冷冻储存于−80°C。

蛋白酶消化

如前所述进行蛋白酶消化(什考奇等人。, 1994). 翻译混合物或XO匀浆分为冰块和氯化钙2已添加至10 mM最终浓度。然后添加蛋白酶K(PK)(0.2mg/ml最终浓度),在有或无1%Triton®声波风廓线仪的情况下X-100。样品在冰上培养1小时通过与PMSF(10 mM)快速混合并煮沸使蛋白酶失活在10体积的1%十二烷基硫酸钠、0.1 M Tris、pH 8.0中放置5分钟然后在>10体积的缓冲液A(0.1 M NaCl,1%Triton X-100,2 mM EDTA、0.1 mM PMSF、0.1 M Tris、pH 8.0)。RRL样本直接免疫沉淀。XO样品在4°C下孵育1-2小时,16000×离心持续15分钟至免疫沉淀前清除不溶性碎屑。的准确性蛋白酶保护试验定期使用分泌控制蛋白。只有在保护对照组持续使用>85%。因为蛋白酶保护通常效率为90–95%,即实际的移位效率水通道蛋白结构的含量可能略高于计算值值。

免疫沉淀和免疫吸附

对于免疫沉淀,抗泌乳素抗血清(ICN生物医学,加利福尼亚州科斯塔梅萨)或单克隆抗体myc-9E10(埃文等人。,1985)(小鼠腹水)以1:1000稀释度添加到翻译中产品在缓冲液A中溶解。预培养10–30分钟后,5.0μl蛋白质A–亲和凝胶(美国伯乐,加利福尼亚州里士满),以及样品在4°C下旋转10 h,然后清洗三次使用缓冲液A,两次使用0.1 M NaCl、0.1 M Tris、pH 8.0和添加SDS样品缓冲液。

为了进行免疫吸附,将翻译产物分层到0.5 M蔗糖、100 mM KCl、5.0 mM MgCl2,1.0 mM DTT,50mM HEPES,pH 7.5,180000×离心对于4°C下10分钟。将膜颗粒重新悬浮在50μl冰镇0.1 M蔗糖、0.1 M KCl、5 mM MgCl2, 1mM DTT,50 mM HEPES,pH 7.5,并稀释至0.5 ml 0.1 M NaCl,0.1M Tris,pH 8.0,存在(免疫吸附)或不存在(免疫沉淀)抗体。将等分样品在4°C下培养2h,16000×离心30分钟,以及将微丸溶解在缓冲液A中。蛋白质A-亲和凝胶(5μl)向每个试管中添加,并向免疫沉淀中添加抗体管。后续步骤与以下步骤相同免疫沉淀。

放射自显影和定量

通过SDS-PAGE分析样品(英语HANCE,杜邦/新英格兰核电站,波士顿,MA)、荧光照相术和放射自显影术。自动放射自显影被量化使用Pharmacia LKB(新泽西州皮斯卡塔韦)图像主DTS密度计(和/或磷光成像),并使用Image Master 1D软件版本1.0(法玛西亚LKB)。分析前,密度计是用柯达(纽约州罗切斯特市)预先校准的校正胶片的摄影步进片(0.2-OD间隔)非线性(0.07–1.8 OD单位)。密度测定的线性为通过连续稀释翻译的多次定时曝光证实通过直接比较,产品浓度超过40倍使用磷光成像分析美国伯乐个人的分子成像仪Fx(柯达屏幕,Quant-1软件)。波段强度根据体积平均像素强度(OD)计算×毫米2)自动射线照片和/或直接凝胶的磷光成像。换位效率由以下因素决定修正与起始材料相关的蛋白酶保护肽片段。AQP1在位置1、96和266处含有三个蛋氨酸残基(图(图1)。1). P报告含有四种蛋氨酸残基。除了作为值得注意的是,计算出的移位效率代表了报告表位受保护的指示片段没有洗涤剂。数字由代表编制使用AGFA(内华达州格鲁西特)工作室的自动放射自显影扫描II传输扫描仪和Adobe(加利福尼亚州山景城)Photoshop软件。

结果

表位标记AQP1融合蛋白的构建

C末端易位报告员越来越习惯于研究原核生物和真核生物的生物发生和拓扑结构多面体整膜蛋白(博伊德等人。, 1990;史密斯扫帚等人。, 1990;查韦斯和霍尔,1992年;特拉克斯勒等人。, 1993;什考奇等人。, 1994;贝贾和比比,1995;等人。, 1995;鲸鱼和斯托菲尔,1996年;Schmidt-Rose和Jentsch,1997年;奥塔等人。, 1998). 在这个技术,新生链被顺序截断并连接到报告者域,以及报告者相对于膜用于推断融合位点的拓扑结构。通过分析一系列这样的融合蛋白,可以定义拓扑结构在蛋白质合成的特定阶段和定位起始和终止的拓扑决定因素易位。因为每个构造都提供拓扑信息只有一个熔合点,因为熔合下游有残留物站点被删除,生成的拓扑仅反映那些由上游,即N末端,地形决定因素。这对获得它们的拓扑是协同翻译的。然而,它具有重要意义如果初始共平移拓扑与成熟蛋白的拓扑结构。

之前的拓扑分析表明内质网膜AQP1的拓扑结构包含四个TM片段和三个膜外肽环,而血浆中的成熟蛋白膜包含由五个肽环连接的六个TM片段(普雷斯顿等人。, 1994;什考奇等人。, 1994)。AQP1拓扑的实验差异主要限于TM3及其侧翼残基的跨膜取向(图(图1A)。1A) ●●●●。特别是,TM3 N端和C端侧翼残基是最初分别直接进入内质网腔和胞浆AQP1合成(什考奇等人。, 1994),但它们位于功能成熟的AQP1分子的相反取向(普雷斯顿等人。, 1994). 本研究假设AQP1成熟包括TM3从其初始类型旋转180度I型拓扑到其成熟的II型拓扑。这样的旋转将正确定位TM3侧翼残基,并定位TM2和TM4在不改变蛋白质其他区域的拓扑结构(图(图11A) ●●●●。

为了监测TM3拓扑结构,需要一个10-残基c-myc表位标签(埃文et(等)阿尔。, 1985)在T120残基或AQP1的P77位TM2-TM3肽环内(图(图1B)。1B) ●●●●。得到的质粒(AQP1.T120.myc和AQP1.P77.myc)然后在残基L139、P169、V214或V264处按顺序截短分别在TM片段3、4、5和6后融合为被动牛催乳素C末端易位报告子(P)(罗斯曼等人。, 1988). 截断的预测大小,myc标记的AQP1多肽如图所示图1B:。1B.P报告基因,编码来自分泌细胞的142个C末端残基蛋白质牛催乳素,分子量为~15 kDa。

如果TM3从I型拓扑重定向到II型拓扑,那么mycT120位的表位会从胞浆转移到内质网管腔,而P77位的表位将从ER管腔移动回到胞浆中(图(图1A)。1A) ●●●●。TM3侧翼的重新定向因此,残留物将作为AQP1从四跨到六跨拓扑,因为这也会可能使TM2和TM4进入适当的膜跨方向(图(图1)。1). 通过同时表征蛋白酶myc和P记者在新兴增长链中的可访问性长度,我们推断应该可以定义点,在AQP1合成期间或之后,这种重新定向发生。

表位插入对AQP1功能的影响

确定是否存在myc表位改变AQP1折叠,我们首先表达全长AQP1.T120.myc和XO中的AQP1.P77.myc蛋白质,已知可有效合成功能性水道(Zhang和Verkman,1991年;普雷斯顿et(等)阿尔。, 1992). 卵母细胞微注射野生型或myc标记的AQP1 cRNA,质膜透水性为通过渗透性引起的肿胀来确定。如图所示图1C,1C、,AQP1.T120.myc表现出近70%的野生型AQP1水通道活动。这与普雷斯顿et(等)阿尔。(1994)T120是表位插入的允许位点。相反,myc插入TM2-TM3肽环(AQP1.P77.myc)导致AQP1的表达非常差和快速降解(我们的未公布的结果)和几乎完全破坏水道活动(图(图1C)。1C) ●●●●。出于这些原因,最初的实验重点是T120 myc标记的构造。

爪蟾卵母细胞AQP1的拓扑结构

通过使用一系列融合蛋白,其中C末端P报告子为在残基N端(R93)或C端工程成天然AQP1(V107、T120或L139)至TM3。cRNA与[35S] 蛋氨酸转化为成熟的XO,以及之后2 h,将卵母细胞均质化,在有PK的情况下用PK消化不含非变性洗涤剂,免疫沉淀抗催乳素抗血清。在这些条件下,合成放射性标记蛋白需要60-90分钟,并进行蛋白水解在最大合成时显著降解之前,而保留在ER隔间中的构件(等人。,1997; 我们未发表的结果)。生成的每个构件非糖基化和核心糖基化蛋白与先前一致研究(什考奇等人。, 1994)(图(图2,2第1、4、7和10车道;这个残基N42处的糖基化位点如图所示)。糖基化通过内切糖苷酶H消化和/或微粒体膜存在与否的体外翻译(什考奇等人。, 1994; 我们未发表的结果)。蛋白酶消化显示P报告基因转位到内质网在残留物R93处将N端子熔断至TM3。在这个结构中,糖基化和非糖基化多肽都产生了蛋白酶保护带(图(图2,2,车道1-3)。如前所述(什考奇等人。,1994),一些新生的链也经历了分裂事件,可能通过信号肽酶产生额外的受保护的蛋白酶,16-kDa肽片段。当P报告员在位置C处熔断时终端至TM3,85–95%的链(车道)中的PK使其退化4–12). 观察到这些细菌有少量的蛋白酶抗性可能代表不完全消化或报告者在少量(<15%)链中易位。总之,这些数据表明,在合成TM4之前,TM3最初以I型拓扑跨越XO-ER膜,其N内质网管腔中的末端侧翼残基及其C末端残基在细胞溶质中。TM3两侧各融合点的位置推导出的拓扑如图所示图2。2TM1的初始拓扑和TM2也显示为先前研究中确定的结果(什考奇et(等)阿尔。, 1994)。

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XO中TM3的共平移拓扑。AQP1是截短并在残基R93、V107、,T120和L139,如图所示。体外转录表达的卵母细胞cRNA均质,用PK消化,用免疫沉淀抗催乳素抗血清。向上箭头(车道2)表示PK保护的P-反应片段。P的拓扑位置每个融合蛋白中的报告者如下图所示自动射线照片。在3号通道中,有少量蛋白酶抗性在洗涤剂存在下回收材料。观察到这一点在一些实验中,可能代表蛋白质原因是,它对PK消化具有内在抗性。

接下来我们使用myc标记的质粒T120.myc。TM3公司T型,120亿日元。TM4公司T型,T120毫米。TM5公司T型、和120亿日元。TM6公司T型(在残基L139、P169处截断,V214和V264)或全长AQP1.T120.myc以确定TM3在剩余时间内是否保持在I型方向AQP1合成。构造函数再次标记为[35S] 微量注射XO中的蛋氨酸,消化PK,抗myc或抗P免疫沉淀SDS-PAGE前的抗血清。如图所示图3A,A、 残留T120的myc标签没有更改TM3的初始类型I方向。新兴的连锁店如图所示,糖基化(在残基N42处),myc和P记者主要停留在细胞溶质中蛋白酶。合成TM4(质粒120亿日元。TM4公司T型),C终端P报告员保持细胞溶质和PK可获得(图(图3B)。B) ●●●●。免疫沉淀用myc抗血清回收了一个16 kDa大小的微弱片段(图(图3B,B、 车道2)。(长时间曝光后碎片更容易被欣赏[我们未公布的结果]。)虽然这个碎片只有6%车道1中起始材料的强度预计为含有33%编码在完整融合中的蛋氨酸残基蛋白质。AQP1片段中可能保留有两个蛋氨酸残基(M1和M96)。消化P报告中的四种蛋氨酸残留物。(请注意,通道5中没有P-反应碎片。)M1未移除因为AQP1的17-残基胞质N末端是空间位阻的无法访问(什考奇等人。, 1994). 因此,在TM4的合成,myc表位在新生链的小部分(~20%)。

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XO中TM3的拓扑重定向。质粒在AQP1残基T120编码myc报告子,然后编码P报告子表达所示的TM3、TM4、TM5或TM6(分别为A–D)在XO中,在存在或不存在Triton X-100的情况下用PK消化(细节)如材料和方法中所述。样品为用抗myc(myc)或抗催乳素(P)抗血清免疫沉淀SDS-PAGE分析。(E) 全长AQP1.T120.myc的结果。向上箭头(B–E)表示PK保护的多肽片段由蛋白酶消化产生。向下箭头(C)表示细胞溶质环不可触及的全长链蛋白酶。每个自动射线图下方的图表指示电位通过PK消化推导出myc和P表位的拓扑结构。PK网站消化用箭头表示,而无法到达的部位用箭头表示用用线挡住的箭头表示。myc和P的拓扑报告人来源于基于受保护碎片的图案。

对于T120.myc。TM5公司T型构造,截断于V214残基,P报告基因移位到ER管腔(图(图3C)。C) ●●●●。P报告者的转位效率在实验,但为~50%(三个实验的平均值),一致已知信号序列活动编码在TM5中。这个导致残基N205的部分糖基化N42残基与三条全长蛋白带的出现(图(图3C,C、 车道1和4),如前所述(什考奇et(等)阿尔。, 1994). 15%至20%的新兴连锁店在没有洗涤剂的情况下,完全抵抗PK消化(图(图3C,C、 向下箭头)。因此,myc表位是在这些多肽中是无法接近的。PK消化也产生了几个myc-反应性、蛋白酶保护片段(图(图3C,C、 车道2,向上箭头)。有趣的是,一个30-kDa片段对两个P和myc抗体(图(图3C,C、 车道2和5,向上箭头)。由于P报告基因的大小为15 kDa,因此很可能产生了这个片段来自TM3 N末端的PK消化(预测的裂解位点如图所示图3C)。C) ●●●●。这将去除10–12 kDa的AQP1多肽并生成包含P报告子和额外的15 kDa糖基化、myc标记的AQP1多肽。这些碎片代表10%的初始信号,包含五个六个蛋氨酸残基存在于全长链中。较小的此外,还观察到16kDa大小的myc反应片段表示初始信号的2%,但仅包含33%的初始蛋氨酸残留物(图(图3C,C、 车道2)。这些的存在异质碎片表明有几种替代拓扑在AQP1的这个特定阶段,内质网膜中存在形式生物成因(图(图3C)。C) ●●●●。根据预测的蛋氨酸分布在融合蛋白中,我们计算出myc表位变成之后立即在35%的新生链中免受蛋白酶的影响TM5的合成。

T120.myc的蛋白酶消化。TM6公司T型建造生成两个29和26 kDa的myc反应性多肽片段(图(图3D,D、 向上箭头)。在这种情况下,尺寸的变化是由于去除P报告子和细胞溶质AQP1 C末端残基分别为糖基化和非糖基化多肽(注意图中无P保护碎片图3D,D、 车道5)。受保护的碎片代表16%的初始带强度,但仅包含33%的初始蛋氨酸残留。因此,myc表位是48%的合成链受到保护。同样,49%的从全长AQP1.T120.myc构造派生的链PK消化后生成29-kDa myc反应性核心片段。这个与42残留AQP1 C末端内的PK消化一致细胞溶质域(图(图3E)。E) ●●●●。每一个都有受保护的碎片因此,构建物代表AQP1的整个疏水核心与myc标签和N-连接低聚糖一起预测大小约为29 kDa。

这些结果表明,在XO中,AQP1-TM4、-TM5和-TM6与TM3-TM4肽的部分重新定向有关从其初始蛋白酶可获得的细胞溶质位置到蛋白酶保护的、对洗涤剂敏感的部位,可能位于ER中流明。

体外AQP1拓扑

在补充有犬胰腺微粒体膜的RRL中表达(客户关系管理)(什考奇等人。, 1994). 因此,我们测试了AQP1拓扑成熟也在体外重建。质粒T120毫米。TM4公司T型,-TM5T型、和-TM6公司T型全长AQP1.T120.myc为以RRL表示,并辅以CRM,报告拓扑为通过蛋白酶消化和免疫沉淀测定(图(图4A)。4A) ●●●●。生成的每个构件核心糖基化蛋白类似于在XO中观察到的蛋白。在CRM中,P在TMs 4和6(图(图4A,4A、 车道4-6和16-18)。当记者遵循TM5(构造T120.myc.TM5T型),两个PK消化后回收的P-反应片段包含信号强度的10%和初始蛋氨酸的三分之二残留物(图(图4A,4A、 车道10–12)。因此,记者被转移了TM5进入内质网腔,尽管易位再次启动(~15%)的效率明显低于XO。在这些链条中,TM5和TM6均以其预测方向跨越膜,TM5-TM6肽环位于内质网腔中。与…对比XO,myc表位保留细胞溶质,蛋白酶在>所有结构的90%,包括全长AQP1(对比图图4A,4A、 7–9和13–15车道,图图3)。). 这些发现表明补充CRM的RRL未能重新定位TM3-TM4肽循环并生成成熟的六跨AQP1拓扑。符合该发现AQP1.T120.myc也未能获得其抗蛋白酶核心构象。

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体外AQP1拓扑。的表达式T120毫米。TM4公司T型,-TM5T型、和-TM6T型RRL和犬胰腺微粒体(A)中的AQP1.T120.myc或卵母细胞来源的内质网膜(B)。翻译产品被消化PK和免疫沉淀,如图所示图3。.向上箭头表明多肽片段在没有洗涤剂,但没有洗涤剂。的潜在拓扑放射自显影图下显示的表位是从蛋白酶中推导出来的myc和P记者的可访问性。PK消化的位点是表明。

了解XO和RRL,我们尝试使用互补方法。在这方面,补充RRL卵母细胞胞浆和含CRM的体外微量注射将AQP1结构合成到XO中并没有显著改善AQP1成熟效率(我们未发表的结果)。然而,当AQP1构建物在RRL中表达,并辅以XO衍生ER膜(XOmb),myc标记的结构产生了一个紧密的拓扑类似于从完整XO中获得的XO(图(图4B)。4B) ●●●●。合成后TM4(T120.myc.TM4T型),P记者留下了细胞溶质,而myc表位在27%的新生链(图(图4B,4B、 车道1-6)。(注意16-kDamyc反应片段仅代表初始信号的9%强度。)TM5合成后(T120.myc.TM5T型),16%的新兴连锁店再次受到蛋白酶的完全保护(图(图4B,4B、 车道7–12)和a回收了PK保护的约30kDa片段,其中含有两种myc和P表位。正如我们在卵母细胞中观察到的那样,myc表位是在这个阶段,总共34%的新生链受到蛋白酶的保护合成阶段,该分数与P报告者的易位效率(31%)。类似地,在TM6的合成、P报告子和AQP1 C末端细胞溶质,而myc反应性蛋白酶保护的片段从T120.myc的60%中恢复。TM6公司T型和42%的AQP1.T120.myc新生链(图(图4B,4B、 13–15和19–21车道)。这些数据表明,在XOmb中,与完整XO中一样,TM3的重新定向TM4合成后开始,并且重新定向的效率随着合成额外的C末端TM片段而增加。

体内和体外AQP1成熟

确定TM3的不完全重新定向微注射XO和体外表达系统代表了我们研究了低效的成熟过程与延迟的成熟动力学全长myc标记AQP1结构的拓扑成熟使用脉冲相位分析。RNA注射后2小时在XO中,AQP1.T120.myc主要作为核心糖基化物回收表观大小为33 kDa的多肽。PK消化产生29-30kDa myc-反应片段,包含32%的初始片段放射性信号和66%的初始蛋氨酸残留。因此,48%的新合成AQP1蛋白获得了蛋白酶抗性合成后立即构象(图(图5,5、A和F)。在追逐期间,我们观察到分数和获得的核心糖基化AQP1蛋白的绝对量保护蛋白酶的构象。myc表位的蛋白酶保护在合成后5小时内达到78%的最大值(平均值三个实验;图5F)。5F) ●●●●。

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AQP1在体内和体内的拓扑成熟体外试验。编码AQP1.T120.myc的质粒在显微注射中表达爪蟾卵母细胞(A),RRL补充CRM(B),以及如前所述,RRL补充ER-衍生卵母细胞ER膜(D)材料和方法。在RNA注射后指示的时间(A) 或启动体外翻译(B–E),样本为用PK消化并免疫沉淀,如图所示图3和4。4.向下箭头表示糖化的全长AQP1链。向上箭头表示PK保护的AQP1疏水核。C类E显示分泌控制的蛋白酶保护结果蛋白质,牛催乳素,分别在CRM和XOmb中翻译和培养。(F) 蛋白酶AQP1.T120.myc的抗性由获得PK抗性的糖基化链。(G) 总AQP每个时间点的蛋白质。结果表示三至四个单独的实验±SE。

与XO相比,AQP1.T120.myc的<10%收购了RRL中的蛋白酶抗性构象1小时(图(图5B,5B、 车道1-3)。这一比例仅增加到23%在12小时的追逐过程中(图(图5B,5B、 车道4–12和5F)。对于这些实验表明,CRM在引导多肽方面的效率>95%移位,微粒体膜保持完整在追逐期间完全完好无损(图(图5C)。5C) ●●●●。附加实验表明,AQP1成熟效率当翻译和/或孵育在不同温度下进行(我们未公布的结果)。在RRL中补充有XOmb、34%和75%的糖基化AQP1.T120.myc在1和12小时内获得了一种抗蛋白酶构象,分别(图(图5,5、D和F)。RRL补充了XOmb,因此在促进AQP1拓扑成熟方面表现出类似的效率作为完整的卵母细胞。移位在XOmb中也很有效,并且膜的完整性在整个孵育期内保持不变(图(图5E)。5E) ●●●●。因此,AQP1未能在CRM中成熟并不仅仅是一个体外RRL系统的伪影,但却反映了特异性ER衍生微粒体膜的特性。重要的是不同内质网膜对直接易位的效率没有似乎可以预测他们重组其他事件的能力AQP1拓扑成熟所必需的。

排除myc表位保护增加的可能性可能是由于四跨结构的相对不稳定性,对每个时间点的总AQP1蛋白进行定量(图(图5G)。5G) ●●●●。每个系统的蛋白质都会逐渐丢失。然而,退化是缓慢的,并且发生的时间无法解释观察到的拓扑结构发生变化。在XO和XOmb中,超过90%的AQP1存在合成后5小时,在重新定向接近完成。

AQP1在ER衍生膜中的免疫吸附

为了进一步证实T120-myc表位被转位到在体外AQP1成熟过程中,我们测试了内质网内腔使用非蛋白水解剂可获得myc表位免疫吸附分析(图(图6)。6)。全长AQP1构建物AQP1.T120.myc和一种控制蛋白编码N末端myc标签(myc.AQP1)的基因在RRL中表达补充CRM或XOmb。微粒体在存在或不存在抗myc抗体并通过蔗糖沉淀缓冲。然后将吸附抗体回收的蛋白质与洗涤剂后免疫沉淀法回收蛋白质溶解作用。含有在CRM和XOmb中,N-末端myc表位均>50%(图(图6,6、A和C) ●●●●。这一结果与确定的细胞溶质相一致N端点的方向(Smith and Agre,1991年;什考奇et(等)阿尔。, 1994)并证明膜上的myc标签细胞溶质抗体可获得该蛋白。少于10%myc表位位于内质网腔(残基P77未发布的结果)。在CRM中AQP1.T120.myc结构在1和8小时内分别为55和45%翻译,分别表明myc表位在残基T120仍然主要可以从胞浆中获得在图中所示的四跨拓扑中预期图1。1.英寸然而,XOmb的免疫吸附效率最初只是23%,孵育8小时后降至13%,与myc表位重新定位为不可访问的一致,管腔位置(图(图6,6、B和C)。超过总AQP1的80%蛋白质在8h孵育期内恢复。这些发现支持蛋白质水解实验得出的结论,即XOmb,但不是CRM,有效重建T120-myc表位的易位进入ER管腔。

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myc标记AQP1的免疫吸附。质粒编码M1,myc残基的myc表位。AQP1(A)或残渣T120,AQP1.T120.myc(B),在CRM或翻译后,免疫吸附(IA)和按照材料和方法。(C) 免疫吸附回收的蛋白质百分比经过8h追踪期后,免疫沉淀法恢复了蛋白质。8小时后剩余的总蛋白质显示在自动射线照片。值表示对照质粒myc。AQP1和三个实验(±SE)AQP1.T120myc(AQP1.T120.myc)。

TM3的拓扑重定向涉及逆行移位N端侧翼残留物

如果AQP1从四跨转换为六跨通过TM3 180度旋转进行拓扑,然后作为TM3 C端子残基移位到内质网腔,TM3 N末端预计残留物会从内质网腔移到胞浆。我们使用AQP1.P77.myc构造测试了这一假设。研究顺序截断的P77-myc构造表示myc标记没有显著改变下游地形决定因素编码在TMs 4、5和6(我们的未发布的结果)。然而,如上所述,这些构造是XO表达不良。因此,我们确定了它们在RRL中的拓扑补充CRM或XOmb。

全长AQP1.P77.myc构建物的PK消化导致两个受蛋白酶保护的myc反应片段的出现(图(图7A)。7A) ●●●●。较大19-kDa的尺寸片段(修正为myc表位)与之前的易位和糖基化N-末端肽环显示为在四跨AQP1拓扑中包含TM1、TM2和TM3(什考奇等人。, 1994). 蛋氨酸调整后myc表位的平均转位效率CRM中全长糖基化链为53%(n=6)和33%单位为XOmb(n=4)(图(图7B)。7B) ●●●●。此外,myc表位变成翻译后XOmb中的PK越来越容易访问(87%14小时后可访问),而可访问性基本上保持不变在CRM中没有变化。AQP1稳定性在在不同的膜制备之间观察(图(图7C)。7C) ●●●●。这个重新定向的效率和动力学与T120.myc标记的构造。这可能是由于myc的其他影响AQP1折叠上的标记,因为AQP1.P77.myc不具备功能水道。与T120 myc构造的数据一起研究结果支持AQP1拓扑成熟涉及的模型TM3 N端和C端侧翼的协调重新定位残留到ER膜的对侧。

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TM3 N端的拓扑重定向侧翼残留物。(A) AQP1.P77.myc在RRL中表达,补充有使用PK和用抗myc抗体免疫沉淀,如图所示图4。4.向下箭头表示全长核心糖基化AQP1结构。向上的箭头表示衍生的糖基化myc反应片段来自全长多肽。该图显示了myc表位会产生受保护片段。(B) 脉冲相位分析AQP1.P77.myc以RRL表示,并辅以CRM(阴影条)或XOmb(实心棒)如图所示图5。5.表位百分比protected代表全长糖基化链的部分产生了19-kDa myc反应的PK保护片段。易位值根据蛋氨酸含量进行校正,并表示六个(CRM)或二到四个(XOmb)实验的平均值。(C) 总计蛋白质是七个(CRM)或五个(XOmb)实验的平均值对1小时时出现的蛋白质进行标准化(±SE)。

讨论

人们普遍认为,大多数真核生物的拓扑结构多面体蛋白在内质网膜上共同翻译形成并且一旦建立就在随后的步骤中保持加工和细胞内贩运。当前研究提供了这条规则的例外,并证明了初始共翻译ER膜的拓扑是动态的,可以通过以下方式进行修改随后的褶皱事件。具体而言,AQP1成熟过程通过涉及翻译后再定位的复杂途径三个内部TM片段和两个连接肽环。首字母易位事件是由序列共同翻译的信号和停止传输序列,产生松散折叠,蛋白酶敏感的四跨结构(什考奇等人。,1994). 在随后的成熟过程中,TM3 C末端侧翼残基翻译后从可访问的初始PK重新定向细胞溶质中的位置到内质网腔中PK保护的位置。同时,TM3 N末端侧翼残基发生逆行从内质网腔到胞浆的移位。我们建议事件与TM3 180度旋转进入成熟期有关II型拓扑和TM2和TM4在平面内的重新定位生成预测的六跨AQP1结构的膜,如如图所示图1。1虽然TM3重新定向最初是TM4和TM5合成后检测到合成所有六种TM后,重新定向显著增强部分。在完整的XO和XOmb中,AQP1成熟也与随着获得了一种抗蛋白酶的核心结构TM3重新定向伴随着TM螺旋的压实和/或最终成熟和功能性的细胞溶质肽环蛋白质。

这些发现对分子多胞蛋白在内质网中获得拓扑结构的机制膜。在真核蛋白合成过程中。,共平移)新生链的拓扑命运主要是取决于两个因素:核糖体与内质网膜的结合,以及Sec61易位通道的门控状态(克劳利et(等)阿尔。, 1994;等人。, 1996;等人。,1997;蛾类等人。, 1997). 当新生链退出时核糖体,它要么通过易位通道向内质网管腔或核糖体与胞质溶胶直接接触后离开(克劳利等人。, 1994;Jungnile和Rapoport,1995年;等人。, 1997;哈曼等人。, 1998). 准确地说调节核糖体结合状态和转座子门控信号多面体蛋白中的停止转移序列能够控制成长中的新兴产业链所面临的环境以共翻译方式的多面体蛋白质拓扑结构(比比,1998年)。因此,AQP1生物起源的初始事件可以部分解释通过TM1和TM5中编码的信号序列活动的作用以及TM3和TM6中编码的停止传输活动(什考奇et(等)阿尔。, 1994). 令人惊讶的结果是AQP1只收购通过这些共翻译事件的四个跨膜节段(什考奇等人。, 1994). 尤其是TM2无法终止易位(什考奇等人。, 1994)而且是暂时的位于内质网腔内,而TM3终止易位最初以与观察方向相反的方向跨越膜在成熟蛋白质中(普雷斯顿等人。, 1994)。

因此,AQP1成熟需要一种新的重新定向机制已达到中间水平的TM段(例如TM3)跨膜拓扑结构。TM3重新定向可能会发生在新生链从易位基因中释放后,并且螺旋填料期间(波波和恩格曼,1990年). 这样的过程似乎然而,不太可能,因为它需要极性和带电残留物穿过膜的疏水环境。相反,AQP1拓扑成熟似乎开始于该链仍与Sec61易位机制和/或其他ER蛋白。在这方面,碳酸盐萃取实验表明新生的AQP1链无法整合稳定地进入ER膜,直到至少三个TM片段合成的(什考奇等人。, 1994). 在当前研究中,TM3甚至在AQP1合成完成之前,重新定向似乎就开始了,在核糖体预计仍与Sec61结合的时候(Borel和Simon,1996年;蛾类等人。, 1997). 这个发现与易位孔的大内径一致(20–60 Å) (哈内因等人。, 1996;哈曼等人。,1997)以及最近的研究表明TM片段可能在进入脂质之前,在转座子内部或附近积聚双层(斯卡赫和林加帕,1993年;Lin和Addison,1995年;Borel和西蒙,1996;蛾类等人。, 1997). 因此,有可能内质网易位机制可能持有AQP1 N末端TM段处于中间折叠状态,直到下游合成TM段提供足够的信息,以便完成所有螺旋的折叠和膜集成(Hegde和Lingappa,1997). 下游折叠信息的缺失可以解释为什么截断T120.myc这样的构造。TM5公司T型未能有效获得抗蛋白酶核心构象表现出多种中间拓扑形式。

转座子相关蛋白可能发挥促进多面体蛋白质折叠的积极作用问题。TM段如何从translocon中退出在多面体蛋白生物发生过程中进行监测和调节?怎么会TM螺旋的积累影响或受转座子的影响门控?逆行和顺行易位肽段被促进了吗?进一步研究检查特定阶段TM螺旋的分子环境解决这些问题需要生物起源。

C末端易位报告子已被广泛用于研究多面体蛋白质拓扑结构和依赖上游的能力地形信息可以准确地指导下游的地形多肽片段(特拉克斯勒等人。, 1993). 此外,这该技术假设ER中蛋白质的初始拓扑结构膜准确地反映了蛋白质在其他地方的拓扑结构单元格。基于这个前提,我们之前建议四跨AQP1拓扑可能代表功能性水道单位(什考奇等人。, 1994). 然而,这似乎是四跨结构实际上是AQP1的折叠中间层成熟。因此,尽管C终端报告器技术提供了对蛋白质生物生成过程的宝贵见解不能准确预测最终拓扑,这取决于发生翻译后拓扑修改。应该注意到易位事件也会受到两种情况的影响记者和融合地点的选择。为了减少这种情况可能,我们使用了一个忠实且被动跟踪各种异源拓扑信号(罗斯曼等人。, 1988;查韦斯和霍尔,1992年). 此外,同源融合蛋白的检测相关的水通道蛋白、AQP4,以及使用相同的报告物和类似物融合位点表明TM2内的特定结构信息TM3负责观察到的异常生物生成途径AQP1类(等人。, 1995)。

最近,越来越多的真核蛋白质被认为在共翻译生物发生中表现出变异路径。通常,这些变化涉及局部交互相邻地形决定因素之间。例如,C端子TM已经观察到节段有助于易位和相邻N端TM段的定位,特别是那些TM相对较短或含有带电残留物的片段(卡拉米亚和马诺伊尔,1992年;威尔金森等人。, 1996;贝勒等人。, 1997;等人。, 1997;Schmidt-Rose和Jentsch,1997年;奥塔等人。, 1998). 在AQP1的情况下,拓扑成熟涉及蛋白质折叠的更多全局方面其中远端结构元素影响顺行以及逆行易位事件。因此,AQP1生物成因与Sec61p,其中蛋白质的C末端一半需要促进N末端半体的正确跨膜定向(威尔金森等人。, 1996). 非共翻译生物成因因此,路径可以部分解释为什么不同的拓扑结构当C终端报告员的结果为与其他分析技术的比较(阿达奇等人。,1994;Doan公司等人。, 1996;Schmidt-Rose和Jentsch,1997年;和格林沃尔德,1998年;Nakai公司等人。, 1999)。

需要注意的是,蛋白质拓扑的某些方面可能是依赖于表达系统。犬胰腺微粒体尽管如此,重建TM3重新定向的效率非常低它们在指导a的易位方面几乎100%有效分泌蛋白。相反,AQP1拓扑成熟度为在完整的XO和卵母细胞来源的ER膜中均有效观察到。之前曾报告过类似结果科比尔卡(1990),谁发现了XOmb而非CRM能够授予子表绑定属性对体外翻译的β肾上腺素能受体的蛋白酶抗性。一个有趣的可能性是某些多面体蛋白可能需要专门的组件来实现其正确的拓扑添加蛋白质移位所需的基本成分(对冲等人。, 1998;Hegde和Lingappa,1999年). 差异因此,在CRM和XOmb之间介导AQP1成熟,可能反映不同数量的易位相关因素不同的单元格类型。AQP1中的差异也可能成熟是由于不同的膜制备技术或,或者,生物发生的其他方面,如四聚体(Smith和Agre,1991年;妈妈等人。, 1993). 最后,尽管卵母细胞能有效生成功能性水通道蛋白,目前尚不清楚哺乳动物细胞中的AQP生物发生是否会表现出更多折叠变化。进一步研究如何定义不同ER膜介导AQP1成熟的制剂无疑将提供洞察力多面体蛋白质生物发生的这些独特方面。

致谢

作者感谢Skach实验室的成员对手稿进行有益的讨论和评论,并向K。Moss寻求技术援助。这项工作得到了National的支持卫生研究院资助GM 53457和DK51818。W.R.S.是一个美国心脏协会的资深研究员。

使用的缩写:

AQP公司水通道蛋白
客户关系管理粗犬齿微粒体
急诊室内质网
PK(主键)蛋白酶K
RRL公司兔子网织红细胞裂解物
TM(TM)跨膜
XO公司爪蟾莱维斯卵母细胞
XOmb(XOmb)爪蟾卵母细胞衍生ER薄膜

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文章来自细胞的分子生物学由以下人员提供美国细胞生物学学会