跳到主要内容
访问密钥 NCBI主页 MyNCBI主页 主要内容 主导航
核酸研究。1997年3月15日;25(6): 1155–1161.
数字对象标识:10.1093/nar/256.1155
预防性维修识别码:项目经理146580
PMID:9092624

影响核酸与寡核苷酸阵列杂交的空间因素。

摘要

我们研究了使用间隔分子来减少载体对固定化寡核苷酸杂交行为的空间位阻。这些间隔物由多种单体单元通过磷酰胺化学作用,缩合到胺功能化聚丙烯载体上而形成。最佳间隔区长度被确定为至少40个原子的长度,从而使杂交产率提高了150倍。还研究了间隔物中不同带电基团的影响,结果表明,间隔物中的正负电荷基团都会降低杂交的产量。如果连接到支架上的寡核苷酸彼此过于接近,杂交中的立体障碍也可能是一个问题。使用可切割和稳定的连接剂组合改变表面覆盖率,使含有约50%最大寡核苷酸浓度的表面的杂交产率最高。

全文

本文全文可作为PDF格式(179K)。

选定的引用

这些参考文献在PubMed中。这可能不是本文的完整参考文献列表。

  • Gallop MA、Barrett RW、Dower WJ、Fodor SP、Gordon EM。组合技术在药物发现中的应用。1.背景和肽组合库。医学化学杂志。1994年4月29日;37(9):1233–1251.[公共医学][谷歌学者]
  • Drmanac R,Labat I,Brukner I,Crkvenjakov R。通过杂交对大碱基和DNA进行测序:方法理论。基因组学。1989年2月;4(2):114–128.[公共医学][谷歌学者]
  • Khrapko KR、Lysov YuP、Khorlin AA、Ivanov IB、Yershov GM、Vasilenko SK、Florentiev VL、Mirzabekov AD。一种通过寡核苷酸基质杂交进行DNA测序的方法。DNA序列。1991;1(6):375–388.[公共医学][谷歌学者]
  • Guo Z、Guilfoyle RA、Thiel AJ、Wang R、Smith LM。通过在玻璃支架上用寡核苷酸阵列杂交直接荧光分析遗传多态性。核酸研究。1994年12月11日;22(24):5456–5465. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
  • Fodor SP、Read JL、Pirrung MC、Stryer L、Lu AT、Solas D.光定向、空间寻址并行化学合成。科学。1991年2月15日;251(4995):767–773.[公共医学][谷歌学者]
  • Southern EM,Maskos U。大量相关化合物的平行合成和分析:寡核苷酸的应用。生物技术杂志。1994年6月30日;35(2-3):217–227.[公共医学][谷歌学者]
  • Maskos U,Southern EM.寡核苷酸(寡核苷酸)相互作用的平行分析。影响寡核苷酸双链形成的因素分析。核酸研究。1992年4月11日;20(7):1675–1678. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
  • Maskos U,Southern EM。玻璃载体上的寡核苷酸杂交:寡核苷酸合成的新型连接物和原位合成寡核苷酸的杂交特性。核酸研究。1992年4月11日;20(7):1679–1684. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
  • Maskos U,Southern EM。一项使用在玻璃支撑物上合成的大型寡核苷酸阵列进行寡核苷酸重组的研究。核酸研究。1993年10月11日;21(20):4663–4669. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
  • Case-Green SC,Southern EM.通过固相杂交研究脱氧核苷与寡核苷酸的碱基配对特性。核酸研究。1994年1月25日;22(2):131–136. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
  • Williams JC、Case-Green SC、Mir KU、Southern EM。通过杂交到阵列的寡核苷酸相互作用研究:悬垂末端对双链产量的影响。核酸研究。1994年4月25日;22(8):1365–1367. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
  • Southern EM、Case-Green SC、Elder JK、Johnson M、Mir KU、Wang L、Williams JC。用于分析核酸杂交行为的互补寡核苷酸阵列。核酸研究。1994年4月25日;22(8):1368–1373. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
  • Seela F,Kaiser K。含有1,3-丙二醇作为核苷替代物的寡核苷酸。核酸研究。1987年4月10日;15(7):3113–3129. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
  • Durand M、Chevrie K、Chassignol M、Thoung NT、Maurizot JC。含有由六乙二醇链组成的发夹环的寡核苷酸的圆二色性研究:构象和稳定性。核酸研究。1990年11月11日;18(21):6353–6359. [PMC免费文章][公共医学][谷歌学者]
  • Matson RS、Rampal JB、Coassin PJ。聚丙烯载体上的生物聚合物合成。I.寡核苷酸。Anal生物化学。1994年3月;217(2):306–310.[公共医学][谷歌学者]
  • Frydman Benjamin、Westler William M、Samejima Keijiro。精胺在溶液中与tRNA(Phe)的TpsiC环结合:来自750 MHz(1)H-NMR分析的证据。组织化学杂志。1996年4月19日;61(8):2588–2589.[公共医学][谷歌学者]

文章来自核酸研究由以下人员提供牛津大学出版社