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细胞分子生命科学。2010年6月;67(11): 1919–1927.
2010年2月26日在线发布。 数字对象标识:2007年10月10日/00018-010-0302-1
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PMID:20186458

A类629RKLKK公司633铰链区的基序在多个水平上控制雄激素受体

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摘要

雄激素受体蛋白具有参与DNA结合、配体结合和反式激活的特定结构域,其活性需要在转录激活过程中整合。铰链区域,更具体地说629RKLKK公司633母题似乎在这一过程中起着至关重要的作用。事实上,尽管该基序不是DNA结合域的一部分,但其阳性残基参与了最佳DNA结合和核移位,如突变分析所示。然而,当突变的AR被迫进入细胞核时,残基似乎在反式激活中发挥不同的作用。此外,我们通过FRAP分析表明,在激活过程中,AR分布在细胞核中的一个活动部分和两个不活动部分,并且AR的突变发生在细胞核中629RKLKK公司633模体影响AR在这三个核内部分的分布。总的来说629RKLKK公司633基序是一个多功能基序,集核定位、受体稳定性、DNA结合、反式激活电位和核内流动性于一体。

电子辅助材料

本文的在线版本(doi:10.1007/s00018-010-0302-1)包含对授权用户可用的补充材料。

关键词:雄激素受体,DNA结合,铰链区,核内流动性,转录活性

介绍

雄激素受体(AR)属于核受体的超家族。在配体结合后,AR转位到细胞核,与特定的DNA反应元件结合,然后通过共调节复合物的募集来调节基因表达。这些复合物重塑染色质,改变DNA拓扑结构,增强转录过程的不同步骤。尽管体外生物化学分析大量记录了核受体这一一般作用机制的主要步骤,但对不同参与者体内动力学的研究却很有限,有时难以调和[1].

与所有核受体一样,AR具有一个DNA-结合域(DBD),其N末端由一个复合激活域(NTD)两侧,C末端由配体结合域(LBD)两侧。尽管这些域中的每一个都可以自主活动,但它们的功能需要整合在正确的时空序列中,以实现目标基因的正确反式激活。

连接DBD和LBD的铰链最初被认为只是一个灵活的连接物,但后来有证据表明,它对控制核受体的活性起着至关重要的作用[2,]. DNA上ppARγ-RXRα异二聚体的晶体结构表明,该区域与DNA结合和受体-受体相互作用有关[4]. Bag-1M是一种协同伴侣蛋白,与糖皮质激素受体的铰链相互作用并下调反式激活[5]. 维甲酸受体-α、糖皮质激素受体和雌激素受体-α的活性受翻译后修饰如甲基化的调节[69]和铰链区域的乙酰化[8,10].

对于AR,铰链也与DNA结合有关[11],核定位[1214],是翻译后修改的目标[15]. 此外,许多共同调节蛋白依赖于铰链与AR的适当相互作用,在前列腺癌活检和雄激素不敏感综合征中分别描述了铰链突变的激活和失活[16,17].

在这里,我们确定一个629RKLKK公司633我们得出了令人惊讶的结论,突变对转录活性、DNA结合、核移位和核内不动性的影响完全出乎意料。我们的数据明显挑战了目前核受体转录调控的简化概念,尤其是AR。

材料和方法

质体构筑

pSG5-前面已经描述了flag-wtAR质粒和Δ629–636缺失突变体(称为Δ11)[19]. 通过使用两个内部引物和两个外部引物的两步PCR定点突变,创建了含有单、双或四个氨基酸替换的标记全长AR突变体。由此产生的突变人类AR cDNA片段被克隆为后面的三/Psy(磅/平方英寸)I片段进入pSG5-flag-wtAR结构,其中相应的片段已被相同的限制性内切酶切除。pEGFP-(GA)6-wtAR和pEGFP-(GA)6-A573D分别编码全长野生型人类AR和全长人类AR DNA结合突变体(A573D),并且两者都以N末端融合到增强型绿色荧光蛋白(EGFP),之前在[20]. 通过将后面的三/生态pSG中的RI片段5携带pEGFP-(GA)相应突变的表达载体6-wtAR矢量,其中后面的三/生态RI片段已被移除。缺失突变体Δ629–636先前在[19]其中它被称为Δ11。pEGFP-NLS-(GA)6-通过插入编码SV40-NLS(PKKKRKVD)的寡核苷酸来创建wtAR表达质粒Bgl公司II和巴姆HI粘性端进入pEGFP-(GA)6-用消解的wtAR矢量Bgl公司二、。同样,为A573D、∆629–636、R629/K630V、K632/K633V和RKKK/VVVV突变体创建EGFP-NLS-AR表达载体。为了简单起见,R629/K630V、K632/K633V和R629/K630/K632/K633V突变体分别重命名为RK、KK和RK+KK突变体。

细胞培养、瞬时转染和稳定细胞系的产生

如前所述,维持HeLa和COS-7细胞[19]. 建立表达各种EGFP-NLS-AR蛋白的Hep3B细胞系并按所述进行培养[20]. Denayer等人通过将pcDNA5/FRT/TO衍生载体整合到HEK 293 FLP-In细胞系中,建立了稳定的MMTV报告细胞系[18]. 如前所述进行瞬时转染[19].

免疫细胞化学和荧光显微镜

将HeLa细胞以6×10接种到有腔盖玻璃四孔Labtek II载玻片(Sanbio)中4细胞/孔。第二天,每孔细胞转染200 ng AR表达载体。固定前用10 nM R1881刺激细胞1小时。蛋白质用M2抗标记抗体(Stratagene)进行免疫染色,然后用TRITC结合的山羊抗鼠抗体(Sigma-Aldrich)孵育。利用蔡司LSM510共焦扫描显微镜(Carl Zeiss)通过荧光显微镜分析表达蛋白的亚细胞分布。

电泳迁移率变化分析

电泳迁移率变化分析如所述进行[19]. 对于超转移,在探针之前向提取物中添加1μl三倍稀释的M2抗标记抗体。

FRAP与FRAP数据的计算机分析

FRAP研究和计算机分析按所述进行[20]. FRAP曲线是通过蒙特卡洛计算机模拟生成的。在模拟具有不同动力学的两个固定部分时,每个单位时间步长评估两个固定/动员概率。FRAP实验数据拟合到模拟曲线,假设自由扩散,扩散系数为5.76μm2/s(根据A573D突变体计算),或假设存在扩散系数为1.44μm的固定组分(wtAR)2/第条。

结果

铰链中假定的α-螺旋

已知AR铰链区的一些前列腺癌突变和缺失会导致反式激活潜能增加[19]. 在这里,我们着手确定这一现象的潜在机制和涉及的氨基酸。因此,我们通过用缬氨酸替换A628到T648的每个残基来建立缬氨酸筛选,并分析对转录活性的影响(图1a) ●●●●。从我们在铰链区域引入的21个点突变中,只有那些影响正电荷(R或K)的突变导致AR活性的小幅度增加(图1a) ●●●●。只有R629V和K630V突变体表现出统计上显著的活性增加。有趣的是,这些残留物位于629RKLKK公司633被描述为核易位信号的基序[13]. 因此,我们研究了几种突变对AR核转位的影响。与wtAR相比,当带正电残基受到影响时,我们发现核转运受损(图1c) ●●●●。关于该基序中的其他残基,只有G635V突变体表现出核易位减少。

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AR铰链区域的替代分析。功能分析。如图所示,一个基于TAT-GRE的报告子与AR表达质粒共同转染HeLa细胞。结果显示为10 nM R1881诱导因子±SEM*第页<0.05与学生确定的wtARt吨-测试。每个突变体的Western blot数据如下所示X(X)-轴。b条电动迁移分析。标记的TAT-GRE探针与含有所示突变AR的细胞提取物孵育。移位的复合物用箭头。超换档,用星号通过添加抗标记抗体获得。提取物的免疫印迹如右图所示。c(c)核移位研究。用指示的AR表达载体转染HeLa细胞,刺激、固定和免疫染色。荧光显微镜分析表达的AR蛋白的细胞定位

结构预测程序Predictprotein[21],提出氨基酸G627和N636之间的部分铰链区域形成两位α-螺旋(补充图1a)。为了确定活性增加是否是该假定螺旋结构破坏的结果,我们通过将A628、L631和L634转化为天冬酰胺(A628N、L631N、L624N)来破坏该螺旋,但我们没有观察到AR活性的任何显著变化(补充图1b)。此外,L631P和L634P突变对活性也没有影响。相比之下,K632P和K633P突变显示出增加的活性(补充图1c)与图中所示的K632V和K633V的活性非常相似1a.因此,侧链的带电性质而非二级结构对该区域的抑制功能至关重要。每组突变体的蛋白质印迹表明,它们的表达水平与wtAR相似(图1a和补充图1d)。

的多种功能629RKLKK公司633铰链图案

一些前列腺癌突变以及铰链区的实验性缺失导致AR的反式激活潜能增加[10,19]. 铰链区域的突变分析表明,影响带正电残基的取代导致AR活性增加(图1和补充图1)。只有在分析了双突变体后,我们才观察到对DNA结合的影响(图2b) ●●●●。然而,双RK和KK突变体受到的影响不同。KK双突变体能很好地结合DNA并进行核移位,但效力显著增加,而RK和四重RK+KK突变体活性降低,核导入量大大减少,对DNA的亲和力低(图2).

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重复或四重复突变对629RKLKK公司633动机。功能分析。如图所示,一个基于TAT-GRE的报告子与AR表达质粒共同转染HeLa细胞。结果显示为归一化荧光素酶单位。每个突变体的Western blot数据如下所示X(X)-轴。b条电泳迁移率变化分析。标记的TAT-GRE探针与突变AR过度表达的细胞提取物孵育。移位络合物用箭头。超换档,用星号通过添加抗标记抗体获得。提取物的蛋白质印迹在正确的.c(c)核移位研究。用指示的AR表达载体转染HeLa细胞,刺激、固定和免疫染色。荧光显微镜分析表达的AR蛋白的细胞定位

这四个带电残基形成了我们这里所说的629RKLKK公司633与核移位信号重叠的基序[12]. 为了排除∆629–636、RK、KK和RK+KK突变体活性的变化是其受损核易位的直接影响,AR突变体被融合到EGFP正负SV40-NLS。这些融合蛋白在激素刺激后均显示核定位。SV40-NLS融合不会改变wtAR和KK突变体在基于质粒或基于染色质的模板上进行私有转录的能力。尽管其DNA结合减少(图2b) NLS融合拯救了RK突变体,而四重RK+KK突变体则没有(图).

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当定位于细胞核时,铰链区突变体的活性。核定位研究。稳定表达EGFP-NLS-AR蛋白的Hep3B细胞的共焦图像。b条功能分析。用所示表达载体瞬时转染Hep3B细胞或MMTV稳定细胞系。对于Hep3B细胞,TAT-GRE-luc报告子被联合转染。结果显示为归一化荧光素酶值±SEM。c(c)蛋白质印迹。与EGFP加或减SV40-NLS融合的指示受体蛋白在HeLa细胞中表达,并用抗标记抗体检测

这个629RKLKK公司633基序调节核内迁移率

EGFP的融合也使研究629RKLKK公司633通过光漂白后荧光恢复(FRAP)分析研究体内核内流动性的基序突变。对于失去DNA结合的非活性AR突变体(A573D),只能计算出一个流动部分。在我们的FRAP实验中,将这种高流动性DNA结合突变体作为对照。这些数据与以前的报告一致[20].

在图中4a、 wtAR的FRAP曲线显示了相对较慢的扩散和二次再分配,这是分布在流动和暂时不流动部分上的蛋白质的典型特征。在并行FRAP实验中,所有AR铰链突变体的恢复速度都比wtAR快(图4a和b)。在恢复的前几秒,对曲线进行更仔细的检查,发现了迁移率的显著差异(图4c和d)。

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用FRAP测量EGFP-NLS-AR蛋白的核内分布和迁移率。d日实验FRAP数据的拟合曲线。为了进行比较,在所有曲线上绘制了wtAR的FRAP数据。进行了三个独立的实验,数据代表了至少45个细胞的平均值。e(电子)FRAP数据分析的示意图。FRAP数据与具有固定组分和停留时间指示参数的模拟曲线拟合得最好。长固定分数(LIF)和短固定分数(SIF)内的分子百分比在饼图。假设其余分子均位于自由扩散的流动部分。停留时间表征单个AR的平均固定时间(秒)。各种LIF的计算停留时间显示在饼图

拟合FRAP数据的计算分析

利用计算机模拟对FRAP数据进行分析,得出三个定量迁移率参数,即:扩散系数、固定化分数和保留时间。这些最拟合的模拟表明,wtAR可能分布在至少三个不同的分数之间(图4e) ●●●●。大约四分之一的wtAR分子参与长时间不动部分(LIF),保留时间约为12秒。其次,一半的AR分子参与短寿命的结合类型,这里称为短不动分数(SIF),估计保留时间为0.1秒。剩余的AR分子被称为流动部分,与DBD突变体类似,自由扩散。对于Δ629–636突变体,尽管分子在不同组分中的分布不同,但观察到类似的双结合行为(图4e) ●●●●。对于RK突变体,似乎没有LIF,这些受体中只有10%位于SIF中。相比之下,KK突变曲线表明SIF完全丧失,LIF中仅存在5%的受体。相反,将629RKLKK公司633该基序导致不动AR分数显著增加。

讨论

类固醇受体的铰链区在核转位和DNA结合中的作用已被充分证明,但其在反式激活特性中的可能含义尚不清楚[11,2225]. 删除629RKLKK公司633AR铰链的基序导致了一个受体,其与DNA的结合强度大大降低,并被排除在细胞核之外,但其反式激活潜能增加[19]. 为了解释这些数据之间的明显矛盾,我们剖析了这个基序,并将不同的功能归于不同的残基。

核移位和反式激活

首先,我们确认了629RKLKK公司633模体参与激素诱导的核移位和AR的转录活性(图1和补充图1). 由于RKLKLGN片段的缺失早先被证明足以诱导更高的AR活性,我们进一步将注意力集中在这部分的阳性残基上。赖氨酸K638的突变似乎也有轻微增加的活性(图1a) ●●●●。由于这种增加在统计上并不显著,K638残基被排除在进一步研究之外。

R629和K630对于配体诱导的核移位至关重要(图2c和表1)这很可能是这些突变体活性降低的原因(图2a) ●●●●。K632和K633作为核转位的次级调节因子(图2c) ●●●●。我们的数据符合最近描述的AR NLS–importinα复合物的晶体结构[13]. NLS内的单点突变降低了导入蛋白-α的结合亲和力,从而影响核易位。

表1

wtAR和突变蛋白的结果总结

不带SV40-NLSEGFP-SV40-NLS公司
活动本地化DNA结合长不动分数短固定分数
水处理报告北卡罗来纳州25%50%
Δ629–636↑↑↑否>C↓↓
韩国N<C↓↓↓↓
KK公司↑↑否>C
RK+KKN<CND(无损检测)ND(无损检测)

wtAR、Δ629–636、RK、KK和RK+KK的数据如图所示2,,3,,以及和44在之前的研究中[19]总结了。在没有SV40-NLS的情况下观察到转录活性、细胞定位和DNA结合亲和力。长不动部分和短不动部分的数据来自EGFP-NLS融合蛋白的FRAP实验

箭头饰面向上地代表增长,而箭头朝下表示减少。这个箭头数量描述了与wtAR相关的增加或减少的相对程度。水平箭头表示类似于wtAR的行为,而破折号表示功能丧失

LIF公司长不动分数,证券投资基金短不动分数,ND(无损检测)未确定

带正电残基在调节转录活性中的重要性(图1a) 在使用双重或四重替换时得到确认(图a) ●●●●。为了消除核易位变化对各种AR突变体活性的影响,将它们融合到SV40-NLS(图b) ●●●●。这并不影响wtAR和KK蛋白的活性,它们在没有SV40-NLS的情况下已经转移到细胞核中(图2c) ●●●●。Δ629–636和RK蛋白在没有SV40-NLS的情况下几乎具有唯一的细胞质部分(图2c)[19]. 添加NLS有助于两个突变体的核移位(图a) 并且RK突变体的活性显著增加(图b) ●●●●。在染色模板上,但在瞬时转染中,NLS与KK突变体的融合降低了活性。原因尚不清楚。

用EGFP-NLS-RK进行的实验表明,残基R629和K630对于转移到细胞核是必需的,但对于AR的反式激活特性则不是必需的。这意味着AR的核定位是雄激素诱导的完全反应所必需的,但是这也意味着雄激素诱导反应的核定位629RKLKK公司633模体在AR的反式激活机制中具有额外的独立作用。

DNA结合与核内迁移

AR通过雄激素反应报告基因进行转录激活的一个明显必要步骤是直接结合DNA。这个629RKLKK公司633该基序在体外明显参与AR与雄激素反应元件(AREs)的结合。令人惊讶的是,与wtAR相比,所有体外DNA亲和力降低的突变蛋白都具有更高的活性(表1). 然而,当带正电的残留物在629RKLKK公司633基序全部被取代,蛋白质不再具有转录活性,即使被迫进入细胞核。这很可能是RK+KK突变体无法与ARE结合的结果(图2b) ●●●●。

为了调和are体外亲和力的强烈降低与反式激活增加之间的关系,我们提出突变AR在雄激素调节增强子处循环更快。核受体(如糖皮质激素受体和雌激素受体)的“打-跑”机制现在已经建立[1,26,27]. 在这个模型中,受体只与启动子短暂相互作用(“hit”)。其他因素被招募,如染色质重塑复合物、组蛋白修饰复合物和转录机制的成分以时间调节的顺序方式[1,26,27]. 受体本身被激素反应元件(“run”)取代。这种快速的“打-射”循环可能会导致更快的招募,从而导致共激活物复合物的循环。更快的循环应该会导致ARE的RNA聚合酶II招募/启动增强。

为了研究629RKLKK公司633我们利用FRAP技术(图4a–d)。为此,我们开发了稳定表达上述EGFP-NLS-AR蛋白的细胞系(Hep3B)。激素刺激1h后,所有稳定表达的蛋白主要定位于细胞核。在图中4,wtAR的FRAP曲线显示了相对较慢的扩散和二次再分配,这表明该蛋白质同时具有流动和暂时不动部分。对于失去DNA结合的非活性AR突变体(A573D),只能计算出一个流动部分。在我们的FRAP实验中,将这种高流动性DNA结合突变体作为对照。这些数据与以前的报告一致[20].

实验数据的计算分析使我们能够证明wtAR分布在至少三个不同的部分之间:LIF、SIF和自由扩散部分(图4e) ●●●●。以前已经证明其他转录因子在两个不动组分之间的分布[29]. 此外,对于AR Klokk等人[26]在染色质化MMTV-LTR启动子阵列上显示两个暂时不动的组分。通过特定AR突变体,我们提供了第一行证据,证明AR作用是通过与亚核结构的交替作用时间在亚核水平上进行调节的,并且这种调节是由铰链区域N末端的带正电残基维持的(表1).

基于DNA结合与FRAP数据之间的相关性629RKLKK公司633基序突变体,不动组分的差异很可能是由改变的DNA结合特性来解释的。DNA结合缺失导致AR自由迁移。较低的体外DNA结合亲和力与两种流动组分的减少相关。我们提出LIF与体外DNA高亲和力之间的联系,因为参与强DNA结合的残基R629和K630对LIF也是必不可少的。根据所提供的数据,我们无法排除AR的长不动部分和短不动部分背后的机制。

转录活性增加和DNA结合亲和力降低与LIF中停留时间缩短之间的相关性支持我们的理论,即响应元件的更快循环导致更高的活性(表1). 解释这些明显矛盾的一个可能的假设是我们所说的“锚理论”。在最近提出的一个模型中,序列特异性结合蛋白可以在细胞核中快速扩散,并在很短的时间内与染色质非特异性结合[30]. 或者,它可以沿着染色质纤维滑动,直到遇到特定的位点,从而产生更稳定的结合。在我们的锚定理论中,我们建议629RKLKK公司633基序是染色质中DNA相互作用的稳定剂。这可以解释为什么RK和KK突变体对ARE的亲和力降低,LIF和SIF降低。例如,其中一个组分可能含有对染色质进行ARE扫描的受体。

确实很容易推测,不动部分代表DNA或染色质结合受体。然而,不同固定组分之间的AR分布和组成可能不仅取决于DNA结合。看看不同的共激活剂在不同的固定组分中的作用是什么,这将是一件有趣的事情。

转录产物复合物很少在启动子上形成[1,30]. 转录启动需要发生特定的事件序列。每一个这样的事件都是许多快速的随机和短暂的因素碰撞的结果,这些因素都是无效的[1,30]. 事实上,两种固定组分LIF和SIF之间的差异可以通过AR和共同调节器之间的相互作用来解释。我们引入的突变可能对铰链相互作用的协调剂有不同的影响。事实上,大量的共调节因子已被证明在与铰链重叠的位点与AR相互作用,包括共激活因子[10,3138],也包括共加压剂[10,31,39]. 此外630KLKK公司633基序可以改变共同调节因子p300、HDAC1和NCoR的结合[10,31]. AR的铰链区域可以通过磷酸化、乙酰化、SUMO化、neddylation和泛素化进行修饰,这些共价变化影响受体的稳定性、亚细胞定位以及与其他蛋白质的相互作用[40,41]. 众多可能的交互伙伴可以产生不同的复合物,每个复合物都有自己的移动性和交易激活潜力。

总的来说629RKLKK公司633AR铰链区的基序是一个多功能结构域,它整合了核定位、受体稳定性、DNA结合、反式激活电位和核内流动性(表1). 在这项研究中,我们定义了629RKLKK公司633这些过程中的主题。减少DNA结合但保留活性的突变表明核内流动性增加。我们提供的第一行证据表明,AR作用是通过与亚核结构的交替作用时间在亚核水平上调节的,并且629RKLKK公司633铰链区的基序在这些过程中起着至关重要的作用。目前,这些不同组分的特征尚不清楚,但DNA/染色质的相互作用而非辅激活剂的招募似乎是主要因素。

致谢

这项工作得到了“Bijzonder Onderzoeksfonds K.U.Leuven”(Onderzoekstoelage和CREA/08/031)的资助;法兰德斯研究基金会(F.W.O.拨款1.5.065.05);以及国会指导的医学研究项目(前列腺癌研究项目奖DAMD17-02-1-0082)。C.H.持有F.W.O.博士奖学金,a.H.是F.W.O博士后研究员。

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文章来自细胞和分子生命科学:CMLS由以下人员提供施普林格