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| 状态 |
2024年5月20日公开 |
| 标题 |
国家编目5 |
| 样品类型 |
SRA公司 |
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| 源名称 |
海马
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| 有机体 |
褐家鼠 |
| 特点 |
组织：海马
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| 提取的分子 |
总核糖核酸 |
| 提取协议 |
使用HiPure Unviersal RNA Mini Kit（Magen）采集RNA。使用1.3 ug总RNA构建测序文库。
使用VAHTS通用V10 Illumina RNA-seq文库制备试剂盒（Vazyme）构建了链特异性文库。
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| 图书馆战略 |
RNA-Seq号 |
| 库源 |
转录组学的 |
| 库选择 |
cDNA |
| 仪器型号 |
Illumina NovaSeq公司6000 |
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| 描述 |
国家编目5
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| 数据处理 |
原始数据由Skewer处理，数据质量由FastQC v0.11.5检查(网址：//www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/）。
使用STAR将干净的读数与大鼠参考基因组mRatBN7.2对齐。
转录物的表达是通过使用Perl的FPKM（每百万映射读取外显子模型的每千碱基片段数）计算的。
装配：mRatBN7.2
补充文件格式和内容：制表符分隔的文本文件包括每个样本的原始计数
补充文件格式和内容：制表符分隔的文本文件包括每个样本的FPKM原始值
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| 提交日期 |
2023年11月13日 |
| 上次更新日期 |
2024年5月20日 |
| 联系人姓名 |
赵厚玉 |
| 电子邮件 |
zhy117820@126.com
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| 电话 |
18019157705
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| 组织名称 |
海军医学大学
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| 街道地址 |
上海市杨浦区盘山路5号
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| 西蒂 |
上海 |
| 省/自治区 |
杨浦区 |
| 邮政编码 |
200433 |
| 国家 |
中国 |
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| 平台ID |
GPL25947型 |
| 系列（1） |
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| 关系 |
| 生物样品 |
SAMN38237903号 |
| SRA公司 |
SRX22515654型 |
