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| 状态 |
2024年1月24日公开 |
| 标题 |
LSEC；柠檬酸铁注射小鼠，代表3 |
| 样品类型 |
SRA公司 |
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| 源名称 |
肝脏
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| 有机体 |
小家鼠 |
| 特点 |
组织：肝脏
细胞系：LSEC
细胞类型：FAC分类的LSEC（CD45-dim，STAB2-high，CD146-high）
基因型：野生型
治疗：静脉注射柠檬酸铁（150 ug）5小时
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| 治疗方案 |
不适用
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| 生长方案 |
不适用
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| 提取的分子 |
总核糖核酸 |
| 提取协议 |
根据制造商的说明，使用TRIzol™LS试剂（ThermoScientific，#10296028）提取分选的LSEC中的RNA，并进行额外的糖原RNA沉淀步骤（Thermo Scientistic，#R0551）。
根据制造商的协议（Thermo Fisher Scientific），使用Ion AmpliSeq™转录组小鼠基因表达试剂盒制备文库
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| 图书馆战略 |
RNA-Seq号 |
| 图书馆来源 |
转录组学的 |
| 库选择 |
cDNA |
| 仪器型号 |
离子激流质子 |
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| 描述 |
雌性Balb/c小鼠
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| 数据处理 |
使用Ion Torrent RNASEQ分析管道（Torrent Suite 5.0.4版）处理原始读取
htseq-count，版本0.6.0，默认参数
DESeq2，版本1.18.1，规范化
程序集：AmpliSeq鼠标转录组v1
补充文件格式和内容：htseq规范化计数
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| 提交日期 |
2023年6月23日 |
| 上次更新日期 |
2024年1月24日 |
| 联系人姓名 |
米查？米库拉 |
| 电子邮件 |
mikula.michal@gmail.com
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| 电话 |
+48225462655
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| 组织名称 |
Maria Skłodowska-Curie国家肿瘤研究所
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| 部门 |
遗传学
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| 街道地址 |
伦琴5
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| 西蒂 |
华沙 |
| 邮政编码 |
02781 |
| 国家 |
波兰 |
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| 平台ID |
GPL18635型 |
| 系列（2） |
| GSE235692标准 |
NRF2通过MAPK p38-ETS1诱导的依赖性铁触发信号调节LSEC Bmp6 mRNA表达[I] |
| GSE235976标准 |
NRF2通过MAPK p38-ETS1依赖性铁触发信号调节LSEC Bmp6 mRNA表达 |
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| 关系 |
| 生物样品 |
SAMN35881681号 |
| SRA公司 |
SRX20765468号 |
