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样品GSM713210 GSM713210的查询数据集
状态 2011年4月22日公开
标题 乳腺活检,样本7重复1
样品类型 核糖核酸
 
源名称 乳腺针活检,预处理,非CR
有机体 智人
特点 组织:乳腺肿瘤活检
治疗:剂量前密集型多西紫杉醇
病理完全反应:无
示例:7
复制:1
治疗方案 所有样本均来自预处理患者。
生长方案 所有样本均来自冷冻初级乳腺针活检。
提取的分子 总核糖核酸
提取协议 冰冻活组织切片,激光捕获显微切割侵袭性肿瘤细胞,并按照制造商的说明分离总RNA。
标签 生物素
标签协议 参见范德比尔特微阵列共享资源(http://array.mc.vanderbilt.edu/).
 
杂交协议 参见范德比尔特微阵列共享资源(http://array.mc.vanderbilt.edu/).
扫描协议 参见范德比尔特微阵列共享资源(http://array.mc.vanderbilt.edu/).
描述 6817-A-589JP50
预处理乳腺穿刺活检的基因表达数据。
数据处理 对有应答和无应答患者肿瘤样本之间差异表达探针的数据进行分析。使用GeneSpring GX软件(Agilent)对数据进行RMA汇总、分位数归一化和log2转换。
 
提交日期 2011年4月21日
上次更新日期 2011年4月22日
联系人姓名 詹妮弗·皮滕波尔
电子邮件 j.pietenpol@vanderbilt.edu
组织名称 范德比尔特大学医学中心
街道地址 皮尔斯南23大道652号普雷斯顿研究大楼
西蒂 纳什维尔
省/自治区 TN公司
邮政编码 37232
国家 美国
 
平台ID GPL570型
系列(1)
GSE28796标准 剂量密集型多西他赛治疗的乳腺癌预处理活检的基因表达谱

数据表标题描述
ID_REF(标识_参考)
VALUE(价值) Log2 RMA信号

数据表
ID_REF(标识_参考) VALUE(价值)
AFFX-BioB-5_at公司 0.30451202
AFFX生物B-M_at 0.2666216
AFFX-BioB-3_at公司 0.28234577
AFFX-生物C-5_at 0.26160145
AFFX-生物C-3_at 0.24341679
AFFX-BioDn-5_at公司 0.26869965
AFFX-BioDn-3_at公司 0.15114498
AFFX-CreX-5_at公司 0.05966091
AFFX-CreX-3_at公司 0.06534481
AFFX-DapX-5_at公司 0.014283896
AFFX-DapX-M_at公司 -0.13109517
AFFX-DapX-3_at公司 0.029384613
AFFX-LysX-5_at公司 0.00523591
AFFX-LysX-M_at公司 0.004210591
AFFX-LysX-3_at公司 0.018666267
AFFX-PheX-5_at公司 -0.022188783
AFFX-PheX-M_at公司 -0.12105918
AFFX-PheX-3_at公司 -0.105332375
AFFX-ThrX-5_at公司 -0.026853561
AFFX-ThrX-M_at公司 0.4063624

总行数:54675

表格已截断,表格大小已满1178千字节.




补充文件 尺寸 下载 文件类型/资源
GSM713210.CEL.gz 4.0兆字节 (英尺/平方英尺)(http) CEL公司
样本表中包含的已处理数据

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