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| 状态 |
2024年5月19日公开 |
| 标题 |
患者2 OSCC3 |
| 样品类型 |
核糖核酸 |
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| 源名称 |
头颈癌
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| 有机体 |
智人 |
| 特点 |
组织：口腔鳞癌
年龄：59岁
性别：男
吸烟：是的
酒精：是的
种族：白种人
位置：口腔和活动舌头
阶段：IV
既往放射治疗：无
既往化疗：否
组织学炎症亚型：免疫排斥
基质纤维化：无
纤维粘液样基质：是
瘤周间质纤维化：无
瘤周间质炎症：否
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| 提取的分子 |
总核糖核酸 |
| 提取协议 |
使用Rneasy FFPE试剂盒（Qiagen，目录号73504）对前瞻性收集的HNSCC肿瘤组织的3-5张5 um厚的FFPE组织切片切片进行RNA提取。在H&E染色切片的指导下，由外科口腔病理学家（RY）确定肿瘤丰富区域和瘤周间质3-4mm，并手动进行显微解剖。
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| 标签 |
生物素
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| 标签协议 |
根据制造商的协议，生物素化捕获探针和彩色编码报告探针用于杂交复合物
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| 杂交协议 |
质量控制：在纳米芯片上进行RNA质量控制（QC）分析，以确保在50-300ng中所需的200nt，无需事先扩增或酶反应。
杂交在常规热循环中进行。在巴尔的摩马里兰大学基因组科学研究所（IGS）的n计数器中使用磁珠纯化杂交混合物。
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| 扫描协议 |
使用555FOV的计数器数字分析仪扫描，图像采集在计数器SPRINT系统上
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| 描述 |
SCC03系列
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| 数据处理 |
数据分析使用IO-360平台770个基因代码集，使用nSolver 4.0软件基本和高级服装分析进行。
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| 提交日期 |
2022年12月13日 |
| 上次更新日期 |
2024年5月19日 |
| 联系人姓名 |
瓦西里厄斯·伊奥纳斯·西奥菲卢（Vasileios Ionas Theofilou） |
| 电子邮件 |
vtheofilou@umaryland.edu
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| 电话 |
4109006188
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| 组织名称 |
马里兰州大学巴尔的摩分校牙科学院
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| 部门 |
肿瘤学和诊断科学
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| 街道地址 |
巴尔的摩街650 W
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| 西蒂 |
巴尔的摩 |
| 省/自治区 |
医学博士 |
| 邮政编码 |
21201 |
| 国家 |
美国 |
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| 平台ID |
GPL27956型 |
| 系列（1） |
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| 关系 |
| 重新分析 |
GSM4972417标准 |
