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样品GSM5665294 GSM5665294的查询数据集
状态 2024年5月16日公开
标题 肺部SU_HX_3
样品类型 SRA公司
 
源名称 SU_HX(X)
有机体 褐家鼠
特点 菌株:Sprague Dawley
组织:肺
年龄和性别:5周龄,男性
治疗:糖原治疗(SU_HX),缺氧条件
治疗方案 雄性Sprague-Dawley大鼠(日本SLC),130–150 g,皮下注射20 mg/kg SU-5416,并在常压2周后暴露于缺氧(10%氧气)3周。然后大鼠在常氧条件下给予溶媒或白杨素(100mg/kg/天)或TMZ(0.7g/L饮用水)3周(分别为SU_HX组、白杨素组、TMZ组)。对照大鼠在常氧条件下维持8周(对照组)。
提取的分子 总核糖核酸
提取协议 根据制造商的ISOGEN plus(TAKARA)方案制备组织衍生总RNA。
使用标准Illumina协议制备RNA文库用于测序。
 
图书馆战略 RNA-Seq号
库源 转录组学的
库选择 cDNA
仪器型号 Illumina NextSeq 500公司
 
数据处理 使用折叠变化和错误发现率(FDR)的过滤特性来识别DEG。
 
提交日期 2021年11月2日
上次更新日期 2024年5月16日
联系人姓名 Jun-Dal Kim先生
组织名称 富山大学
部门 国家医学研究所复杂生物系统研究部
门诊化验室 复杂生物系统研究实验室。
街道地址 2630苏吉塔尼
西蒂 富山
省/自治区 富山
邮政编码 930-0194
国家 日本
 
平台ID GPL20084型
系列(1)
GSE186996标准 白杨素或曲美他嗪治疗前后糖耐缺氧大鼠肺组织的综合转录组分析
关系
生物样品 SAMN22837294标准
SRA公司 SRX12895963型

未提供补充数据文件
SRA运行选择器帮助
SRA中有原始数据
已处理的数据可用于序列记录

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