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状态 |
2024年5月16日公开 |
标题 |
肺部SU_HX_3 |
样品类型 |
SRA公司 |
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源名称 |
SU_HX(X)
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有机体 |
褐家鼠 |
特点 |
菌株:Sprague Dawley 组织:肺 年龄和性别:5周龄,男性 治疗:糖原治疗(SU_HX),缺氧条件
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治疗方案 |
雄性Sprague-Dawley大鼠(日本SLC),130–150 g,皮下注射20 mg/kg SU-5416,并在常压2周后暴露于缺氧(10%氧气)3周。然后大鼠在常氧条件下给予溶媒或白杨素(100mg/kg/天)或TMZ(0.7g/L饮用水)3周(分别为SU_HX组、白杨素组、TMZ组)。对照大鼠在常氧条件下维持8周(对照组)。
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提取的分子 |
总核糖核酸 |
提取协议 |
根据制造商的ISOGEN plus(TAKARA)方案制备组织衍生总RNA。 使用标准Illumina协议制备RNA文库用于测序。
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图书馆战略 |
RNA-Seq号 |
库源 |
转录组学的 |
库选择 |
cDNA |
仪器型号 |
Illumina NextSeq 500公司 |
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数据处理 |
使用折叠变化和错误发现率(FDR)的过滤特性来识别DEG。
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提交日期 |
2021年11月2日 |
上次更新日期 |
2024年5月16日 |
联系人姓名 |
Jun-Dal Kim先生 |
组织名称 |
富山大学
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部门 |
国家医学研究所复杂生物系统研究部
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门诊化验室 |
复杂生物系统研究实验室。
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街道地址 |
2630苏吉塔尼
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西蒂 |
富山 |
省/自治区 |
富山 |
邮政编码 |
930-0194 |
国家 |
日本 |
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平台ID |
GPL20084型 |
系列(1) |
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关系 |
生物样品 |
SAMN22837294标准 |
SRA公司 |
SRX12895963型 |