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样品GSM556433 GSM556433的查询数据集
状态 2010年8月30日公开
标题 IPAH-10型
样品类型 核糖核酸
 
源名称 PMBC
有机体 智人
特点 单元类型:PMBC
疾病状态:特发性肺动脉高压
性别:女性
提取的分子 总核糖核酸
提取协议 采集方案:通过外周静脉穿刺,用柠檬酸钠将每名受试者的全血采集到BD Vacutainer®CPT™试管中。
分离方案:通过离心法从全血中分离外周血单个核细胞(PBMC),并在-80°C下将细胞储存在RNAlate(加州巴伦西亚Qiagen Inc.)中。
使用Trizol(Invitrogen,Corporation,Carlsbad,CA)提取和异丙醇沉淀法从PBMC中分离出总RNA,然后使用Qiagen RNeasy迷你试剂盒(Qiangen)进行清理。
标签 生物素
标签协议 使用Affymetrix(加州圣克拉拉)试剂盒从5µg总RNA制备微阵列靶点,用于反转录和单轮体外转录。HG-U133+2.0与10µg cRNA杂交,并按照制造商的方案进行处理。
 
杂交协议 Affymetrix标准协议
扫描协议 Affymetrix标准协议
说明 基因表达数据
IPAH_10_6型
数据处理 使用RMA对原始数据进行标准化,并以非对数转换信号强度表示
 
提交日期 2010年6月15日
上次更新日期 2010年6月15日
联系人姓名 克里斯托弗·柯德伦
电子邮件 克里斯·科尔德伦@ucdenver.edu
电话 303 724 6056
组织名称 科罗拉多大学医学院
部门 医学
门诊化验室 肺科学与重症监护医学
街道地址 东17号广场12700号
西蒂 极光
省/自治区 一氧化碳
邮政编码 80045
国家 美国
 
平台ID GPL570型
系列(2)
GSE22356标准 硬皮病相关肺动脉高压患者外周血细胞免疫表型的改变
GSE76809型 系统性硬化症的多组织功能基因组研究

数据表标题描述
ID_REF(标识_参考)
VALUE(价值) RMA信号强度

数据表
ID_REF(标识_参考) VALUE(价值)
1007_秒_秒 60.5064
1053_吨 96.5233
117_吨 287.861
121_吨 212.915
1255_g_时间 5.98095
1294_吨 230.605
1316_天 37.0834
1320_吨 15.4527
1405_i_at(_安) 3027.08
1431_at(公元1431年) 11.1258
1438_天 30.1075
1487_安 130.259
1494年_月_日 48.7085
1552256_阿特 80.6314
1552257_阿特 123.473
1552258_吨 36.8477
1552261_在 18.0163
1552263_安 211.121
1552264_a_阿特 581.082
1552266_吨 8.74627

总行数:54675

表格已截断,表格大小已满998千字节.




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样本表中包含的已处理数据

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