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样品GSM5133764 GSM5133764的查询数据集
状态 2024年3月2日公开
标题 血清肺癌rep22-二期
样品类型 蛋白质
 
通道1
源名称 血清,肺癌,II期
有机体 智人
特点 性别:男
年龄:67岁
样本类型:血清
癌症类型:肺癌
烟:没有
家族历史:否
结核病史:否
手术:是的
设计阶段:二期
分子:血清自身抗体蛋白IgG
提取的分子 蛋白质
提取协议 标准协议
标签 Cy3(Cy3)
标签协议 用PBST清洗后,将微阵列与1:1000稀释的氟偶联山羊抗人IgG(532nm)和驴抗人Ig M(635nm)(宾夕法尼亚州西格罗夫Jackson ImmunoResearch)在室温下在黑暗中孵育1h。用PBST洗涤后,用dd H2O冲洗微阵列并干燥
 
通道2
源名称 血清,肺癌,II期
有机体 智人
特点 分子:血清自身抗体蛋白IgM
提取的分子 蛋白质
提取协议 标准协议
标签 Cy5细胞
标签协议 用PBST清洗后,将微阵列与1:1000稀释的氟偶联山羊抗人IgG(532nm)和驴抗人Ig M(635nm)(宾夕法尼亚州西格罗夫Jackson ImmunoResearch)在室温下在黑暗中孵育1h。用PBST洗涤后,用dd H2O冲洗微阵列并干燥
 
 
杂交协议 将微阵列从−80°C下取出,然后在RT下放入封闭缓冲液(PBS中的3%BSA)中3小时。然后将1:200稀释在结合缓冲液中的血清样品(PBST中的1%BSA)添加到微阵列中,并在4°C下培养过夜
扫描协议 微阵列使用LuxscanTM 10K-A(CapitalBio Corporation,中国北京)进行扫描。
描述 实验设计第二阶段
数据处理 使用GenePix Pro 6.0(Axon Instruments,Foster City,CA)进行数据分析。每个光点的信号(SNR)定义为前地面与背景中位数强度的比值,并使用中位数值进行归一化。
 
提交日期 2021年3月3日
上次更新日期 2024年3月2日
联系人姓名 何艳斌
电子邮件 heyanbin@bcbio.cn
电话 18565610792
组织名称 BCBIO公司
街道地址 中国广东省佛山市顺德区岭南大道南2号中欧中心A
西蒂 佛山
省/自治区 广东
邮政编码 528315
国家 中国
 
平台ID GPL29810系列
系列(1)
GSE168198 人类血清:对照组与肺癌组

数据表标题描述
ID_REF(标识_参考)
VALUE(价值) SNR归一化中值(SNR是每个光点的前景与背景中值强度的比值)。

数据表
ID_REF(标识_参考) VALUE(价值)
1 13.23076923
2 5.426190476
33.91269841
4 13.71030466
5 7.745966155
6 7.945879121
7 4.020627286
8 32.12257194
9 61.04907975
10 18.7917978
11 12.50846056
12 16.50594177
13 32.93989071
14 8.495202559
15 8.854014599
16 30.84369462
17 18.93499446
18 13.2357487
19 67.70889433
20 14.67600772

总行数:182

表格已截断,表格大小已满2 KB.




补充文件 大小 下载 文件类型/资源
GSM5133764_相位2_LC_20.gpr.gz 25.3千桶 (英尺/平方英尺)(http) 地质雷达
样本表中包含的已处理数据

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