GEO出版物 讲义 NAR 2024（最新） NAR 2002（原件） 所有出版物 常见问题 MIAME公司 发送电子邮件给GEO    美国国立生物技术信息中心>地理位置>访问显示 未登录|登录 GEO帮助：将鼠标悬停在屏幕元素上以获取信息。 范围：自我 站台 样品 系列 家庭   格式：HTML格式 柔软 MINiML公司   数量：简介 快  GEO加入：   样品GSM508316 GSM508316的查询数据集 状态 2012年1月13日公开 标题 212695 样品类型 核糖核酸   通道1 来源名称 人类参考B 有机体 智人 特点 参考文献：地层基因人类通用参考文献，含有1/10添加的MCF7和ME16C RNA 生物材料供应商 地层成因 提取的分子 总核糖核酸 提取协议 stratagene分离的总RNA 标签 Cy3（Cy3） 标签协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124   频道2 来源名称 212695 有机体 智人 特点 幻灯片名称：A44K-4722 i-spy编号：1032 实验名称：212695 研究：ISPY 年龄：37.58岁 组织学分级（1=Ⅰ级（低）；2=二级（中级）；3=等级iii（高）；4=不确定）：2 组织学（1=坏死；2=导管癌；3=小叶；4=导管/小叶混合癌；5=其他6=无侵袭性肿瘤；）：2 临床肿瘤大小（化疗前），cm（-1=n/a）：9 临床t期（化疗前）（1=<=2cm；2=>2-5cm；3=>5cm）：3 er（0=阴性；1=阳性；）：1 pgr（0=阴性；1=阳性；）：1 her2（0=负；1=正；）：0 pam50的固有亚型：Luminal A 新辅助化疗*（1=ac仅；2=ac+t；3=ac+t+herceptin；4=ac+t+其他；）：A=阿霉素，C=环磷酰胺，t=紫杉烷：2 病理完全应答（pcr）：否 rcb等级：II=rcb指数大于1.36或等于3.28 无复发生存时间-从化疗开始日期到最早的时间：局部或远处进展或死亡（时间单位为天）：1384 无复发生存指标（1=事件；局部或远期进展或死亡，0=最后随访时检查）：0 总生存期-从研究化疗开始日期到死亡或最后随访的时间；（时间单位为天）：1384 生存状态（7=存活；8=死亡，9=丢失）：9 提取的分子 总核糖核酸 提取协议 Qiagen Rneasy试剂盒 标签 Cy5细胞 标签协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124     杂交协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124 扫描协议 用GenePix 4000B荧光扫描仪收集Cy3和Cy5的荧光阵列图像，并用GenePix Pro 5.1分析软件提取和分析图像强度数据。 描述 212695 数据处理 两个通道的数据均为低标准化，然后取对数（2）比   提交日期 2010年2月10日 上次更新日期 2015年7月17日 联系人姓名 查尔斯·佩罗 电子邮件 cperou@med.unc.edu 组织名称 北卡罗来纳大学教堂山分校 部门 遗传学、病理学和检验医学教授；综合癌症中心 街道地址 12-044 Lineberger综合癌症中心CB#7295 西蒂 教堂山 省/自治区 数控 邮政编码 27599-7264 国家 美国   平台ID GPL1708型 系列（1） GSE22226标准 新辅助性乳腺癌化疗反应的异质性和无复发生存率：来自I-SPY 1试验的结果 数据表标题描述 ID_REF（标识_参考） 点参考ID VALUE（价值） 与UNF_VALUE相同，但删除了标记值 现场 阵列上的点编号 CH1_平均值 CH1_SD公司 通道1强度的标准偏差 CH1_BKD_媒体 通道1背景中值强度 CH1_BKD_SD 通道1背景中值强度的标准偏差 CH2_平均值 通道2平均强度 CH2_SD公司 通道2强度的标准偏差 CH2_BKD_媒体 通道2背景中值强度 CH2_BKD_SD公司 通道2背景中值强度的标准偏差 TOT_BPIX公司 背景像素数 总像素 点像素数 CH2BN_媒体 通道2归一化背景中值强度 CH2IN_MEAN公司 通道2归一化平均强度 CH1DL_MEAN（甲烷平均值） 通道1低标准化平均强度 CH2DL_平均值 通道2低标准化平均强度 日志_RAT2N_MEAN log2_信道2相对于信道1的归一化比率（全局归一化） 腐蚀，腐蚀 像素间相关系数 旗帜 现场标志。0：未标记；阴性：标记为不良点；正面：标记为好点 UNF_价值 log2_ CH2DL_MEAN与CH1DL_MEAN的比值（LOG_RAT2L_MEAN） 数据表 ID_REF（标识_参考） VALUE（价值） 现场 CH1_平均值 CH1_SD公司 CH1_BKD_媒体 CH1_BKD_SD CH2_平均值 CH2_SD公司 CH2_BKD_媒体 CH2_BKD_SD公司 TOT_BPIX公司 总像素 CH2BN_媒体 CH2IN_MEAN公司 CH1DL_MEAN（甲烷平均值） CH2DL_平均值 日志_RAT2N_MEAN 腐蚀，腐蚀 旗帜 UNF_价值 1 1.014 44290 51 11 36 6 163 111 95 82 429 80 71 123 22 45 1.794 .15 0 1.014 2 .116 44084 47 10 36 6 131 88 96 83 338 80 72 99 18 20 1.296 .03 0 .116 三 -.37 43878 57 10 36 6 138 82 99 85 335 80 75 104 32 25 .466 .06 0 -.37 4 .921 43672 51 10 35 6 157 93 90 82 327 80 68 118 23 45 1.644 .16 0 .921 5 .25 43466 73 17 36 6 171 122 95 81 349 80 71 129 48 57 .649 .23 0 .25 6 .958 43260 47 10 36 6 145 103 89 89 328 80 67 109 17 34 1.933 .11 0 .958 7 .062 43054 47 9 35 6 130 86 94 80 338 80 71 98 20 21 1.17 .03 0 .062 8 .111 42848 48 9 36 6 128 89 91 83 339 80 68 96 20 21 1.222 .07 0 .111 9 1.364 42642 50 8 36 6 167 118 88 71 326 80 66 126 20 53 2.1 .29 0 1.364 10 .811 42436 51 9 36 6 154 98 93 73 332 80 70 116 22 40 1.617 .18 0 .811 11 -.089 42230 48 8 36 6 135 90 102 76 342 80 77 102 20 19 1.059 -1 0 -.089 12 -.99 42024 218 58 36 6 214 121 104 82 338 80 78 162 199 100 -1.114 .38 0 -.99 13 -.768 41818 53 12 37 6 123 69 96 84 354 80 72 93 27 15 .392 .04 0 -.768 14 .092 41612 69 17 35 103 154 121 88 93 338 80 66 116 45 48 .557 .04 0 .092 15 .837 41406 48 10 36 105 152 86 97 91 323 80 73 115 19 34 1.807 .07 0 .837 16 2.175 41200 47 10 36 6 202 112 95 77 337 80 71 153 16 72 2.898 .25 0 2.175 17 .274 40994 57 13 36 6 146 126 91 77 342 80 68 110 30 37 1 .23 0 .274 18 .46 40788 64 10 36 6 158 106 86 76 332 80 65 119 38 52 .948 .2 0 .46 19 -.104 40582 149 41 36 5 220 133 88 78 348 80 66 166 126 117 -.176 .53 0 -.104 20 -1.009 40376 93 23 36 6 146 102 97 82 335 80 73 110 74 37 -.624 .18 0 -1.009 总行数：44290 表格已截断，表格大小已满3480 KB. 未提供补充数据文件 样本表中包含的已处理数据 |国家土地管理局|国家卫生研究院|GEO帮助|免责声明|无障碍|