GEO出版物 讲义 NAR 2024（最新） NAR 2002（原件） 所有出版物 常见问题解答 迈阿密 发送电子邮件给GEO    美国国立生物技术信息中心>地理位置>访问显示 未登录|登录 GEO帮助：将鼠标悬停在屏幕元素上以获取信息。 范围：自我 站台 样品 系列 家庭   格式：HTML格式 柔软 MINiML公司   数量：简介 快  GEO加入：   样品GSM508290 GSM508290的查询数据集 状态 2012年1月13日公开 标题 228306-2008 样品类型 核糖核酸   通道1 源名称 人类参考B 有机体 智人 特点 参考文献：Stratagene Human Universal reference包含1/10添加的MCF7和ME16C RNA 生物材料供应商 斯特拉赫纳 提取的分子 总核糖核酸 提取协议 stratagene分离的总RNA 标签 Cy3（Cy3） 标签协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124   频道2 源名称 228306-2008 有机体 智人 特点 幻灯片名称：A44K-28703-4768a i-spy编号：1106 实验名称：228306-2008 研究：ISPY 年龄：50.41岁 组织学分级（1=i级（低）；2=二级（中级）；3=等级iii（高）；4=不确定）：3 组织学（1=坏死；2=导管癌；3=小叶；4=导管/小叶混合癌；5=其他6=无侵袭性肿瘤；）：2 临床肿瘤大小（化疗前），cm（-1=n/a）：6 临床t分期（化疗前）（1=<=2cm；2=>2-5cm；3=>5cm）：3 er（0=负；1=正；）：1 pgr（0=阴性；1=阳性；）：1 her2（0=负；1=正；）：0 pam50的固有亚型：亮度B 新辅助化疗*（1=仅ac；2=ac+t；3=ac+t+赫赛汀；4=ac+t+其他；）：A=阿霉素，C=环磷酰胺，t=紫杉烷：2 病理完全应答（pcr）：否 rcb等级：II=rcb指数大于1.36或等于3.28 无复发生存时间-从化疗开始日期到最早的时间：局部或远处进展或死亡（时间单位为天）：677 无复发生存指标（1=事件；局部或远期进展或死亡，0=最后随访时检查）：1 总生存期-从研究化疗开始日期到死亡或最后随访的时间；（时间单位为天）：1176 生存状态（7=存活；8=死亡，9=丢失）：8 提取的分子 总核糖核酸 提取协议 Qiagen Rneasy试剂盒 标签 Cy5细胞 标签协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124     杂交协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124 扫描协议 使用GenePix 4000B荧光扫描仪采集Cy3和Cy5的荧光阵列图像，并使用GenePix Pro 5.1分析软件提取图像强度数据并进行分析。 描述 228306-2008 数据处理 两个通道的数据均为低标准化，然后取对数（2）比   提交日期 2010年2月10日 上次更新日期 2022年6月6日 联系人姓名 查尔斯·佩罗 电子邮件 cperou@med.unc.edu 组织名称 北卡罗来纳大学教堂山分校 部门 遗传学、病理学和检验医学教授；综合癌症中心 街道地址 12-044 Lineberger综合癌症中心CB#7295 西蒂 教堂山 省/自治区 数控 邮政编码 27599-7264 国家 美国   平台ID GPL4133标准 系列（1） GSE22226标准 新辅助性乳腺癌化疗反应的异质性和无复发生存率：来自I-SPY 1试验的结果 关系 重新分析人 GSE205568标准 数据表表头说明 ID_REF（标识_参考） 点参考ID VALUE（价值） 与UNF_VALUE相同，但删除了标记值 现场 阵列上的点编号 CH1_平均值 CH1_SD公司 通道1强度的标准偏差 CH1_BKD_媒体 通道1背景中值强度 CH1_BKD_SD公司 通道1背景中值强度的标准偏差 CH2_平均值 通道2平均强度 CH2_SD公司 通道2强度的标准偏差 CH2_BKD_媒体 通道2背景中值强度 CH2_BKD_SD公司 通道2背景中值强度的标准偏差 TOT_BPIX公司 背景像素数 TOT_SPIX公司 点像素数 CH2BN_媒体 通道2归一化背景中值强度 CH2IN_MEAN公司 通道2归一化平均强度 CH1DL_MEAN（甲烷平均值） 通道1低标准化平均强度 CH2DL_平均值 通道2低标准化平均强度 日志_RAT2N_MEAN log2_通道2相对于通道1的归一化比率（全局归一化） 腐蚀，腐蚀 像素间相关系数 旗帜 现场标志。0：未标记；阴性：标记为不良点；正面：标记为好点 UNF_价值 log2_ CH2DL_MEAN与CH1DL_MEAN的比值（LOG_RAT2L_MEAN） 数据表 ID_REF（标识_参考） VALUE（价值） 现场 CH1_平均值 CH1_SD公司 CH1_BKD_媒体 CH1_BKD_SD公司 CH2_平均值 CH2_SD公司 CH2_BKD_媒体 CH2_BKD_SD公司 TOT_BPIX公司 TOT_SPIX公司 CH2BN_媒体 CH2IN_MEAN公司 CH1DL_MEAN（甲烷平均值） CH2DL_平均值 日志_RAT2N_MEAN 腐蚀，腐蚀 旗帜 UNF_价值 1 2.263 45220 6369 2025 45 20 24689 7509 50 135 392 80 39 19594 5697 27347 1.629 .95 0 2.263 2 -1.506 44688 50 13 45 13 49 34 40 98 423 120 31 38 11 三 .485 .12 0 -1.506 三 .035 44156 48 12 44 12 59 57 40 33 474 120 31 46 8 8 1.907 .12 0 .035 4 -1.142 43624 49 15 42 11 51 30 37 36 417 120 29 40 14 6 .652 .04 0 -1.142 5 -.752 43092 48 12 44 11 51 34 39 34 462 120 30 40 8 5 1.322 -1 0 -.752 6 .658 42560 46 12 44 14 56 29 39 27 112 32 30 44 4 7 2.807 .14 0 .658 7 -1.54 42028 49 13 43 11 49 31 39 30 418 120 30 38 13 4 .415 .03 0 -1.54 8 -.631 41496 48 13 43 12 54 36 39 30 419 120 30 42 10 6 1.263 -1 0 -.631 9 -1.326 40964 49 12 44 12 49 32 39 30 454 120 30 38 11 4 .678 .03 0 -1.326 10 -1.377 40432 51 14 45 11 48 27 37 43 200 32 29 38 13 5 .585 .06 0 -1.377 11 -1.27 39900 50 13 43 12 52 29 39 32 447 120 30 41 14 6 .652 .19 0 -1.27 12 -1.075 39368 392 152 44 12 209 115 42 32 370 80 33 165 349 166 -1.4 .71 0 -1.075 13 -.388 38836 90 23 45 16 114 68 38 43 344 80 30 90 66 51 .415 .52 0 -.388 14 -1.349 38304 479 134 43 12 205 123 39 32 338 80 30 162 429 168 -1.723 .65 0 -1.349 15 -.359 37772 82 20 43 12 110 70 39 38 316 80 30 87 59 46 .548 .46 0 -.359 16 -.848 37240 5514 1354 43 13 2420 851 39 38 369 80 30 1920 4842 2689 -1.535 .94 0 -.848 17 2.875 36708 128 35 42 11 680 329 36 34 325 80 28 539 86 637 2.571 .85 0 2.875 18 -.411 36176 208 44 45 12 190 110 38 38 312 80 30 150 181 136 -.442 .66 0 -.411 19 -.202 35644 18235 5663 46 19 12941 4773 42 49 366 80 33 10270 16430 14279 -.829 .97 0 -.202 20 -.091 35112 65 16 45 12 91 56 37 34 352 80 29 72 33 31 1.104 .29 0 -.091 总行数：45220 表格已截断，表格大小已满3633千字节. 未提供补充数据文件 样本表中包含的已处理数据 |国家土地管理局|无人机|GEO帮助|免责声明|无障碍|