GEO出版物 讲义 NAR 2024（最新） NAR 2002（原件） 所有出版物 常见问题 MIAME公司 发送电子邮件给GEO    美国国立生物技术信息中心>地理位置>访问显示 未登录|登录 GEO帮助：将鼠标悬停在屏幕元素上以获取信息。 范围：自我 站台 样品 系列 家庭   格式：HTML格式 柔软 MINiML公司   数量：简介 快  GEO加入：   样品GSM508289 GSM508289的查询数据集 状态 2012年1月13日公开 标题 227349-2008 样品类型 核糖核酸   通道1 来源名称 人类参考B 有机体 智人 特点 参考文献：地层基因人类通用参考文献，含有1/10添加的MCF7和ME16C RNA 生物材料供应商 地层成因 提取的分子 总核糖核酸 提取协议 stratagene分离的总RNA 标签 Cy3（Cy3） 标签协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124   频道2 来源名称 227349-2008 有机体 智人 特点 幻灯片名称：A44K-17065-2034 i-spy编号：1120 实验名称：227349-2008 研究：ISPY 年龄：41.09 组织学分级（1=Ⅰ级（低）；2=二级（中级）；3=等级iii（高）；4=不确定）：1 组织学（1=坏死；2=导管癌；3=小叶；4=导管/小叶混合癌；5=其他6=无侵袭性肿瘤；）：2 临床肿瘤大小（化疗前），cm（-1=n/a）：3.3 临床t分期（化疗前）（1=<=2cm；2=>2-5cm；3=>5cm）：2 er（0=阴性；1=阳性；）：1 pgr（0=阴性；1=阳性；）：1 her2（0=负；1=正；）：0 pam50的固有亚型：富含Her2 新辅助化疗*（1=ac仅；2=ac+t；3=ac+t+herceptin；4=ac+t+其他；）：A=阿霉素，C=环磷酰胺，t=紫杉烷：2 病理完全反应（pcr）：无 rcb类：不可用 无复发生存时间-从化疗开始日期到最早的时间：局部或远处进展或死亡（时间单位为天）：530 无复发生存指标（1=事件；局部或远期进展或死亡，0=最后随访时检查）：0 总生存期-从研究化疗开始日期到死亡或最后随访的时间；（时间单位为天）：530 生存状态（7=存活；8=死亡，9=丢失）：9 提取的分子 总核糖核酸 提取协议 Qiagen Rneasy试剂盒 标签 Cy5细胞 标签协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124     杂交协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124 扫描协议 用GenePix 4000B荧光扫描仪收集Cy3和Cy5的荧光阵列图像，并用GenePix Pro 5.1分析软件提取和分析图像强度数据。 描述 227349-2008 数据处理 两个通道的数据均为低标准化，然后取对数（2）比   提交日期 2010年2月10日 上次更新日期 2015年7月17日 联系人姓名 查尔斯·佩罗 电子邮件 cperou@med.unc.edu 组织名称 北卡罗来纳大学教堂山分校 部门 遗传学、病理学和检验医学教授；综合癌症中心 街道地址 12-044 Lineberger综合癌症中心CB#7295 西蒂 教堂山 省/自治区 数控 邮政编码 27599-7264 国家 美国   平台ID GPL1708型 系列（1） GSE22226标准 新辅助性乳腺癌化疗反应的异质性和无复发生存率：来自I-SPY 1试验的结果 数据表标题描述 ID_REF（标识_参考） 点参考ID VALUE（价值） 与UNF_VALUE相同，但删除了标记值 现场 阵列上的点编号 CH1_平均值 CH1_SD公司 通道1强度的标准偏差 CH1_BKD_媒体 通道1背景中值强度 CH1_BKD_SD 通道1背景中值强度的标准偏差 CH2_平均值 通道2平均强度 CH2_SD公司 通道2强度的标准偏差 CH2_BKD_媒体 通道2背景中值强度 CH2_BKD_SD公司 通道2背景中值强度的标准偏差 TOT_BPIX公司 背景像素数 总像素 点像素数 CH2BN_媒体 通道2归一化背景中值强度 CH2IN_MEAN公司 通道2归一化平均强度 CH1DL_MEAN（甲烷平均值） 通道1低标准化平均强度 CH2DL_平均值 通道2低标准化平均强度 日志_RAT2N_MEAN log2_信道2相对于信道1的归一化比率（全局归一化） 腐蚀，腐蚀 像素间相关系数 旗帜 现场标志。0：未标记；阴性：标记为不良点；正面：标记为好点 UNF_价值 log2_ CH2DL_MEAN与CH1DL_MEAN的比值（LOG_RAT2L_MEAN） 数据表 ID_REF（标识_参考） VALUE（价值） 现场 CH1_平均值 CH1_SD公司 CH1_BKD_媒体 CH1_BKD_SD CH2_平均值 CH2_SD公司 CH2_BKD_媒体 CH2_BKD_SD公司 TOT_BPIX公司 总像素 CH2BN_媒体 CH2IN_MEAN公司 CH1DL_MEAN（甲烷平均值） CH2DL_平均值 日志_RAT2N_MEAN 腐蚀，腐蚀 旗帜 UNF_价值 1 .039 44290 68 16 53 13 111 63 62 60 449 80 40 72 26 27 1.093 .15 0 .039 2 .682 44084 65 14 54 14 112 79 55 58 350 80 35 72 19 31 1.75 -1 0 .682 三 1.126 43878 109 23 53 14 278 142 63 54 335 80 40 180 74 162 1.322 .58 0 1.126 4 1.038 43672 114 21 54 13 277 173 64 60 405 80 41 179 78 162 1.202 .55 0 1.038 5 1.267 43466 188 35 54 13 462 244 63 56 303 52 40 300 149 358 .956 .7 0 1.267 6 1.475 43260 91 23 53 13 275 145 64 58 372 80 41 178 53 149 1.85 .48 0 1.475 7 .362 43054 66 18 54 15 114 76 64 62 256 52 41 74 21 27 1.459 .33 0 .362 8 .718 42848 73 18 54 14 147 116 56 53 256 52 36 95 32 53 1.635 .31 0 .718 9 .532 42642 78 12 55 14 156 77 62 57 293 52 40 101 38 55 1.407 .24 0 .532 10 1.265 42436 91 21 53 13 263 144 74 62 375 80 48 170 54 131 1.683 .53 0 1.265 11 1.559 42230 3906 1067 54 15 11089 4020 64 60 422 80 41 7200 3796 11185 .895 .92 0 1.559 12 .426 42024 842 224 55 15 1137 564 60 57 361 80 38 738 794 1066 -.17 .85 0 .426 13 -.08 41818 84 21 53 13 143 100 62 57 390 80 40 92 51 48 .746 .34 0 -.08 14 .504 41612 74 19 54 14 146 81 63 52 285 52 40 94 34 48 1.433 .2 0 .504 15 .664 41406 83 18 54 13 181 105 62 55 391 80 40 117 46 73 1.409 .37 0 .664 16 .635 41200 74 19 54 13 146 94 56 54 359 80 36 94 34 52 1.536 .28 0 .635 17 .453 40994 91 22 54 14 184 109 62 59 378 80 40 119 57 78 1.094 .43 0 .453 18 2.468 40788 125 30 53 14 588 267 63 54 370 80 40 381 82 457 2.244 .79 0 2.468 19 1.469 40582 760 141 53 14 2030 491 63 55 325 52 40 1318 708 1961 .854 .91 0 1.469 20 .648 40376 358 122 53 13 587 259 63 56 374 80 40 381 319 500 .161 .78 0 .648 总行数：44290 表格已截断，表格大小已满3543 KB. 未提供补充数据文件 样本表中包含的已处理数据 |国家土地管理局|国家卫生研究院|GEO帮助|免责声明|无障碍|