GEO出版物 讲义 NAR 2024（最新） NAR 2002（原件） 所有出版物 常见问题解答 迈阿密 发送电子邮件给GEO    美国国立生物技术信息中心>地理位置>访问显示 未登录|登录 GEO帮助：将鼠标悬停在屏幕元素上以获取信息。 范围：自我 站台 样品 系列 家庭   格式：HTML格式 柔软 MINiML公司   数量：简介 快  GEO加入：   样品GSM508285 GSM508285的查询数据集 状态 2012年1月13日公开 标题 226962-2008 样品类型 核糖核酸   通道1 源名称 人类参考B 有机体 智人 特点 参考文献：Stratagene Human Universal reference包含1/10添加的MCF7和ME16C RNA 生物材料供应商 斯特拉赫纳 提取的分子 总核糖核酸 提取协议 stratagene分离的总RNA 标签 Cy3（Cy3） 标签协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124   频道2 源名称 226962-2008 有机体 智人 特点 幻灯片名称：A44K-17065-2030 i-spy编号：1088 实验名称：226962-2008 研究：ISPY 年龄：53.05 组织学分级（1=i级（低）；2=二级（中级）；3=等级iii（高）；4=不确定）：3 组织学（1=坏死；2=导管癌；3=小叶；4=导管/小叶混合癌；5=其他6=无侵袭性肿瘤；）：2 临床肿瘤大小（化疗前），cm（-1=n/a）：4.5 临床t期（化疗前）（1=<=2cm；2=>2-5cm；3=>5cm）：2 er（0=负；1=正；）：1 pgr（0=阴性；1=阳性；）：1 her2（0=负；1=正；）：0 pam50的固有亚型：亮度B 新辅助化疗*（1=仅ac；2=ac+t；3=ac+t+赫赛汀；4=ac+t+其他；）：A=阿霉素，C=环磷酰胺，t=紫杉烷：2 病理完全应答（pcr）：是 rcb类：0=rcb索引0 无复发生存时间-从化疗开始日期到最早的时间：局部或远处进展或死亡（时间单位为天）：1967 无复发生存指标（1=事件；局部或远期进展或死亡，0=最后随访时检查）：0 总生存期-从研究化疗开始日期到死亡或最后随访的时间；（时间单位为天）：1967 生存状态（7=存活；8=死亡，9=丢失）：7 提取的分子 总核糖核酸 提取协议 Qiagen Rneasy试剂盒 标签 Cy5细胞 标签协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124     杂交协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124 扫描协议 使用GenePix 4000B荧光扫描仪采集Cy3和Cy5的荧光阵列图像，并使用GenePix Pro 5.1分析软件提取图像强度数据并进行分析。 描述 226962-2008 数据处理 两个通道的数据均为低标准化，然后取对数（2）比   提交日期 2010年2月10日 上次更新日期 2015年7月17日 联系人姓名 查尔斯·佩罗 电子邮件 cperou@med.unc.edu 组织名称 北卡罗来纳大学教堂山分校 部门 遗传学、病理学和检验医学教授；综合癌症中心 街道地址 12-044 Lineberger综合癌症中心CB#7295 西蒂 教堂山 省/自治区 数控 邮政编码 27599-7264 国家 美国   平台ID GPL1708型 系列（1） GSE22226标准 新辅助性乳腺癌化疗反应的异质性和无复发生存率：来自I-SPY 1试验的结果 数据表表头说明 ID_REF（标识_参考） 点参考ID VALUE（价值） 与UNF_VALUE相同，但删除了标记值 现场 阵列上的点编号 CH1_平均值 CH1_SD公司 通道1强度的标准偏差 CH1_BKD_媒体 通道1背景中值强度 CH1_BKD_SD公司 通道1背景中值强度的标准偏差 CH2_平均值 通道2平均强度 CH2_SD公司 通道2强度的标准偏差 CH2_BKD_媒体 通道2背景中值强度 CH2_BKD_SD公司 通道2背景中值强度的标准偏差 TOT_BPIX公司 背景像素数 TOT_SPIX公司 点像素数 CH2BN_媒体 通道2归一化背景中值强度 CH2IN_MEAN公司 通道2归一化平均强度 CH1DL_MEAN（甲烷平均值） 通道1低标准化平均强度 CH2DL_平均值 通道2低标准化平均强度 日志_RAT2N_MEAN log2_通道2相对于通道1的归一化比率（全局归一化） 腐蚀，腐蚀 像素间相关系数 旗帜 现场标志。0：未标记；阴性：标记为不良点；正面：标记为好点 UNF_价值 log2_ CH2DL_MEAN与CH1DL_MEAN的比值（LOG_RAT2L_MEAN） 数据表 ID_REF（标识_参考） VALUE（价值） 现场 CH1_平均值 CH1_SD公司 CH1_BKD_媒体 CH1_BKD_SD公司 CH2_平均值 CH2_SD公司 CH2_BKD_媒体 CH2_BKD_SD公司 TOT_BPIX公司 TOT_SPIX公司 CH2BN_媒体 CH2IN_MEAN公司 CH1DL_MEAN（甲烷平均值） CH2DL_平均值 日志_RAT2N_MEAN 腐蚀，腐蚀 旗帜 UNF_价值 1 -4.541 44290 350 2573 54 13 66 40 52 38 449 80 46 59 310 13 -4.506 .06 0 -4.541 2 .61 44084 63 14 54 13 69 38 49 38 350 80 44 62 10 16 1 -1 0 .61 三 .314 43878 95 26 53 13 111 58 51 37 368 80 45 99 45 55 .363 .42 0 .314 4 -.09 43672 99 22 52 12 98 55 47 36 384 80 42 88 50 47 -.031 .28 0 -.09 5 .509 43466 172 48 52 13 228 108 53 36 404 80 47 205 121 172 .397 .71 0 .509 6 -.319 43260 92 21 53 13 90 56 52 36 296 52 46 81 42 34 -.157 .26 0 -.319 7 .074 43054 66 15 52 13 70 38 49 38 346 80 44 63 16 17 .44 -1 0 .074 8 .448 42848 70 17 52 12 80 52 47 39 368 80 42 72 20 28 .737 .15 0 .448 9 .45 42642 74 19 54 22 84 54 48 40 372 80 43 75 22 31 .678 .22 0 .45 10 .323 42436 88 21 53 13 104 53 52 41 303 52 46 93 38 47 .425 .15 0 .323 11 .559 42230 4272 1015 54 14 6587 2287 52 40 424 80 46 5934 4326 6371 .481 .92 0 .559 12 .003 42024 899 278 54 13 904 394 52 34 374 80 46 814 847 849 -.138 .9 0 .003 13 -1.666 41818 90 25 55 12 68 41 53 37 297 52 47 61 40 12 -1.322 .05 0 -1.666 14 -.114 41612 70 14 53 14 70 42 48 36 360 80 43 63 20 18 .234 .04 0 -.114 15 1.268 41406 63 15 54 12 77 48 46 34 337 80 41 69 10 25 1.637 .12 0 1.268 16 -.696 41200 63 15 53 13 57 31 48 35 348 80 43 51 12 7 -.322 -1 0 -.696 17 -.08 40994 92 20 52 13 97 57 52 36 393 80 46 87 43 41 .036 .26 0 -.08 18 .468 40788 133 30 54 13 166 86 51 38 319 52 45 149 81 112 .396 .59 0 .468 19 1.23 40582 756 248 53 14 1719 570 51 50 416 80 45 1548 706 1658 1.096 .93 0 1.23 20 .115 40376 383 100 52 12 402 181 46 33 395 80 41 362 329 357 -.044 .82 0 .115 总行数：44290 表格已截断，表格大小已满3499千字节. 未提供补充数据文件 样本表中包含的已处理数据 |国家土地管理局|无人机|GEO帮助|免责声明|无障碍|