GEO出版物 讲义 NAR 2024（最新） NAR 2002（原件） 所有出版物 常见问题解答 迈阿密 发送电子邮件给GEO    美国国立生物技术信息中心>地理位置>访问显示 未登录|登录 GEO帮助：将鼠标悬停在屏幕元素上以获取信息。 范围：自我 站台 样品 系列 家庭   格式：HTML格式 柔软 MINiML公司   数量：简介 快  GEO加入：   样品GSM508280 查询GSM508280的数据集 状态 2012年1月13日公开 标题 235533-2008 样品类型 核糖核酸   通道1 源名称 人类参考B 有机体 智人 特点 参考文献：Stratagene Human Universal reference包含1/10添加的MCF7和ME16C RNA 生物材料供应商 斯特拉赫纳 提取的分子 总核糖核酸 提取协议 stratagene分离的总RNA 标签 Cy3（Cy3） 标签协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124   频道2 源名称 235533-2008 有机体 智人 特点 幻灯片名称：A44K-17065-2016 i-spy编号：1176 实验名称：235533-2008 研究：ISPY 年龄：47.58岁 组织学分级（1=i级（低）；2=二级（中级）；3=等级iii（高）；4=不确定）：3 组织学（1=坏死；2=导管癌；3=小叶；4=导管/小叶混合癌；5=其他6=无侵袭性肿瘤；）:5 临床肿瘤大小（化疗前），cm（-1=n/a）：6 临床t分期（化疗前）（1=<=2cm；2=>2-5cm；3=>5cm）：3 er（0=阴性；1=阳性；）：0 pgr（0=阴性；1=阳性；）：0 her2（0=阴性；1=阳性；）：1 pam50的固有亚型：富含Her2 新辅助化疗*（1=ac仅；2=ac+t；3=ac+t+herceptin；4=ac+t+其他；）：A=阿霉素，C=环磷酰胺，t=紫杉烷：3 病理完全应答（pcr）：是 rcb类：0=rcb索引0 无复发生存时间-从化疗开始日期到最早的时间：局部或远处进展或死亡（时间单位为天）：855 无复发生存指标（1=事件；局部或远期进展或死亡，0=最后随访时检查）：0 总生存期-从研究化疗开始日期到死亡或最后随访的时间；（时间单位为天）：855 生存状态（7=存活；8=死亡，9=丢失）：7 提取的分子 总核糖核酸 提取协议 Qiagen Rneasy试剂盒 标签 Cy5细胞 标签协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124     杂交协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124 扫描协议 使用GenePix 4000B荧光扫描仪采集Cy3和Cy5的荧光阵列图像，并使用GenePix Pro 5.1分析软件提取图像强度数据并进行分析。 描述 235533-2008 数据处理 两个通道的数据均为低标准化，然后取对数（2）比   提交日期 2010年2月10日 上次更新日期 2015年7月17日 联系人姓名 查尔斯·佩罗 电子邮件 cperou@med.unc.edu 组织名称 北卡罗来纳大学教堂山分校 部门 遗传学、病理学和检验医学教授；综合癌症中心 街道地址 12-044 Lineberger综合癌症中心CB#7295 西蒂 教堂山 省/自治区 数控 邮政编码 27599-7264 国家 美国   平台ID GPL1708型 系列（1） GSE22226标准 新辅助性乳腺癌化疗反应的异质性和无复发生存率：来自I-SPY 1试验的结果 数据表表头说明 ID_REF（标识_参考） 点参考ID VALUE（价值） 与UNF_VALUE相同，但删除了标记值 现场 阵列上的点编号 CH1_平均值 CH1_SD公司 通道1强度的标准偏差 CH1_BKD_媒体 通道1背景中值强度 CH1_BKD_SD公司 通道1背景中值强度的标准偏差 CH2_平均值 通道2平均强度 CH2_SD公司 通道2强度的标准偏差 CH2_BKD_媒体 通道2背景中值强度 CH2_BKD_SD公司 通道2背景中值强度的标准偏差 TOT_BPIX公司 背景像素数 TOT_SPIX公司 点像素数 CH2BN_媒体 通道2归一化背景中值强度 CH2IN_MEAN公司 通道2归一化平均强度 CH1DL_MEAN（甲烷平均值） 通道1低标准化平均强度 CH2DL_平均值 通道2低标准化平均强度 日志_RAT2N_MEAN log2_通道2相对于通道1的归一化比率（全局归一化） 腐蚀，腐蚀 像素间相关系数 旗帜 现场标志。0：未标记；阴性：标记为不良点；正面：标记为好点 UNF_价值 log2_ CH2DL_MEAN与CH1DL_MEAN的比值（LOG_RAT2L_MEAN） 数据表 ID_REF（标识_参考） VALUE（价值） 现场 CH1_平均值 CH1_SD公司 CH1_BKD_媒体 CH1_BKD_SD公司 CH2_平均值 CH2_SD公司 CH2_BKD_媒体 CH2_BKD_SD公司 TOT_BPIX公司 TOT_SPIX公司 CH2BN_媒体 CH2IN_MEAN公司 CH1DL_MEAN（甲烷平均值） CH2DL_平均值 日志_RAT2N_MEAN 腐蚀，腐蚀 旗帜 UNF_价值 1 -.396 44290 72 17 56 13 55 24 44 22 458 80 43 54 15 11 -.54 .03 0 -.396 2 .16 44084 69 14 57 13 54 25 42 24 368 80 41 53 11 12 0 .03 0 .16 三 .698 43878 114 28 57 13 125 55 42 22 359 80 41 123 54 87 .525 .56 0 .698 4 -.222 43672 107 24 57 13 82 50 44 20 381 80 43 81 47 40 -.396 .36 0 -.222 5 .164 43466 193 42 59 13 181 74 42 19 295 52 41 179 128 144 .043 .75 0 .164 6 1.691 43260 92 22 60 13 136 58 44 23 391 80 43 134 30 97 1.508 .54 0 1.691 7 1.918 43054 78 33 58 14 109 496 42 21 357 80 41 107 18 71 1.722 .69 0 1.918 8 1.232 42848 81 19 58 13 90 40 42 20 393 80 41 89 21 50 1.061 .44 0 1.232 9 -.174 42642 84 20 59 13 64 33 44 19 257 52 43 63 23 21 -.322 .19 0 -.174 10 .358 42436 86 22 58 13 77 49 45 23 369 80 44 76 26 33 .193 .24 0 .358 11 .662 42230 74 17 58 14 67 35 44 24 356 80 43 66 15 24 .524 .12 0 .662 12 .495 42024 1026 249 58 13 1359 519 45 22 370 80 44 1345 950 1338 .427 .91 0 .495 13 1.183 41818 97 24 57 12 126 59 45 23 400 80 44 124 37 85 1 .51 0 1.183 14 .038 41612 72 14 57 13 57 27 43 24 359 80 42 56 14 14 -.1 .06 0 .038 15 .942 41406 69 15 57 13 63 30 42 23 366 80 41 62 11 22 .807 .09 0 .942 16 -.378 41200 69 16 57 14 50 24 42 24 368 80 41 49 11 8 -.584 .09 0 -.378 17 .337 40994 92 20 59 14 79 45 42 20 338 52 41 78 31 39 .165 .33 0 .337 18 1.272 40788 138 27 58 13 220 88 42 21 316 52 41 217 76 185 1.138 .76 0 1.272 19 .335 40582 1012 138 58 13 1202 218 42 24 294 52 41 1190 936 1181 .268 .95 0 .335 20 .224 40376 501 162 56 14 539 226 43 24 397 80 42 533 434 507 .141 .84 0 .224 总行数：44290 表格已截断，表格大小已满3490 KB. 未提供补充数据文件 样本表中包含的已处理数据 |国家土地管理局|无人机|GEO帮助|免责声明|无障碍|