GEO出版物 讲义 NAR 2024（最新） NAR 2002（原件） 所有出版物 常见问题 MIAME公司 发送电子邮件给GEO    美国国立生物技术信息中心>地理位置>访问显示 未登录|登录 GEO帮助：将鼠标悬停在屏幕元素上以获取信息。 范围：自我 站台 样品 系列 家庭   格式：HTML格式 柔软 MINiML公司   数量：简介 快  GEO加入：   样品GSM508257 GSM508257的查询数据集 状态 2012年1月13日公开 标题 244359-3 样品类型 核糖核酸   通道1 来源名称 人类参考B 有机体 智人 特点 参考文献：地层基因人类通用参考文献，含有1/10添加的MCF7和ME16C RNA 生物材料供应商 地层成因 提取的分子 总核糖核酸 提取协议 stratagene分离的总RNA 标签 Cy3（Cy3） 标签协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124   频道2 来源名称 244359-3 有机体 智人 特点 幻灯片名称：A44K-17065-1858-244359 i-spy编号：1218 实验名称：244359-3 研究：ISPY 年龄：47.82 组织学分级（1=Ⅰ级（低）；2=二级（中级）；3=等级iii（高）；4=不确定）：3 组织学（1=坏死；2=导管癌；3=小叶；4=导管/小叶混合癌；5=其他6=无侵袭性肿瘤；）：2 临床肿瘤大小（化疗前），cm（-1=n/a）：6 临床t期（化疗前）（1=<=2cm；2=>2-5cm；3=>5cm）：3 er（0=负；1=正；）：0 pgr（0=阴性；1=阳性；）：0 her2（0=负；1=正；）：0 pam50的固有亚型：类Basal 新辅助化疗*（1=ac仅；2=ac+t；3=ac+t+herceptin；4=ac+t+其他；）：A=阿霉素，C=环磷酰胺，t=紫杉烷：2 病理完全应答（pcr）：否 rcb等级：II=rcb指数大于1.36或等于3.28 无复发生存时间–从化疗开始到最早：局部或远处进展或死亡的时间（时间单位为天）：1379 无复发生存指标（1=事件；局部或远期进展或死亡，0=最后随访时检查）：0 总生存期-从研究化疗开始日期到死亡或最后随访的时间；（时间单位为天）：1379 生存状态（7=存活；8=死亡，9=丢失）：7 提取的分子 总核糖核酸 提取协议 Qiagen Rneasy试剂盒 标签 Cy5细胞 标签协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124     杂交协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124 扫描协议 用GenePix 4000B荧光扫描仪收集Cy3和Cy5的荧光阵列图像，并用GenePix Pro 5.1分析软件提取和分析图像强度数据。 描述 244359-3 数据处理 两个通道的数据均为低标准化，然后取对数（2）比   提交日期 2010年2月10日 上次更新日期 2015年7月17日 联系人姓名 查尔斯·佩罗 电子邮件 cperou@med.unc.edu 组织名称 北卡罗来纳大学教堂山分校 部门 遗传学、病理学和检验医学教授；综合癌症中心 街道地址 12-044 Lineberger综合癌症中心CB#7295 西蒂 教堂山 省/自治区 数控 邮政编码 27599-7264 国家 美国   平台ID GPL1708型 系列（1） GSE22226标准 新辅助性乳腺癌化疗反应的异质性和无复发生存率：来自I-SPY 1试验的结果 数据表标题描述 ID_REF（标识_参考） 点参考ID VALUE（价值） 与UNF_VALUE相同，但删除了标记值 现场 阵列上的点编号 CH1_平均值 CH1_SD公司 通道1强度的标准偏差 CH1_BKD_媒体 通道1背景中值强度 CH1_BKD_SD 通道1背景中值强度的标准偏差 CH2_平均值 通道2平均强度 CH2_SD公司 通道2强度的标准偏差 CH2_BKD_媒体 通道2背景中值强度 CH2_BKD_SD公司 通道2背景中值强度的标准偏差 TOT_BPIX公司 背景像素数 总像素 点像素数 CH2BN_媒体 通道2归一化背景中值强度 CH2IN_MEAN公司 通道2归一化平均强度 CH1DL_MEAN（甲烷平均值） 通道1低标准化平均强度 CH2DL_平均值 通道2低标准化平均强度 日志_RAT2N_MEAN log2_信道2相对于信道1的归一化比率（全局归一化） CORR公司 像素间相关系数 旗帜 现场标志。0：未标记；阴性：标记为不良点；正面：标记为好点 UNF_价值 log2_ CH2DL_MEAN与CH1DL_MEAN的比值（LOG_RAT2L_MEAN） 数据表 ID_REF（标识_参考） VALUE（价值） 现场 CH1_平均值 CH1_SD公司 CH1_BKD_媒体 CH1_BKD_SD CH2_平均值 CH2_SD公司 CH2_BKD_媒体 CH2_BKD_SD公司 TOT_BPIX公司 TOT_SPIX公司 CH2BN_媒体 CH2IN_MEAN公司 CH1DL_MEAN（甲烷平均值） CH2DL_平均值 日志_RAT2N_MEAN 腐蚀，腐蚀 旗帜 UNF_价值 1 -.088 44290 80 16 36 8 83 28 55 18 360 52 55 83 36 34 -.653 .4 0 -.088 2 -.083 44084 59 17 33 10 64 21 56 20 418 80 56 64 14 14 -1.699 .03 0 -.083 三 .253 43878 129 28 33 9 168 57 55 19 351 80 55 169 95 113 .249 .82 0 .253 4 .19 43672 124 38 34 8 155 64 55 19 351 80 55 156 88 101 .166 .78 0 .19 5 1.614 43466 222 52 35 10 634 237 56 19 403 80 56 640 187 575 1.643 .92 0 1.614 6 .005 43260 80 19 35 10 88 30 56 19 411 80 56 88 37 38 -.492 .47 0 .005 7 .168 43054 78 16 34 10 90 33 54 18 403 80 54 90 37 42 -.29 .51 0 .168 8 -.383 42848 74 12 36 9 73 24 58 18 304 52 58 73 27 20 -1.34 .23 0 -.383 9 .119 42642 118 35 35 10 143 49 57 20 370 80 57 144 81 88 .068 .81 0 .119 10 .216 42436 120 28 33 10 155 55 57 20 379 80 57 156 85 99 .187 .7 0 .216 11 -.434 42230 90 22 36 11 85 29 56 20 386 80 56 85 46 34 -.897 .45 0 -.434 12 .541 42024 1200 315 36 10 1648 589 54 19 389 80 54 1664 1129 1642 .468 .92 0 .541 13 .075 41818 85 20 35 10 95 30 54 19 410 80 54 95 44 46 -.286 .46 0 .075 14 .046 41612 78 20 34 9 83 27 51 19 338 80 51 83 36 38 -.46 .45 0 .046 15 .363 41406 65 14 34 10 77 30 55 19 366 80 55 77 23 29 -.494 .18 0 .363 16 .127 41200 62 16 34 9 69 22 56 18 406 80 56 69 18 19 -1.108 .23 0 .127 17 .323 40994 140 28 34 10 190 63 57 21 386 80 57 191 106 132 .338 .87 0 .323 18 .698 40788 266 79 35 10 434 118 54 20 420 80 54 438 232 377 .733 .91 0 .698 19 1.013 40582 570 158 36 1261 1098 400 55 94 401 80 55 1109 525 1060 .981 .94 0 1.013 20 -.246 40376 365 87 36 1285 338 120 57 73 386 80 57 341 331 279 -.213 .22 0 -.246 总行数：44290 表格已截断，表格大小已满3479千字节. 未提供补充数据文件 样本表中包含的已处理数据 |国家土地管理局|国家卫生研究院|GEO帮助|免责声明|无障碍|